Abstract
Fundo
A associação entre polimorfismos sobre o câncer 15q25.1 e pulmão tem sido amplamente avaliado; No entanto, os estudos têm produzido resultados contraditórios. Nós procuramos investigar esta inconsistência através da realização de uma meta-análise abrangente sobre dois polimorfismos (
CHRNA3
gene: rs1051730 e
AGPHD1
gene: rs8034191). Em 15q25.1
métodos
Os dados foram extraídos de 15 e 14 estudos sobre polimorfismos rs1051730 e rs8034191 envolvendo 12301/14000 e 14075/12873 casos de câncer de pulmão /controles, respectivamente. O modelo de efeitos aleatórios foi aplicado, abordando heterogeneidade e viés de publicação
Resultados
Os dois polimorfismos seguido Hardy-Weinberg para todos os estudos (
P Art 0,05). . Para rs1051730-G /A, portadores de um alelo tinham um risco aumentado de 36% para câncer de pulmão (95% intervalo de confiança [CI]: 1,27-1,46;
P
0,0005), sem heterogeneidade (
P
= 0,258) ou viés de publicação (
P
Egger
= 0,462). Para rs8034191-T /C, o contraste alélicas indicou que C alelo conferiu um risco aumentado de 23% para câncer de pulmão (95% CI: 1,08-1,4;
P
= 0,002), com a heterogeneidade significativa (
P
0,0005), sem viés de publicação (
P
Egger
= 0,682). Análises de subgrupos sugeriram que a heterogeneidade entre os estudos foi derivado de etnia, desenho do estudo, a informação correspondente, e subtipos de câncer de pulmão. Por exemplo, a associação de rs1051730 polimorfismos e rs8034191 com câncer de pulmão foi heterogênea entre os caucasianos (OR = 1,32 e 1,22; IC 95%: 1,25-1,44 e 1,05-1,42;
P Art 0,0005 e 0,008, respectivamente ) e asiáticos (OR = 1,51 e 1,03; IC 95%: 0,47-2,27 0,76-3 e;
P
= 0,237 e 0,934, respectivamente) sob o modelo de alelos, e essa associação foi relativamente reforçada sob o modelo dominante. Não houve viés de publicação observáveis para ambos os polimorfismos.
Conclusões
Nossos resultados demonstraram que
rs1051730-A CHRNA3
gene alelo e
AGPHD1
rs8034191- gene T alelo podem ser fatores de risco que conferem para o desenvolvimento de câncer de pulmão em caucasianos, mas não no leste-asiáticos
Citation:. Gu M, Dong X, Zhang X, Wang X, Y Qi, Yu J, et ai. (2012) forte associação entre dois polimorfismos em 15q25.1 e Lung Cancer Risk: A Meta-Analysis. PLoS ONE 7 (6): e37970. doi: 10.1371 /journal.pone.0037970
editor: Yan Gong, Faculdade de Farmácia da Universidade da Flórida, Estados Unidos da América
Recebido: 19 Janeiro, 2012; Aceito: 27 de abril de 2012; Publicação: 06 de junho de 2012
Direitos de autor: © 2012 Gu et al. Este é um artigo de acesso aberto distribuído sob os termos da Licença Creative Commons Attribution, que permite uso irrestrito, distribuição e reprodução em qualquer meio, desde que o autor original ea fonte sejam creditados
Financiamento:. Este trabalho foi apoiado pelo Shanghai Levante Star Program (11QA1405500) e Fundação Nacional de Ciência para Jovens cientistas da China (30.900.808). Os financiadores não tiveram nenhum papel no desenho do estudo, coleta de dados e análise, decisão de publicar ou preparação do manuscrito
Conflito de interesses:. Os autores leram a política da revista e tem as seguintes conflitos: Xuezhi Zhang é um funcionário da China Petrochemical Corporation. Não há patentes, produtos em desenvolvimento ou produtos comercializados a declarar. Isto não altera a adesão dos autores para todos os PLoS ONE políticas de dados e materiais de compartilhamento.
Introdução
O cancro do pulmão é o tumor maligno mais comum ea primeira causa de mortalidade por câncer, com uma estimativa de 1,3 milhões de novos casos diagnosticados anualmente no mundo [1], [2]. Os fatores de risco conhecidos para o câncer de pulmão incluem tabagismo e exposição a radiação ionizante (por exemplo, radônio, imagiologia médica). evidências acumuladas sugerem que factores genéticos podem contribuir para a variação na susceptibilidade ao cancro do pulmão. É amplamente aceito que o câncer de pulmão é uma doença multifatorial complexa, atribuída à interação de fatores genéticos com fatores ambientais [3], [4]. Apesar dos esforços intensivos dedicados a investigar os fatores genéticos para câncer de pulmão, os genes de condução e variantes genéticas que determinam o desenvolvimento de cancro do pulmão não são claras.
A região 15q25.1 cromossoma foi identificado como um hotspot para o cancro do pulmão susceptibilidade por estudos recentes de associação do genoma (GWA) [5], [6], [7], [8]. Resultados de estudos de associação genética para a dependência da nicotina, tabagismo, e doenças relacionadas ao fumo têm convergido para implicar a região cromossômica 15q25.1. A relação entre rs1051730 polimorfismos em
CHRNA3
gene e rs8034191 no
AGPHD1
gene e câncer de pulmão de risco ou fenótipos relacionados tem sido amplamente investigada. Como afirma McClellan e King, muitos, se não a maioria dos polimorfismos genéticos que são relatados para ser associado com doenças comuns em estudos GWA são associações factualmente falsas causadas por diferenças sutis em ascendência entre as populações sendo estudado (conhecido como “estratificação populacional críptica” ) [9]. Além disso, com base no fato de que estudos individuais com tamanhos de amostra insuficientes não têm poder estatístico suficiente para detectar as variantes comuns com efeitos minúsculos sobre a carcinogênese de pulmão, os resultados não são reprodutíveis. Para obter uma estimativa mais precisa e investigar a inconsistência, foi avaliado o efeito de dois rs1051730 polimorfismos e rs8034191 sobre o risco de câncer de pulmão, abordando heterogeneidade e viés de publicação.
Métodos
Realizamos este análise de acordo com as orientações dos itens de relatório preferido para revisões sistemáticas e meta-análises (PRISMA) declaração [10] (ver quadro S1 e lista de verificação S1).
Pesquisa Estratégia para identificação dos estudos
Foram pesquisados os bancos de dados PubMed e EMBASE para artigos publicados antes de janeiro de 2012, utilizando as combinações booleanas de termos do assunto (CHRNA3 OU AGPHD1 OU LOC123688) e (o cancro do pulmão ou carcinoma OU neoplasia) e (gene ou polimorfismo OU alelo OU genótipo ou variante OU mutação). Os artigos foram restrito para Inglês de língua e estudos humanos. O texto completo dos artigos recuperados foi analisada para decidir se as informações sobre o tema de interesse foi incluído. listas de referências destes artigos recuperados e revisões sistemáticas foram também verificados para citações de artigos não identificados inicialmente. Para artigos que envolvam mais do que um grupo heterogêneo geográfica ou étnica, cada grupo foi tratado separadamente. Quando a freqüência do genótipo não foi relatada, entramos em contato com os autores para obter a informação relevante.
Critérios
inclusão /exclusão
Os artigos foram incluídos nesta meta-análise se 1) examinou a hipótese de que
CHRNA3
polimorfismo rs1051730 do gene e /ou
AGPHD1
polimorfismo rs8034191 do gene foram associados com o risco de câncer de pulmão; 2) seguido de um caso-controle ou caso-controle ou desenho estudo transversal aninhado; e 3) fornecido informações suficientes sobre a contagem do genótipo /alelo entre casos e controles para estimar a razão de chances (OR) eo intervalo de confiança de 95% correspondente (IC 95%). Os resultados relativamente completos e recentes foram extraídos quando havia vários artigos que envolvem a mesma população.
informações extraídas
As informações a seguir foi extraído de forma independente e entrou em bancos de dados separados por dois autores (MG e WN ) a partir de cada estudo qualificada: sobrenome do primeiro autor, data de publicação, etnia população, desenho do estudo, as características basais da população do estudo, incluindo idade, etnia, sexo, tabagismo, e as contagens de genótipos em casos e controles. Qualquer discrepância encontrada foi julgado por uma discussão até que um consenso foi alcançado.
O Índice de qualidade de Avaliação
A qualidade do estudo foi avaliada usando uma avaliação Índice de qualidade desenvolvido para estudos de associação genética por Thakkinstian et al [ ,,,0],11]. Os escores totais variou de 0 (pior) a 12 (melhor). Os critérios para avaliação da associação genética entre dois polimorfismos estudados e câncer de pulmão qualidade estão descritos na Tabela S1.
Análise Estatística
Gestão de dados e análises estatísticas foram realizadas utilizando o software STATA (StataCorp, Texas , EUA, versão 11.0 para Windows). Desvio de Hardy-Weinberg foi testado por χ
2 ou teste exato de Fisher, em grupos de controle. Independentemente de heterogeneidade entre os estudos, foi implementado um modelo de efeitos aleatórios utilizando o método DerSimonian e Laird para trazer as estimativas efeito de tamanho individuais juntos, e a estimativa de heterogeneidade foi tirada do modelo de Mantel-Haenszel [12]. OR bruto e 95% CI foram usados para comparar alélicas e contraste dominante entre os casos e controles.
Entre-estudo heterogeneidade foi avaliada pelo índice de inconsistência
I
2 Estatística (variando de 0 a 100%), que foi documentado para a percentagem de variabilidade entre-estudo devido a heterogeneidade observada em vez de ao acaso, com valores mais elevados o que sugere a existência de heterogeneidade [13], [14]. No caso de heterogeneidade entre estudo, examinamos as características do estudo que poderiam estratificar os estudos em subgrupos com efeitos homogêneos. Para estimar o grau em que um ou mais co-variáveis explicou a heterogeneidade, foram empregados meta-regressão, como uma extensão de efeitos aleatórios meta-análise.
meta-análise cumulativa foi conduzido para identificar a influência da primeira estudo publicado nas publicações posteriores, e a evolução das estimativas combinadas ao longo do tempo de acordo com a data ascendente da publicação. Para identificar os estudos potencialmente influentes, foi realizada a análise influente (também conhecido como análise de sensibilidade), removendo um estudo individual de cada vez para verificar se alguma destas estimativas tendenciosa a estimativa global.
O gráfico de funil e teste de Egger foram aplicadas para avaliar o viés de publicação [15]. O teste de Egger pode detectar funil trama assimetria por determinar se a intercepção se desvia significativamente de zero em uma regressão das estimativas de efeito padronizados contra a sua precisão. Apare e encher método também foi usado para estimar o número e os resultados dos estudos potencialmente perdidos resultantes de viés de publicação. A probabilidade de 0,05 foi considerado significativo, exceto para o
I
2 e Estatística do Egger, para o qual um nível de significância foi definido como . 0,1
Resultados
Pesquisa de Estudos
com base em nossa estratégia de busca, o rastreio primário produziram 40 artigos potencialmente relevantes, dos quais 12 preencheram os critérios de inclusão, na tentativa de avaliar a associação da
rs1051730 do gene CHRNA3 Comprar e /ou
AGPHD1
polimorfismos rs8034191 gene com o risco de câncer de pulmão [5], [16], [17], [18], [19], [20], [21], [22], [23 ], [24], [25], [26]. Um diagrama de fluxo esquematizado do processo de selecção e exclusão de artigos com razões específicas (Figura 1). Os 12 artigos qualificados foram publicados entre 2008 e 2011, envolvendo 16 estudos com 9 em caucasianos, 4 em leste-asiáticos, 2 em afro-americanos, e 1 em (caucasianos, afro-americanos e hispânicos) populações mistas. A pontuação de estudos de qualidade variou de 7 a 10 (média: 8,5) a partir de uma pontuação máxima de 12. Em detalhe, havia 11 (15) e 10 (14) artigos (estudos) para rs1051730 e rs8034191 polimorfismos envolvendo 12301/14000 e 14075/12873 casos de câncer de pulmão /controles, respectivamente.
características de estudos
As características basais de todos os estudos qualificados estão resumidos na Tabela 1. distribuições de genótipos de dois polimorfismos estavam em Hardy -Weinberg equilíbrio para todos os estudos (
P Art 0,05). Dez dos 16 estudos qualificados foram emparelhados na idade ou sexo ou estado de fumar entre casos e controles [16], [18], [19], [21], [22], [24], [25], [26]. Cinco estudos foram hospital de base [16], [19], [23], [26], eo resto eram de base populacional. Três estudos envolveram o cancro do pulmão de células não pequenas como um ponto final, e um estudo envolveu carcinoma do pulmão de células escamosas, como um ponto final. As frequências de
CHRNA3
rs1051730-um gene alelo variou largamente entre caucasianos e asiáticos, com os afro-americanos no meio. Por exemplo, em grupos de controle, o rs1051730-A alelo variou de 29,45% para 37,14% em caucasianos, de 1,39% para 3,3% no Leste Asiático e, a partir de 16,15% para 19,85% em afro-americanos. A observação foi similar para
AGPHD1
alelo gene rs8034191-C, com freqüências variando de 23,04% a 39,47% nos controles caucasianos, de 1,82% para 3,72% nos controles do Leste Asiático e, a partir de 16,15% para 31,44 em Africano controles -American.
Análise geral
Devido à escassez dos alelos mutantes de ambos os polimorfismos estudados no leste-asiáticos e para maximizar o poder estatístico para detectar uma associação, foram considerados os efeito de risco de dois polimorfismos, tanto ao abrigo alélicas e modelos dominantes
A comparação global do
rs1051730-A CHRNA3
gene alelo rendeu um risco extremamente aumentado para câncer de pulmão (OR = 1,33;. 95% CI : 1,24-1,44;
P 0,0005
) em relação ao alelo rs1051730-G; no entanto, houve evidência moderada de heterogeneidade entre os estudos (
I
2 = 57,8%;
P
= 0,003). A magnitude do risco foi ligeiramente potencializado sob o modelo dominante (OR = 1,36; IC 95%: 1,27-1,46;
P
0,0005), mas a heterogeneidade estava ausente (
I
2 = 18,4%;
P
= 0,258) (Tabela 2). Do mesmo modo para
AGPHD1
/C polimorfismo do gene rs8034191-T, em comparação com o alelo T, o alelo C conferido um 23% de aumento de risco significativo para câncer de pulmão (95% CI: 1,08-1,4;
P
= 0,002) com a heterogeneidade (
I
2 = 87,2%;
P Art 0,0005). A magnitude do risco foi ligeiramente enfraquecido sob o modelo dominante (OR = 1,2; IC 95%: 1,02-1,42;
P
= 0,03;
I
2 = 85,2%;
P
. 0,0005) (Tabela 3)
Para ambos os polimorfismos, como refletido pela fiscalização gráfico de funil visual (Figura 2-a e 2-C) e Egger de regressão estatística de assimetria, houve baixa probabilidade de viés de publicação (
P
= 0,742 e 0,682 para rs1051730 e rs8034191, respectivamente). Outra evidência de publicação seletiva sugeriu que não havia estudos em falta necessários para fazer a trama funil simétrico para ambos os polimorfismos (Figura 3-B e 3-D).
Para cada estudo, OR é mostrado por o centro do círculo sólido azul cujos extremos superiores e inferiores representam o correspondente IC 95%. OR valores foram calculados para os fumantes atuais contra os não fumantes (incluindo ex-fumantes) quando disponível ou ex-fumadores contra os que nunca fumaram outra forma. A linha pontilhada verde é representada pelo ajuste OR e percentual de fumar nos casos para os estudos incluídos.
Análises
cumulativos e influente
Na meta-análise cumulativa, em todos os modelos genéticos que não encontrou nenhuma evidência sugerindo que o primeiro estudo publicado que geraram um resultado potencialmente significativo, em seguida, replicação acionada posterior publicação. A análise influente mostrou que nenhum estudo influenciado os resultados globais de forma significativa para ambos os polimorfismos (dados não mostrados).
Subgrupo Análise
Em vista da heterogeneidade significativa e procurar por suas fontes potenciais, nós realizado um painel de análises de subgrupos na etnia, a informação correspondente, desenho do estudo, e tipo da doença.
o agrupamento de estudos de descida das populações indicou que as chances de desenvolver câncer de pulmão foi significativamente aumentada em afro-americanos para ambos os polimorfismos, e não foi significativa ou extremamente reduzido em asiáticos para
CHRNA3
polimorfismo rs1051730 do gene (modelo alélicas: OR = 1,51; IC 95%: 0,76-3,0;
P
= 0,237; e dominante modelo: OR = 1,22; 95% CI: 0.59-2,52;
P
= 0,592) (Tabela 2), e
polimorfismo rs8034191 do gene AGPHD1
(modelo alélicas: OR = 1,03; IC 95%: 0,47-2,27;
P
= 0,934; e modelo dominante: OR = 0,72; IC 95%: 0,52-0,99;
P
= 0,043) (Tabela 3). Em contraste, não houve alterações significativas nas estimativas de risco em caucasianos para ambos os polimorfismos. Após a estratificação por a informação correspondente no idade ou sexo ou status entre casos e controles de fumar, as estimativas de risco foram relativamente enfraquecido em estudos combinados para ambos os polimorfismos, tanto ao abrigo alélicas e modelos dominantes (Tabelas 2 e 3), e a qualidade de heterogeneidade não foi . melhorou
na análise de subgrupo por desenho do estudo, associação de ambos os polimorfismos estudados com cancro do pulmão foi potencializado em estudos baseados em hospitais sob o modelo de alelos (rs1051730: OR = 1,56, 95% CI: 1,1-2,21,
P
= 0,012; e rs8034191: OR = 1,31, 95% CI: 0,96-1,79,
P
= 0,092), enquanto que sob o modelo dominante, esta associação foi potencializado em estudos de base populacional (rs1051730 : OR = 1,39, 95% CI: 1,31-1,48,
P Art 0,0005; e rs8034191: OR IC = 1,25, 95%: 1,03-1,51,
P
= 0,021). Restringindo a análise ao cancro do pulmão de células não pequenas-observada nenhuma evidência de heterogeneidade, e descobriu que a magnitude de risco foi significativa mas relativamente enfraquecido sob modelo alélica (rs1051730: OR IC = 1,24, 95%: 1,1-1,38,
P Art 0,0005; e rs8034191: OR = 1,21, 95% CI: 1,08-1,36,
P
= 0,001), enquanto que desta magnitude foi significativamente reforçada sob o modelo dominante (rs1051730: OR = 1,38, 95 % CI: 1,18-1,61,
P Art 0,0005; e rs8034191: OR = 1,35, 95% CI:. 1,16-1,58,
P Art 0,0005)
análise de meta-regressão
Para identificar outras fontes de heterogeneidade, realizamos meta-análise de regressão de idade (média ou valor mediano), sexo (por cento do sexo masculino), e taxa de tabagismo (percentual de fumantes atuais e antigos) . Entre essas variáveis, a associação de
rs1051730 CHRNA3
gene (coeficiente de correlação: 0,48,
P
= 0,069) e
AGPHD1
rs8034191 do gene (coeficiente de correlação: 0,57,
P
= 0,043) polimorfismos com o risco de câncer de pulmão foi observada em casos com uma alta taxa de fumar sob o modelo de alelos (Figura 3).
Discussão
Através de uma meta-análise abrangente , foi avaliada a associação de dois polimorfismos comuns em 15q25.1 com o risco de câncer de pulmão. Os resultados gerais demonstraram que
rs1051730-A CHRNA3
gene alelo e
AGPHD1
alelo gene rs8034191-T podem ser fatores para o desenvolvimento de câncer de pulmão em caucasianos, mas não no leste-asiáticos que conferem risco . Apesar de potenciais fontes de heterogeneidade não poderia ser facilmente eliminado, o presente estudo, a nosso conhecimento, é a primeira meta-análise até à data lidar com a associação destes dois polimorfismos com a suscetibilidade ao câncer de pulmão.
Foram identificados etnia como uma fonte potencial de heterogeneidade entre estudo de análise de subgrupo. heterogeneidade genética é inevitável na estratégia de identificação da doença [27]. Descobrimos que a associação de rs1051730 e rs8034191 polimorfismos com o risco de câncer de pulmão foi heterogênea entre caucasianos e asiáticos. A significância foi observado apenas no primeiro caso, que consistiu com os resultados de estudos de populações ocidentais GWA. Também notamos diferenças notáveis em
rs1051730-A CHRNA3
gene alelo e
AGPHD1
alelo gene rs8034191-C entre caucasianos e asiáticos, o que torna muito difícil de detectar a associação fraca nos asiáticos, a menos examinando uma população muito grande. Isto sugere que diferentes origens genéticas podem causar esta discrepância ou que diferentes populações podem ter diferentes padrões de desequilíbrio de ligação. Os polimorfismos estudados podem estar em ligação com uma outra variante causal em uma população étnica, mas não em outro [28]. Por exemplo, o polimorfismo rs1051730 está em desequilíbrio de ligação completa com o alelo potencialmente patogênicos de rs16969968 (D398N) no
CHRNA5
gene [17], [29]. Nós, portanto, especular que rs1051730 polimorfismo pode ter um efeito pleiotrópico sobre a etiologia da carcinogênese de pulmão entre os diferentes grupos étnicos. Tendo em vista os antecedentes genéticos divergentes, é necessário construir um banco de dados de polimorfismos relacionados ao câncer de pulmão em cada grupo étnico /racial.
Além da influência perturbadora de etnia na estimativa global, qualquer estimativa deve ser tratado com cautela quando os estudos foram estratificados por desenho do estudo. Nesta meta-análise, para ambos os polimorfismos, as estimativas de risco em estudos hospitalares foram mais fortes do que em estudos de base populacional. Além do tamanho relativamente pequeno da amostra, as desvantagens de estudos baseados em hospitais não devem ser ignoradas, como a estratificação da população continua a ser uma questão importante [30]. Dois estudos recrutaram sujeitos de apenas um hospital, e, assim, pode haver um perfil socioeconômico estreito para ambos os casos e controles. Além disso, a má comparabilidade entre casos e controles em estudos baseados em hospitais pode exercer um efeito de confusão sobre a verdadeira associação à luz de uma especialidade regional para a doença e as taxas de hospitalização diferencial entre casos e controles [31]. Em contraste, os indivíduos provenientes da comunidade ou a população em geral pode ser mais representativa da população, tornando os resultados de estudos de base populacional mais convincente. Considerando-se os intervalos de confiança mais amplos das estimativas, mais estudos são necessários para quantificar o tamanho do efeito de forma confiável.
Além disso, nossa análise de meta-regressão encontrada uma associação de dois polimorfismos estudados com o risco de câncer de pulmão em pacientes com uma taxa de tabagismo maior . Definimos taxa de fumar com base no percentual de fumantes atuais e ex-se disponível. Esta definição é improvável que a minar a nossa observação, já que a exclusão de cada vez fumar pode levar a uma subestimação do risco para câncer de pulmão. Além disso, nossos dados sobre tabagismo e outros fatores de confusão foram extraídos de publicações recentes (após o ano 2008) a partir de revistas de câncer de profissionais que se reflecte na pontuação alta qualidade. Além disso, o fumo é, de longe, o maior contribuinte para o cancro do pulmão, o que representa cerca de 90% a incidência de cancro do pulmão [32]. Estudos anteriores demonstraram que polimorfismos no
gene CHRNA3
foram associados com um risco aumentado de iniciação do tabagismo, indicando um potencial genótipo-fenótipo interação [33].
Os pontos fortes deste estudo incluem a relativa grande tamanho da amostra, nenhum desvio de Hardy-Weinberg, ea alta qualidade dos estudos qualificados. No entanto, nosso estudo devem ser interpretados com várias limitações técnicas em mente. Em primeiro lugar, a maioria dos estudos nesta meta-análise foram estudos de caso-controle, que são suscetíveis ao viés de seleção, incluindo apenas os casos não fatais. Em segundo lugar, porque apenas estudos publicados em Inglês foram recuperados e os “cinza” da literatura (artigos em outros idiomas além do Inglês) não foi incluído, o viés de publicação pode ser possível, apesar de nossas parcelas de funil e testes estatísticos não mostrá-lo. No entanto, a assimetria na trama funil, sendo visualmente interpretado ou estatisticamente testado, pode resultar de uma diferença essencial entre as pequenas e grandes estudos que surge a partir inerente heterogeneidade entre estudo [34]. Porque atualmente não temos nenhum padrão ouro para comparar os resultados dos testes de enredo funil [34], o teste de Egger e o enredo funil de costume foram contestados. Não podemos excluir completamente uma baixa probabilidade de que pequenos estudos negativos estão ausentes da trama. No entanto, a guarnição e método de preenchimento sugeriu nenhum estudo em falta necessários para fazer a trama funil simétrico para ambos os polimorfismos. Em terceiro lugar, a natureza única baseada no locus da meta-análise excluída a possibilidade de gene para o gene e as interações gene-ambiente, bem como os efeitos baseados no haplotipo, sugerindo que os estudos adicionais que avaliam estes aspectos são necessários. Em quarto lugar, nós nos concentramos apenas em dois polimorfismos em 15q25.1 e não considerou outros genes candidatos ou polimorfismos. É provável que os polimorfismos estudados, por si só fazer uma contribuição menor para o risco de predição em pacientes com câncer de pulmão, mas se os dois polimorfismos quando integrados com outros fatores de risco irá aumentar a previsão requer uma investigação mais aprofundada.
Em conjunto, nós expandiram estudos previamente individuais, fornecendo a evidência convincente de que
rs1051730-a CHRNA3
gene alelo e
AGPHD1
alelo gene rs8034191-T podem ser fatores para o desenvolvimento de câncer de pulmão em caucasianos que conferem risco , mas não no leste-asiáticos. Temos reforçado as descobertas anteriores sobre a associação da alta taxa de fumar com maior risco de câncer de pulmão. Estudos futuros deverão investigar os marcadores dentro e adjacente ao 15q25.1 para esclarecer se o presente associação é causal ou devido a desequilíbrio de ligação.
Informações de Apoio
Tabela S1.
Critérios para avaliação da associação genética de
CHRNA3
rs1051730 do gene polimorfismo e
AGPHD1
rs8034191 do gene polimorfismo com câncer de pulmão
doi qualidade:. 10.1371 /journal.pone.0037970.s001
(DOC)
Fluxograma S1. .
PRISMA fluxograma
doi: 10.1371 /journal.pone.0037970.s002
(PDF)
Checklist S1.
PRISMA lista
doi:. 10.1371 /journal.pone.0037970.s003
(DOC)