Abstract
Devido aos avanços na tecnologia de sequenciamento, antígenos de câncer somaticamente mutados, ou neo-antigénios, agora são prontamente identificáveis e tornaram-se alvos atraentes para a imunoterapia. Em particular, as vacinas alvo-neo-antigénio mostraram promessa em vários estudos pré-clínicos e clínicos. No entanto, até à data, estudos de vacinas alvo-neo-antigénio ter envolvido tumores com cargas excepcionalmente elevadas de mutação. Ainda não está claro se as vacinas alvo-neo-antigénio será amplamente aplicável a cancros com intermediária para encargos de mutação baixos, tais como câncer de ovário. Para resolver isso, avaliamos se um derivado do murino ovário modelo de tumor ID8 poderia ser alvo de vacinas neo-antigénio. Realizamos todo exome e transcriptoma sequenciamento em células ID8-G7. Foram identificadas 92 mutações somáticas, 39 dos quais foram transcritas, mutações missense. Para a parte superior 17 previsto MHC de classe I mutações de ligação, nos ratinhos imunizados por via subcutânea com vacinas de péptidos sintéticos de comprimento que codificam para a mutação relevante. Sete de 17 vacinas induziram respostas de células T CD4 e /ou CD8 T específicas de mutação robustos. No entanto, nenhuma das vacinas prolonga a sobrevivência de ratinhos portadores de tumor em ambos a configuração profilático ou terapêutico. Além disso, nenhuma das linhas de células T específicas de neo-antigénio reconhecido células tumorais ID8-G7
in vitro
, indicando que as mutações correspondentes não deu origem a epítopos
genuíno
MHC-apresentados. Além disso, a análise bioinformática dos dados Cancer Genome Atlas revelou que apenas 12% (26/220) dos casos HGSC tinha uma probabilidade ≥90% de abrigar pelo menos um neo-antigénio autênticos, naturalmente processados e apresentados contra 51% (80/158) de cancros do pulmão. Nossas descobertas destacar as limitações da aplicação de vacinas alvo-neo-antigénio para tipos de tumores com encargos de mutação intermediárias /baixa
Citation:. Martin SD, Brown SD, Wick DA, Nielsen JS, Kroeger DR, Twumasi-Boateng K, et ai. (2016) Baixo Burden mutação no cancro do ovário pode limitar o Utilitário de Vacinas neo-antigénio-visados. PLoS ONE 11 (5): e0155189. doi: 10.1371 /journal.pone.0155189
editor: Ali A. Ashkar, McMaster University, Canadá