Abstract
carcinoma papilífero (PTC) é um tumor bem diferenciado da tireóide, que é responsável por aproximadamente 80% dos casos de câncer de tireóide. Por outro lado, carcinoma anaplásico da tireóide (ATC) é um subtipo menos frequente, mas agressivo, com prognóstico reservado. Os microRNAs (miRNAs), pequenos RNAs não-codificantes, surgiram como potentes reguladores pós-transcricional da expressão de genes que modulam a expressão de genes relacionados ao câncer. Computacional análises estimam que um único miARN pode modular centenas de alvos de ARNm e, ao mesmo tempo, cooperar com os outros para regular um único transcrito de ARNm. Devido ao grande número de alvos previstos e possíveis interações, apenas um pequeno número de miRNAs têm caracterizado papéis biológicos, eo panorama de regulação miRNA-mediada em câncer de tiróide continua a ser compreendido. Levando em consideração a grande quantidade de dados de expressão de genes depositados em bancos de dados públicos que alinhados previsão alvo miRNA e dados de expressão de genes de conjuntos de dados públicos da PTC e ATC para construir uma rede de regulação pós-transcricional no cancro da tiróide. Após uma análise de conjunto enriquecimento gene identificamos vias de sinalização e processos biológicos potencialmente modulados pelos miRNAs desregulados em PTC e ATC. Nossos resultados mostram a interação miRNA-mRNA que poderia contribuir com a desregulamentação de mediadores tumor-hospedeiro-chave, tais como moléculas da matriz extra-celular, interleucinas e receptores de interleucina, o que poderia conduzir uma progressão comportamento e tumor mais agressivo. Além disso, nossa análise pelo banco de dados Cancer Genome Atlas (TCGA) revelou que a expressão aberrante de genes de ECM e citocinas é frequente em PTC e está associada com o comportamento agressivo e diminuição da taxa de sobrevida global. Em conclusão, podemos lançar luz sobre a regulação pós-transcricional da expressão gênica em cancros da tiróide diferenciados e indiferenciados, revelando um potencial papel dos miRNAs na modulação de moléculas de interação tumor-hospedeiro, particularmente moléculas de ECM e mediadores do sistema imunológico, o que poderia estimular a interação entre e tumores do sistema imune para gerar um comportamento mais agressivo. Propomos um romance miRNA putativa: rede de mRNA que poderia levar a um novo caminho para estudos funcionais
Citation:. Geraldo MV, Kimura ET (2015) Análise Integrada de cancro de tiróide conjuntos de dados públicos revela o papel da pós-transcricional regulamento na progressão do tumor por Segmentação de sistema Imune Mediadores. PLoS ONE 10 (11): e0141726. doi: 10.1371 /journal.pone.0141726
editor: Soheil S. Dadras, da Universidade de Connecticut Health Center, United States