Abstract

Fundo

A identificação de biomarcadores sensíveis para a detecção de câncer de ovário é de alta relevância clínica para a detecção e /ou monitoramento de recorrência da doença mais cedo. Nós desenvolvemos uma estratégia de descoberta de biomarcadores de várias etapas sistemática e verificação para identificar marcadores metilação do DNA candidato para a detecção baseada em sangue de câncer de ovário.

Metodologia /Principais Achados

Nós usamos a plataforma Illumina Infinium analisar o estado de metilação do DNA de 27,578 locais CpG em 41 tumores ovarianos. Foi utilizada a estratégia de seleção marcador que enfatizou sensibilidade ao exigir a coerência da metilação em todo tumores, ao conseguir especificidade pela exclusão de marcadores com metilação em leucócitos controlo ou DNA soro. A nossa estratégia de verificação envolvidos testando a capacidade dos marcadores identificados para monitorar a carga da doença em amostras de soro colhidas em série de pacientes com câncer ovariano que haviam sido submetidos a ressecção cirúrgica do tumor em comparação com os níveis de CA-125.

Foram identificados um marcador,

IFFO1

metilação do promotor (IFFO1-M), que é frequentemente metilado em tumores do ovário e que raramente é detectada no sangue dos controlos normais. Quando testado em 127 soros colhidos em série de pacientes com câncer ovariano, IFFO1-M mostrou cinética pós-ressecção significativamente correlacionada com soro CA-125 medições em seis de 16 pacientes.

Conclusões /Significado

Nós implementado um marcador de rastreio e estratégia de verificação eficaz, que conduz à identificação de IFFO1-M como um marcador candidato à base de sangue para detecção sensível de cancro do ovário. Os níveis séricos de IFFO1-M exibida cinética pós-ressecção consistentes com uma reflexão da carga de doença. Prevemos que outros marcadores candidatos emergentes a partir desta linha de desenvolvimento marcador IFFO1-M e pode fornecer capacidades de detecção da doença que complementam biomarcadores existentes

Citation:. Campan M, Moffitt M, Houshdaran S, Shen H, Widschwendter M, Daxenbichler L, et ai. (2011) Tela Genoma-Scale for DNA metilação-Based detecção de marcadores para o cancro do ovário. PLoS ONE 6 (12): e28141. doi: 10.1371 /journal.pone.0028141

editor: Jörg D. Hoheisel, Deutsches Krebsforschungszentrum, Alemanha