PLOS ONE: High-throughput Transcriptoma e Análise RNAi Identifica aim1, ERGIC1, TMED3 e TPX2 como alvos potenciais da droga no cancro da próstata

Abstract

O câncer de próstata é um grupo heterogéneo de doenças e há uma necessidade de métodos mais eficientes e específicas de tratamento. Neste estudo, o potencial da técnica de dados de expressão do gene e a interferência de RNA foram combinadas para avançar futuras terapias de cancro da próstata personalizados. Para distinguir o mais promissor

in vivo

prevalidated alvos de drogas câncer de próstata, uma análise bioinformática foi realizado com dados de expressão de genes do genoma de 9873 amostras de tecidos humanos. No total, foram seleccionados 295 genes em estudos funcionais em células de cancro da próstata em cultura, devido à sua elevada expressão de mRNA de próstata, cancro da próstata ou em amostras de cancro da próstata metastático. Em segundo lugar, ensaio de viabilidade celular base de ARNi foi realizada em células de cancro da próstata LNCaP e VCaP. Com base nos resultados de siRNA, padrões de expressão gênica em tecidos humanos e novidade, função retículo endoplasmático alvos associados

aim1

,

ERGIC1

e

TMED3

, bem como a regulação da mitose

TPX2

foram selecionados para posterior validação.

aim1

,

ERGIC1

, e

TPX2

mostraram-se altamente expressa especialmente em tecidos de câncer de próstata, e expressão elevada de ARNm de

ERGIC1

e

TMED3

associada a

AR

e

ERG

oncogene expressão.

ERGIC1

silenciar especificamente regulada a proliferação de

ERG

oncogene células cancerosas da próstata positivas e inibiu a expressão do mRNA ERG nestas células, indicando que ele é um alvo da droga potente no ERG subgrupo positivo de cancros da próstata.

TPX2

expressão associada com insuficiência PSA e

TPX2

silenciamento reduzida expressão PSA, indicando que TPX2 regula a sinalização mediada receptor de andrógeno. Em conclusão, o uso combinatória de técnicas de RNAi microarray e rendeu em um grande número de potenciais novos biomarcadores e alvos terapêuticos, para o futuro desenvolvimento de abordagens específicas e personalizadas para a gestão de cancro da próstata

Citation:. Vainio P, Mpindi JP , Kohonen P, Fey V, Mirtti T, Alanen KA, et al. (2012) High-throughput Transcriptoma e RNAi análise identifica

aim1

,

ERGIC1

,

TMED3

e

TPX2

como alvos potenciais da droga no cancro da próstata. PLoS ONE 7 (6): e39801. doi: 10.1371 /journal.pone.0039801

editor: Surinder K. Batra, University of Nebraska Medical Center, Estados Unidos da América

Recebido: 28 de outubro de 2011; Aceito: 31 de maio de 2012; Publicado: 28 Junho 2012

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