PLOS ONE: O Proteomics de câncer colorretal: Identificação de uma assinatura proteína associada à Prognóstico

Abstract

O câncer colorretal é um dos mais comuns tipos de câncer e não há requisito para a identificação de biomarcadores de prognóstico. Neste proteína estudo perfis de expressão foram estabelecidas para o cancro colo-rectal e mucosa do cólon normal, proteômica usando uma combinação de electroforese em gel bidimensional com cortes frescos congelados de câncer emparelhado Dukes B-rectal e mucosa colorretal normal (n = 28), análise de imagem gel e cromatografia líquida de alta eficiência-espectrometria de massa. análise de agrupamento hierárquico e análise de componentes principais mostrou que os perfis de cancro colo-rectal e mucosa do cólon normal de expressão de proteínas agrupadas em padrões distintos de expressão da proteína. Quarenta e cinco proteínas foram identificadas como apresentando, pelo menos, 1,5 vezes o aumento da expressão em cancro colorectal e a identidade destas proteínas foi confirmada por espectrometria de massa em tandem cromatografia de líquido. Quinze proteínas que mostraram aumento da expressão foram validados por imuno-histoquímica utilizando um tissue microarray câncer colorretal bem caracterizado contendo 515 primária do câncer colorretal, 224 linfonodo metástases e 50 amostras de mucosa do cólon normais. As proteínas que apresentaram o maior grau de sobre-expressão em cancro colo-rectal primário em comparação com a mucosa de cólon normal foram a proteína de choque térmico 60 (p 0,001), S100A9 (p 0,001) e a proteína de tumor em translação controlada (p 0,001). Análise de proteínas identificadas individualmente 14-3-3β como um biomarcador de prognóstico (χ

2 = 6,218, p = 0,013, HR = 0,639, IC 95% 0,448-0,913). análise de agrupamento hierárquico identificado fenótipos distintos associados à sobrevida e uma assinatura de duas proteínas que consiste em 14-3-3β e aldeído desidrogenase 1 foi identificado como mostrando significância prognóstica (χ

2 = 7,306, p = 0,007, HR = 0,504, 95 CI% 0,303-0,838) e que se manteve independentemente de prognóstico (CI p = 0,01, HR = 0,416, 95% ,208-,829) em um modelo multivariado

Citation:. O’Dwyer D, Ralton LD, O ‘ Shea a, Murray GI (2011) As Proteomics de câncer colorretal: Identificação de uma assinatura proteína associada ao prognóstico. PLoS ONE 6 (11): e27718. doi: 10.1371 /journal.pone.0027718

Autor: Christina Lynn Addison, Instituto de Pesquisa Hospital Ottawa, Canadá

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