Abstract
Fundo
O cancro do cólon (CRC) de desenvolvimento muitas vezes inclui instabilidade cromossômica (CIN), levando a amplificações e exclusões de segmentos de DNA grandes. Epidemiológicos, clínicos e estudos citogenéticos mostraram que existem diferenças consideráveis entre os tumores CRC de afro-americanos (AA) e pacientes caucasianos. Neste estudo, nós determinamos cópia genômica aberrações numéricas em tumores esporádicos CRC de AAs, a fim de investigar possíveis explicações para as diferenças observadas.
Metodologia /Principais Achados
array de todo o genoma Aplicamos hibridação comparativa do genoma (aCGH), utilizando um chip de 105k para identificar aberrações no número de cópias em amostras de 15 AAs. Além disso, fizemos uma análise comparativa da população com os dados aCGH em caucasianos, bem como com uma lista amplamente divulgado de genes de câncer de cólon (genes CAN). Houve uma média de 20 aberrações por paciente com mais amplificações do que as eliminações. Análise do número de cópias de DNA de cromossomos frequentemente alterados revelou que as supressões ocorreram principalmente nos cromossomos 4, 8 e 18. duplicações cromossômicas ocorreram em mais de 50% dos casos nos cromossomos 7, 8, 13, 20 e perfil X. O CIN mostrou algumas diferenças quando comparado com alterações caucasianos.
Conclusões /Significado
amplificação do cromossoma X em pacientes do sexo masculino e cromossomos 4, 8 e 18 deleções foram aberrações proeminentes em AAs. Alguns genes podem foram alteradas em altas freqüências em AAs com
EXOC4, EPHB6, GNAS, MLL3
e
TBX22
como os genes mais frequentemente excluído e
HAPLN1, ADAM29, Smad2
e
SMAD4
como os genes mais frequentemente amplificados. O CIN observada pode desempenhar um papel específico no CRC em AAs
Citation:. Ashktorab H, Schäffer AA, Daremipouran M, Smoot DT, Lee E, Brim H (2010) distintas alterações genéticas no cancro colorectal. PLoS ONE 5 (1): e8879. doi: 10.1371 /journal.pone.0008879
editor: Ulrich Zanger, Dr. Margarete Fischer-Bosch Instituto de Farmacologia Clínica, Alemanha