PLOS ONE: EphB2 SNPs e esporádica Prostate Cancer Risk em homens afro-americanos

Abstract

O

gene EphB2

tem sido implicado como um gene supressor de tumor somaticamente alterados, tanto o câncer de próstata (PC) e cancro colorectal. Temos demonstrado anteriormente uma associação entre um

EphB2

variante da linha germinativa absurdo eo risco de câncer de próstata familiar entre homens americanos Africano (AAM). Aqui partimos para testar a hipótese de que a variação comum no seio da

EphB2

locus é associado com aumento do risco de PC esporádica na AAM. Foram genotipados um conjunto de 341 polimorfismos de nucleotídeo único (SNPs) que engloba o

EphB2

lócus, incluindo variantes de codificação e não-codificantes conhecidos e novos, em 490 casos de PC esporádicos AA e 567 controles pareados. A análise de regressão logística baseada no marcador único revelou sete

EphB2

SNPs mostrando associação estatisticamente significativa com o risco de câncer de próstata em nossa população. A associação mais significativa foi alcançada para um romance sinónimo de codificação SNP, TGen-624, (Odds Ratio (OR) = 0,22; 95% Intervalo de Confiança (IC) 0,08-0,66, p = 1 × 10

-5). Dois outros SNPs também mostram associações significativas para a proteção efeito rs10465543 e rs12090415 (p = 1 × 10

-4), OR = 0,49 e 0,7, respectivamente. Dois SNPs adicionais revelaram tendências para um aumento no risco de câncer de próstata, rs4612601 e rs4263970 (p = 0,001), OR = 1,35 e 1,31, respectivamente. Além disso, análise de haplótipos revelou baixos níveis de desequilíbrio de ligação dentro da região, com dois blocos sendo associado com o risco de câncer de próstata entre nossa população. Estes dados sugerem que a variação genética no

EphB2

local pode aumentar o risco de PC esporádica entre AAM

Citation:. Robbins CM, Hooker S, Kittles RA, Carpten JD (2011)

EphB2

SNPs e esporádica Prostate Cancer Risk in homens Africano americano. PLoS ONE 6 (5): e19494. doi: 10.1371 /journal.pone.0019494

editor: Jen-Tsan Ashley Chi, da Universidade de Duke, Estados Unidos da América

Recebido: 02 de novembro de 2010; Aceito: 08 de abril de 2011; Publicado em: 16 de maio de 2011

Deixe uma resposta