Abstract
Na Índia, o câncer bucal tem consistentemente classificada entre as três principais causas de mortes relacionadas ao câncer, e surgiu como uma das principais causas para as mortes relacionadas com o cancro entre os homens. Falta de opções terapêuticas eficazes é um dos principais desafios no manejo clínico de pacientes com câncer bucal. Nós interrogado grande conjunto de amostras a partir de estudos de expressão de genes do cancro orais para identificar potenciais alvos terapêuticos que estão envolvidos em vários eventos característicos do cancro. As estratégias terapêuticas dirigidas para tais objectivos podem ser esperados para controlar eficazmente as células cancerosas. Conjuntos de dados de diferentes estudos de expressão gênica foram integrados através da remoção de lote efeitos e foi usado para as análises a jusante, incluindo análise de expressão diferencial. análise de redes de dependência foi feito para identificar genes que sofram alterações topológicas em amostras de cancro oral, quando comparado com amostras de controlo. análise de raciocínio causal foi realizado para identificar hipóteses significativas, o que pode explicar os perfis de expressão gênica em amostras de câncer bucal. Texto de mineração de abordagem foi utilizado para detectar marcas de câncer associados com genes expressos de forma significativa no câncer oral. Ao todo, 2365 genes foram detectados a ser diferencialmente expressos genes, que inclui alguns dos genes altamente expressos diferencialmente como metaloproteinases de matriz (MMP-1/3/10/13), de quimiocina (CXC Motif) ligandos (IL8, CXCL-10 /-11), PTHLH, SERPINE1, NELL2, S100A7A, MAL, CRNN, TGM3, CLCA4, queratinas (KRT-3/4/13/76/78), inibidores de serina e SERPINB11 peptidase (SPINK-5/7). XIST, TCEAL2, ARN e FGFR2 são alguns dos genes importantes detectadas pelo dependência e análise de rede causal. análise de mineração Literatura anotada 1014 genes, dos quais 841 genes foram estatisticamente significativamente anotados. A integração da produção de várias análises, resultou na lista de potenciais alvos terapêuticos para o câncer bucal, que incluíram alvos como a ADM, TP53, EGFR, LYN, CTLA4, SKIL, CTGF e CD70
Citation:. Bundela S, Sharma A, Bisen PS (2014) potenciais alvos terapêuticos para o cancro oral: ADM, TP53, EGFR, LYN, CTLA4, SKIL, CTGF, CD70. PLoS ONE 9 (7): e102610. doi: 10.1371 /journal.pone.0102610
Autor: Enrique Hernandez-Lemus, Instituto Nacional de Medicina Genômica, México