PLOS ONE: anaplásico linfoma Kinase Rearranjo na Digestive Cancer Tract: Implicações para a terapia-alvo na população chinesa

Abstract

Fundo

anaplásico linfoma quinase

(

ALK

) rearranjos definir um subgrupo de câncer de pulmão que é elegível para a inibição da quinase alvo. O objetivo deste estudo é observar a taxa de incidência da fusão ALK em uma grande coorte de pacientes com câncer do trato digestivo chineses.

Pacientes e Métodos

Tissue microarray (TMA) foi construído a partir de 808 digestivo casos de câncer do trato, incluindo 169 carcinoma de células escamosas do esôfago, câncer gástrico 182 e 457 de câncer colorretal casos (CRC). Testámos todas as capas de expressão ALK por meio de um ensaio de imuno-histoquímica totalmente automatizado (IHC). Os casos IHC-positivos foram submetidos a fluorescência

In situ

fluorescente (FISH), reacção em cadeia da polimerase em tempo real (qRT-PCR), como alvo do gene de enriquecimento e sequenciação para confirmação de

ALK

gene rearranjo e descoberta de novos parceiros de fusão.

resultados

Entre os casos testados, 2 (0,44%) casos de CRC mostrou positiva, tanto por IHC e FISH. Por qRT-PCR,

EML4-ALK

fusão foi encontrada em um caso CRC IHC-positivo. Em outro caso CRC IHC-positivo, alvo de enriquecimento de gene e sequenciamento revelou

ALK

foi fundido a um parceiro de novela,

espectrina beta não-eritrocítica 1

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