Como discutido anteriormente, acredita-se que a síndrome do intestino irritável ser causada pelo comportamento não natural (disfunção) dos músculos de órgãos do tracto gastrointestinal ou os nervos que controlam os órgãos. Os nervos que controlam o tracto gastrointestinal, no entanto, é de facto muito complexo. Existe um sistema de nervos que correm thefull comprimento do tracto gastrointestinal, desde o esófago até o ânus nas paredes musculares dos órgãos. Estes nervos estão ligados a outros nervos que viajam de e para a medula espinhal. Nervos da medula espinhal, por sua vez, as viagens para e a partir do cérebro. (O tracto gastrointestinal é ultrapassado na quantidade de nervos tem apenas pela medula espinal e do cérebro). Deste modo, o processo não natural do sistema nervoso, em IBS pode ocorrer em um o cérebro, o órgão muscular gastrintestinal, ou a medula espinhal. O sistema de nervos que está no controle dos órgãos gastrointestinais, como acontece com a maioria dos outros órgãos, contém nervos motor e sensorial. Os nervos sensoriais são continuamente sentindo o que está acontecendo dentro do órgão e envia essa informação para os nervos na parede do órgão. A partir daí, a informação pode ser enviada para o cérebro através da medula espinal. Toda esta informação é recebida e processada na medula espinal, cérebro ou na parede do órgão. Em seguida, com base nesta entrada sensorial e a forma como a entrada é processado, as respostas são enviadas para o órgão ao longo dos nervos motores. Duas das respostas motoras mais característicos do intestino são contracção ou relaxamento do músculo do órgão e a secreção de muco e /ou fluido para dentro do órgão. função anormal dos nervos dos órgãos gastrointestinais, como mencionado acima, pelo menos teoricamente, poderia ocorrer no cérebro, a espinal medula ou o órgão. Além disso, as anormalidades que poderia acontecer no cérebro, os nervos motores, ou em centros de processamento no intestino, ou os nervos sensoriais. Alguns cientistas afirmam que a causa de qualquer doença funcional é anomalias na função dos nervos motores. Como um exemplo, os comandos anormais através dos nervos motores pode produzir um espasmo doloroso dos músculos. No entanto, outros vão argumentar que os centros de processamento anormalmente funcionamento são responsáveis ​​por doenças funcionais porque eles interpretam mal as sensações normais ou retransmitir sinais incomuns para o órgão. De facto, algumas doenças funcionais pode ser devido ao motor e /ou disfunção sensorial. Alguns outros podem ser causadas por anormalidades no processamento centres.Other pessoas estudando argumentam que a causa de doenças funcionais é anormalidades na função dos nervos sensoriais. As actividades normais, por exemplo, a expansão do intestino delgado por alimentos, podem dar origem a sinais sensoriais não naturais que são transmitidas para o cérebro através da medula espinal, onde eles são identificados como dor. Uma área que agora está recebendo muita atenção científica é o papel potencial do gás produzido pelas bactérias intestinais em pessoas com IBS. Estudos têm demonstrado que as pessoas com a síndrome do intestino irritável produzir maiores quantidades de gás do que os indivíduos que não sofrem de SII, e o gás é possivelmente retidas por mais tempo no intestino delgado. Em pacientes com a síndrome do intestino irritável, o aumento do volume abdominal ao longo do dia, atingindo um máximo, à noite e retornando à linha de base até a manhã seguinte. Em indivíduos que não têm IBS, não há nenhum aumento da sua dimensão abdominal durante o dia. Tem havido muita controvérsia sobre o papel que a má digestão e /ou absorção de açúcares na dieta pode desempenhar no agravamento dos sintomas de IBS. Má digestão da lactose, é muito comum como é má absorção de frutose, um adoçante encontrado em muitos alimentos processados. Má digestão destes açúcares podem também agravar os sintomas de IBS desde açúcares não absorvidas muitas vezes causar o aumento da formação de gás. Apesar destas anormalidades na produção de gás de transporte e pode dar origem a alguns dos sintomas da SII, muito mais trabalho precisa ser feito antes torna-se claro que o gás intestinal desempenha um papel na IBS.Dietary gordura em indivíduos saudáveis ​​provoca alimentos bem como gás mover-se mais lentamente através do sistema digestivo. Algumas pessoas que sofrem de síndrome do intestino irritável pode até responder a gordura na dieta de uma forma extrema com maior lentidão. Assim, a gordura na dieta poderia e, possivelmente, não agravar os sintomas da síndrome do intestino irritável.