Abstract

Fundo

RNA ribossômico (rRNA) é um regulador central do crescimento celular e podem controlar o desenvolvimento do câncer. A rRNA cis não-codificante (nc-rRNA) a montante do

45S rRNA

local de início da transcrição foi recentemente implicada no controle de

rRNA

transcrição em fibroblastos de rato. Nós investigamos se a semelhante nc-rRNA pode ser expresso em células epiteliais cancerosas humanas, e relacionada com quaisquer características genômicas.

Metodologia /Principais Achados

Usando a medição quantitativa rRNA, demonstramos que a nc rRNA é transcrito em células epiteliais do pulmão e cancro do pulmão humanos, a partir de cerca de -1000 nucleótidos a montante do

rRNA

local de início da transcrição (+1) e estendendo-se pelo menos a 203. Esta NC-rRNA foi significativamente mais abundante na maior parte das linhas celulares de cancro do pulmão, relativamente a uma linha de células epiteliais de pulmão não transformada. Sua abundância correlacionada negativamente com 45S rRNA totais em 12 de 13 linhas de células (p = 0,014). Durante a análise da sequência de -388 a 306, observamos diversas, polimorfismos frequentes Intercopy de nucleotídeo único (SNPs) em

rRNA

, com uma frequência maior do que o previsto por acaso em 12 locais. Um SNP a 139 (L /C) na sequência de comando 5 ‘variou entre as linhas de células e negativamente correlacionada com o nível do nc-rRNA (P = 0,014). Modelação da estrutura secundária do rRNA sequência 5’-líder indicou um pequeno aumento da estabilidade estrutural devido ao 139 L /C SNP e um desvio menor em ocorrências configuração local.

Conclusões /Significado

os resultados demonstram a ocorrência de um sentido nc-rRNA em células epiteliais do pulmão e câncer humano, e implicam um papel na regulação da

gene rRNA

, o que pode ser afetado por uma 139 SNP no 5 “sequência líder da transcrição rRNA primária

Citation:. Shiao YH, Lupascu ST, Gu YD, Kasprzak W, Hwang CJ, Campos JR, et al. (2009) Um Intergenic não-codificante rRNA correlacionada com a expressão do

rRNA Comprar e frequência de um

rRNA

Single Nucleotide Polymorphism em células de câncer de pulmão. PLoS ONE 4 (10): E7505. doi: 10.1371 /journal.pone.0007505

editor: Anita Brandstaetter, Innsbruck Medical University, Áustria

Recebido: 22 de julho de 2009; Aceito: 30 setembro de 2009; Publicado: 19 de Outubro, 2009