PLOS ONE: Associação entre TCF7L2 Gene Polimorfismo e Risco de Câncer: uma meta-análise

Abstract

Objectivo

O fator de transcrição 7-like 2 (

TCF7L2) gene tem sido sugerido para desempenhar um papel importante na patogênese do câncer. No entanto, os resultados têm sido inconsistentes. Neste estudo, foi realizada uma meta-análise para esclarecer as associações entre

TCF7L2

polimorfismo eo risco de câncer.

Métodos

literatura publicada entre PubMed e EMBASE foram recuperados. odds ratio agrupados (OR) com intervalo de confiança de 95% (IC) foram calculados utilizando fixo ou de efeitos aleatórios do modelo.

Resultados

Um total de 19 estudos (14.814 casos e 33,856 controles) foram identificados para a análise da associação entre o

TCF7L2

risco polimorfismo e câncer. Os resultados mostraram que

TCF7L2

polimorfismo foi associado com câncer de mama (modelo homogêneo: OR = 1,17, 95% CI = 1,02-1,35,

I

2 = 21,8%,

p Compra de heterogeneidade = 0,276; modelo heterogêneo: OR = 1,11, 95% CI = 1,03-1,20,

I

2 = 0,0%,

p Compra de heterogeneidade = 0,543), o câncer de próstata (modelo homogêneo: OR = 0,89, 95% CI = 0,84-0,96,

I

2 = 0,0%,

p Compra de heterogeneidade = 0,640; modelo heterogêneo : OR = 0,89, 95% CI = ,84-,95,

I

2 = 0,0%,

p Compra de heterogeneidade = 0,871) e cancro do cólon (modelo heterogêneo: OR = 1,15, 95% CI = 1,01-1,31,

I

2 = 0,0%,

p Compra de heterogeneidade = 0,658), mas não com câncer colorretal, câncer de pulmão e câncer de ovário .

Conclusões

a presente meta-análise indicou que houve um número significativamente associações entre o

TCF7L2

polimorfismo rs7903146 ​​e risco de cânceres de mama, próstata e cólon, ao invés de câncer colorretal , câncer de pulmão e câncer de ovário

Citation:. Chen J, Yuan T, Liu M, Chen P (2013) Associação entre TCF7L2 Gene Polimorfismo e Risco de câncer: uma meta-análise. PLoS ONE 8 (8): e71730. doi: 10.1371 /journal.pone.0071730

editor: Swati Palit Deb, Virginia Commonwealth University, Estados Unidos da América

Recebido: 21 de fevereiro de 2013; Aceito: 09 de julho de 2013; Publicação: 09 de agosto de 2013

Direitos de autor: © 2013 Chen et al. Este é um artigo de acesso aberto distribuído sob os termos da Licença Creative Commons Attribution, que permite uso irrestrito, distribuição e reprodução em qualquer meio, desde que o autor original ea fonte sejam creditados

Financiamento:. Os autores não têm apoio ou financiamento para relatar

Conflito de interesses:. Os autores declararam que não existem interesses conflitantes

Introdução

O fator de transcrição 7-like 2 (

TCF7L2

) gene, previamente classificado como

TCF-4

, foi encontrada para ser associada com a diabetes de tipo 2. variante rs7903146 ​​do

gene TCF7L2

foi inicialmente identificado como um marcador de susceptibilidade de diabetes tipo 2 por meio do estudo de associação do genoma [1]. Os seguintes estudos confirmaram ainda a associação entre o

TCF7L2

variante rs7903146 ​​e diabetes tipo 2 [2]. Além disso, os indivíduos com alelos T de

TCF7L2

variante rs7903146 ​​demonstraram alto risco de resistência à insulina [3]. Alternativamente,

TCF7L2

pode afetar o câncer independentemente do diabetes, como o

TCF7L2

produto do gene está envolvida a via de sinalização /β-catenina Wnt. TCF7L2 forma um complexo nuclear activa com β-catenina que se liga e induz a expressão de genes alvo envolvidos na proliferação celular, a evasão de apoptose, e a invasão de tecidos e metástases.

Até à data, muitos estudos foram publicados investigar o associação entre

rs7903146 ​​TCF7L2

ou rs12255372 (está em alta desequilíbrio de ligação com rs7903146) e vários tipos de cancro, incluindo o cancro da mama [4] – [8], o câncer de próstata [5], [9] – [ ,,,0],12], o cancro colorectal [5], [13] – [15], o cancro do cólon [5], [16], o cancro do pulmão [5] e de ovário [6]. No entanto, as conclusões têm sido conflitantes. Por isso, foi realizada uma meta-análise para esclarecer a associação entre o

TCF7L2

variante rs7903146 ​​e câncer risco.

Materiais e Métodos

Literatura e Pesquisa Estratégia

Foram pesquisados ​​os bancos de dados da literatura PubMed e EMBASE. A estratégia de busca para identificar todos os estudos possíveis envolveu o uso das seguintes palavras-chave: (

TCF7L2

ou fator de transcrição 7-like 2 ou

TCF-4

) e (variante ou variação ou polimorfismo ou genótipo) e (câncer ou carcinoma ou tumor). Foram incluídos todos os estudos relacionados publicados no idioma Inglês. As listas de referências dos artigos recuperados foram mão-pesquisado. Se mais do que um artigo foram publicadas usando a mesma série de casos, apenas o estudo com os dados mais recentes foi incluído. A pesquisa bibliográfica foi atualizado em 18 de Fevereiro de 2013.

critérios de inclusão e Extração de dados

Os estudos incluídos na meta-análise deve satisfazer os seguintes critérios de inclusão: (1) avalia as associações de

TCF7L2

polimorfismo com o risco de câncer; (2) usa caso-controle ou coorte; e (3) fornece dados suficientes para o cálculo do odds ratio (OR) com intervalo de confiança de 95% (CI). As informações a seguir foi extraído de cada estudo: (1) o nome do primeiro autor; (2) ano de publicação; (3) país de origem; (4) etnia; (5) Tipo de câncer; (6) tamanho da amostra de casos e controles; (7) co-variáveis ​​’OR ajustado com IC 95% sob modelo de co-dominante; (8) freqüência do alelo menor nos casos e controles; (9)

p Compra de teste de Hardy Weinberg nos controles; e (10) polimorfismo estudado. Os dois autores avaliaram independentemente os artigos para o cumprimento dos critérios de inclusão /exclusão, desacordos resolvidos e chegou a uma decisão consistente.

Análise Estatística

A associação de

TCF7L2

polimorfismo com o risco de câncer foi estimada pelo cálculo RUP reunidas e ICs de 95% sob um modelo de co-dominante. O significado da pool ou foi determinada pelo teste Z (P 0,05 foi considerado estatisticamente significativo). teste Q foi realizada para avaliar a heterogeneidade entre os estudos. Um aleatório (método DerSimonian-Laird [17] ou fixo (método de Mantel-Haenszel) foi utilizado [18] modelo de efeitos para calcular em pool ou na presença (

P

≤0.10) ou ausência (

P Art .. 0,10) de heterogeneidade, respectivamente análise de subgrupo por tipo de câncer foi realizada para resolver o entre-estudo heterogeneidade viés de publicação foi avaliada pelo teste de Begg [19] e teste de Egger [20] (

P Art 0,05 foi considerado estatisticamente significativo) a análise dos dados foi realizada usando STATA versão 11 (StataCorp LP, College Station, TX, EUA)

Resultados

características dos estudos

neste estudo, nós seguimos a Declaração PRISMA (Checklist S1). um fluxograma descrevendo o processo de inclusão /exclusão de estudo é apresentado na Fig. 1. a pesquisa bibliográfica identificou um total de 128 documentos potencialmente relevantes. deles, 112 trabalhos foram excluídos devido a irrelevância óbvia pela leitura dos títulos e resumos. Além disso, dois trabalhos foram excluídos porque eles foram comentários. Então, 14 artigos preencheram os critérios de inclusão primários. No entanto, um papel foi excluído porque não fornecer dados suficientes para calcular ou com IC 95% [21]. Desde mais de um estudo foi incluído em dois artigos de Folsom et al [5] e Goode et [6] al, eles foram considerados como estudos separados na meta-análise. Além disso, desde rs7903146 ​​estava em alta LD com rs12255372, combinamos todos os estudos incluídos juntos. Por fim, 19 estudos para a associação entre

TCF7L2

risco polimorfismo e câncer foram incluídos na meta-análise final. Destes, cinco foram sobre câncer de mama, cinco eram sobre o câncer de próstata, quatro eram sobre o cancro colorectal, dois estavam em cancro do cólon, dois estavam em câncer de pulmão, e um deles era sobre o câncer de ovário. As características dos estudos incluídos estão listadas na Tabela 1. Note-se que, porque a maioria dos estudos fornecida co-variáveis ​​’OR ajustado com IC 95% sob um modelo de co-dominante, calculamos a estimativa combinada apenas sob este modelo.

resultados de meta-análise

foi identificado um total de 14814 casos e 33856 controles para a análise da associação entre o

TCF7L2

polimorfismo com o risco de câncer. Os resultados indicaram que

TCF7L2

polimorfismo pode não ser associado com o risco de câncer sob modelo de co-dominante (modelo homogêneo: OR = 1,07, 95% CI = 0,95-1,21,

I

2 = 61,4%,

p Compra de heterogeneidade 0,001, Figura 2; modelo heterogêneo: OR = 1,04, 95% CI = 0,97-1,12,

I

2 = 58,1%,

p Compra de heterogeneidade = 0,001, Figura 3). No entanto, uma análise mais aprofundada de subgrupo por tipo de câncer sugeriu que o tamanho do efeito foi significativo para câncer de mama (modelo homogêneo: OR = 1,17, 95% CI = 1,02-1,35,

I

2 = 21,8%,

p Compra de heterogeneidade = 0,276; modelo heterogêneo: OR = 1,11, 95% CI = 1,03-1,20,

I

2 = 0,0%,

p Compra de heterogeneidade = 0,543), o câncer de próstata (modelo homogêneo: OR = 0,89, 95% CI = 0,84-0,96,

I

2 = 0,0%,

p Compra de heterogeneidade = 0,640; heterogêneo modelo: OR = 0,89, 95% CI = 0,84-0,95,

I

2 = 0,0%,

p Compra de heterogeneidade = 0,871) e cancro do cólon (modelo heterogêneo: OR = 1,15, 95% CI = 1,01-1,31,

I

2 = 0,0%,

p Compra de heterogeneidade = 0,658), mas não para o câncer colorretal, câncer de pulmão e ovário câncer (todos os

p Art 0,05, Tabela 2)

publicação viés potencial

No viés de publicação pode ser detectada sob homogênea. co-dominante modelo (

p

= 0,780 para o teste de Begg e

p

= 0,123 para o teste de Egger) e modelo heterogêneo co-dominante (

p

= 0,889 para o teste de Begg e

p

= 0,274 para o teste de Egger).

Discussão

para o melhor de nosso conhecimento, a nossa meta-análise representa o primeiro a investigar a associação entre o

TCF7L2

polimorfismo rs7903146 ​​eo risco de câncer. Os resultados sugerem que

TCF7L2

polimorfismo rs7903146 ​​pode não ser associado com o risco de câncer. No entanto, uma análise mais aprofundada estratificada demonstrou a associação significativa com cancro da mama, cancro da próstata e cancro do cólon, ao invés de câncer colorretal, câncer de pulmão e câncer de ovário.

Curiosamente, o alelo T do polimorfismo rs7903146, que tem sido associado com o aumento do risco de diabetes tipo 2, mostrou a relação inversa com o cancro da próstata com base na nossa meta-análise. A constatação foi consistente com os dos estudos realizados por Folsom et ai. [5] e Machiela et al [12]. No entanto, os outros três estudos incluídos não sugeriu qualquer associação [9] – [11]. Além disso, encontramos associação positiva entre o polimorfismo rs7903146 ​​eo risco de câncer de mama. Recentemente, Michailidou K et al. [22] encontraram rs7904519 em intron 4 de

TCF7L2

(r

2 = 0,37 com rs7904519 /rs12255372), a ser associado com câncer de mama. Mais estudos são necessários para analisar os potenciais mecanismos diferentes de

TCF7L2

polimorfismo em vários cancros.

A heterogeneidade entre os estudos é comum em meta-análise de estudos de associação genética. Embora a heterogeneidade pode ser tida em conta através da realização de um modelo de efeitos aleatórios, aumentaria as chances de erro do tipo I [23]. Encontramos significativa heterogeneidade entre estudo na associação de

TCF7L2

polimorfismo rs7903146 ​​com o risco de câncer. Portanto, a análise de subgrupo por tipos de câncer foi realizado para explorar a fonte de heterogeneidade. Os resultados mostraram que a heterogeneidade entre os estudos desapareceu em vários subgrupos, mas manteve-se em outros subgrupos sugerindo outras variáveis ​​pode confundir a associação.

A meta-análise atual tem vários pontos fortes. Em primeiro lugar, OR (IC 95%), após ajustamento a partir de co-variáveis ​​estudo individual foi usada para calcular a estimativa da reunidas, o que aumentou a precisão da estimativa de efeito. Em segundo lugar, poder estatístico foi muito melhorada para o estudo de associação de

TCF7L2

polimorfismo rs7903146 ​​na análise conjunta. No entanto, várias limitações Também deve ser notado. Em primeiro lugar, o caso – desenho do estudo de controle não permite a inferência de causalidade entre o polimorfismo do gene e o resultado. Em segundo lugar, o efeito do gene – gene /gene – interacções entre o ambiente não foi abordada nesta meta-análise. Em terceiro lugar, embora etnia desempenha um papel importante na associação de

TCF7L2

polimorfismo rs7903146 ​​com o risco de câncer, nós não realizar uma análise mais aprofundada subgrupo por etnia por causa de estudos limitados para cada tipo de câncer.

em conclusão, os resultados indicaram que houve uma associação significativa entre o

TCF7L2

polimorfismo rs7903146 ​​eo risco de câncer de mama, câncer de próstata e câncer de cólon, ao invés de câncer colorretal, câncer de pulmão e câncer de ovário. Além disso bem desenhados estudos em grande escala com a consideração de interações gene-gene e gene-ambiente devem ser realizados para investigar a associação no futuro.

Informações de Apoio

Checklist S1.

PRISMA Checklist

doi:. 10.1371 /journal.pone.0071730.s001

(DOC)

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