Abstract

Fundo

metilação aberrante do genoma global tem sido investigado como um indicador prognóstico em vários tipos de câncer, mas os resultados são controversos e ambígua.

Métodos e achados

esta meta-análise apresenta estimativas em pool das provas para elucidar esta questão. Foram pesquisados ​​os bancos de dados eletrônicos: PubMed, Embase, ISI Web of Science e da Biblioteca Cochrane (até agosto de 2013) para identificar todos os estudos relevantes. A associação entre o nível de índices de hipometilação do genoma ‘surrogates (, Alu e Sat-α LINE-1) e a sobrevida global (OS) de pacientes com câncer foi examinada. Além disso, as taxas de risco em pool (horas) com seu intervalo de confiança de 95% (IC 95%) foram calculados para estimar as influências através de efeitos fixos e modelo de efeitos aleatórios. Finalmente, vinte estudos com população total de 5447 preencheram os critérios de inclusão. Os resultados indicam que os RHs resumo para os estudos que empregam LINE-1, Alu, e Sat-alfa elementos repetitivos também mostram que a hipometilação do DNA global têm efeitos desejáveis ​​significativos sobre o valor prognóstico do tumor. Os RHs em pool (e ICs) de LINE-1, Alu e Sat-α foram 1,83 (1,38-2,44), 2,00 (1,16-3,45) e 2,92 (1,04-8,25), com um índice de medida de heterogeneidade dos I

2 (e

p

-valor) mostra de 66,6% (

p

= 0,001), 57,1% (

p

= 0,053) e 68,2% (

p

= 0,076), respectivamente. A análise de meta-regressão e subgrupo indicaram que a percentagem de amostra hypomethylated de pacientes com câncer é uma das fontes de heterogeneidade.

Conclusão

Nossas descobertas meta-análise suportam a hipótese de que a hipometilação do DNA global é associada a um prognóstico prejudicial em pacientes com tumor

Citation:. Li J, Huang Q, Zeng F, Li W, Z Ele, Chen W, et al. (2014) o valor prognóstico da Global DNA hipometilação em Câncer: uma meta-análise. PLoS ONE 9 (9): e106290. doi: 10.1371 /journal.pone.0106290

editor: Surinder K. Batra, University of Nebraska Medical Center, Estados Unidos da América

Recebido: 12 Março, 2014; Aceito: 29 de julho de 2014; Publicação: 03 de setembro de 2014

Direitos de autor: © 2014 Li et al. Este é um artigo de acesso aberto distribuído sob os termos da Licença Creative Commons Attribution, que permite uso irrestrito, distribuição e reprodução em qualquer meio, desde que o autor original ea fonte sejam creditados

Data Availability:. O autores confirmam que todos os dados subjacentes às conclusões estão totalmente disponíveis sem restrições. Todos os dados são incluídos dentro do papel

Financiamento:. Este trabalho foi financiado pela National Science Foundation Natural da China (81101562, 81273099), fundos de pesquisa fundamental para a Universidades Central (12ykpy13), Fundação de Ciência Natural de Província de Guangdong (S2012010009633), Ciência e Tecnologia Projeto de Planejamento da província de Guangdong (2012B060300005), Projeto chave de Guangzhou Medical and Health Science and Technology (20121A021018), o projeto para a chave da medicina Disciplina Construção de Guangzhou Município (2013-2015-07). Os financiadores não tiveram nenhum papel no desenho do estudo, coleta de dados e análise, decisão de publicar ou preparação do manuscrito

CONFLITO DE INTERESSES:.. Os autores declararam que não existem interesses conflitantes

Introdução

O cancro é uma das principais causas de morte no mundo, sendo responsável por 7,6 milhões de mortes (cerca de 13% de todas as mortes) em 2008, e este número deverá continuar a aumentar para cerca de 13,1 milhões de mortes em 2030 [1] . A identificação fiável de biomarcadores moleculares prognósticos é importante para a facilitação da escolha racional de potenciais métodos terapêuticos no tratamento do câncer e para melhorar o prognóstico de pacientes com câncer [2] – [4].

A metilação do DNA é uma epigenética modificação envolvendo uma adição covalente de um grupo metilo (CH

3) a partir do dador de metilo S-adenosilmetionina (SAM) ao carbono da posição 5 do anel de pirimidina de uma base de citosina e formação de 5-metilcitosina (5meC), tipicamente ocorrendo em contextos dinucleótido CpG em células de mamíferos. Embora CpG estão mais concentradas nas regiões enriquecidas referidos como ilhas CpG (CGI), que tendem a ser diferencialmente localizadas nas regiões promotoras de genes, 70-90% de todas as CpGs do genoma humano estão em regiões de grandes sequências repetitivas (isto é, centrómeros e elementos retrotransposão) e são normalmente metilado sob condições normais [5]. Em seguida, o nível de metilação dos elementos repetitivos, incluindo a longo intercaladas (LINHA-1), elemento Alu (UTA), e por Satélite-α (Sat-α) elemento-1, que constituem 11%, 17% e 4% do genoma respectivamente, e cobrem mais de 30% do total dos locais de CpG no genoma, pode servir como índices substitutos como nível de metilação do DNA do genoma [6].

Com os recentes desenvolvimentos no alto rendimento e de alta -Resolução métodos de análise de metilação do DNA tais como pyrosequencing e ensaios de metilação luminométricos (Lumas), o nível de metilação do DNA mundial foi totalmente analisada em vários tumores. Mais e mais pesquisadores descobriram que hipometilação do DNA é inversamente associado com o progresso do tumor através da promoção da carcinogênese, aumentando a recombinação de DNA ou por efeitos diretos e indiretos sobre a expressão do gene, tais como a sobre-expressão de alguns genes impressos, ativação de genes associados com a invasão tumoral ou metástase e assim em [7]

Apesar de numerosos estudos têm tentado avaliar o valor prognóstico da hipometilação do DNA em diversos tipos de câncer, a identificação dos resultados permanecem controversos e ambígua da seguinte forma:. vários estudos descobriram que hipometilação do DNA mundial foi um prognóstico fator para o resultado sombrio, outros estudos, no entanto, tirou conclusões benéficas [8] – [10] ou não encontrou associação significativa [8], [9], [11] – [14]. Para esclarecer esta questão, realizamos este meta-análise para avaliar o valor prognóstico da hipometilação genômica global em vários tumores.

Materiais e Métodos

critérios

estratégia de procura e selecção

Seguimos a orientação de Moose (meta-análise de estudos observacionais em Epidemiologia) [15] e (Itens de relatório preferido para revisões sistemáticas e meta-análise) PRISMA [16] para conduzir de forma sistemática e informar que esta meta-análise. Dois revisores (Jinhui Li e Qingyuan Huang) realizadas de forma independente uma busca sistemática da literatura dos seguintes bancos de dados eletrônicos para identificar os estudos que avaliaram a utilidade de prognóstico de DNA global (incluindo os seus marcadores substitutos: Alu, LINE-1 e Sat-α) hipometilação em pacientes com qualquer tipo de carcinomas, sem limitação língua:. PubMed, Embase, ISI web of Science e na biblioteca Cochrane (última pesquisa foi em Agosto de 2013)

com base no Medical Subject Headings (MeSH) e termos de pesquisa correspondentes, nossa estratégia de pesquisa foi o seguinte: (a totalidade do genoma “DNA” OR “lINE-1” ou “Sat-α” OR “Alu” E “hipometilação *”) e ( “Prognosis” [malha] OU “Survival Rate” [malha ] OU “Mortalidade” [malha]) AND ( “tumor” OR “câncer”). Durante o mesmo período, nós também procurou manualmente para resumos de bibliografias selecionados cuidadosamente para identificar estudos adicionais. Apenas os papéis restritos a estudos em humanos e publicados como artigos de texto completo em Inglês ou chinês foram incluídos como candidatos principais. Além disso, os estudos identificados não foram limitadas pelo ano de publicação

O conjunto inicial de critérios de elegibilidade aplicados foi a seguinte:. (1) Os artigos representada estudos epidemiológicos iniciais que avaliaram o nível de hipometilação do DNA global e seu padrão de corte correspondente, incluindo os seus marcadores substitutos (lINE-1, Alu, e Sat-α); (2) Os resultados da sobrevivência global (OS) utilizado nos estudos poderia ser aceite; (3) Os estudos relataram uma taxa de risco (HR) eo intervalo de confiança de 95% correspondente (IC 95%) diretamente ou fornecido a curva de dados ou sobrevivência relevantes, que podemos usar para estimar a FC e IC 95%; (4) O tamanho da amostra de estudo foi maior do que trinta indivíduos.

Extração de dados e gestão

Nós projetamos um formulário padrão com o banco de dados Access do Microsoft Office Suite que facilitou a extração e entrada de os dados em um gráfico em branco correspondente. O banco de dados foi utilizado para gravar os dados mais relevantes, que abrangeu (1) as informações gerais dos estudos (ano de publicação, com idade média e follow-up, o número de pacientes, materiais e métodos, tratamentos administrados, os tipos de câncer, e avaliação detectado score) e (2) as horas e correspondente IC de 95% para o sistema operacional de pacientes com um nível de hipometilação global, em comparação com os pacientes sem nível hipometilação global. Durante todo o processo, uma revisão autor (Jinhui Li) extraído os dados dos estudos incluídos e outro autor (Qingyuan Huang) verificou os dados extraídos. Todas as disparidades menores foram resolvidas por discussões entre os autores.

Estudos fornecendo análise uni ou multivariada (ou ambos) resultados para a sobrevivência foram usadas para agregar os dados de sobrevivência. Quando os dados relacionados não estavam disponíveis diretamente dos estudos, foi calculado o FC correspondente e IC 95% usando os métodos indiretos descritos por Tierney

et al

[17]. Este método permite a utilização dos parâmetros indicados nas publicações, tais como a estatística de variância e OE, o número de pacientes que exibiram prognóstico benéfico ou prejudicial e a estatística de log-rank ou o seu

p -valor

para estimar AR e sua variância utilizando as fórmulas estabelecidas. Se os manuscritos oferecidos apenas a curva de sobrevivência, foi utilizado o software Engauge 4.1 para obter os dados de sobrevivência individuais em determinados momentos específicos, em seguida, as tabelas do Excel fornecidos por Tierney

et al

foram usadas para obter os RHs de resumo e CEI.

o Índice de qualidade de Avaliação

para avaliar a qualidade metodológica dos estudos, dois autores (Jinhui Li e Qingyuan Huang) marcou-los de acordo com as diretrizes comentário. As diretrizes OBSERVA incluem as seguintes quatro peças com múltiplas sub-itens: introdução, materiais e métodos, resultados e discussão. Cada uma destas partes contém alguns itens, tais como marcadores analisados, os materiais biológicos utilizados e variáveis ​​de prognóstico padrão entre outros. Os dois investigadores marcou a qualidade de cada publicação independente, e, em seguida, atingiu um valor de consenso para cada item, usando uma lista de verificação em que um ponto foi atribuída a cada relatou um. A maior pontuação representou uma melhor qualidade metodológica.

A análise estatística

Para combinar quantitativamente os dados de sobrevivência, foram extraídas as horas e os ICs de 95% para avaliar o impacto do estado hipometilação global sobre tumor prognóstico. I

2 foi adotada para avaliar a heterogeneidade entre os estudos [18]. I

2 valores de 25%, 50% e 75% correspondem aos pontos de corte para baixo, moderado e alto grau de heterogeneidade [19]. Se a suposição de homogeneidade foi apoiado (I

2 25%), foi adotado o modelo de efeitos aleatórios para calcular o HR de acordo com o método DerSimonian-Laird [20]. Caso contrário, foi utilizado directamente [21] o modelo de efeitos fixos (método de Mantel-Haenszel). Além disso, nós também explorou a heterogeneidade por meio de análise de meta-regressão única variável e análises de subgrupos, utilizando os factores mencionados acima. parcelas funil com regressão de Egger foram adotadas para examinar o efeito do viés de publicação. Para determinar se as conclusões poderiam ser afetados pela remoção de um ou dois estudos, realizamos análises de sensibilidade. Todas as diferenças com a

p

valor que foi inferior a 0,05 foram considerados significativos. Todos os itens acima mencionados foram realizados usando o STATA 12,0 plataforma de software (Stata Corporation, College Station, TX, EUA).

Resultados

Resultados da pesquisa e características

Um total foram identificadas de 146 citações relevantes para a avaliação inicial usando as estratégias de pesquisa descritas anteriormente. Com base na revisão dos títulos e resumos, 107 dos estudos originais foram removidos porque não preenchia os critérios iniciais de elegibilidade. O texto completo dos 39 estudos originais restantes foi então revisto, e 14 desses artigos foram eliminados com base em dados inadequados, e um artigo foi excluída porque era uma publicação de sobreposição. Seis estudos não incluem dados de sobrevivência suficientes, cinco estudos não continha informações detalhadas sobre a metilação global, quatro estudos foram apenas resumos de seminários com nenhum método para obter os textos completos, e os restantes cinco estudos eram estudos básicos de pesquisa científica. Assim, após a aplicação dos critérios de inclusão e de exclusão indicados acima, 20 estudos foram incluídos na análise (Figura 1) [8] – [14], [22] – [33].

as principais características extraídos dos 20 estudos que foram incluídos na meta-análise são resumidos na tabela 1. Dentre esses estudos, 15 ensaios estavam em lINE-1, e três estudos focados em lINE-1 e Alu. Um estudo foi de cerca de Alu e Sat-α, e outro estudo examinou os três índices. A população total do estudo foi de 5447, com uma média de 183 indivíduos por estudo (variação de 42 a 2068). A idade média dos sujeitos foi de 58,6 anos, com uma gama de 42 a 72 anos de idade. Os ensaios foram conduzidos em seis países (Coreia do Sul, EUA, China, Tailândia, Japão e Itália), eo ano de publicação variou entre 2008 e 2013. O nível de metilação do DNA mundial foi detectado através de quatro métodos principais (pyrosequencing metilação, BSP, MSP e COBRA) com dois tipos de nível de hipometilação de divisão. A análise dos materiais biológicos revelaram que 15 estudos utilizaram amostras de tecido, duas amostras de sangue usado, uma cultura de células realizada de amostras de tecidos, e outro utilizadas amostras de medula óssea. A média da pontuação de avaliação foi de 16,5, com uma gama de 14 a 20. Os tumores continham vários tipos, tais como tumores do sistema digestivo, tumores do sistema respiratório e outros tumores. Além disso, fomos capazes de obter directamente as horas e os ICs de 16 dos estudos, enquanto que tivemos de extrapolar as horas e ICs dos outros quatro ensaios a partir da expressão gráfica das distribuições de sobrevivência.

meta-análise

Uma meta-análise foi utilizado para analisar os estudos que adotaram os índices substitutos (lINE-1, Alu e Sat-α) para a determinação do grau de metilação do genoma. Usando o modelo de efeitos aleatórios devido à heterogeneidade significativa dos estudos, foram observados os resultados de sobrevivência sombrio para pacientes com tumor com hipometilação do DNA global. Os RHs sumárias obtidos nos estudos que empregam LINE-1, Alu e Sat-alfa elementos repetitivos também indicou que hipometilação do DNA global tem efeitos negativos significativos sobre o prognóstico do tumor. As horas e os ICs do pool estavam 1,83 (1,38-2,44), 2,00 (1,16-3,45) e 2,92 (1,04-8,25) com I

2 valores de 66,6%, 57,1% e 68,2%, respectivamente. A Figura 2 mostra os resultados da parcela florestal explicado acima.

Os quadrados representam o tamanho do estudo e estão centradas na AR, e os bigodes representam os IC95%. Foi utilizado um modelo de efeitos aleatórios (RE).

Devido à relativamente elevada heterogeneidade exibiu nos ensaios agregados em relação à sobrevida global, meta-regressão e análises de subgrupo foram conduzidas para explorar a heterogeneidade da as co-variáveis, incluindo o local de estudo, número de pacientes, com idade média de follow-up, materiais biológicos, a taxa de hipometilação e de corte, método de detecção de metilação, tipos de câncer, informações de tratamento e índice de qualidade. Devido ao número limitado de estudos que utilizaram Alu (n = 5) e Sat-α (n = 2) para a análise de hipometilação global e a relação OS, nós só realizado meta-regressão para as publicações sobre LINE-1 como o substituto de metilação do genoma global. Em última análise, o nível de metilação foi encontrado para ser um fonte de heterogeneidade (

P

= 0,067), ao passo que as outras variáveis ​​não foram (Tabela 2). A análise de subgrupos do estado geral de sobrevivência e hipometilação do DNA mundial detectada uma pequena correlação significativa nos pacientes com uma taxa de metilação do DNA global de menos de 50% (HR, 2,52; IC 95%, 1,72-3,71; I

2, 54,2 %). No entanto, após estratificação por idade média, ano de publicação, a média de acompanhamento, amostras biológicas utilizadas, hipometilação cut-off, e método de ensaio, não houve resultados significativos foram encontrados.

O viés de publicação e análise de sensibilidade

Nós escolhemos o teste de Egger para avaliar o viés de publicação. As parcelas funil revelou que todos os estudos incluídos não revelaram qualquer evidência de assimetria óbvia (

p

= 0,142; Figura 3). Além disso, a análise de sensibilidade revelou que a omissão de qualquer estudo individual não afetaria os resultados globais.

As parcelas graph funil o log da taxa de risco (HR) contra o erro padrão do log do HR ( um indicador da dimensão da amostra). Os círculos abertos indicam os estudos individuais. A linha no centro representa o HR pool. O teste de Egger para viés de publicação não tem nenhuma significância (p = 0,322).

Discussão

Para o melhor de nosso conhecimento, esta meta-análise é o primeiro estudo a avaliar sistematicamente a associação entre o nível de metilação do DNA global e prognóstico de tumores. O nosso estudo agregadas o resultado de 5447 amostras de 20 estudos individuais. Em resumo, todos os três índices substitutos, LINE-1, Alu e Sat-α teve efeito indicativo sobre o prognóstico do tumor, e são biomarcadores de prognóstico potencialmente independentes [22], [25].

O mecanismo de início de DNA mundial hipometilação permanece pouco compreendido e vários factores têm sido relatados por estarem implicados em tais processos [28]. Os fatores ambientais [34], [35], tóxicos químicos [36] – [38], dieta e nutrição [39] pode perturbar o mecanismo subjacente de metilação do genoma e pode alterar o nível de metilação do DNA mundial [40]. Enzimas relacionadas com a metilação do DNA, tais como DNMT1, DNMT3a, DNMT3B [41], e TET1-3 [42], [43] podem ser os alvos de compostos exógenos e endógenos ou a perturbação deles pode resultar em hipometilação de DNA.

O mecanismo pelo qual hipometilação do DNA mundial confere um prognóstico tumor pobres continua a ser totalmente explorado. A hipometilação de DNA de todo o genoma tem sido mostrada a ser associado com a instabilidade do genoma. A perda global de metilcitosina tem sido proposto para comprometer a repressão do gene em regiões genómicas que são geralmente silencioso em células normais, e este efeito pode resultar na re-expressão de proto-oncogenes ou genes marcados, bem como a activação de virai e parasítica transposons, todos que possam contribuir para a instabilidade do genoma [29]. Além disso, a hipometilação do ADN foi consistentemente demonstrada para aumentar a imunogenicidade e reconhecimento imunitário das células cancerosas através da sobre-regulação de moléculas diferentes envolvidas no antigénio pró-cedência e apresentação, incluindo antigénios HLA classe I e das moléculas de co-estimulação [44]. Outra explicação é que a hipometilação global pode afectar a desregulação da transcrição, em seguida, proto-oncogenes, retrovirus endógenos, e é também possível que os elementos transponíveis podem ser actived, e estas poderiam afectar a agressividade do tumor [25].

Nesta análise , a heterogeneidade persistiu no subgrupo do índice de lINE-1 com um I

2 de 66,6%. A fonte de heterogeneidade inter-estudo presente no OS encontrado nesta análise foi avaliada através de meta-regressão e análise de subgrupo. Os resultados indicam que a percentagem de amostra hypomethylated de pacientes com câncer pode ser responsável por parte da heterogeneidade inter-estudo (

p

= 0,067). Além disso, a análise de subgrupo indica que a percentagem de amostra hypomethylated de pacientes de câncer tinham uma relação óbvia com o prognóstico dos pacientes no grupo com um nível de hipometilação menos de 50% (HR, 2,52; 95% CI, 1,72-3,71) e não no grupo com uma hipometilação nível superior a 50%. Portanto, foram adotados modelos aleatórios. Esta diferente pode ser atribuído a várias razões, uma das quais é a falta de informação de detalhe medicina aqueles pacientes utilizado. Como metilação é reversível, se os pacientes tinham utilizado drogas que afectam a metilação do DNA, o biomarcador epigenética irá ser afectada pelo tratamento. Além disso, as amostras biológicas utilizadas podem afectar a taxa de metilação. Além disso, a desmetilação pode também ser específico para o cancro, ou seja, algumas sequências genómicas podem apresentar susceptibilidade diferencial de hipometilação de DNA. Além disso, o grau de hipometilação global pode marcadamente dependem do tipo histológico do cancro [29]. No total, a análise combinada de todos os estudos sobre diferentes tipos de cancros utilizados nesta meta-análise demonstra o valor preditivo de hipometilação de DNA global de sobrevivência em doentes com cancro prejudicial. No entanto, apesar de alguns fatores não teve influência significativa, não podemos excluir completamente a possibilidade de que alguns desses co-variáveis ​​podem potencialmente responsáveis ​​por parte da heterogeneidade, como o poder de análise de meta-regressão foi conhecido por ser baixa. Além disso, devido ao número limitado de estudos sobre Alu e Sat-α incluídos, meta-regressão e análises de subgrupo não poderia ser conduzida para estes índices com base na estabilidade dos resultados. Além disso, a análise de subgrupo dos métodos utilizados para avaliar o estado de metilação do DNA revelou que o método pyrosequencing foi significativamente melhor (HR, 0,54; 95% CI, ,15-,93) para o exame do estado de metilação de biosamples em comparação com outros métodos. Como para o valor de cut-off de hipometilação, a mediana foi utilizado na grande maioria dos estudos incluídos, e análise de subgrupos de “dicotomia” também mostrou significância preditivo significativa de mau prognóstico (HR: 2,15; IC de 95%: 1,25-3,71 ). Assim, pyrosequencing com mediana como um critério de corte de hipometilação pode ser a escolha ideal para os clínicos que precisam para prever o prognóstico de pacientes com base em seus status de metilação do genoma. Esta descoberta está de acordo de relatórios anteriores mostraram que aqueles pyrosequencing é uma ferramenta ideal para a discriminação do estado de metilação de pacientes com características clínicas diferentes [45], [46].

Como todos os três índices exibiram o valor preditivo correspondente, e em vários estudos de coorte e caso-controle clínicos, o lINE-1 foi adotado como um biomarcador preditivo para a sobrevivência de pacientes com tumor [45], [47], podemos concluir que lINE-1 sozinho ou acompanhado por outros dois biomarcadores deve ser a valorização dos cirurgiões. Estes índices são comuns na maioria dos tipos de cancro [48], e algumas publicações indicam que a previsão do efeito será melhor através da combinação de detecção de dois ou três indicadores [11], [22], [49], embora estas ainda precisar de mais estudos. Além disso, alguns estudos clínicos sobre a metilação estão sob pesquisas, tais como drogas epigenéticas (por exemplo, DHA, DIC ou outro ensaios clínicos et al), combinado com estes biomarcadores preditivos, vai lançar luz sobre esses pacientes com tumores malignos e médicos clínicos [50], [51].

a análise de sensibilidade realizada neste estudo revelaram que a nossa estimativa combinada do efeito foi robusto e não se alterou significativamente nos vários cenários testados. Além disso, a meta-análise incluiu dados de uma ampla gama de países, o que indica que os resultados são mais representativos. Isso pode ser atribuído ao fato de que nós seguimos essas duas diretrizes rigorosamente e usou um rigoroso critério de estratégia de pesquisa e seleção. Além disso, o passo mais importante da estratégia de busca foi que nós não limitar a língua para Inglês. Isto resultou na pontuação de avaliação, sendo relativamente mais elevada, isto é, as qualidades dos estudos selecionados foram maiores. No entanto, a inclusão de estudos não publicados e resumos de conferências em nossa análise, assumindo que a metodologia de avaliação correspondente e meta-análise pode ser realizada, poderia melhorar os resultados.

Nós reconhecemos que a nossa meta-análise sofria de várias limitações apesar de nossas tentativas de realizar uma análise abrangente. Uma das limitações principais é a heterogeneidade dos três grupos de índice. O LINE-1, Sat-a, e Alu elementos repetitivos exibiu heterogeneidade mediana (I

2 valores de 66,6%, 57,1% e 68,2%, respectivamente). Isto pode ser devido ao fato de que a meta-análise foi a análise do estudo e não uma análise individual. Além disso, o tamanho da amostra de índices de Sat-α, e Alu são um pouco pequenos (5 e 2, respectivamente) a ser particularmente poderosa para explorar as fontes de suas heterogeneidades podem existir mesmo que a qualidade destes papéis é grande. No entanto, nossa análise abrangente revelou que a taxa de hipometilação é uma fonte de heterogeneidade e que forneceu explicações gerais para esta descoberta. Além disso, apenas um dos estudos incluídos no nosso método meta-análises utilizado de Q-MSP, e a sua remoção não afectou os resultados, tal como determinado através de análise de sensibilidade não foi afectada pela remoção do mesmo. Finalmente, embora o teste de Egger sugeriu um

p

valor = 0,142, o enredo funil fornece uma ligeira evidência de assimetria entre os estudos incluídos, o que indica que existe algum preconceito investigação epidemiológica. Alguns dos tamanhos de amostra limitados podem inevitavelmente aumentar o risco de viés ou o risco de erros aleatórios, porque apenas 20 estudos (19 publicações) foram incluídos na meta-análise. No entanto, porque foi realizada uma extensa análise da literatura com os critérios de avaliação rigorosos, os resultados destes estudos foram relativamente mais elevado. A pontuação média foi de 16,5 (intervalo de 14 a 20) de acordo com as diretrizes comentário. Portanto, todos os estudos eram de boa qualidade.

Com base nos resultados desta meta-análise, suportam a hipótese de que pacientes com tumor com hipometilação global em todas as populações consideradas têm prognóstico sombrio. Do ponto de vista dos médicos, o uso de “médio” como referência hipometilação, e usando pyrosequencing para detectar a linha-1 por si só ou combinado com outro nível de metilação dois biomarcadores de amostras biológicas retiradas de um paciente pode ser um meio útil para prever a sua resultado dos pacientes, e, se for baixa metilação é detectado, um tratamento de reforço, tais como o uso de radiação pós-operatória e quimioterapia [52], [53], ou algum tipo de tratamento de intervenção e imuno-terapêutica [7], [54] deveria ser considerado. Entretanto, uma validação é necessária para avaliar se este biomarcador epigenética deve ser usado em aplicação clínica rotineira como uma ferramenta de prognóstico para pacientes com vários tumores. Estudos futuros devem ter um design mais rigorosa, amostras maiores (para aumentar o poder estatístico dos resultados), de modo uniforme de analisar os resultados de sobrevivência e o nível de hipometilação, e bio-amostras concordantes. Além disso, estudos futuros requerem o uso de um período longo e determinado de acompanhamento para confirmar estes resultados.

Informações de Apoio

Checklist S1.

PRISMA Checklist

doi:. 10.1371 /journal.pone.0106290.s001

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