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Sumário

Acumulando mostra uma estreita ligação entre inflamação e câncer. No entanto, a identificação completa de fatores de transcrição principais (ou seja, o núcleo TFS) mediando as ligações desreguladas continua sendo um desafio, principalmente devido à falta de amostras que podem efetivamente refletem as conexões entre inflamação e tumorigênese. Aqui, construímos uma série de redes de regulação mediada por TF a partir de uma grande compêndio de perfil de expressão de tecidos normais do cólon, doenças inflamatórias do intestino (IBD) e cancro colorrectal (CRC), que contém 1201 amostras no total, e, em seguida, proposta uma da rede abordagem baseada caracterizar ligações potenciais ponte inflamação e câncer. Para o efeito, foram computados relações significativamente desregulados entre suas redes de câncer ligados a inflamação e, e foram identificados, em seguida, 24 TFs núcleo com seus genes desregulados. Colectivamente, a nossa abordagem nos fornece uma visão muito importante na tumorigênese associada à inflamação no cancro colorectal, o que também poderia ser aplicada para identificar relações funcionalmente desregulados que medeiam as ligações entre outros fenótipos da doença diferentes

Citation:. Xiao Y, Fan H, Zhang Y, Xing W, Y Ping, Zhao H, et al. (2013) identificação sistemática do Núcleo dos fatores da transcrição Doenças Mediadora desregulado Ligações Bridging inflamatória intestinal e câncer colorretal. PLoS ONE 8 (12): e83495. doi: 10.1371 /journal.pone.0083495

editor: Paolo Provero, Universidade de Turim, Itália