Abstract
A investigação sobre
hMLH1
e
hMSH2
mutações tendem a se concentrar sobre a síndrome de Lynch (LS) e cancro colorectal LS-like (CRC). Nenhum estudo até à data têm avaliado o papel da
hMLH1
e
hMSH2
genes em massa esporádica CRC (sem pré-selecção pela MSI ou idade de início precoce). Nós teve como objetivo identificar romance
hMLH1
e
hMSH2
variantes de DNA, para determinar as frequências e locais, tanto esporádica e LS CRC e suas relações com características clinicopatológicas de CRC no nordeste da China mutação. 452 pacientes esporádicos e 21 LS CRC foram selecionados para germinativas e somáticas mutações em
hMLH1
e
hMSH2
genes com PCR-SSCP sequenciamento. Foram identificadas 11
hMLH1 Comprar e sete
hMSH2
DNA variantes em nossa coorte estudo. Seis deles eram novos: quatro em
hMLH1
gene (IVS8-16 A T, c.644 GAT GTT, c.1529 CAG CGG e c.1831 ATT TTT) e dois em
hMSH2
gene (-39 C T, AACAACA inserção no c.1127 e AAG eliminação na c.1129). Em esporádica CRC, germinativas e mutação somática frequências de
hMLH1
/
hMSH2
gene eram 15,59% e 17,54%, respectivamente (
p
= 0,52). mutações germinativas presentes em
hMLH1
e
hMSH2
genes eram 5,28% e 10,78%, respectivamente (
p Art 0,01). mutações somáticas no
hMLH1
e
hMSH2
genes eram 6,73% e 11,70%, respectivamente (
p =
0,02). Em LS CRC, gene, tanto da linha germinativa e frequências de mutação somática de
hMLH1
/
hMSH2
foram 28,57%. O site mutação germinativa mais prevalente no
hMSH2
gene foi c.1168 CTT TTT (3,90%), um polimorfismo. frequência de mutação somática de
hMLH1
/
hMSH2
gene foi significativamente diferente nos proximal, cólon distal e câncer retal (
p
= 0,03). Nossas descobertas elucidar o espectro de mutações e frequência de
hMLH1
e
hMSH2
genes em esporádica e LS CRC, e suas relações com características clinicopatológicas de CRC
Citação:. Hu F , Li D, Wang Y, Yao X, Zhang W, J Liang, et ai. (2013) Novel DNA variantes e Mutação Frequências de
hMLH1 Comprar e
hMSH2
Genes do câncer colorretal na China População Nordeste. PLoS ONE 8 (4): e60233. doi: 10.1371 /journal.pone.0060233
editor: Anthony WI. Lo, da Universidade Chinesa de Hong Kong, Hong Kong
Recebido: 04 de janeiro de 2013; Aceito: 23 de fevereiro de 2013; Publicação: 03 de abril de 2013
Direitos de autor: © 2013 Hu et al. Este é um artigo de acesso aberto distribuído sob os termos da Licença Creative Commons Attribution, que permite uso irrestrito, distribuição e reprodução em qualquer meio, desde que o autor original ea fonte sejam creditados
Financiamento:. Este trabalho foi apoiado pelos subsídios da National Science Foundation Natural da China (No. 30671801 e 30371243) e da Fundação para os estudiosos regressado de Harbin (No. 2005AFLXJ017). Os financiadores não tiveram nenhum papel no desenho do estudo, coleta de dados e análise, decisão de publicar ou preparação do manuscrito
CONFLITO DE INTERESSES:.. Os autores declararam que não existem interesses conflitantes
Introdução
o câncer colorretal (CRC) é uma das neoplasias mais comuns em todo o mundo, e ocupa o quinto de todos os cânceres na China. Organização Mundial da Saúde estima que 220.000 novos casos de CRC ocorreu na China em 2008 (GLOBOCAN, 2008). A incidência de CRC aumentou 5,73% em uma base anual, entre 1992 a 2005 (13,06-23,54 /10,0000) em Nangang District, Harbin, China [1].
Um dos caminhos genéticos na desenvolvimento de CRC é a falha do sistema de reparação de emparelhamentos incorrectos do ADN (MMR) [2], o que contribui para a manutenção da estabilidade genómica por reconhecer e remover mutações de inserção /deleção que ocorrem durante a replicação do ADN [3]. Os dois genes principal incompatibilidade de reparação são
hMLH1
e
hMSH2,
que mapa para cromossomas 3p21.3-23 [4] e 2p21-22 [5], respectivamente.
Desde o primeiro relato de
hMLH1
e
hMSH2
mutações genéticas em síndrome de Lynch (LS) CRC [4], [5], os estudos sobre
hMLH1 Comprar e
hMSH2
mutações genéticas foram publicados. No entanto, a maioria dos trabalhos publicados focada em LS ou como LS-CRC. Em, 30 de pequeno tamanho amostra total (n = 5-61, exceto por uma de 315 pacientes) estudos foram publicados que rastreados mutações germinativas em
hMLH1
e
hMSH2
genes em CRC esporádica . mutações patológicas de
hMLH1
e
hMSH2
genes eram mais propensos a estar presente em pacientes mais jovens [6], e naqueles com instabilidade de microssatélites (MSI). Em nossa análise desses 30 estudos, MSI ou início da idade precoce (com idade inferior a 40, 45, 50 ou 55 anos) foi utilizado para pré-selecionar pacientes para
hMLH1
e
hMSH2
gene mutações no CRC esporádicos. No entanto, nenhum estudo teve por objetivo detectar frequências de mutação de
hMLH1
e
hMSH2
genes em massa esporádica CRC sem MSI ou pré-selecção idade. Na China, quatro estudos (n = 26-58) rastreada germinativas ou somáticas mutações do
hMLH1 Comprar e
hMSH2
genes em CRC esporádica com pré-selecção por MSI [7], [8], [ ,,,0],9], [10]. Quer altas frequências de
hMLH1
e
hMSH2
mutações genéticas ocorrem em CRC esporádica na China não foi elucidado. Além disso, fortes evidências sugerem que as mutações raras de efeitos graves são responsáveis por uma parcela substancial de câncer humano complexo [11]. Por isso, realizamos este estudo para identificar romance
hMLH1
e
hMSH2
variantes de DNA, para determinar tanto as frequências e locais, tanto esporádica e LS CRC mutação, e para estimar as relações entre germinal e somática mutações do
hMLH1 /hMSH2
gene e as características clinicopatológicas de CRC do nordeste da China.
Materiais e Métodos
assuntos
Depois de obter o consentimento informado dos sujeitos de estudo e aprovação do Conselho Institucional de Pesquisa da Universidade médica Harbin, foram identificados pacientes com CCR submetidos a cirurgia no Hospital do Câncer e da segunda Hospital Afiliado da Universidade médica Harbin, sem pré-selecção e baseando-se apenas no diagnóstico patológico. Os doentes com carcinoma neuroendócrino, melanoma maligno, linfoma de não-Hodgkin, tumores do estroma gastrintestinal, e carcinoma colorrectal metastático foram excluídos da análise. De 1 de Junho de 2004 e 15 de maio de 2005 e 15 de Maio de 2007 a 01 de janeiro de 2008, 473 pacientes primários CRC (452 esporádica CRC; 21 LS CRC) foram recrutados. 457 amostras de sangue e 356 tecidos tumorais foram coletadas para análise genética molecular.
Extração de DNA
O DNA foi extraído com sucesso de todas as amostras de sangue de 457 (436 esporádica CRC e 21 LS CRC) e 356 tecidos tumorais (342 esporádica e 14 LS), utilizando o procedimento clássico de fenol-clorofórmio [12].
na coleta de amostras de sangue e tecidos e extração de DNA, não foi possível obter o DNA tecido tumoral de 117 pacientes com CCR (110 esporádica e 7 LS), devido a que os tecidos tumorais foram apenas grande o suficiente para o diagnóstico de patologia ou que nós não extrair DNA com sucesso. Portanto, só têm o seu DNA no sangue. Nos restantes 16 pacientes de CRC esporádicos, obtiveram-se amostras duplas de sangue e tecidos. No entanto, na extracção de DNA, que não extrair ADN com sucesso a partir de amostra de sangue. Finalmente, 340 pacientes com CCR (326 esporádica e 14 LS) estão emparelhados DNA sangue e tecidos.
Triagem de linhagem germinativa e Somatic Mutações do
hMLH1 Comprar e
hMSH2
Genes
PCR-SSCP análise de sequenciação.
os primers para 20 pares de todos os 19 exons no
hMLH1
gene e 17 pares de todos os 16 exons no
hMSH2
gene (Tabela 1), incluindo as fronteiras intrão-exão, foram sintetizados por PCR genómico. As amplificações de PCR foram realizadas utilizando o seguinte protocolo de 35 ciclos de: desnaturação durante 30 s a 95 ° C, emparelhamento durante 30 segundos a 54 ° C a 64 ° C, extensão durante 30 s a 72 ° C, seguido por uma extensão final de 5 min a 72 ° C (ABI 9700). Os produtos de PCR foram identificadas por electroforese em agarose 1% (Biowest agarose, Gene Company Ltd).
produtos de PCR foram desnaturados a 98 ° C durante 8 minutos e colocadas em gelo. A electroforese foi realizada em 8% a 15% não desnaturantes de poliacrilamida geles. Após a electroforese, os géis foram corados com prata (refinado Chemical Plant, Xangai, China). 15% das amostras foram replicados na detecção de mutações de cada fragmento amplificado por PCR na análise de PCR-SSCP, com a taxa de concordância que varia de 99,1% para 100% para vários fragmentos amplificados por PCR.
produtos de PCR que mostra a mobilidade anormal em análise SSCP foram enviados para sequenciar usando ABI3730XL. Os resultados da sequenciação foram analisados de mutações genéticas com Chromas 2,22 software (Technelysium Pty. Ltd., Queensland, Austrália).
Avaliação da Mutação Patogenicidade
Para mutações relatado anteriormente, foram utilizados os resultados da verificação de função para determinar a patogenicidade. Se nenhuma verificação função foi relatado, a previsão função por qualquer dois dos resultados PolyPhen /SIFT /MAPP-MMR foi utilizado para determinar a sua patogenicidade.
Para as novas variantes de DNA, a patogenicidade de substituição de base em exons foram previstos pelo programa PolyPhen [13] e MAPP-MMR [14]. Base de Dados de inserção, deleção e substituição na promotoras, intrões ou 3’UTR foram avaliadas por critérios para determinar o potencial patogenicidade [15]. Nós também detectou as variantes de DNA novos em 100 controles saudáveis para determinar o potencial de patogenicidade.
Análise Estatística
Categoria e as variáveis contínuas foram testadas pelo teste do qui-quadrado e
t
testar, respectivamente. Todas as análises estatísticas foram realizadas pela SAS 9.1 (SAS Institute, Cary, NC, EUA).
Resultados
Mutações
As mutações no
hMLH1
gene .
Foram identificados 11 variantes de DNA no gene
hMLH1
. IVS8-16 A T, c.1831 ATT TTT e GAA eliminação c.1845_1847 foram DNA variantes somáticas, outras oito variantes de DNA foram ambos germinal e variantes somáticas. Quatro (IVS8-16 a T, c.704 GAT TTG, CAG c.1529 CGG, c.1831 ATT TTT) um novo ADN foram variantes identificadas em pacientes de CRC esporádicos (Figura 1 e Tabela 2). Todas as quatro novas variantes de ADN não foram detectados em 100 controlos saudáveis. c.1529 CAG CGG foi previsto não ter pathogeneity, o pathogeneity de outras três variantes de DNA novos eram incertos. Sete mutações (-28 A G, c.927 CCC CCT, IVS13 + 14 G A, IVS14-19 A G, c.1742 CCG . CTG, GAA eliminação c.1845_1847 e C * 35_ * 37 eliminação CTT) foram anteriormente relatados no banco de dados do Insight [10], [16], [17], [18], [19], [20], [21]. c.1742 CCG CTG e exclusão c.1845_1847 GAA foram relatados para ser mutações patológicas [21], [22]
Nós também identificados dois polimorfismos.. c.655 ATC GTC foi relatado como sendo um polimorfismo comum nos caucasianos [23], [24], [25], enquanto c.1151 GTT GAT foi relatada como sendo mais comum na população Asiática [26]. Portanto, nós não classificá-los como mutações em nosso estudo.
As mutações no
hMSH2
gene.
Foram identificados sete
hMSH2
variantes de DNA. Inserção em AACAACA c.1127 AAG e eliminação em c.1129 foi DNA variantes somáticas, outras seis variantes de DNA foram ambas de linha germinal e variantes somáticas. Duas variantes de DNA (-39 C T, AACAACA inserção no c.1127 AAG e eliminação em c.1129) foram recentemente detectado neste estudo (Figura 2 e Tabela 2). Na triagem as duas variantes de DNA novos em 100 controles saudáveis, há variantes foram detectadas. A patogenicidade das duas variantes de DNA era incerto. Cinco outras mutações (c.23 ACG ATG, c.471 GGC GGA, c.505 ATA GTA, c.1168 CTT TTT e c.1886 CAA CGA) foram relatados anteriormente na base de dados do Insight [14], [27].
Dois pacientes do sexo masculino realizado mutações somáticas em ambos
hMLH1 Comprar e
hMSH2
genes. Outro paciente do sexo masculino levou o c.1831 ATT mutação TTT do gene
hMLH1
eo c.23 ACG . Mutação ATG do
hMSH2
gene em ambos os tecidos tumorais e sangue
Mutation frequências
frequências de mutação em pacientes com CCR esporádicos.
Entre 436 pacientes CRC esporádicos com DNA de sangue disponíveis, freqüências de mutação germinativa de
hMLH1
e
hMSH2
genes foram 5,28% (23/436) e 10,78% (47/436), respectivamente, (
P
0,01) (Tabela 3). Excluindo as mutações sinônimas (c.927 CCC CCT em
hMLH1 Comprar e c.471 GGC GGA em
hMSH2
), as frequências de mutação em
hMLH1 Comprar e
hMSH2
genes foram 4,59% (20/436) e 8,72% (38/436), respectivamente (
p =
0,01). Se o paciente que realizou duas mutações germinativas só foi contado uma vez (um paciente abrigava tanto -39 C T e c.23 ACG mutações ATG em
hMSH2
eo IVS13 + 14 G A mutação do
hMLH1
; o outro paciente carregavam tanto c.1831 ATT mutação TTT no
hMLH1 Comprar e c.23 ACG ATG no
hMSH2
); em seguida, 15,59% (68/436) dos pacientes apresentaram mutações germinativas em
hMLH1
/
hMSH2
gene. frequências de mutação patológica de
hMLH1
e
hMSH2
genes foram 0,23% (1/436) e 0%, respectivamente.
Entre 342 pacientes CRC esporádicos com disponíveis DNA em tecidos tumorais, as frequências de mutação somática em
hMLH1
e
hMSH2
genes foram 6,73% (23/342) e 11,70% (40/342), respectivamente (
p =
0,02) (Tabela 3). Excluindo mutações sinônimas (c.927 CCC CCT em
hMLH1 Comprar e c.471 GGC GGA em
hMSH2
), frequências de mutação de
hMLH1
e
hMSH2
genes foram 5,85% (20/342) e 9,94% (34/342), respectivamente (
p =
0,03). Se as mutações foram contadas por pacientes em vez de o número real de mutações (três pacientes realizado mutações somáticas de ambos
hMLH1 Comprar e
hMSH2
genes), em seguida, 17,54% (60/342) dos pacientes apresentaram somática mutações do
hMLH1
/
hMSH2
gene. frequências de mutação patológica de
hMLH1
e
hMSH2
genes foram 0,58% (2/342) e 0%, respectivamente.
frequência de mutação germinativa não foi significativamente diferente da de frequência de mutação somática em
hMLH1
e
hMSH2
genes, respectivamente (
p =
0,49 e
p =
0,69, respectivamente).
frequências de mutação em pacientes LS CRC.
Entre 21 amostras de DNA do sangue de pacientes LS CRC, um (4,76%) paciente carregava uma mutação germinativa de
hMLH1 Comprar e cinco (23,81%) pacientes realizada mutações germinativas em
hMSH2
. No geral, seis (28,57%) pacientes apresentaram mutações germinativas do
hMLH1
/
hMSH2
gene.
Os tecidos tumorais só estavam disponíveis em 14 LS pacientes com CCR, um (7,14 %) paciente carregava uma mutação somática no
hMLH1 Comprar e três (21,43%) pacientes carregava uma mutação somática no
hMSH2
. No total, quatro (28,57%) pacientes apresentaram mutações somáticas no
hMLH1
/
hMSH2
gene.
Não há mutações patológicas foram detectados em pacientes LS CRC.
A distribuição de mutações nos diferentes Éxons
A maior prevalência mutação germinativa de
hMSH2
no CRC esporádica foi detectado no exão 7 (3,90%), seguido pelo exão 12 (2,52%), exão 1 (1,38%), e o exão 3 (0,46%). As mutações nestas quatro exões foram responsáveis por 76,6% do total de mutações em
hMSH2
. Quanto ao
hMLH1
, frequências de mutação eram geralmente mais baixos do que em
hMSH2
; as maiores prevalências de mutação estavam no exão 16, exão 9, exão 13 e exon 19 (0,23%) (Tabela 3).
As relações entre linhagem germinativa e Somatic Mutações do
hMLH1 /hMSH2
gene e clínicopatológicos Características do CRC
frequência de mutação somática de
hMLH1
/
hMSH2
gene foi de 22,7% (15/66) no câncer de cólon proximal, 17,7% (11 /62) no câncer de cólon distal e 10,5% (22/209) no cancro rectal (
p
= 0,03). Considerando que, frequência mutação germinativa de
hMLH1
/
hMSH2
gene não foi significativamente diferente no câncer de cólon proximal (17,3%, 14/81), câncer de cólon distal (17,8%, 13/73) e câncer retal (10,1%, 28/276) (
p
= 0,09). (Tabelas 4 e 5).
germinativa e frequência de mutação somática de
hMLH1
/
hMSH2
gene não foi significativamente diferente em outras características clínico-patológicas ( idade, sexo, IMC, estágio Dukes, histotipos, tipos patológicos, grau diferenciado e tamanho do tumor) do CRC.
por causa de menos LS pacientes CRC, nós não analisar as relações entre germinal e somática
hMLH1 /hMSH2
mutações genéticas e as características clinicopatológicas de LS CRC.
Discussão
de acordo com o modelo supostamente da variante doença rara comum [28], [29], nós analisamos as variantes raras de
hMLH1
e
hMSH2
genes em esporádica e LS CRC. Foram identificados 18 tipos de DNA variantes em nosso estudo. Seis foram novas variantes de ADN e 12 tenham sido previamente relatado. Dos seis variantes de DNA novos, quatro estavam em
hMLH1
e dois em
hMSH2
.
Dois dos quatro romance
hMLH1
variantes de DNA, p .Asp235 Val (c.644 GAT GTT) e p.Gln510Arg (c.1529 CAG CGG), ambos levam a amino ácido muda de polaridade, o que pode afetar a estrutura do domínio
hMSH2
ligação e
hPMS2 /hPMS1
domínio do
hMLH1
de ligação, respectivamente, e fazer com que a disfunção do sistema de DNA MMR. Outra variação DNA, p.Ile611Phe (c.1831 ATT TTT), levar a nenhuma mudança de polaridade de aminoácidos no
hPMS2 /hPMS1
domínio de ligação ao
hMLH1
produto do gene, pode ter nenhum efeito sobre a função do sistema de MMR de ADN [30]. IVS8-16 a T é previsto para ter qualquer efeito sobre o splicing no exão 9.
um dos dois
hMSH2
variantes de ADN, -39 C T, era uma variância em 5 ‘UTR, que pode afetar mRNA transcrição. A outra variação, c.1127 ins AACAACA e c.1129 del AAG, era uma mutação frameshift, o que pode afetar o
hMSH6
domínio de ligação e
hMutL
homólogo interação do
hMSH2
produto do gene e causar a disfunção do sistema de DNA MMR [30]
.
Embora a falha do sistema de MMR de ADN é uma das vias genéticos no desenvolvimento de CRC [2]. De acordo com os critérios de avaliação mutação pathogeneity, uma nova variante de DNA, c.1529 CAG CGG, foi previsto não ter pathogeneity, o pathogeneity de outras cinco variantes de DNA novos eram incertos. Portanto, não podemos elucidar o papel dessas variantes romance de ADN de
hMLH1
e
hMSH2
genes na ocorrência e desenvolvimento de CRC
c.1742 CCG . CTG de
hMLH1 Comprar e c.1886 CAA CGA de
hMSH2
eram mutações fundadores na população asiática [31]. Três outras mutações de
hMSH2
, c.23 ACG ATG, c.505 ATA GTA e c.1168 CTT TTT, foram de maior prevalência em asiáticos (2,44%, 1,74% e 6,97%, respectivamente) em comparação com os brancos (0,05%, 0,05% e 0,53%, respectivamente) [31]. Ela pode explicar a diferença racial dos pacientes com CCR. Além disso, ele pode ser mais eficiente na detecção de mutações em populações asiáticas
Uma vez que detectou uma maior prevalência de c.1168 CTT . TTT da
hMSH2
em ambos os LS (14,29%, 3/21) e esporádicos (3,90%, 17/436) CRC, nós selecionados para a mutação em controles saudáveis. A frequência de mutação em controles saudáveis foi de 4,16% (21/505), que não foi significativamente diferente comparando com CRC (
p
= 0,84). Esta mutação particular também foi relatado como um polimorfismo na Coréia por Kim et al, que não detectou diferença significativa entre casos e controles [26].
associação significativa foi observada apenas entre somática
hMLH1 /hMSH2
mutações genéticas e localização do tumor de CRC esporádica (
p =
0,03). A frequência de mutação somática de
hMLH1 /hMSH2
gene foi maior no câncer de reto, o seguinte foi no câncer de cólon proximal, ea menor foi no câncer de cólon distal. O não-pathogeneity ou pathogeneity incerto podem explicar a associação não-significativa entre
hMLH1 /hMSH2
mutações genéticas e outras características clinicopatológicas de CRC esporádica.
Em nossa meta-análise anterior, com base na linha germinativa mutações do
hMLH1
e
hMSH2
genes (artigo aceito, 10.1371 /journal.pone.0051240), a frequência de mutação patológica agrupada de
hMLH1
foi 8,72% (95% Cl: 6,12% -12,29%) em CRC esporádica. Ele foi de 10,28% (IC 95%: 4,28-22,70%) em estudos americanos, 7,47% (IC 95%: 4,06-13,34%) em estudos europeus, e 3,21% (IC 95%: 0,88-11,03%) em estudos asiáticos (
p =
0,65). Em nossa coorte, foi apenas 0,23%. A frequência de mutação patológica agrupada de
hMSH2
foi de 7,28% (IC 95%: 5,12% -10,26%) no CRC esporádica. Foi 5,89% (IC 95%: 2,08-15,61%) em estudos americanos, 7,58% (IC 95%: 4,05-13,76%) em estudos europeus, e 3,64% (95% CI: 1,96-6,65%) em estudos asiáticos (
p
= 0,85). No entanto, nenhuma mutação patológica da
hMSH2
foi detectado em nosso estudo.
Oito [7], [9], [32], [33], [34], [35], [36], [37] e nove estudos [7], [9], [32], [33], [34], [35], [36], [37], [38] na Ásia detectado mutações somáticas de
hMLH1 Comprar e
hMSH2
genes em CRC esporádica. A prevalência agrupada de mutações patológicas foi 11,86% (IC 95%: 7,62-18,01%) e 7,90% (IC 95%: 4,72-12,94%), respectivamente sobre meta-análise, que é maior do que em nosso estudo (0,58% e 0%).
Todos os estudos publicados detectado germinativas ou somáticas mutações no CRC esporádicos com pré-selecção (MSI, idade de início precoce, ou mutação RII-p TGF) [36], o que poderia explicar a frequência de mutação maior nos estudos individuais publicados e meta-análises de estudos publicados anteriormente. Além disso, o pequeno tamanho da amostra nos estudos publicados também podem contribuir para os resultados inconsistentes.
Apenas um estudo na Ásia detectado mutações somáticas de
hMLH1
e
hMSH2
genes em 31 pacientes CRC esporádicos sem pré-selecção [37]. O maior estudo detectar mutações germinativas foi de 315 pacientes Europeia BG-CRC com idade inferior a 55 anos; a frequência de mutação do
hMSH2
foi encontrado para ser de 0,32% (1/325, patogenicidade incerta), ao passo que nenhuma mutação no
hMLH1
foi detectado [39].
nossa meta-análise anterior, as frequências de mutação germinativa em pool de
hMLH1
e
hMSH2
genes foram 28,55% (IC 95%: 26,04% -31,19%) CI e 19,41% (95%: 15,88% -23,51%) em Amsterdam-critérios LS positivos CRC. Em Amsterdam-critérios negativo LS CRC, estas frequências de mutação do pool estavam 16,70% (IC 95%: 14,53-19,13%) e 11,13% (IC 95%: 9,49-13,42%) para
hMLH1
e
hMSH2
genes, respectivamente. Em nosso estudo, nenhuma mutação germinativa no
hMLH1
exons foi encontrado, semelhante a um estudo no Japão [40]. A frequência de mutação germinativa de
hMSH2
foi 9,52% (2/21) (excluindo o c.1168 polimórfica mutação CTT TTT), que foi relativamente menor do que na meta-análise (11,13%, 95% CI:. 9,49-13,42%)
Cinco estudos asiáticos detectada a mutação somática de
hMLH1
ou
hMSH2
no LS CRC [7], [41], [42 ], [43], [44]. As frequências de mutação somática agrupados em
hMLH1
e
hMSH2
genes foram 9,57% (IC 95%: 1,36-44,73%) e 25,65% (IC 95%: 10,30-50,89%), respectivamente sobre meta-análise. Em nosso estudo, a frequência de mutação somática de
hMSH2
no LS CRC foi 14,29% (2/14) (excluindo a mutação polimórfica, c.1168 CTT TTT). No entanto, não há mutações somáticas no
hMLH1
exões foram encontrados em LS CRC, semelhante aos dois estudos japoneses [41], [43]. A frequência de mutação somática de
hMSH2
no LS CRC variou de 5,88% a 58,33% nos cinco estudos publicados asiáticos. Um pequeno tamanho da amostra pode explicar as variações de frequência de mutação no LS CRC.
Em conclusão, foram identificados seis variantes de DNA novos (quatro em
hMLH1
e dois em
hMSH2
). Em esporádica CRC, germinativas e mutação somática frequências de
hMLH1 /hMSH2
gene eram 15,59% e 17,54%, respectivamente. A prevalência de mutações germinativas foi 5,28% em
hMLH1 Comprar e 10,78% no
hMSH2
. As frequências de mutação somática em
hMLH1
e
hMSH2
genes eram 6,43% e 11,70%, respectivamente. Em LS CRC, gene, tanto da linha germinativa e frequências de mutação somática de
hMLH1
/
hMSH2
foram 28,57%. O site mutação germinativa mais prevalente no
hMSH2
gene foi c.1168 CTT TTT (3,90%), um polimorfismo. frequência de mutação somática de
hMLH1
/
hMSH2
gene foi significativamente diferente no câncer de cólon proximal, câncer de cólon distal e câncer retal.
Nossas descobertas podem ajudar a elucidar a variante de DNA espectro ea frequência do
hMLH1
e
hMSH2
genes em pacientes com CCR, especialmente os pacientes com CCR esporádicos na China, e suas relações com características clinicopatológicas de CRC esporádica. Estudos funcionais para determinar como estas variantes de DNA novos afetar a função da proteína são necessárias.
Reconhecimentos
Obrigado pela edição nativa da Edição Internacional de Ciência.