Sumário

É bem conhecido que a conversão do epitélio de cólon normal de adenoma e, em seguida, para o carcinoma decorre de alterações moleculares adquiridos no genoma. A base genética do cancro colorectal tem sido elucidada, em certa medida, e muito resta a ser conhecido sobre a identidade de genes específicos de cancro que estão associadas com o avanço do cancro colorrectal a partir de uma fase para a seguinte. Aqui neste estudo buscou-se identificar os genes do câncer romance que poderia subjacentes a progressão específica do palco e metástase de câncer colorretal. Foi realizada uma meta-análise baseada em palco dos dados genoma-sequenciação de tumor volumoso e extraído usando várias abordagens para novos genes que impulsionam a progressão para a fase-II, fase-III e câncer colorretal estágio IV. O consenso destes genes motorista semeado a construção de redes específicas de estágio, que foram então analisadas para a centralidade de genes, o agrupamento de sub-redes, e enriquecimento dos processos gene-ontologia. Nosso estudo identificou três genes motorista novos como hubs para a progressão fase-II:

DYNC1H1

,

GRIN2A

,

GRM1

. Quatro genes motorista novos foram identificados como centros para a progressão fase-III:

IGF1R

,

CPS1

,

SPTA1

,

DSP

. Três novos genes motorista foram identificados como centros para a progressão estágio IV:

GSK3B

,

GGT1

,

EIF2B5

. Nós também identificamos vários genes que não sejam drivers que apareceram para sublinhar a progressão do cancro colorectal. Nosso estudo rendeu biomarcadores de diagnóstico potenciais para o câncer colorretal, bem como novos alvos de drogas específicas do estágio de intervenção racional. Nossa metodologia é extensível à análise de outros tipos de câncer para preencher as lacunas no nosso conhecimento

Citação:. Palaniappan A, Biomarkers Ramar K, Ramalingam S (2016) Computacional identificação de novos Stage-específicos em câncer colorretal Progressão. PLoS ONE 11 (5): e0156665. doi: 10.1371 /journal.pone.0156665

editor: Johnson Rajasingh, University of Kansas Medical Center, United States