PLOS ONE: O Efeito da XPD /ERCC2 Polimorfismos em câncer gástrico risco entre diferentes etnias: Uma revisão sistemática e meta-Analysis

Abstract

Fundo

Potencial grupo xeroderma pigmentoso D (XPD) , também chamado de reparo de excisão grupo de acesso de cortesia dois (ERCC2), polimorfismos Lys751Gln e Asp312Asn têm sido implicados no risco de câncer gástrico entre as diferentes etnias.

Métodos

Nosso objetivo foi investigar o efeito do XPD polimorfismos Lys751Gln e Asp312Asn na susceptibilidade ao câncer gástrico entre diferentes etnias, através de uma revisão sistemática e meta-análise. Cada artigo inicialmente incluído foi marcado para a avaliação de qualidade. dados desejáveis ​​foram extraídos e registrados em bases de dados. 13 estudos eram, em última análise beneficiar da meta-análise de polimorfismo Lys751Gln e 9 estudos para a meta-análise de polimorfismo Asp312Asn. Adotamos o modelo genético provavelmente apropriado (modelo recessivo) para ambos os polimorfismos Lys751Gln e Asp312Asn. Potenciais fontes de heterogeneidade foram procurados para fora através de subgrupo e análises de sensibilidade e viés de publicação foram estimados.

Resultados

conclusões estatisticamente significativas foram aparentemente observado em asiáticos, mas não em caucasianos tanto para XPD Lys751Gln e XPD polimorfismos Asp312Asn. Um achado estatisticamente significativa podia ser visto no câncer gástrico do tipo noncardia para o polimorfismo XPD Lys751Gln. Um achado estatisticamente significativa também pode ser visto no subgrupo de alta qualidade, amostra subgrupo tamanho pequeno e moderada, artigos publicados depois de 2007, ou PCR-RFLP genotipagem subgrupo para o polimorfismo XPD Asp312Asn.

Conclusões

a nossa meta-análise indica que XPD Gln751Gln (CC) genótipo e Asn312Asn genótipo (AA) pode parecer ser mais suscetíveis ao câncer gástrico em populações asiáticas, mas não em populações caucasianas, sugerindo que os dois genótipos podem ser importantes biomarcadores de suscetibilidade ao câncer gástrico para populações asiáticas, a suposição de que precisa ser confirmado em estudos bem desenhados entre diferentes etnias. Gln751Gln (CC) genótipo também pode estar associada com o tipo noncardia risco de câncer gástrico, o que também deve ser confirmado entre diferentes etnias no futuro

Citation:. Xue H, Lu Y, Lin B, Chen J, Tang F, G Huang (2012) O Efeito da XPD /ERCC2 Polimorfismos em câncer gástrico risco entre diferentes etnias: uma revisão sistemática e meta-análise. PLoS ONE 7 (9): e43431. doi: 10.1371 /journal.pone.0043431

editor: Rui Medeiros, IPO, Inst Porto Oncology, Portugal |

Recebido: 05 de abril de 2012; Aceito: 20 de julho de 2012; Publicação: 13 de setembro de 2012

Direitos de autor: © Xue et al. Este é um artigo de acesso aberto distribuído sob os termos da Licença Creative Commons Attribution, que permite uso irrestrito, distribuição e reprodução em qualquer meio, desde que o autor original ea fonte sejam creditados

Financiamento:. Este trabalho foi apoiada pela National Science Foundation Natural da China (bolsas 30830038, 30970842 e 81071180); “973” Projeto (2012CB932604); Discovery Project New Drug (2012ZX09506-001-005); Projeto chave da Comissão de Ciência e Tecnologia de Xangai Município (subsídios 10JC1410000); ea principal Academic Projeto Disciplina Shanghai (concessão S30203). Os financiadores não tiveram nenhum papel no desenho do estudo, coleta de dados e análise, decisão de publicar ou preparação do manuscrito

CONFLITO DE INTERESSES:.. Os autores declararam que não existem interesses conflitantes

Introdução

Embora a incidência de câncer gástrico em todo o mundo diminuiu, a mortalidade ainda ocupa a segunda posição [1]. Na China, câncer gástrico constitui ainda uma das neoplasias mais letais [2]. Como é amplamente conhecido, factores infecciosos, dietéticos, ambientais e genéticos estão envolvidos na carcinogénese gástrica, mas as pessoas expostas a factores de risco que finalmente desenvolver cancro gástrico compreende uma proporção menor [3], sugerindo que a susceptibilidade genética hospedeiro desempenha um papel importante na gástrica o risco de câncer entre as diferentes etnias. Tais vários susceptibilidades poderia ser explicado, em parte, por polimorfismos de nucleotídeo único (SNPs) de genes suscetíveis nas diferentes etnias [4], [5]. Nossos papéis de meta-análise anteriormente publicados forneceram a evidência adicional para tais diferenças etnicamente sensíveis [5], [6].

É amplamente reconhecido que o DNA deve permanecer estável para realizar suas funções fisiológicas importantes, mas é persistentemente vulneráveis ​​a vários danos endógenos e /ou exógenos e, assim, as suas mutações prováveis ​​poderia acumular e carcinogénese pode ocorrer devido ao DNA danificado. sistema de reparação do ADN, no entanto, joga um papel vital em manter as funções normais das células e integridade do genoma através da inversão do DNA danificado [7]. mutações hereditárias polimorfismos funcionais ou acumulados de genes de reparo de DNA pode influenciar a capacidade de acolhimento para reparar o DNA danificado e, portanto, modular o risco de câncer [8]. SNPs dos genes de reparo de DNA comum foram identificados [9] e demonstrou estar ligado a carcinogênese esporádica [10], [11].

reparação por excisão de nucleotídeos (NER), uma das principais vias de reparo de DNA em humanos , é capaz de remover lesões da base de distorção do hélice produzidas por luz ultravioleta (UV) e uma variedade de agentes químicos [12]. XPD se acredita participar na desenrolamento de ADN durante a transcrição de NER e porque possui ADN-dependente de cadeia simples ATPase e 5′-3 actividades de helicase de ADN “[13], [14]. XPD gene (ERCC2), localizado no cromossomo 19q13.3, compreende 23 exons e seus polimorfismos são pensados ​​para gerar alterações estruturais da via NER e suscetibilidade ao câncer de influência. Os polimorfismos mais amplamente investigados XPD em associações com susceptibilidade ao cancro compreende um nonsynonymous A substituição de C no exão 23, causando uma lisina (Lys) a glutamina (Gln) a substituição no codão 751 (Lys751Gln, rs1052559), um G nonsynonymous A substituição do exão 10 levando a um ácido aspártico (Asp) para asparagina (Asn) a substituição no codão 312 (Asp312Asn, rs1799793), e um sinónimo C a substituição do exão 6, enquanto conserva a arginina (R) resíduo no codão 156 (Arg156Arg, rs238406) [15].

em 2005, Huang WY

et al.

publicou o primeiro estudo envolveu em polimorfismo XPD Lys751Gln em relação ao risco de câncer gástrico [16]. Desde então, os pesquisadores relataram associações de XPD Lys751Gln, Asp312Asn, e /ou Arg156Arg com a susceptibilidade ao câncer gástrico entre diferentes etnias, mas com resultados mistos ou conflitantes [17] – [30]. Existe apenas um artigo publicado a respeito polimorfismo Arg156Arg em relação ao risco de câncer gástrico [28]. Até à data, houve três papéis meta-análise relevantes publicados focando polimorfismos XPD [31] – [33]. Dois artigos estavam preocupados principalmente com susceptibilidades de câncer em geral, em vez de suscetibilidade ao câncer gástrico em profundidade [31], [32], proporcionando assim menos informações sobre a sua associação com o risco de câncer gástrico. Mais importante, esses três meta-análises [31] – [33] todos falharam a adoptar o modelo genético mais provável apropriado, e assim os valores autênticos desses resultados estatísticos poderia ser comprometida

Por conseguinte, o objectivo da. nossa meta-análise foi o de explorar, utilizando o modelo genético mais apropriado, o efeito de polimorfismos XPD sobre o risco de câncer gástrico entre diferentes etnias e identificar possíveis fontes de heterogeneidade entre os estudos elegíveis.

Materiais e Métodos

Pesquisa Estratégia

Uma busca sistemática da literatura foi realizada para artigos sobre SNPs XPD /ERCC2 associados com o risco de câncer gástrico. O MEDLINE, EMBASE, chinês Knowledge Nacional de Infra-estrutura (CNKI), Web of Science, e bases de dados BIOSIS foram usados ​​simultaneamente com a combinação dos termos “XPD”, “ERCC2”, “reparo do DNA”, “NER”, “Lys751Gln”, “Asp312Asn”, ou “Arg156Arg”; “gene”; “Polimorfismo”, “variante” ou “SNP”; e “câncer gástrico”, “carcinoma gástrico”, ou “o câncer de estômago” até dezembro de 2011. A pesquisa foi realizada sem qualquer restrição sobre a linguagem. O escopo da pesquisa computadorizada da literatura foi expandido de acordo com as listas de referências dos artigos recuperados. Os artigos originais relevantes também foram procurados manualmente.

Seleção Estudo

Estudos sobre a associação de XPD /ERCC2 SNPs (Lys751Gln, Asp312Asn, e /ou Arg156Arg) com o risco de câncer gástrico foram incluídos se o foram reunidas as seguintes condições: (i) qualquer estudo descreveu a associação de pelo menos um dos XPD /ERCC2 SNPs com cancro gástrico; (Ii) qualquer estudo relatou os números de ambos os controles e os casos de câncer gástrico; (Iii) os resultados foram expressos como odds ratio (OR) com intervalo de confiança de 95% (IC); e (iv) estudos eram de caso-controle ou aninhados queridos caso-controle.

metodológica Qualidade Comentário

Para identificar os estudos de alta qualidade, principalmente nós adotado critérios predefinidos para Qualidade Comentário inicialmente proposto pela Thakkinstian

et al

[34], adaptado por Camargo

et al

[35], e refinada por Xue

et al

[5] -… [7]. Os critérios (visto na Tabela S1 on-line) cobrir a credibilidade dos controles, a representatividade dos casos, a consolidação de câncer gástrico, o exame de genotipagem e avaliação associação. A qualidade metodológica foi avaliada independentemente por dois investigadores (Lin B e Lu Y). Discordâncias foram resolvidas através da discussão. Pontuação variou de o menor zero para o mais alto dez. Artigos com a pontuação mais baixa do que 6,5 foram considerados os “de baixo ou moderado de qualidade”, enquanto aqueles não inferior a 6,5 ​​foram considerados como aqueles “alta qualidade”.

Data Extraction

A seguintes dados de cada artigo foram extraídas: autores, ano de publicação, país, etnia dos participantes (classificados como caucasianos, asiáticos, etc), desenho do estudo, fonte de controles, o número de controlos e dos casos, método de genotipagem, distribuição de idade e sexo, classificação de Lauren (intestinal e difuso, ou misto), classificação anatômica (cárdia ou não-cárdia cancro), hábito de fumar, beber hábito e

Helicobacter Pylori

estado da infecção.

Os dados foram extraídos e registrados em duas bases de dados de forma independente por dois investigadores (Lin B e Lu Y) que estavam cegos para nomes de diário, instituições ou doações de fundos. Qualquer discrepância entre estes dois investigadores foi resolvido pelo investigador (Xue H), que participou da conversa com eles e tomou uma decisão final.

Análise Estatística

Todas as análises estatísticas foram realizadas utilizando STATA software estatístico (versão 10.1, Stata Corp, College Station, TX). Frente e verso Ps 0,05 foram considerados estatisticamente significativos. Hardy-Weinberg (HWE) nos controles foi calculado novamente em nossa meta-análise. A bondade do qui-quadrado de ajuste foi utilizada para testar desvios HWE (significativo ao nível de 0,05).

odds ratio (OR) e intervalos de confiança de 95% (IC 95%) foram utilizados para avaliar a força de associações entre XPD /ERCC2 SNPs e risco de câncer gástrico. OU

1 ou

2, e OR

3 foram calculados para genótipos CC contra AA, CA contra AA e CC contra CA para o polimorfismo XPD Lys751Gln; AA contra GG, GA contra GG e AA contra GA para o polimorfismo XPD Asp312Asn; AA contra o CC, CA contra o CC e AA contra CA para XPD Arg156Arg polimorfismo, respectivamente. As diferenças emparelhadas foram usadas para determinar o modelo genético mais apropriado. Se OR

1 = ou

3 ≠ 1 e OR

2 = 1, um modelo recessivo é sugerido. Se OR

1 = ou

2 ≠ 1 e OR

3 = 1, um modelo dominante está implícita. Se OR

2 = 1 /OU

3 ≠ 1 e OR

1 = 1, é sugerido um modelo overdominant completa. Se OR

1 OR

2 1 e OR

1 OR

3 1, ou OR

1 OR

2 1 e OR

1 OU

3 1, um modelo codominante é indicado [34]. Tome polimorfismo XPD Lys751Gln como um exemplo para ilustrar isso. Se um modelo dominante foi indicado, o agrupamento original foi derrubado e o novo grupo de transportadoras C (CC + CA) foi comparado com o genótipo AA; Se um modelo recessivo foi sugerido, CC foi comparada com o grupo de AA, mais CA; se um modelo overdominant completa estava implícito, o grupo de CC + AA foi comparado com CA; ou se um modelo codominante foi insinuado, CC foi comparado com CA e com AA, respectivamente.

A estatística Q foi utilizado para avaliar a heterogeneidade entre os estudos incluídos na meta-análise. I-quadrado (

I

2) valor, representando variação ou atribuíveis à heterogeneidade foi então usada para quantificar o grau de tal heterogeneidade entre estudo [36]. De acordo com critérios publicados recentemente Veneza [37], “

I

2 25% não representa heterogeneidade,

I

2 = 25-50% representa a heterogeneidade moderada,

I

2 = 50-75% representa grande heterogeneidade, e

I

2 75% representa extrema heterogeneidade “. variância entre estudo Tau-quadrado (τ

2) O valor também foi utilizado para avaliar variação entre-estudo. Um modelo de efeitos fixos, utilizando o método de Mantel-Haenszel (M-H), foi empregado para calcular as RUP agrupados quando homogeneidade existia com base no valor de p Q-teste não menos de contraste 0.1.By, um modelo de efeitos aleatórios, usando DerSimonian método e Laird (D + L), foi utilizada se existir heterogeneidade foi baseado em p-valor Q de teste inferior a 0,1. Mesmo para o homogeneidade entre-estudos, também foi usado D + método L. Meta-análises de regressão e análises de subgrupo foram utilizados para explorar e controlar as potenciais fontes de heterogeneidade entre os estudos. A importância das RUP em pool foi testado pelo teste Z (P 0,05 foi considerado significativo)

A análise de sensibilidade foi realizada, em que as estimativas de meta-análise foram calculados após cada um estudo que está sendo omitido em cada turno

por fim, o viés de publicação foi avaliada através da realização de parcelas funil qualitativamente e estimada por Begg do e testes de Egger quantitativamente.

Resultados

Literatura Search and Selection Estudo

após pesquisa abrangente, um total de 140 artigos em Inglês e 7 em chinês foram recuperados. Em nossa meta-análise foram inicialmente incluídos 15 estudos em conjunto [16] – [30], que preencheram os critérios de inclusão. Esses 15 estudos foram preliminarmente adequada à meta-análise das associações com câncer gástrico em relação XPD SNPs, entre os quais 13 estudos em causa polimorfismo XPD Lys751Gln [16] – [26], [28], [29], 9 estudos em causa XPD Asp312Asn polimorfismo [17] – [21], [23], [27], [28], [30], e apenas 1 estudo em causa XPD Arg156Arg polimorfismo [28]. 1 artigo [23] foi indexado em ambos os motores de busca chineses Inglês e

Tradicionalmente falando, qualquer estudo que desviou HWE deveria ter sido removido.; No entanto, Minelli C et al. assinalou recentemente que os estudos que parecem desviar-se HWE deve ser mais investigada em vez de apenas excluída a menos que existam outros motivos para duvidar da qualidade do estudo [38]. Até à data, ainda não é conclusiva se os estudos desviaram HWE devem ser incluídos ou excluídos na realização de meta-análise. Em nossa meta-análise, 3 estudos em questão XPD Lys751Gln polimorfismo [16], [25], [29] foram desviou HWE, e 3 estudos em causa polimorfismo XPD Asp312Asn [17], [27], [30] também foram desviado HWE; no entanto, considerando que o número de participantes nesses estudos eram grandes e dado que análises de sensibilidade seria conduzida, finalmente permaneceu esses estudos em nossa meta-análise

Assim, 13 estudos [16] – [26]. , [28], [29] com um total de 6344 controlos e 2750 casos de polimorfismo XPD Lys751Gln, e 9 estudos [17] – [21], [23], [27], [28], [30] com 3429 controles e 1715 casos de polimorfismo XPD Asp312Asn acabaram por ser elegível para a meta-análise de polimorfismos XPD. As características correspondentes foram vistos na Tabela 1 e Tabela 2. O fluxograma de seleção pesquisa bibliográfica e do estudo foi iluminada na Figura 1.

geral Meta-análise, Meta-regressão As análises e análises de subgrupos

Para XPD Lys751Gln polimorfismo, OU

1 (valor p), OU

2 (valor p), e OR

3 (valor p) foram 1,22 (p = 0,266), 1,11 (p = 0,369), e 1,02 (p = 0,811), respectivamente, dificilmente insinuar um efeito modelo específico de alelo putativo susceptível C. Heterogeneidade-chi quadrado foi 29.83 (d.f. = 12), o valor de p foi de 0,003, e

I

2 foi de 59,8%. Após a análise de meta-regressão usando co-variável única (etnia composto por caucasianos, asiáticos, ou população turca), os valores de p de valor t coeficiente para os asiáticos, caucasianos, ou população turca foram 0,001, 0,139 e 0,585, respectivamente; fortemente indicando que os asiáticos única covariável poderia principalmente constituem a fonte de heterogeneidade entre os estudos. τ

2 para os asiáticos, caucasianos, ou população turca covariável única foram de 0, 0,09178 e 0,1347, respectivamente. Para os asiáticos única covariável, τ

2 diminuiu de 0,1233 a 0, indicando asiáticos única covariável poderia ser responsável por 100% da fonte de heterogeneidade entre os estudos. Quando estratificado por análise de etnia subgrupo, OR

1 (valor p), OU

2 (valor p), e OR

3 (valor p) entre a população asiática foram 2,63 (p = 0,002), 1,14 ( p = 0,653), e 1,51 (p = 0,034), respectivamente, altamente indicando um efeito de modelo recessivo do alelo putativo susceptível C (OU

1 = OU

3 ≠ 1 e OR

2 = 1).

Para XPD Asp312Asn polimorfismo, OU

1 (valor p), OU

2 (valor p), e OR

3 (valor p) foram 1,75 (p = 0,015), 1,15 (p = 0,549), e 1,47 (p = 0,003), respectivamente, altamente indicando um efeito de modelo recessivo de putativa susceptível um alelo (OU

1 = OU

3 ≠ 1 e OR

2 = 1) . Heterogeneidade-chi quadrado foi 9,91 (d.f. = 8), valor de p 0,272, e

I

2 foi de 19,2%, indicando que não há heterogeneidade entre os estudos. Após a análise de meta-regressão usando co-variável única (etnia composta dos caucasianos ou asiáticos), valor de p valor do coeficiente t de etnia única covariável foi 0,277, indicando que a etnia pode constituir uma das fontes de pouca heterogeneidade entre os estudos. τ

2 diminuiu 0,0354-0,02075, indicando etnicidade poderia ser responsável por 41,4% da fonte de pouca heterogeneidade entre os estudos. Da mesma forma, quando estratificados por análise de etnia subgrupo, OR

1 (valor p), OU

2 (valor p), e OR

3 (valor p) entre a população asiática foram de 2,10 (p = 0,026), 1,22 (p = 0,574), e 1,80 (p = 0,008), respectivamente, indicando adicionalmente um efeito de modelo recessivo de putativa susceptível um alelo (OU

1 = OU

3 ≠ 1 e OR

2 = 1 ).

no seu conjunto, um modelo genético recessivo foi finalmente escolhido para ambos os polimorfismos XPD Lys751Gln e XPD Asp312Asn em nossa meta-análise.

em nossa meta-análise, os dados disponíveis foram estratificados, à luz dos participantes étnicos, em caucasianos, asiáticos, e da população turca. Na Figura 2, os resultados estatisticamente significativos foram observados em asiáticos, mas não em caucasianos ou população turca (polimorfismos tanto XPD Lys751Gln e XPD Asp312Asn). As RUP agrupados (IC de 95%, valor de p) foram 2,41 (1,69-3,43, p = 0,000), 0,98 (0,82-1,17, p = 0,803) e 0,97 (0,33-2,82, p = 0,954) em asiáticos, caucasianos, e população turca (polimorfismo XPD Lys751Gln na Parte a) ou 1,77 (1,19-2,63, p = 0,005) e 1,31 (0,86-1,99, p = 0,211) em asiáticos e caucasianos (polimorfismo XPD Asp312Asn na parte B), respectivamente. Quanto XPD Lys751Gln polimorfismo, os valores de P de heterogeneidade Q-estatística em caucasianos, asiáticos, e população turca foram 0,802, 0,701 e 0,045;

I

2 foram 0,0%, 0,0% e 75,1%; e τ

2 foram 0.0000, 0.0000, e 0,4489, respectivamente, demonstrando nenhuma heterogeneidade dos caucasianos ou asiáticos, mas extrema heterogeneidade na população turca (mostrado na Tabela 3). Quanto polimorfismo XPD Asp312Asn, os valores P de heterogeneidade Q-estatística em caucasianos e asiáticos foram 0,180 e 0,470;

I

2 foram 41,6% e 0,0%; andτ

2 foram 0,0587 e 0,0000, respectivamente, demonstrando nenhuma heterogeneidade dos asiáticos, mas heterogeneidade moderada dentro caucasianos (mostrado na Tabela 4).

Os estudos foram inseridos no sequencialmente meta-análise por ano de publicação. Os tamanhos dos quadrados indicam o peso relativo de cada estudo. Pesos foram obtidos a partir da análise de efeitos aleatórios. Bares, intervalo de confiança de 95% (CI). A) O polimorfismo XPD Lys751Gln em associação com câncer gástrico; B) XPD Asp312Asn polimorfismo em associação com câncer gástrico.

Como mostrado na Tabela 3 e Tabela 4, os dados específicos para XPD Lys751Gln e XPD Asp312Asn polimorfismos foram estratificados, respectivamente, em a base do tamanho da amostra, em dois subgrupos: grande amostra (o número total de controlos e de casos não inferior a 500) e a amostra pequena e moderada (o número total de controlos e de casos inferior a 500) os subgrupos. Não houve achado significativo foi observado em qualquer subgrupo de amostra pequena e moderada ou grande homólogo de exemplo para o polimorfismo XPD Lys751Gln, dado que as RUP em pool (IC95%, valor de p) foram de 0,96 (0,61-1,51, p = 0,858) para o ex e 1,17 (0,84-1,64, p = 0,351) para o último, respectivamente; no entanto um achado estatisticamente significativa foi observada no subgrupo de amostra pequena e moderada, mas não em grande homólogo de exemplo para o polimorfismo Asp312Asn, dado que as RUP em pool (IC95%, valor de p) foram de 1,74 (1,18-2,56, p = 0,005) para o primeiro e 1,35 (0,82-2,21, p = 0,239) para o último, respectivamente.

os dados também foram estratificados, em conformidade com as pontuações de avaliação da qualidade, em alta qualidade (pontuação não inferior a 6,5) e de baixa e moderada qualidade (pontuação inferior a 6,5) subgrupos. Quanto polimorfismo XPD Lys751Gln, não encontrando estatisticamente significativa foi testemunhado em qualquer subgrupo de alta qualidade ou de baixa e moderada homólogo qualidade, dado que as RUP em pool (IC95%, valor de p) foram 1,20 (0,91-1,60, p = 0,199) no primeiro caso e 0,61 (0,34-1,11, p = 0,104) para o último. Quando etnia sub-estratificação foi realizada para o subgrupo de alta qualidade, um achado estatisticamente significativa foi muito aparentemente testemunhou entre os asiáticos, mas nenhum achado estatisticamente significativa foi observada entre os caucasianos, porque as RUP em pool (IC95%, valor de p) foram 2,54 (1,77-3,65, p = 0,000) para o primeiro e 0,98 (0,82-1,17, p = 0,803) para o último, respectivamente. Quanto polimorfismo Asp312Asn, uma conclusão estatisticamente significativa foi testemunhado no subgrupo de alta qualidade, mas não em contrapartida de baixa e moderada qualidade, dado que as RUP em pool (IC95%, valor de p) foram 1,56 (1,05-2,33, p = 0,028) no primeiro caso e 1,42 (0,85-2,40, p = 0,184) para o último. Da mesma forma, quando a etnia sub-estratificação foi realizada para o subgrupo de alta qualidade, um achado estatisticamente significativa foi muito aparentemente testemunhou entre os asiáticos, mas nenhum achado estatisticamente significativa foi observada entre os caucasianos, porque as RUP em pool (IC95%, valor de p) foram 2,37 (1.29- 4,36, p = 0,005) para o primeiro e 1,31 (0,86-1,99, p = 0,211) para o último, respectivamente.

os dados foram, adicionalmente, estratificada, de acordo com o tempo publicação, no subgrupo publicação anterior ( artigos publicados antes ou em 2007) e o subgrupo publicação posterior (artigos publicados depois de 2007). Quanto polimorfismo XPD Lys751Gln, não houve resultados significativos foram observados com base em que as RUP em pool (IC95%, valor de p) foram 0,89 (0,66-1,19, p = 0,428) no primeiro e 1,23 (0,84-1,81, p = 0,285) na segunda, respectivamente. Quanto polimorfismo Asp312Asn, uma conclusão estatisticamente significativa foi observada no subgrupo publicação posterior, mas não no subgrupo publicação anterior, alegando que as RUP em pool (IC95%, valor de p) foram 1,46 (1,02-2,09, p = 0,041) em o primeiro e 1,61 (0,89-2,92, p = 0,115) no segundo, respectivamente.

Quando o câncer gástrico foi classificada em não-cárdia (ou distal) e subtipos cárdia, uma conclusão estatisticamente significativa foi encontrada entre os não tipo -cardia mas não entre tipo cárdia para XPD Lys751Gln polimorfismo com o fundamento de que as RUP em pool (IC de 95%, valor de p) foram de 2,03 (1,16-3,54, p = 0,013) entre tipo não-cárdia e 0,88 (0,66-1,18, p = 0,403) entre tipo cárdia. Quanto polimorfismo Asp312Asn, foi observado achado estatisticamente significante entre tipo cárdia com o fundamento de que o pool ou (IC de 95%, valor de p) foi de 0,89 (0,56-1,43, p = 0,642), mas OR (IC de 95%, valor de p ) quanto ao tipo não-cárdia não pôde ser calculado porque apenas um estudo [21] claramente indicado o número de genótipos do tipo não-cárdia.

em termos de patologia, cancro gástrico pode ser classificada em intestinal e difuso, ou subtipos misturado, mas apenas um estudo [19] claramente tratada e mencionou o número de genótipos de câncer subtipo difuso; assim subtipo patológica estratificação não poderia ser feito em nossa meta-análise.

Factores de confusão, tais como

Helicobacter pylori

infecção ou tabagismo não puderam ser analisados ​​em nossa meta-análise porque os dados relevantes necessários de pelo menos dois estudos não poderia ser acessível em nossa meta-análise.

E quando as técnicas de genotipagem foram consideradas, não houve achado significativo foi observado em cada subgrupo técnica de genotipagem para o polimorfismo XPD Lys751Gln porque reunidas RUP (IC de 95%, valor de p) foram de 0,94 (0,68-1,29, p = 0,701) e 1,67 (0,68-4,14, p = 0,265) em RFLP e TagMan subgrupos, respectivamente; no entanto um achado estatisticamente significativa foi observada no subgrupo RFLP genotipagem, mas não no subgrupo direto sequenciamento para o polimorfismo Asp312Asn porque RUP agrupados (IC95%, valor de p) foram 1,90 (1,09-3,31, p = 0,023) e 1,24 (0,70-2,20, p = 0,450), respectivamente.

Análise de Sensibilidade

As meta-análises foram realizadas repetidamente quando cada estudo específico havia sido removido. Os resultados indicaram que as estimativas de efeitos aleatórios antes e após a exclusão de cada estudo foram semelhantes em geral, sugerindo moderadamente elevada estabilidade dos resultados da meta-análise. Por polimorfismo XPD Lys751Gln, como mostrado na Figura 3, Parte A, o estudo isolado mais influentes na estimativa global combinada parecia ser o estudo realizado por Long XD et al. [25], coincidentemente desviou HWE, a análise de sensibilidade, no entanto, indicou moderadamente elevada estabilidade dos resultados dos fatos que as RUP (IC 95%, valor de p) foram 1,12 (0,85-1,48, p = 0,410) antes da remoção desse estudo e 0,98 (0,83-1,15, p = 0,781) após a remoção desse estudo. Em vista do estudo [16] realizado por Huang WY et al. que é desviado do HWE, as RUP (IC 95%, valor de p) foram 1,12 (0,85-1,48, p = 0,410) antes da remoção desse estudo e 1,17 (0,87-1,58, p = 0,309) após a remoção desse estudo para a toda etnia, indicando alta estabilidade dos resultados. Do mesmo modo, após a remoção do estudo [29] realizado por Engin AB et ai., Também desviado HWE, o OR (IC de 95%, valor de p) tornou-se 1,19 (0,91-1,57, p = 0,209) para a todos etnia, indicando uma elevada estabilidade dos resultados. Se todos os três estudos-HWE desviado [16], [25], [29] foram removidos, a OR (IC 95%, valor de p) tornou-se 1,06 (0,88-1,28, p = 0,555) para a toda etnia, indicando moderadamente alta estabilidade dos resultados (as figuras que ilustram foram omitidos, devido ao comprimento do papel).

os resultados foram calculados por omissão de cada estudo (à esquerda), por sua vez. Bares, 95% de intervalo de confiança. foram utilizadas meta-análise de efeitos aleatórios estimativas (forma exponencial). A) Análise de Influência dos coeficientes de odds ratio de síntese sobre a associação para XPD Lys751Gln polimorfismo com o risco de câncer gástrico; B) Análise de Influência dos coeficientes de odds ratio de síntese sobre a associação para XPD Asp312Asn polimorfismo com o risco de câncer gástrico.

Para o polimorfismo Asp312Asn, como mostrado na Figura 3 Parte B, o único estudo que mais influenciou na estimativas global combinada parecia ser o estudo realizado por Chen Z et al. [28], a análise de sensibilidade, no entanto, indicou moderadamente elevada estabilidade dos resultados dos fatos que as RUP (IC 95%, valor de p) foram 1,48 (1,12-1,97, p = 0,007) antes da remoção desse estudo e 1,32 (1,04-1,70, p = 0,025) após a remoção do referido estudo. Se todos os três estudos-HWE desviado [17], [27], [30] foram removidos, a OR (IC 95%, valor de p) tornou-se 1,56 (1,05-2,33, p = 0,028) para a toda etnia, também indicando moderadamente elevada estabilidade dos resultados (as figuras que ilustram foram omitidas devido ao comprimento do papel).

-análise Meta cumulativa

cumulativos meta-análises de associação polimorfismo XPD Lys751Gln também foram realizados entre os asiáticos e caucasianos através da variedade de tempo de publicação e número total de tamanho da amostra. Como mostrado na Figura 4 Parte A, as inclinações para associações significativas para o polimorfismo XPD Lys751Gln podiam ser vistos entre os asiáticos. Na Figura 4 da parte B as inclinações para associações nulos para polimorfismo XPD Lys751Gln poderia ser notado entre os caucasianos em ordem cronológica. pode ser observada inclinações semelhantes para o polimorfismo Asp312Asn entre diferentes populações de etnia (Figuras não mostrado)

A) entre os asiáticos.; B) entre os caucasianos.

viés de publicação Análise

O viés de publicação foi preliminarmente examinada por parcelas funil qualitativamente e estimada por Begg do e testes de Egger quantitativamente. Por polimorfismo XPD Lys751Gln, o seu gráfico de funil (Figura 5A) mostrou que os pontos quase simetricamente distribuídas, predominantemente dentro de pseudo limites de confiança de 95%. Os valores de P foram 0,428 e 0,989 no teste de Begg e teste de Egger, respectivamente, insinuando sem viés de publicação. Por polimorfismo Asp312Asn, o seu gráfico de funil (Figura 5B) mostrou que os pontos quase simetricamente distribuídas, predominantemente dentro de pseudo limites de confiança de 95%. Os valores de P foram 0,108 e 0,045 no teste de Begg e teste de Egger, respectivamente, insinuando nenhum ou um pouco de viés de publicação

Nota:. trama Funil com pseudo limites de confiança de 95% foi utilizado. A) enredo funil de viés de publicação para o polimorfismo XPD Lys751Gln; B) enredo funil de viés de publicação para o polimorfismo XPD Asp312Asn.

Discussão

Em nossa meta-análise de resultados estatisticamente significativos foram aparentemente observado em asiáticos, mas não em caucasianos tanto para XPD Lys751Gln e polimorfismos XPD Asp312Asn. Também com base nas conclusões de meta-análises cumulativas, as inclinações para associações significativas em asiáticos, tanto para XPD Lys751Gln e polimorfismos XPD Asp312Asn poderia ser obviamente visto quando classificado por tempo de publicação eo tamanho total da amostra. XPD Gln751Gln (CC) e os genótipos Asn312Asn (AA) pode parecer ser mais suscetíveis ao câncer gástrico em asiáticos.

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