Abstract

Fundo

Recentemente Equinodermo associada a microtúbulos de proteína-like 4- quinase de linfoma anaplásico (

EML4-ALK

) gene de fusão tornou-se um importante biomarcador para ALK inibidor de tirosina-quinase de tratamento (crizotinibe) em NSCLC. No entanto, o melhor método de detecção eo significado de

EML4-ALK

tipos variantes permanecem incertas.

Métodos

polimerase-transcriptase reversa reação em cadeia (RT-PCR), fluorescência a hibridação in situ (FISH) e imuno-mancha (IHC) foram realizados em tecidos de tumor de doentes com NSCLC 312 para a detecção de

ALK

rearranjos. análises de mutação para

EGFR

e

KRAS

genes também foram realizadas.

Resultados

Treze dos 312 pacientes (4,17%) tiveram

ALK

rearranjos detectados por RT-PCR. Se os dados de RT-PCR foi usado como o padrão-ouro, os testes de peixe tinha uma baixa sensibilidade (58,33%), mas muito boa especificidade (99,32%). IHC mancha teve melhor sensibilidade (91,67%) do que os peixes, mas menor especificidade (79,52%), quando o corte foi IHC2 +. Todos os 8 pacientes com elevada abundância de

EML4-ALK

células positivas em tecidos de tumor (avaliado por as intensidades de sinal de um produto de RT-PCR), foram também tem uma expressão elevada da proteína ALK (IHC3 +), e positiva para os peixes, exceto uma falha em peixes. Variantes 3a + 3b (4/5, 80%) de

EML4-ALK

gene de fusão foram mais comum ter alta abundância de

EML4-ALK

células positivas em tecidos tumorais do que a variante 1 ( 03/01, 33,3%). Meta-análise dos dados publicados de 2273 doentes com NSCLC revelou que a variante 3 (23/44, 52,3%) foi o tipo mais comum na população chinesa, enquanto a variante 1 (28/37, 75,7%) foi mais comum em caucasianos.

Conclusões

Entre os três métodos de detecção, RT-PCR pode detectar não só a presença de

EML4-ALK

gene de fusão e seus tipos de variantes, mas também a abundância de

EML4-ALK

células positivas em tecidos tumorais NSCLC. Os dois últimos fatores podem afetar a resposta ao tratamento com inibidor anti-ALK. Incluindo RT-PCR como um teste de diagnóstico para o tratamento inibidor ALK nos ensaios clínicos prospectivos é recomendado

citação:. Wu Y-C, Chang I-C, Wang, C-G, Chen T-D, Chen Y-T, Liu H-P, et al. (2013) Comparação de IHC, FISH e Métodos de RT-PCR para a detecção de

ALK

rearranjos de 312 células não pequenas do pulmão pacientes com câncer em Taiwan. PLoS ONE 8 (8): e70839. doi: 10.1371 /journal.pone.0070839

editor: Syed A. Aziz, Health Canada e Universidade de Ottawa, Canadá