Abstract
Fundo
Up-regulação da H família dos retrovírus endógeno humano mais abundante (HERV-H), especialmente transcrições env-relacionados, se correlaciona com cancro do cólon. No entanto, o padrão de expressão emendados transcrições de HERV-H não-codificante não é clara.
Metodologia /Principais Achados
Neste estudo, transcrições expressão de HERV-H emendados em câncer de cólon foi investigada por uma estratégia de RT-PCR utilizando iniciadores de segmentação do ARNt
Sua local de ligação do iniciador e a região R na “repetição terminal longa 3 (LTR), seguido de clonagem e sequenciação dos produtos de amplificação. As sequências foram então atribuídos para indivíduo loci HERV-H através do emprego de diferenças de nucleótidos particulares entre loci. Diferentes padrões de HERV-H transcrições emendados de elementos ativos distintos de expressão foram encontrados em linhas celulares de cancro do cólon HT29, LS 174T, RKO, SW480 e SW620. Além disso, os padrões de expressão em SW480 e RKO foram significativamente alteradas por tratamento desmetilação. Curiosamente, mais elementos HERV-H foram encontrados para ser transcricionalmente ativa em tecidos tumorais de cólon do que em tecidos normais adjacentes (14
vs.
7).
Conclusões /Significado
esta é a primeira pesquisa para estudar o carácter de expressão de transcritos não codificante de splicing elementos HERV-H no cancro do cólon. padrões de expressão de HERV-H transcrições emendados diferiu entre linhas celulares de cancro de cólon e podem ser afetados por níveis de metilação do DNA genômico. Mais importante ainda, além da vista geralmente aceite de sobre-regulação da expressão de HERV-H em tecidos de tumor do cólon, que encontramos loci HERV-H mais activo no tumor do cólon, em comparação com os tecidos normais adjacentes
citação:. Q Liang , Xu Z, Xu R, Wu L, Zheng S (2012) os padrões de expressão de transcritos não-codificante emendados de humano endógeno Retrovirus HERV-H Elementos em cancro do cólon. PLoS ONE 7 (1): e29950. doi: 10.1371 /journal.pone.0029950
editor: Klaus Roemer, Universidade de Saarland Medical School, Alemanha