Abstract
Fundo
fosfatase e homólogo angiotensina (
PTEN
) é um gene supressor de tumor bem estabelecida. Recentemente, estudos crescentes investigaram a associação entre
PTEN
polimorfismo IVS4 (rs3830675) e risco de vários tipos de câncer. No entanto, os resultados dos estudos individuais foram controversos. O objetivo desta meta-análise foi elucidar se
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polimorfismo IVS4 foi associado com o risco de câncer.
Métodos
As bases de dados, incluindo PubMed, Web of Knowledge e chinês Knowledge Nacional Infra-estrutura (CNKI) foram sistematicamente procurou identificar literaturas potencialmente elegíveis. odds ratio (OR) e seu intervalo de confiança de 95% (IC) foram usadas para avaliar a força da associação entre
PTEN
IVS4 polimorfismo eo risco de câncer.
Resultados
A total de sete estudos de caso-controle foram finalmente incluídos nesta meta-análise. A análise conjunta sugeriu que os indivíduos com
PTEN
IVS4 (- /-) genótipo foram significativamente associados com risco aumentado de câncer (OR = 1,45, 95% CI = 1,19-1,76, P 0,001) e subgrupo de digestivo cancro do tracto (OR IC = 1,67, 95% = 1,28-2,18, P 0,001) em comparação com a (+ + /) genótipo. A análise revelou que o alelo (-) alelo foi significativamente associada com maior risco de câncer (OR = 1,30, 95% CI = 1,12-1,50, P = 0,001) e subgrupo de câncer do trato digestivo (OR = 1,42, 95% CI = 1,16 -1,74, P = 0,001), em comparação com o (+) alelo. Não houve associação significativa entre a
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IVS4 (+/-) genótipo eo risco de câncer
Conclusão
PTEN
IVS4 (-. /- ) genótipo foi significativamente associada com risco aumentado de câncer especialmente para câncer do trato digestivo em comparação com (+ /+) genótipo. O (-) alelo do
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polimorfismo IVS4 (rs3830675) foi significativamente associada com risco aumentado de câncer especialmente para câncer do trato digestivo em comparação com (+) alelo. O modelo de efeito recessivo e modelo de efeito dominante também demonstrou associação significativa entre o
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IVS4 (rs3830675) polimorfismo e maior risco de câncer especialmente para câncer do trato digestivo. Além disso em grande escala e bem concebida estudos sobre diferentes etnias ainda são necessários para confirmar os resultados de nossa meta-análise
Citation:. Sun L, Liu J, Yuan Q, Xing C, Yuan Y (2014) Associação entre
PTEN
Gene IVS4 Polimorfismo e Risco de Câncer: uma meta-análise. PLoS ONE 9 (6): e98851. doi: 10.1371 /journal.pone.0098851
editor: Aamir Ahmad, Faculdade de Medicina da Wayne State University, Estados Unidos da América
Recebido: 01 de janeiro de 2014; Aceito: 07 de maio de 2014; Publicação: 05 de junho de 2014
Direitos de autor: © 2014 Sun et al. Este é um artigo de acesso aberto distribuído sob os termos da Licença Creative Commons Attribution, que permite uso irrestrito, distribuição e reprodução em qualquer meio, desde que o autor original ea fonte sejam creditados
Financiamento:. Este estudo é apoiada por doações do Programa Nacional de Pesquisa básica da China (973 Programa Ref No. 2010CB529304), os subsídios do Projeto de Ciência e Tecnologia da província de Liaoning (Ref No.2011225002) e os subsídios do Projeto de Ciência e Tecnologia da província de Liaoning ( Ref No. 2012225016). Os financiadores não tiveram nenhum papel no desenho do estudo, coleta de dados e análise, decisão de publicar ou preparação do manuscrito
CONFLITO DE INTERESSES:.. Os autores declararam que não existem interesses conflitantes
Introdução
a carga global do cancro continua a aumentar, em grande parte, com cerca de 12,7 milhões de casos de câncer e 7,6 milhões de mortes por câncer a cada ano em todo o mundo [1]. Carcinogénese é um multi-passo e processo complexo influenciado por vários factores ambientais e genéticos. A evidência emergente tem demonstrado que o polimorfismo do gene desempenha um papel importante na diferença de susceptibilidade individual para o cancro [2]. Identificação do polimorfismo do gene que está associado ao risco de câncer beneficiaria largamente a prevenção precoce e tratamento para o câncer.
fosfatase e homólogo angiotensina (
PTEN
), um gene supressor tumoral bem estabelecida, é mapeado para 10q23.3 cromossoma.
gene PTEN
abrange 105 kb incluindo nove exons e oito íntrons. A proteína PTEN 403 amino-ácido é uma dupla fosfatase, actuando em ambos os locais de serina-treonina e tirosina [3]. PTEN proteína contém três partes: um domínio catalítico de fosfatase N-terminal, um domínio C2 C-terminal e uma cauda C-terminal de 50 amino-ácido, que compreende um motivo de ligação PDZ e locais de fosforilação CK2 [4]. PTEN está envolvido na regulação do crescimento celular, proliferação e apoptose em vias de transdução de sinal e participa no controlo do ciclo celular [5], [6]. Desde o seu primeiro clone em 1997, somática
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mutações têm sido amplamente relatadas em vários tipos de câncer, incluindo câncer de próstata, câncer de mama, câncer de endométrio e assim por diante [7] – [9]. Nos últimos anos, muita atenção tem sido dada para o polimorfismo da linha germinativa de
gene PTEN
.
PTEN
polimorfismos foram relatados para ser envolvido em vários tipos de câncer, como câncer de mama [10], [11], câncer gástrico [12] e cancro do cólon [13].
PTEN
polimorfismo IVS4 (rs3830675) com a inserção ATCTT em 109 pb a jusante do exão 4 em intron 4 foi um dos comum
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polimorfismos. Mais recentemente, estudos crescentes investigaram a associação entre
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IVS4 polimorfismo (rs3830675) e risco de vários tipos de cancro, incluindo o cancro da mama [11], [14], o cancro colorectal [13], câncer gástrico [12] [15], câncer de esôfago [16] e câncer de próstata [17]. No entanto, os resultados de estudos individuais foram inconclusivos. Por exemplo, Canbay et ai. sugeriu que
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IVS4 (- /-) genótipo foi associado com aumento do risco de cancro colo-rectal [13]; mas George et al. informou que não foi observada associação significativa entre
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polimorfismo IVS4 e susceptibilidade ao câncer de próstata [17].
Até agora, nenhuma meta-análise foi realizada para investigar a associação de
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polimorfismo IVS4 (rs3830675) com a susceptibilidade ao câncer. Para explorar se
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polimorfismo IVS4 (rs3830675) foi associada com riscos de câncer e subtipos específicos de câncer, foi realizada uma meta-análise sobre a associação entre o
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IVS4 polimorfismo (rs3830675) e câncer risco no presente estudo.
Materiais e Métodos
Identificação e Qualificação de relevante estudos
bases de dados eletrônicas do web of Science, PubMed e Infra-estrutura chinesa Knowledge Nacional (CNKI) foram sistematicamente procurado utilizando diferentes combinações dos termos de pesquisa, incluindo “fosfatase e tensina homólogo /PTEN”, “polimorfismo /mutação /variante” e “câncer /neoplasia /tumor maligno”. Os correspondentes termos de pesquisa chineses foram utilizados durante a pesquisa de banco de dados chinês. As referências citadas em cada literaturas incluídos foram ainda procurou manualmente para identificar potenciais estudos disponíveis. Se as informações fornecidas na literatura não era suficientemente clara, o autor foi contactado para dados brutos adicionais. Quando a sobreposição de dados existe, só foi adoptado o estudo com informações mais completas. A data da última pesquisa foi 12 de novembro de 2013.
Inclusão e Exclusão Critérios
Todos os estudos incluídos devem obedecer aos seguintes critérios: estudo caso-controle; estudos sobre a associação entre o
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polimorfismo IVS4 gene (rs3830675) eo risco de câncer; estudos publicados em Inglês ou chinês; estudos com dados brutos suficientes para estimar odds ratio (OR) e seu intervalo de confiança de 95% (CI). As principais razões para exclusão foram: dados duplicados; rever; não é relevante para o cancro ou polimorfismo específico; experiências com animais; não caso-controle projetado; não há dados em bruto, mesmo depois de entrar em contato com o autor.
Data Extraction
Dois autores (Liping Sun e Jingwei Liu) independentemente extraíram os dados dos estudos incluídos. Os dados a seguir foram extraídos de cada estudo individual: primeiro autor, ano de publicação, a etnia da população estudada, tipo de câncer, o número de cada genótipo em casos e controles, métodos de genotipagem para
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polimorfismo IVS4 gene, fonte de controlos. O conflito foi resolvido após discussão e consenso foi finalmente alcançado em todos os dados extraídos
Análise Estatística
Toda a análise estatística foi realizada pelo software Stata (versão 11.0;. StataCorp, College Station, TX). RUP e os seus IC 95% foram utilizados para avaliar a força da associação entre o
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risco polimorfismo do gene e câncer. valor de P 0,05 foi considerado estatisticamente significativo. A heterogeneidade foi avaliada pela I-quadrado (I
2) valor e utilizando estatística Q (P 0,10 sugere uma heterogeneidade significativa entre os estudos) [18]. Quando heterogeneidade entre os estudos não foi significativa, foi utilizado um modelo de efeitos fixos usando o método de Mantel-Haenszel [19] para calcular as RUP sejam combinadas. Caso contrário, foi realizado um modelo de efeitos aleatórios utilizando DerSimonian e método Laird [20]. A análise de sensibilidade foi realizada para explorar a heterogeneidade quando heterogeneidade significativa foi indicada. análises de subgrupos foram realizadas para explorar os efeitos da etnia, tipo de câncer e fonte de controles. Além disso, o viés de publicação foram avaliados qualitativamente através da realização de parcelas de funil e avaliada quantitativamente pelo teste de Begg [21] e teste de Egger [22], respectivamente. valor de P 0,1 para Begg do e testes de Egger sugere viés de publicação significativa
Resultados
Características de Estudos
Esta meta-análise foi organizada com base em declaração PRISMA (PRISMA Checklist).. Um total de 492 literaturas foram obtidos a partir de bases de dados electrónicas, após remoção duplicados. Depois de analisar os títulos e resumos, 468 artigos foram excluídos, sobretudo devido à falta de relevância, revisões, experiências com animais ou não sobre o câncer. Subsequentemente, as restantes 24 publicações foram ainda avaliados para a elegibilidade. Dezessete literaturas foram removidos por causa do não em Inglês ou chinês, não há dados brutos, não caso-controle projetado ou não relacionadas com o polimorfismo IVS4. Finalmente, sete artigos de texto completo com a elegibilidade foram incluídos na presente meta-análise. O fluxograma detalhado da seleção do estudo foi mostrado na Figura 1.
As características basais dos estudos incluídos nesta meta-análise foram resumidos na Tabela 1. Todos os estudos caso-controle incluídos foram publicados em Inglês ou chinês 2001-2013, totalmente constituído por 1831 casos e 2767 controles. As etnias das populações estudadas coberta turco, chinês e americano. O (PCR-RFLP) Método
PTEN
polimorfismo IVS4 em cada estudo foi tudo detectado pelo polimorfismo em cadeia da polimerase comprimento de fragmentos de reacção restrição. Os tipos de câncer estudados das publicações consistiu de câncer de mama, câncer colorretal, câncer gástrico, câncer de esôfago e câncer de próstata. tipos de câncer, incluindo câncer de esôfago, câncer de estômago e câncer colorretal foram integrados como câncer do trato digestivo ao realizar análise de subgrupo baseadas no tipo de câncer.
Dados Quantitativos síntese