PLOS ONE: subtipos moleculares no câncer de cólon estágio II-III Definido pela instabilidade genômica: A recidiva precoce de riscos associados com uma alta variação de número de cópias e Perda de RUNX3 e CDKN2A

Abstract

Objectivo

Nós procuramos investigar vários subtipos moleculares definidos pela instabilidade genômica que podem estar relacionados à morte precoce e recorrência do câncer de cólon.

Métodos

Nós procuramos investigar vários subtipos moleculares definidos pela instabilidade em microssatélites (MSI), mudanças nos padrões de metilação (CPG ilha methylator fenótipo, CIMP) ou variação do número de cópias (CNV) em 8 genes. cancros do cólon Fase II-III (n = 64) foram investigados por amplificação multiplex ligado sonda específica para a metilação (MS-MLPA). Correlação da CNV, CIMP e MSI, com mutações no KRAS e BRAF V600E foram avaliados para a sobreposição de subtipos moleculares e risco de recidiva precoce por meio de regressão uni e multivariada.

Resultados

O fenótipo CIMP ocorreu em 34% (22/64) e MSI em 27% (16/60) dos tumores, com notável sobreposição CIMP /MSI. Entre os subtipos moleculares, um alto fenótipo CNV tinha uma relação associada de chances (OR) para a recorrência de 3,2 (IC 95% 1,1-9,3; P = 0,026). Perdas de CACNA1G (OR de 2,9, IC 95% 1,4-6,0; P = 0,001), IGF2 (OR de 4,3, IC 95% 1,1-15,8; P = 0,007), CDKN2A (p16) (OR de 2,0, IC 95% 1,1-3,6; P = 0,024), e RUNX3 (OR de 3,4, IC 95% 1,3-8,7; P = 0,002) foram associados com recidiva precoce, enquanto o MSI, CIMP, KRAS ou BRAF V600E mutações não foram. A CNV foi significativamente maior nos pacientes falecidos (CNV em 6 de 8) em relação aos sobreviventes (CNV em 3 de 8). Apenas palco e perda de RUNX3 e CDKN2A foram significativas no risco-modelo multivariável para recidiva precoce.

Conclusões

A cópia elevada variação do número de fenótipo é um forte preditor de recidiva precoce e morte, e pode indicar uma relação dose-dependente entre a instabilidade genética e evolução. Perda de supressores de tumor RUNX3 e CDKN2A foram relacionados à recorrência de risco e garante uma investigação mais aprofundada

Citation:. Berg M, Nordgaard O, Korner H, Oltedal S, Smaaland R, Søreide JA, et al. (2015) subtipos moleculares no câncer de cólon estágio II-III Definido pela instabilidade genômica: A recidiva precoce de riscos associado com um número de cópias de variação e Perda de

RUNX3

e

CDKN2A

alta. PLoS ONE 10 (4): e0122391. doi: 10.1371 /journal.pone.0122391

Editor do Academic: Robert Dante, Institut national de la santé et de la recherche médicale, França

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