PLOS ONE: Interação entre Polimorfismos na pré-miRNA Genes and Cooking Exposição Oil Fume sobre o risco de cancro do pulmão em chinês não-fumadores Feminino Population

Abstract

Fundo

Ambos polimorfismos genéticos e factores de risco ambientais desempenham um papel importante no desenvolvimento de doenças crónicas humanas, incluindo o cancro do pulmão. Este é o primeiro estudo de caso-controle de interação entre polimorfismos no pré-miRNA exposição genes e fumos de óleo de cozinha sobre o risco de câncer de pulmão.

Métodos

Um estudo de caso-controle de base hospitalar de 258 casos e 310 controles foi realizado. Seis polimorfismos em miRNAs foram determinadas por Taqman método de discriminação alélica. As interações gene-ambiente foram avaliados em ambos aditivo e multiplicativo escala. As análises estatísticas foram realizadas principalmente com SPSS.

Resultados

A combinação dos genótipos de risco de cinco miRNA SNPs (rs2910164 miR-146a, rs11614913 miR-196a2, miR-608 rs4919510, miR- rs895819 27a e miR-423 rs6505162) com fator de risco (cozinhar exposição de fumos de óleo) contribuiu para um risco significativamente maior de câncer de pulmão, e as RUP correspondentes (intervalos de confiança de 95%) foram 1,91 (1,04-3,52), 1,94 (1,16-3,25 ), 2,06 (1,22-3,49), 1,76 (1,03-2,98) e 2,13 (1,29-3,51). Os indivíduos com ambos os genótipos de risco de miRNA SNPs e exposição a fatores de risco (cozinhar fumaça de óleo) estavam em um maior risco de cancro do pulmão do que as pessoas com apenas um dos dois fatores de risco (RUP foram 1,91, 1,05 e 1,41 para rs2910164 miR-146a , RUP foram 1,94, 1,23 e 1,34 para rs11614913 miR-196a2, RUP foram 2,06, 1,41 e 1,68 para miR-608 rs4919510, RUP foram 1,76, 0,82 e 1,07 para rs895819 miR-27a, e RUP foram 2,13, 1,15 e 1,02 para miR -423 rs6505162, respectivamente). Todas as medidas de interacção biológica indicam que não eram de fato as interações biológicas entre os seis SNPs de miRNAs e exposição à fumaça de óleo de cozinha em uma escala aditiva. modelos logísticos sugeriu que as interações gene-ambiente não foram estatisticamente significativas em uma escala multiplicativa.

Conclusões

As interações entre miRNA SNPs e exposição de fumos de óleo de cozinha sugeridos pela RUP de combinação diferente não foram estatisticamente significativa

Citation:. Yin Z, Cui Z, Guan P, Li X, Wu W, Ren Y, et al. (2015) Interação entre os polimorfismos na pré-miRNA Genes and Cooking Exposição Oil Fume sobre o risco de cancro do pulmão em chinês Não Fumador população feminina. PLoS ONE 10 (6): e0128572. doi: 10.1371 /journal.pone.0128572

Editor do Academic: Hiromu Suzuki, Sapporo Medical University, JAPÃO

Recebido: 31 de outubro de 2014; Aceito: 28 de abril de 2015; Publicação: 17 de junho de 2015

Direitos de autor: © 2015 Yin et al. Este é um artigo de acesso aberto distribuído sob os termos da Licença Creative Commons Attribution, que permite uso irrestrito, distribuição e reprodução em qualquer meio, desde que o autor original ea fonte sejam creditados

Disponibilidade de dados: Todos os dados relevantes estão dentro do papel e seus arquivos de suporte de informação

Financiamento:. Este estudo foi apoiado pela National Science Foundation Natural da China (No. 81.102.194). ZY recebeu o financiamento. Os financiadores não tiveram nenhum papel no desenho do estudo, coleta de dados e análise, decisão de publicar ou preparação do manuscrito

CONFLITO DE INTERESSES:.. Os autores declararam que não existem interesses conflitantes

Fundo

na China, o cancro do pulmão tornou-se a principal causa de mortes relacionadas ao câncer em homens e mulheres [1]. A taxa de incidência e morte de câncer de pulmão em populações urbanas chinesas tenham atingido o número um entre os tumores malignos [2]. O tabagismo é o principal fator de risco para câncer de pulmão; Contudo, estima-se que 15% do sexo masculino e 53% dos pacientes do sexo feminino com cancro do pulmão são os não fumadores [3], o que sugere que outros factores de risco, também têm sido implicados na etiologia do cancro do pulmão. O tabagismo não pode explicar totalmente as características epidemiológicas de câncer de pulmão em mulheres chinesas, por isso é realmente significativo para explorar outros fatores de risco importantes para o cancro do pulmão em mulheres não-fumantes chineses, a fim de controlar o efeito de fumaça de cigarro.

a exposição a factores de risco ambientais desempenham um papel importante no desenvolvimento do cancro do pulmão, mas no mesmo ambiente pessoas diferem na sua susceptibilidade ao cancro. Algumas dessas diferenças são atribuídas ao conceito de que a susceptibilidade genética modifica os efeitos das exposições ambientais [4].

estudos epidemiológicos moleculares mostraram que havia centenas de genes envolvidos na carcinogênese pulmonar [5]. Nos últimos anos, novas evidências suporta um papel extraordinário para microRNAs (miRNAs) na patogênese do câncer de pulmão humano. MiRNAs são classes de RNAs não-codificantes, cerca de 20 nucleótidos de comprimento, que são considerados para regular a expressão do ligando para as regiões cis-regulação de regiões 3’UTR do genes alvo [6]. MiRNAs têm sido implicados em processos biológicos essenciais, incluindo o desenvolvimento, diferenciação, apoptose, proliferação e o desenvolvimento da maioria das doenças, incluindo o cancro [7]. O estudo mostrou que mais de 50% dos genes de miARN localizar em regiões genómicas relacionados com o cancro ou em locais frágeis, sugerindo que miARNs podem desempenhar papéis importantes em [8], o desenvolvimento do cancro. polimorfismos de nucleotídeo único (SNPs) na região da semente ou o precursor haste-laço de miRNA são relatados para afetar significativamente a produção ou transformação de miRNA [9-10]. Estas linhas de evidência sugerem que miARN SNPs podem afectar a expressão ou função dos seus miARNs hospedeiras. Agora, os investigadores concluem que SNP ou mutações na sequência de miRNA pode alterar a expressão, maturação e /ou seleção de alvos de miRNA e, consequentemente, contribuir para modificar o risco de câncer. Nos últimos anos, a associação entre miRNA SNPs e o risco de câncer tornou-se o tema quente na investigação etiologia do câncer.

Há estudos sobre a relação entre miRNA SNPs e os riscos de câncer de pulmão. Por exemplo, Tian et ai. constatou que o SNP rs11614913 no miR-196a2 foi associado com a susceptibilidade de câncer de pulmão, no entanto, não foram observados efeitos significativos sobre a associação para os outros três SNPs (rs2910164, rs2292832 e rs3746444) situados em regiões pré-miRNA de miR -146a, miR-149, miR-196a2, e miR-499 [11]. O estudo recente em coreano sugeriram que a rs2910164C G na pré-miR-146a pode contribuir para a susceptibilidade genética para o cancro do pulmão [12]. A meta-análise mostrou que o risco de câncer de pulmão foi associada com SNP rs11614913 mas não com rs3746444 SNP [13].

Temos estudado o efeito dos SNPs comuns selecionados seis miRNAs sobre a susceptibilidade de câncer de pulmão de não para fumadores do sexo feminino (rs2910164 miR-146a, rs11614913 miR-196a2, miR-30c-1 rs928508, miR-608 rs4919510, rs895819 miR-27a e miR-423 rs6505162) e encontrou o significativamente associada miRNA SNPs (o manuscrito tenha sido apresentado ). No entanto, entre as pessoas que transportam mesmo genótipo de SNPs, algumas delas desenvolvem câncer e outros não. No mesmo ambiente, as pessoas diferem na sua susceptibilidade ao câncer. Algumas destas diferenças pode devido a modificação de fatores genéticos sobre os efeitos de fatores de risco ambientais. Explorando a interação gene-ambiente, que combina a susceptibilidade genética e exposições ambientais em conjunto, podem ser uma boa maneira de compreender a etiologia do câncer. A interação do miRNA SNPs e fatores de risco ambientais sobre a suscetibilidade ao câncer de pulmão não foi relatado até agora.

Cooking exposição de fumos de óleo é sugerido para ser um fator de risco de câncer de pulmão em estudos anteriores. Nossos relatórios anteriores mostraram que a exposição das famílias a fumos de óleo de cozinha foi associado com o risco de cancro do pulmão do sexo feminino [14-18] para não fumadores. Um estudo em uma população elevada incidência no nordeste da Índia descobriu que a interação de XRCC1Gln /Gln genótipo com a exposição de exposição de cozinhar fumaça de óleo foi significativamente associada com maior risco de câncer de pulmão [19]. Há alguns comentários sobre os fatores de risco de câncer de pulmão concluiu a associação significativa entre a exposição ao fumo de óleo de cozinha e risco de câncer de pulmão [20-21].

Em analisa a interação geral anterior, regressão logística tem sido comumente. No entanto, no modelo logístico ou de regressão de Cox, o coeficiente de regressão do termo do produto calcula a interação em uma escala multiplicativa, enquanto significância estatística indica o afastamento multiplicatividade. Rothman argumenta que quando a interação biológica é examinada, temos de nos concentrar na interação como partida de aditividade ao invés de partida de multiplicatividade [22]. Neste artigo, vamos calcular tanto a interação aditivo e da interação multiplicativa. Os resultados podem ser utilizados como referência pelos epidemiologistas para avaliar a interacção biológica entre fatores.

Para nosso conhecimento, este é o primeiro e abrangente estudo caso-controle de câncer de pulmão para avaliar a interação entre o SNPs no pré miRNAs e exposição ao fator de risco ambiental para o desenvolvimento de câncer de pulmão. Neste estudo, descrevemos um estudo de câncer de pulmão caso-controle em fumar população feminina em Shenyang, nordeste da China para estudar a interação entre miRNA SNPs e exposição de fumos de óleo de cozinha.

Materiais e Métodos

Ética Declaração

o estudo foi aprovado pelo Institutional Review Board of China Medical University, Shenyang, China. Todos os pacientes forneceram consentimento informado por escrito.

Os sujeitos do estudo e coleta de dados

Este é um estudo epidemiológico molecular em curso de câncer de pulmão na cidade de Shenyang, localizada no nordeste da China. Cada sujeito foi entrevistado para coletar dados demográficos e fatores ambientais, bem como o sangue venoso 5ml para detectar SNP. Os fatores ambientais incluem o fumo passivo, cozinhar exposição de fumos de óleo, a exposição à fumaça de combustível, história familiar de câncer, a exposição ocupacional e hábito alimentar, que foram obtidos para cada caso e controle por entrevistadores treinados. Indivíduo com um total de 100 cigarros em sua vida foi definido como um fumante, caso contrário, ele foi considerado como um não-fumante.

Neste estudo caso-controle de base hospitalar, sujeitos do estudo incluiu 258 casos e 310 combinados controles para idade e sexo, consecutivamente foram inscritos no estudo durante Julho de 2006 e dezembro de 2012. a inclusão do grupo caso: (1) pacientes com câncer de pulmão diagnosticado recentemente, (2) histologicamente confirmado de câncer de pulmão por patologistas experientes, (3) não receber quimioterapia ou radioterapia, (4) não-fumantes pacientes do sexo feminino, (5) capacidade de passar por uma entrevista de 1,5 hora, (6) com a informação completa da exposição ambiental. Os critérios de exclusão incluíram câncer anterior ou câncer metástase de um tumor diferente. Durante o mesmo período, os controlos consistia em pessoas saudáveis ​​visita à excepção dos casos ou outros pacientes com câncer foram recrutados em centros de exame médico no mesmo hospital, excluindo aqueles com neoplasia e doenças respiratórias. Os controles foram todas as fêmeas não-fumadores e frequência combinados para casos na idade (± 5 anos). Os participantes eram não relacionados Han mulheres de etnia chinesa.

Em nossos trabalhos publicados anteriores, cozinhar exposição de fumos de óleo foi encontrado para ser significativamente associada com o risco de câncer de pulmão em mulheres não-fumadores [14-18], assim, no presente estudo foi analisar a interacção entre SNPs e exposição de fumos de óleo de cozinha. Para cozinhar a exposição de fumos de óleo, os participantes foram questionados sobre a frequência de cozinhar e tipos de óleos. Os indivíduos também foram convidados “Quantas vezes fiz o ar em sua cozinha encher-se de” fumaça “oleosa durante o cozimento?” Para cada uma destas questões, havia quatro respostas possíveis que variam de “nunca”, “raramente”, “às vezes”, para “freqüentemente”. Exposição para cozinhar fumos de óleo foi categorizado como um indicador variável igual a 1 se os participantes relataram freqüentemente ou às vezes, e igual a 0, caso contrário.

SNP genotipagem

Amostras de DNA genômico foram isolados utilizando fenol-clorofórmio Método. A genotipagem dos SNPs foi feito em um Applied Biosystems 7500 Fast Real-Time PCR System (Foster City, CA, EUA), utilizando a discriminação alélica Taqman (Applied Biosystems, Foster City, CA) com um conjunto de sonda iniciador disponível comercialmente (ensaio C_15946974_10 ID para rs2910164, C_31185852_10 para rs11614913, C_176

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