PLOS ONE: Correção: identificação de genes do piloto Câncer druggable amplificados através TCGA Datasets

Aviso de Republicação

Este artigo foi republicado em 18 de agosto de 2014, porque dois dos 16 conjuntos de dados de TCGA (The Cancer Genome Atlas) incluídos neste estudo, ou seja, o cancro do colo do útero (moratória – 27 de setembro de 2014) e pâncreas adenocarcinoma ductal (moratória – 30 de julho de 2015), foram utilizados contrária às Normas de Publicação na https://cancergenome.nih.gov/publications /publicationguidelines

os autores eo TCGA concordaram que uma republicação do artigo com esses conjuntos de dados removidas poderia resolver isso, e os funcionários do editor Académica e PLOS estão satisfeitos que os resultados e conclusões do artigo ficar sem estes dois conjuntos de dados. Nós está republicando o artigo para relatar os resultados obtidos a partir dos 14 conjuntos de dados permitidos

O resumo dos resultados no resumo foi anteriormente:.

Foram realizadas análises GISTIC2 de conjuntos de dados, abrangendo 16 TCGA subtipos de cancro e identificou 486 genes que foram amplificados em dois ou mais conjuntos de dados. A lista foi reduzida para 75 genes associados ao câncer com potenciais propriedades “druggable”. A maioria dos genes foram localizados a 14 amplicões espalhados por todo o genoma. Para identificar genes potenciais motorista câncer, analisamos número de cópias do gene e expressão de mRNA de dados a partir de amostras de pacientes individuais e identificados 42 genes motorista câncer putativos ligado a diversos processos oncogênicos

O resumo dos resultados no resumo é agora.:

foram realizadas análises de conjuntos de dados GISTIC2 TCGA abrangendo 14 subtipos de câncer e identificou 461 genes que foram amplificados em dois ou mais conjuntos de dados. A lista foi reduzida para 73 genes associados ao câncer com potenciais propriedades “druggable”. A maioria dos genes foram localizados a 13 amplicões espalhados por todo o genoma. Para identificar genes potenciais motorista câncer, analisamos número de cópias do gene e expressão de mRNA de dados a partir de amostras de pacientes individuais e identificados 40 genes motorista câncer putativos ligados a diversos processos oncogênicos.

Referência

1. Chen Y, McGee J, Chen X, Doman TN, Gong X, et al. (2014) Identificação de genes do piloto Cancer druggable amplificados através TCGA conjuntos de dados. PLoS ONE 9 (5): doi e98293: 10.1371 /journal.pone.0098293.

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Citação: O

PLOS ONE

Pessoal ( 2014) Correção: identificação de genes do piloto Cancer druggable amplificados através TCGA conjuntos de dados. PLoS ONE 9 (9): e107646. doi: 10.1371 /journal.pone.0107646

Publicação: 02 de setembro de 2014

Direitos de autor: © 2014 A PLOS ONE Staff. Este é um artigo de acesso aberto distribuído sob os termos da Licença Creative Commons Attribution, que permite uso irrestrito, distribuição e reprodução em qualquer meio, desde que o autor original ea fonte sejam creditados.

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