Abstract
Fundo
O status bioenergético de câncer de pulmão de células não pequenas correlaciona-se com a agressividade do tumor. O tipo de canal de tensão anião dependente 1 (VDAC1) é um componente do poro de transição da permeabilidade mitocondrial, regula o intercâmbio mitocondrial de ATP /ADP sugerindo que a sua sobre-expressão pode ser associado a processos dependentes de energia, incluindo o aumento da proliferação e invasão. Para testar esta hipótese, foi realizada uma in vivo gene-expressão meta-análise de câncer de pulmão não-pequenas células cirurgicamente ressecado (NSCLC), utilizando 602 perfis de expressão individuais, para analisar o impacto da VDAC1 na sobrevivência.
Metodologia /As principais conclusões
expressão alta VDAC1 foi associado com menor sobrevida global com a taxa de risco (HR) = 0,6639 (95% intervalo de confiança (IC) 0,4528-0,9721), p = 0,035352 correspondente a 52 contra 101 meses. VDAC1 previu menor tempo de recorrência e mostrou ser um fator prognóstico independente em relação com a histologia, sexo, idade, estágio nodal e estágio do tumor em uma análise multivariada de Cox. análise supervisionado de todos os conjuntos de dados identificados uma assinatura de 6 gene compreendendo HNRNPC, HSPA4, HSPA9, UBE2D2, CSNK1A1 e G3BP1 com as funções que envolvem a regulação do volume de negócios de proteína, RAS-RAF-MEK e transcrição sobreposição. VDAC1 previu a sobrevivência no cancro da mama e mieloma e uma análise sem supervisão revelou enriquecimento da assinatura VDAC1 em subconjuntos específicos.
Conclusões
Em resumo, análise de expressão gênica identifica a expressão do gene VDAC1 como um preditor de mau resultado em NSCLC e outros tipos de câncer e está associada com a desregulação de um conjunto conservado de vias biológicas, que podem ser causalmente associada ao comportamento agressivo tumor
Citation:. Grills C, Jithesh PV, Blayney J, Zhang SD, Fennell dA (2011) Gene Expression Meta-análise identifica VDAC1 como um preditor de mau Outcome in Early Stage Non-Small Cell Lung Cancer. PLoS ONE 6 (1): e14635. doi: 10.1371 /journal.pone.0014635
editor: Rory Edward Morty, Universidade de Giessen Lung Center, Alemanha