Abstract
Objectivo
Variantes genéticas que regulam o sistema imune do hospedeiro podem contribuir para a susceptibilidade para o desenvolvimento de câncer gástrico. Pouco se sabe sobre o papel da imunidade inata e linfoma não-Hodgkin (NHL) genes relacionados com para o risco de câncer gástrico. Este estudo caso-controle foi realizado para identificar genes candidatos para o risco de câncer gástrico para estudos futuros.
Métodos
Na fase de Descoberta, 3.072 SNPs em 203 imunidade inata e 264 NHL relacionadas genes usando o Painel de OPA GoldenGateTM Illumine foram analisados em 42 conjuntos de caso-controle pareados selecionados a partir coreano multi-centro da Cancer Cohort (KMCC). Seis SNPs significativas em quatro imunidade inata (
DEFA6, DEFB1, JAK3,
e
ACAA1
) e 11 SNPs em nove genes relacionados com a NHL (
INSL3, CHMP7, BCL2L11, TNFRSF8, RAD50, CASP7, CHUK, CD79b,
e
CLDN9
) com um permutated
p
-valor 0,01 foram re-genotipados na fase de replicação entre os 386 casos e 348 controles. odds ratio (OR) para o risco de câncer gástrico foram estimados com o ajuste para idade, tabagismo e
H. pylori Comprar e CagA sero-positividade. RUP resumidos na população total do estudo (428 casos e 390 controles) são apresentados usando pooled- e meta-análises
Resultados
Quatro SNPs não tinha heterogeneidade entre as fases:. Na meta- análise,
DEFA6
rs13275170 e
DEFB1
rs2738169 tinha tanto um 1,3 vezes maior odds ratio (OR) para câncer gástrico (95% IC = 1,1-1,6 e 1,1-1,5, respectivamente) .
INSL3
rs10421916 e rs11088680 tinha tanto um 0,8 vezes diminuída ou para o câncer gástrico. (95% IC = 0,7-0,97; e 0,7-0,9, respectivamente)
Conclusões
Nossos resultados sugerem que certas variantes na imunidade inata e genes relacionados com a NHL afetar o risco de câncer gástrico, talvez, modulando mecanismos de infecção-inflamação-imunidade que continuam a ser definido
Citation:. Parque SK, Yang JJ , Oh S, Cho LY, Ma SH, Shin A, et al. (2012) imunidade inata e de Linfoma não-Hodgkin (NHL) Genes relacionados em um estudo de caso-controle aninhado para câncer gástrico Risco. PLoS ONE 7 (9): e45274. doi: 10.1371 /journal.pone.0045274
editor: Georgina L. Segure, University of Aberdeen, Reino Unido
Recebido: 10 de maio de 2012; Aceito: 14 de agosto de 2012; Publicado: 21 de Setembro 2012