Abstract

metabolismo de um carbono (metabolismo do folato) é considerada importante na carcinogênese por causa da o seu envolvimento em reacções de síntese de ADN e de metilação biológicos. Nós investigamos as associações de polimorfismos de nucleotídeo único (SNPs) na via metabólica do folato eo risco de três cancros gastrointestinais em um estudo de caso-controle de base populacional em Taixing City, China, com 218 casos de câncer de esôfago, casos de câncer 206 de estômago, 204 de fígado casos de câncer, e 415 controles populacionais saudáveis. Os participantes do estudo foram entrevistados com um questionário padronizado, e amostras de sangue foram coletadas após as entrevistas. Foram genotipados SNPs do

MTHFR

,

MTR

,

MTRR

,

DNMT1

, e

ALDH2

genes, utilizando PCR- RFLP, SNPlex, ou ensaios de TaqMan. Para ter em conta as comparações múltiplas e reduzir as chances de falsos relatórios, usamos a análise de encolhimento semi-Bayes (SB). Depois de encolhimento e ajuste para possíveis fatores de confusão, encontramos associações positivas entre

MTHFR

rs1801133 e cancro do estômago (qualquer T em relação C /C, SB odds-ratio [sbor]: 1,79, limites posteriores 95%: 1,18, 2.71) e câncer de fígado (sbor: 1,51, 95% dos limites posteriores: 0,98, 2,32). Houve uma associação inversa entre o

rs2228612 DNMT1

e câncer de esôfago (qualquer G contra A /A, sbor: 0,60, 95% dos limites de posteriores: 0,39, 0,94). Além disso, detectamos potencial heterogeneidade entre os estado de consumo de álcool para as RUP relativa

MTRR

rs1801394 para esofágico (homogeneidade posterior

P

= 0,005) e cancro do estômago (homogeneidade posterior

P

= 0,004) e RUP relacionados

MTR

rs1805087 ao câncer de fígado (homogeneidade posterior

P

= 0,021). Entre não-bebedores de álcool, o alelo variante (alelo G) destes dois SNPs foi inversamente associado com o risco destes cancros; enquanto foi observada uma associação positiva entre os bebedores que nunca com o álcool. Os nossos resultados sugerem que os polimorfismos genéticos relacionados com o metabolismo de um carbono pode ser associada com os cancros do esófago, do estômago, e do fígado. Heterogeneidade entre os estado de consumo de álcool das associações entre

MTR

/

MTRR

polimorfismos e estes cancros indica potenciais interações entre consumo de álcool e via metabólica de um carbono

Citation:. Chang SC, Chang PY, Butler B, Goldstein BY, Mu L, Cai L, et al. (2014) Polimorfismos de Nucleotídeo Único de Um Carbono Metabolismo e cânceres de esôfago, estômago e fígado na população chinesa. PLoS ONE 9 (10): e109235. doi: 10.1371 /journal.pone.0109235

editor: Nathan A. Ellis, da Universidade do Arizona, Estados Unidos da América

Recebido: 05 de fevereiro de 2014; Aceito: 09 de setembro de 2014; Publicação: 22 de outubro de 2014

Direitos de autor: © 2014 Chang et al. Este é um artigo de acesso aberto distribuído sob os termos da Licença Creative Commons Attribution, que permite uso irrestrito, distribuição e reprodução em qualquer meio, desde que o autor original ea fonte sejam creditados

Financiamento:. Este trabalho é apoiado em parte pela União Internacional Contra o Câncer (UICC) Transferência de Tecnologia comunhão (ICRETT) atribuído ao Dr. Li-na Mu e pela Fundação para o Autor da National Excelente Tese de Doutorado do PR China, No. 200157, atribuído ao Dr. . Lin Cai. O estudo também foi parcialmente financiado pelo Instituto NIH Nacional de Ciências de Saúde Ambiental, Instituto Nacional do Câncer, do Departamento de Saúde e Serviços Humanos, concede ES06718, ES 011.667, CA09142, bem como o Programa de Pesquisa Alper de Genomics Ambiental da UCLA Jonsson Comprehensive Cancer Center and Clinical Nutrition Research Unit da UCLA. Os financiadores não tiveram nenhum papel no desenho do estudo, coleta de dados e análise, decisão de publicar ou preparação do manuscrito

CONFLITO DE INTERESSES:.. Os autores declararam que não existem interesses conflitantes

Introdução

gastrointestinal (GI) superior cancros são as principais causas de morbidade e mortalidade em todo o mundo. Baseado em GLOBOCAN 2012 estimativas, estômago, fígado e cânceres de esôfago são os quinto, sexto e oitavo cânceres mais comuns, respectivamente, com uma incidência global de cerca de 2.189.829 novos casos de câncer (15,5% do total), e 1,868,700 mortes (22,8 % do total) [1]. A maioria destes casos de câncer (1,694,874 casos, 77,4%) ocorrem em países menos desenvolvidos. China sozinha é responsável por quase metade de todos os cânceres incidente GI (1,023,072 casos, 46,7%) [1].

A continuação da investigação sobre o envolvimento de polimorfismos de nucleotídeo único (SNPs) na etiologia destes três cancros do tracto GI superior tem sido frutífero. De particular interesse são os SNPs localizados dentro dos genes envolvidos no metabolismo do folato [2] – [4]. Folato mantém a estabilidade DNA regulando a biossíntese de DNA, reparo de DNA e de metilação do DNA [5]. Neoplasias podem desenvolver-se quando esta via é desregulada pela depleção de micronutrientes ou através da incorporação de polimorfismos [5]. Várias enzimas estão envolvidas no metabolismo de um carbono, incluindo o metilenotetrahidrofolato redutase (MTHFR), metionina sintase (MTR), metionina sintase redutase (MTRR), metiltransferases de ADN (DNMTs), e aldeído desidrogenase mitocondrial 2 (ALDH2). MTHFR, MTR, e MTRR estão envolvidos na síntese de DNA, e a geração de S-adenosilmetionina (SAM) -a-metil doador universal para reacções de metilação. DNMTs catalisar a metilação do DNA e replicar padrões de metilação. ALDH2 é responsável pela metabolização de acetaldeído gerado durante o metabolismo do álcool. Álcool e acetaldeído pode inibir a absorção de folato e prejudicar a metilação do DNA [6].

O papel do folato e metabolismo de um carbono em cancros do tracto GI superior não é totalmente compreendido. Os estudos em animais forneceram algumas evidências para um efeito de níveis de folato baixos do estresse oxidativo, metilação do DNA, e hepatocarcinogênese [7], [8]; enquanto que a ingestão elevada de folato pode aumentar a metilação do DNA global e reduzir o risco de câncer gástrico [9], [10]. Estudos epidemiológicos sugeriram que os polimorfismos genéticos de genes na via metabólica de um carbono pode modular o risco de cancro esofágico e gástrico [4]. No entanto, os resultados publicados não são conclusivos e limitado em termos do número de genes /polimorfismos sendo investigados. modificação possível por micronutrientes relacionados e fatores de risco conhecidos raramente tem sido explorado. Portanto, considerando a importância do metabolismo de um carbono no desenvolvimento da parte superior do câncer GI, nós examinamos as associações entre oito SNPs nos genes em via metabólica de um carbono e câncer de esôfago, estômago e fígado na população chinesa. Também foi avaliada a heterogeneidade das associações entre os diferentes estratos de micronutrientes plasmáticos (incluindo ácido fólico, vitamina B12 e homocisteína total) e fatores de risco conhecidos para estes cancros.

declaração de Ética Materiais e Métodos

Este estudo foi dispensado pelo conselho de revisão institucional da Universidade da Califórnia em Los Angeles (Certificado isento 02-248).

desenho do estudo e população

a descrição detalhada do desenho do estudo foi publicado anteriormente [11], [12]. Resumidamente, este foi um estudo de caso-controle de base populacional realizado em Taixing, província de Jiangsu, China. casos elegíveis foram pacientes com câncer de esôfago confirmou patologicamente ou clinicamente diagnosticada recentemente (entre 1 de Junho e 30 de dezembro de 2000), o câncer de estômago (entre 1 de Junho e 30 de dezembro de 2000), e câncer de fígado (entre 1 de Janeiro e 30 de junho de 2000) reportados ao Registro de Tumor Taixing CDC. Outros critérios de inclusão, sendo inclusive 20 anos de idade ou mais, em condição médica estável, conforme determinado por um médico, residência em Taixing por 10 anos ou mais, e vontade de participar. Um total de 218 casos de esôfago câncer, 206 casos de câncer de estômago e 204 casos de câncer de fígado participou, representando 67, 65 e 57%, respectivamente, de todos os pacientes com câncer recém-diagnosticados.

Os controles foram selecionados aleatoriamente entre os residentes saudáveis de Taixing da cidade com uma proporção 02:03 frequência correspondente ao grupo caso combinadas em categorias de idade de 5 anos (20-24 a 80-84), sexo e residência (aldeia no município rural ou em um bloco residencial urbano no centro de Taixing Cidade). Há 23 municípios (zonas rurais) e uma cidade central (área urbana) em Taixing City. Cada município rural consiste em 10-12 aldeias, ea área urbana central consiste 10-12 blocos residenciais. Outros critérios de inclusão foram os mesmos que os casos. Um total de 464 controles potenciais foram abordados, e 415 (89,4%) aceitaram participar.

recolha de dados epidemiológicos

Todos os casos e controles recrutados completaram um questionário padrão administrados por entrevistadores treinados. Entrevistas ocorreram tanto nas casas dos participantes, nos hospitais (para casos), ou no escritório do doutor do concelho (para controles). casos de câncer geralmente eram entrevistados no prazo de 6 meses de diagnósticos. O questionário recolheu informações detalhadas sobre fatores demográficos, altura atual e peso, história dietética, história tabagismo, história de beber álcool, hábitos de consumo de chá, história ocupacional, história familiar de câncer e atividades físicas.

ensaios laboratoriais

Cada participante do estudo forneceram uma amostra de sangue periférico 5 ml após suas entrevistas. O ADN foi isolado a partir de coágulos de sangue, utilizando-se o método de fenol-clorofórmio. Os anticorpos da hepatite B ao antigénio de superfície do vírus (HBsAg), os anticorpos IgG para o vírus da hepatite C (VHC), e IgG para cagA-

Helicobacter pylori

(H.

pylori

) foram medidos por enzima-ligada ensaio imunossorvente (ELISA) utilizando kits da Empresa Reagente do Hospital Shanghai de Doenças Infecciosas (Xangai, China), o Shanghai Huamei Empresa Biológica (Xangai, China), ea Companhia Reagente do Biotechnology Industry Park Shanghai (Pudong, Xangai, China), respectivamente. Os níveis plasmáticos de aflatoxina B1 (AFB1) -albumin aduto foram determinadas por ensaio de ELISA, como descrito anteriormente [13], usando aflatoxina livre (Supelco) para os padrões de aflatoxina. Uma comparação entre padrões de aflatoxina livres e ligadas revelou uma relação linear logarítmica, o que nos permite estimar os valores absolutos das amostras. folato plasma e níveis de vitamina B12 foram medidos usando um radioensaio competitivo com folato iodo-125 marcados e cobalto 57 marcado com a vitamina B12 como traçadores (kit radiobinding folato Quantaphase II B12 /, Bio-Rad, CA). homocisteína total de níveis de homocisteína () de plasma foram medidos utilizando um sistema de imunoensaio quimioluminescente comercialmente disponível (IMMULITE 1000 Automated Analyzer, DPC, Los Angeles, CA).

Foram selecionados oito SNPs de

MTHFR

,

MTR

,

MTRR

,

DNMT1

, e

ALDH2

genes, com base nos seguintes critérios: 1) SNPs que são funcionais ou potencialmente funcional (SNPs localizados no codificante, 3 ‘, e 5’ não traduzida regiões); 2) os SNPs anteriormente relatado para ser associada com os cancros do tracto gastrointestinal superior; e 3) SNPs com freqüência do alelo menor de pelo menos 5% no Centro Nacional de Biotecnologia do banco de dados Informação SNP. A genotipagem foi realizada usando o TaqMan (

MTR

rs1805087,

MTRR

rs1532268 /rs1801394, e

ALDH2

rs886205) ou o SNPlex (

DNMT1

rs2228612 e

ALDH2

rs2238151) de ensaio, como descrito anteriormente (Applied Biosystems por Life Technologies, Foster City, CA) [14], ou a análise de PCR-RFLP (

MTHFR

rs1801133 e

ALDH2

rs671) modificado a partir de métodos publicados anteriormente [15], [16]. taxas de chamada genotipagem foram mais de 97% para os métodos TaqMan e PCR-RFLP, e mais de 80% para o ensaio SNPlex. A reprodutibilidade foi de 98% para o ensaio de amostras em duplicado (SNPlex aleatório 3%) [17], e 100% para o ensaio TaqMan (amostras em duplicado aleatória 10%).

A análise estatística

usada teste do qui-quadrado de Pearson para Hardy-Weinberg (HWE) para as distribuições de freqüências genotípicas dos oito SNPs em somente os controles. Testes para HWE entre os controles é um método de controle de qualidade preliminar comumente usado em estudos de associação genética para identificar erros de genotipagem sistemáticas em indivíduos não aparentados. Analisamos cada associação SNP-câncer em modelos genéticos recessivos co-dominante, log-linear, dominante, e, utilizando modelos de regressão logística não condicional para calcular odds ratio (OR) e intervalos de confiança de 95% (IC). Modelos incluídos categorias pareados por idade, sexo, residência (urbana /rural), educação (analfabetismo /escola primária /maior do que ensino médio), índice de massa corporal (IMC, contínua), maços-anos para fumantes (contínuos), frequência de consumo de álcool ( Nunca /ocasionalmente /frequência /todos os dias),

H. pylori

(cancro do estômago; /positivo negativo), estado HBsAg (câncer de fígado; negativos /positivos) níveis de adutos AFB1-albumina e de plasma em quintis (câncer de fígado; quintil estimado: 222,7, 222,7-344,2, 344.2- 442,6, 442,6-588,5, e 588,5 fmol /mg). Para ajustar para efeitos de confusão residuais de idade, que também incluiu o desvio da idade de cada pessoa a partir da idade média em cada categoria de idade [18]. Que advertem que um número de variáveis ​​de ajuste pode ser afectada por variações genéticas, uma vez que estas variáveis ​​ocorrer depois. Na melhor das hipóteses, as nossas estimativas são para efeitos de genótipos diretos, e de outra forma pode ser mais ajustado ou confundidos por fatores incontroláveis ​​que afetam tanto as variáveis ​​de ajuste e os resultados [19]. Assim, fizemos estimativas para efeitos de genótipos direta contra estimativas ajustado apenas para idade e sexo.

Nós ainda realizaram análises estratificadas para verificar a heterogeneidade entre os estratos de micronutrientes ou fatores de risco modificáveis, incluindo micronutrientes plasma (folato, vitamina B12, e tHcy), status, o consumo de álcool fumar, H.

pylori

infecção (cancro do estômago), estado HBsAg (câncer de fígado), e os níveis de AFB1 plasma (câncer de fígado). Utilizou-se os níveis medianos estimados em controlos para dicotomizam níveis plasmáticos de folato (12,76 nmol /L), vitamina B12 (228,88 pmol /L), homocisteína (9,5 umol /L), e AFB1 (388,95 fmol /mg). Utilizou-se o modelo genético dominante, que assumido que o efeito do alelo variante é dominante, se a relação das RUP comparando homozigóticos dos alelos variantes para os heterozigotos era menor do que a comparação heterozigotos para homozigóticos dos alelos comuns; caso contrário, foi utilizado o modelo genética recessiva. Foram avaliados heterogeneidade entre os estratos usando testes de razão de probabilidade, comparando modelos com e sem termos de produto.

Para reduzir os riscos de artefactos de comparações múltiplas e bias-dados esparsos, foi utilizado um Bayes semi-encolhimento (SB) ( penalizado verossimilhança) para estimar os coeficientes de genótipos [20]; as estimativas de odds ratio que relatamos são os antilogs desses coeficientes. estimativa de encolhimento tem sido recomendado extensivamente como um excelente alternativa para Bonferroni na literatura estatística para eliminar artefactos de vários testes em estudos comparativos [21] – [24]. Na estimativa de retracção, em vez de mudar o nível alfa, que regredir ( «encolher») as estimativas para zero a um grau proporcional às suas variâncias estimadas e inversamente proporcional às variações anteriores v. A variância antes desempenha uma papel análogo ao α ajustado -level, em que os valores menores correspondem a mais rigorosa rejeição /critérios de detecção, com α = 0 e v = 0 sendo os limites inferiores de ajustamento em que a rejeição da hipótese nula se torna impossível. No outro extremo, nenhum ajuste ocorre quando se usa o valor original de α ou um valor enorme (efetivamente infinito) para v

.

Em nosso estudo, nós atribuímos uma variação anterior de 0,50 e mediana antes OR = 1 (nenhuma associação) que resulta numa probabilidade de 95% antes de cair dentro do intervalo de 0,25, 4. Isto puxa as associações observadas em relação a hipótese nula ao nível que resultaria se não tivesse sido uma experiência anterior nula observando 4 /v = 8 total de casos e que tinha sido fundida com os dados atuais [20], [25]. Quando foram autorizados, tal como em análises estratificadas diferentes efeitos SNP específico do estrato, a variância antes foi reduzida para 0,25, o que corresponde a uma variação de 0,50 para o coeficiente do produto estrato-SNP (interacção). Para cada estimativa posterior SB, nós fornecemos mais o SB P-valores (unilateral) direcionais, que são equivalentes a probabilidade posterior que a estimativa de ponto está no lado errado do nulo no âmbito do modelo equipada e os priores encolhimento [26], [27].

para resumir as associações dos 8 SNPs para cada um dos três cancros do tracto gastrointestinal superior, construímos uma pontuação polygenetic risco (PRS) [28]. O PRS foi calculada como a soma ponderada do genótipo de risco (ao abrigo modelo dominante ou recessiva como nas análises estratificadas) conta, em que o peso para cada SNP foi determinada pela semi-Bayes log ou de sua associação com cada câncer no modelo totalmente ajustada. PRS só foi estimada entre aqueles com dados genótipo completo sobre todos os 8 SNPs, que incluem 126 casos de esôfago câncer, 125 casos de câncer de estômago, 142 casos de câncer de fígado, e 287 controles. O intervalo (mínimo e máximo de menos) do PRS para cada câncer foi dividido em três categorias igualmente espaçados; esses intervalos foram 0,11-2,05 para câncer de esôfago, de 0 a 1,91 para câncer de estômago, e de 0 a 1,40 para câncer de fígado. Os dados foram analisados ​​usando SAS 9.1.3 (SAS Institute, Cary, NC).

Resultados

Em comparação com controles populacionais, casos de câncer tendem a ser fumantes, tiveram menor IMC e menor escolaridade níveis (Tabela 1). casos de câncer de esôfago e estômago eram mais velhos do que os controles, enquanto os casos de câncer de fígado eram mais jovens. pacientes com câncer de fígado teve a maior relação macho-fêmea de 3,53, e foram mais propensos a consumir álcool; pacientes com câncer de esôfago bebeu com mais frequência do que os outros casos de câncer e controles neste estudo. Para factores de risco específicos para cada local de câncer, não observamos diferentes frequência de

H. pylori

infecção entre pacientes e controles de câncer de estômago. Comparados com os controles, os pacientes de câncer de fígado mostrou uma maior percentagem de HBsAg positivo (65 vs. 25%), anti-HCV positivo (9 vs. 3%), e teve mais elevados níveis plasmáticos de adutos AFB1-albumina (30 vs. 20% no a 5

th quintil)

a Tabela 2 apresenta as estimativas de odds-ratio SB (sbor) para cada associação SNP-cancro dos oito SNPs.; Tabela S1, S2, S3, S4, S5, S6 mostra associações estratificadas e Figura 1 resume os resultados selecionados. distribuições genotípicas entre controles apareceu compatível com Hardy-Weinberg, exceto possivelmente para

DNMT1

rs2228612, que tinha

P

= 0,010, abaixo do nível de alfa tradicional de 0,05, mas maior do que o Bonferroni- nível alfa ajustada de 0,05 /8 = 0,006 (teste de todos os oito SNPs). No entanto, notamos que a adequação viés Maio controla longe de equilíbrio se os fatores correspondentes estão associados tanto com o SNPs e câncer.

associações semi-Bayes-específica estrato seleccionados entre SNPs em

MTHFR

,

MTR

,

MTRR

,

DNMT1

,

ALDH2

e suscetibilidade ao câncer gastrointestinal superior, por níveis plasmáticos de micronutrientes (folato, vitamina B12, e homocisteína) e fatores ambientais (fumar, beber álcool, H.

pylori

estatuto CagA, estado HBsAg, e os níveis plasmáticos de adutos AFB1-albumina). Semi-Bayes OR ajustadas (sbor) e limites posteriores 95% estavam sob modelos genéticos dominantes, exceto para o sbor relativa

ALDH2

rs671to câncer de esôfago, onde foi utilizado modelo genético recessivo.

P

* denota

P

-valor para o teste de homogeneidade.

Temos relatado anteriormente associações positivas do alelo T do

MTHFR

rs1801133 com o estômago e câncer de fígado [11], [12]. Na presente análise, estas associações permaneceram aparente após o ajuste para fatores de confusão e SB encolhimento (qualquer sbor T em relação C /C, totalmente ajustado: 1,79, 95% dos limites posteriores: 1,18, 2,71 para o câncer de estômago; sbor: 1,51, 95% dos limites posteriores: 0,98, 2,32 para câncer de fígado). Na análise estratificada SB, a associação entre o

rs1801133 e câncer de estômago MTHFR

apareceu mais forte entre os indivíduos que tinham níveis de folato no plasma mais baixos, maior plasma vitamina B12 ou níveis de homocisteína, e entre os fumantes (Figura 1). Não houve associação clara do

MTHFR

rs1801133 com câncer de esôfago (Tabela 2 e quadros S1, S2, S3, S4, S5).

Enquanto não houve associação global clara entre SNPs em

MTR

e

MTRR Comprar e qualquer tipo de câncer no principal efeito análises (Tabela 2), a heterogeneidade de associação foi sugerida em estratificada análises sobre o consumo de álcool, incluindo associações de

MTR

rs1805087 com câncer de fígado (homogeneidade

P

= 0,021), e

MTRR

rs1801394 com tanto esofágico (homogeneidade

P

= 0,005) e cancro do estômago (homogeneidade

P

= 0,004). Enquanto G portadores do alelo de

MTR

rs1805087 foram inversamente associados com câncer de fígado entre os não-bebedores (sbor: 0,57, 95% dos limites posteriores: 0,31, 1,04), eles foram positivamente associados com câncer de fígado entre os bebedores (sbor: 1,48, 95% limites posteriores: 0,85, 2,57) (Figura 1). Da mesma forma, os portadores do alelo G de

MTRR

rs1801394 foram inversamente associado com o esôfago e câncer de estômago entre os não-bebedores (sbor: 0,59, 95% dos limites de posteriores: 0,37, 0,94 para câncer de esôfago; sbor: 0,49, 95% posteriores limites: 0,30, 0,79 para o câncer de estômago), mas positivamente associado com câncer entre os bebedores (sbor: 1,56, limites posteriores 95%: 0,95, 2,56 para câncer de esôfago; sbor: 1,39, limites posteriores 95%: 0,83, 2,32 para câncer de estômago) ( . Figura 1)

Para

DNMT1

polimorfismo, rs2228612 foi inversamente associado com câncer de esôfago no modelo genético dominante (qualquer G contra a /a, sbor: 0,60, 95% dos limites posteriores: 0,39 , 0,94) (Tabela 2). Entre três

ALDH2

SNPs, rs671 foi associada com câncer de esôfago no modelo genética recessiva (A /A versus qualquer G, sbor: 1,76, 95% dos limites posteriores: 0,96, 3,24). Nas análises ajustadas estratificadas,

ALDH2

rs671 apareceu associado com câncer de esôfago entre os indivíduos com níveis de folato no plasma inferior (A /A contra qualquer G, sbor: 2,12, 95% dos limites posteriores: 1,01, 4,44) (Figura 1) .

ALDH2

rs2238151 apareceu inversamente associado com câncer de fígado quando se comparam os portadores do alelo T para aqueles com o genótipo C /C (idade e sbor ajustada ao sexo: 0,47, 95% dos limites posteriores: 0,24, 0,92). Enquanto nós não encontrou associações entre

ALDH2

rs886205 e câncer susceptibilidade no principal efeito análises, sbor específicas do estrato sugeriu que

ALDH2

rs886205 foi positivamente associado com câncer de estômago entre os participantes com maior plasmáticos de vitamina B12 níveis (sbor: 1,87, 95% dos limites posteriores: 1,09, 3,20) (Figura 1)

com exceção de análise em modelos SNP individuais, também fizemos a análise SNPs conjunta incluindo todos os 8 SNPs em um modelo. (Tabela 3). Os resultados da análise SNPs conjunta sugeriu associações similares como nos modelos SNP individuais, mas os intervalos posteriores 95% eram mais largas.

A análise sobre PRS sugeriu aproximadamente uma duplicação das probabilidades para o esôfago e fígado cancros entre indivíduos na categoria mais alta PRS em comparação com aqueles na categoria mais baixa (sbor: 2,06; 95% limites posteriores: 1,13, 3,77 para o cancro esofágico e sbor: limites posteriores 2,09, 95%: 1,05, 4,17 para câncer de fígado), com um pouco menos a consistência entre as categorias para o câncer de estômago. Na análise PRS contínua, os resultados sugerem uma duplicação de probabilidades para os três cancros do tracto GI superior, com uma unidade (no registo OU) aumento do PRS (Tabela 4). Alertamos, porém, que analisa PRS não conta para a construção pontuação a partir dos dados e, portanto, pode superestimar os efeitos e subestimam a variabilidade nas estimativas resultantes.

Discussão

Foram examinadas as associações entre oito SNPs em genes envolvidos na via metabólica de um carbono e a susceptibilidade do esófago, do estômago, e cancros do fígado, numa população chinesa. Depois de aplicar métodos de encolhimento SB e controlando para possíveis fatores de confusão, observou-se que qualquer genótipo T de

MTHFR

rs1801133 foi positivamente associado com ambos estômago e câncer de fígado. Encontramos também uma associação inversa entre a variante G alelo do

rs2228612 e câncer de esôfago DNMT1

. Além disso, nosso estudo sugere variações potenciais ou através de estratos de consumo de álcool, incluindo associações de

MTRR

rs1801394 com esôfago e do estômago, e

MTR

rs1805087 com câncer de fígado. As probabilidades para cancros do tracto GI superior foram praticamente dobrou para os participantes chineses com uma unidade (em log OR) aumento de PRS.

Em metabolismo de um carbono, MTHFR irreversivelmente catalisa a conversão de 5,10-metilenotetrahidrofolato (5, 10-methyleneTHF) de 5-metiltetrahidrofolato (5-metilTHF). A 5,10-methyleneTHF é essencial na síntese de timidilato e purinas, e 5-metilTHF é um co-substrato para remetilação de homocisteína a metionina, o qual é ainda convertido para SAM para reacções de metilação [5]. O

MTHFR C677T

(rs1801133) polimorfismo, o que resulta em uma alanina para valina substituição, conduz a actividade da enzima MTHFR reduzida [29], diminuiu-5 metilTHF e uma acumulação de 5,10-methyleneTHF nas células vermelhas do sangue [30].

baixa atividade MTHFR está associado com aumento do risco de câncer devido à baixa de sangue 5-metilTHF e metilação do DNA prejudicada. Inversamente, poderia reduzir o risco de cancro através do aumento da disponibilidade de 5,10-methyleneTHF para a síntese de ADN normal e evitando incorporação errada de uracilo e quebra de cromossomas [5]. Embora as evidências em apoio dessas hipóteses é fraca e inconsistente [5], um

in vitro

estudo sugere que o efeito de

MTHFR rs1801133

sobre a estabilidade DNA e metilação é específico do local e pode depender na disponibilidade de folato [31]. Quando a oferta de ácido fólico é adequado ou alto, o alelo T do

MTHFR

está associada ao aumento da metilação do DNA genômico em células cancerígenas do cólon, mas diminuiu a metilação do DNA em células de câncer de mama. Quando a oferta de ácido fólico é limitado, esta variante está associada a metilação diminuída e inalterada DNA em células do cólon e do cancro da mama, respectivamente [31]. Uracila misincorporation é diminuída em células cancerígenas do cólon que expressa o

MTHFR

alelo T, e aumentou em células de câncer de mama que expressam a mesma variante [31]. Esta diferença site-specific pode explicar em parte a diferença no risco de câncer associado ao

MTHFR

polimorfismo rs1801133 [4]. Em estudos epidemiológicos, o alelo T aparece para diminuir o risco de colorrectais e da mama [32], [33], mas aumentar o risco de cancro do esófago, estômago, fígado, bexiga, colo do útero e pulmão [2] – [4], [34] – [36]

na presente análise usando SB encolhimento, confirmamos nossas descobertas anteriores de associações positivas entre o alelo T do

rs1801133 e câncer de MTHFR

. o estômago e fígado nesta população Taixing [11], [12], o que implica que a perturbação de metilação de ADN resultante desta variante desempenha um papel importante na carcinogénese do fígado e estômago. Meta-análises recentes relataram associações semelhantes (T /T em relação C /C, OR: CI 1,40, 95%: 1,19-1,66 para câncer de estômago; OR: 1,21, 95% CI: 0,95-1,56 para câncer de fígado) [3], [4]. Além disso, Zacho et ai. [4] relatou uma associação maior entre a

rs1801133 MTHFR

e câncer de estômago entre as populações de estudo sem fortificação com ácido fólico (OR: CI 1,60, 95%: 1,36-1,88), em comparação com aqueles com fortificação (OR: 1,15 , 95% CI: 0,81-1,63), que é semelhante à nossa descoberta de uma associação mais forte entre os indivíduos com menores níveis de folato no plasma. Para o câncer de esôfago, nossos dados sugerem um aumento do risco entre os

MTHFR

portadores rs1801133 T alelos (qualquer T vs. C /C, sbor: 1,25, limites posteriores 95%: 0,85, 1,84), o que é consistente com os resultados a partir de uma meta-análise de 19 estudos (C /T em relação C /C, OR: 1,47, 95% CI: 1,32-1,63; T /T em relação C /C, OR: 1,69, 95% CI: 1,49-1,91) [ ,,,0],2].

MTR e MTRR são dois outros importantes enzimas envolvidas no metabolismo de um carbono. MTR catalisa a metilação de homocisteína a metionina.

MTR

A2756G (rs1805087), um SNP comum que conduz à substituição do ácido aspártico com glicina, tem sido largamente estudado. No entanto, há associações aparentes foram observadas com câncer nos seguintes sites: pulmão, próstata, cabeça e pescoço, bexiga, esôfago, estômago, mama ou do cólon e do reto [37] – [46]. MTRR regenera um MTR funcional através de metilação redutora. Dois polimorfismos comuns,

MTRR

A66G (rs1801394, converte isoleucina em metionina) e C524T (rs1532268, muda serina para leucina), foram indicados para regenerar MTR menos eficiente [47]. G portadores do alelo de

MTRR

rs1801394 têm sido associados com risco aumentado de carcinoma hepatocelular (HCC) [48]. Por outro lado, as associações são incompatíveis com outras doenças malignas, incluindo o carcinoma de células escamosas do esôfago (ESCC), câncer de estômago e câncer colorretal [37], [44], [49] – [53]. A maioria dos estudos que investigaram

MTRR

rs1532268 relataram nenhuma associação com colorectal, gástrico, de mama e câncer de pulmão [44], [51], [53] – [56]. Deve-se ter em mente, contudo, que as incoerências e relatos de nenhuma associação aparentes, pode refletir apenas esperava variação no

P

-Valores ( “significância estatística”) em vez de quaisquer conflitos reais.

O nosso estudo observou variação odds-ratio das associações entre estes

MTR

/

MTRR

polimorfismos e cancros do tracto gastrointestinal superior em todo o consumo de álcool, mesmo depois conservadora encolhimento SB. O consumo de álcool parece ter modificado odds-ratios relativos

MTR

rs1805087 ao câncer de fígado, e

MTRR

rs1801394 de esôfago e câncer de estômago. portadores do alelo G destes dois SNPs foram associados positivamente com câncer entre os bebedores, e inversamente associado com câncer entre os não-bebedores. . Matsuo et al, observou um similar ou variação [57]: G /L portadores do genótipo de

MTR

rs1805087 apresentaram maior risco de câncer colorretal entre os bebedores de álcool e menor risco entre os não-bebedores. Embora o efeito funcional do

MTR /MTRR

polimorfismos não foi estabelecida, nossos resultados são biologicamente plausível que o álcool pode perturbar o metabolismo de um carbono por inibir a absorção de folato, suprimindo a síntese de SAM, e prejudicando a metilação do DNA [6]. O álcool também pode causar a inibição da actividade de metionina sintase [6]. Portanto, é possível que o alelo variante destes dois

MTR /MTRR

polimorfismos é protectora para os cancros do tracto gastrointestinal superior no ambiente sem a exposição do álcool. No entanto, torna-se prejudicial quando o metabolismo de um carbono é interrompida por álcool e seus metabolitos.

ALDH2 está envolvida no metabolismo do álcool por oxidação do acetaldeído, um grupo 2B carcinógeno humano, para o ácido acético.