PLOS ONE: Associação de DSC3 mRNA Regulação para Baixo no cancro da próstata com hipermetilação do promotor e de prognóstico reservado

Abstract

Fundo

desmocolina 3 (DSC3), um membro da superfamília gene caderina, está associada a patogênese de alguns cancros, mas o seu papel no câncer de próstata (PCA) permanece largamente desconhecido.

Métodos

nível de expressão do gene DSC3 in disponível conjunto de dados microarray CaP foi examinada usando o banco de dados Oncomine. expressão transcrição DSC3 no painel de linha de células de próstata e uma coorte independente tecido (n = 52) foi estimada por PCR quantitativa (Q-PCR). estatuto epigenética do gene promotor DSC3 em CaP foi investigada por meio do upload de três conjunto de dados (envio de dados de matriz Infinium 450K e dois sequenciamento metilação) no navegador genoma UCSC. Enquanto pyrosequencing análise mediu a metilação do DNA promotor, as estimativas de Q-PCR foram obtidas para DSC3 transcrição re-expressão depois de 5-aza-desoxicitidina (5-Aza) de tratamento. relevância clínica de expressão DSC3 foi estudada por análise de sobrevivência de Kaplan-Meier. Finalmente, a proliferação de células de monitorização estudos funcionais, migração e invasão foram realizadas em linhas de células de próstata após knockdown DSC3 siRNA mediada ou na sequência de 5-aza induzida re-expressão. marcadores EMT vimentina e expressão de E-caderina foi medida por Western Blot. As análises

Resultados

Os dados Microarray revelou uma diminuição significativa na expressão transcrição DSC3 em APC, em comparação com amostras benignas. análise Q-PCR de uma coorte independente revelou DSC3 transcrição para baixo-regulação, tanto em linhas de células APC e tecidos tumorais, mas não em seu homólogo benigna. O exame dos dados NGS e Infinium disponíveis identificado um papel para a regulação epigenética redução mRNA DSC3 em CaP. Pyrosequencing confirmou o aumento da metilação do promotor DSC3 em linhas celulares de cancro e restauração de expressão transcrição mediante tratamento com 5-Aza corroborada este mecanismo de silenciamento epigenético. É importante salientar análise de Kaplan-Meier de uma coorte resultado mostrou uma associação entre a perda de expressão DSC3 e aumentou significativamente o risco de recorrência bioquímica. estudos funcionais indicam um papel para a transição epitelial-mesenquimal em DSC3 regulamentada migração celular /invasão.

Conclusão

Em conjunto, nossos dados sugerem que a metilação do DNA contribui para a regulação negativa de DSC3 no cancro da próstata e perda de DSC3 prevê mau resultado clínico

Citation:. Pan J, Chen Y, Mo C, Wang D, Chen J, Mao X, et al. (2014) Associação de DSC3 mRNA Regulação para Baixo no cancro da próstata com hipermetilação do promotor e mau prognóstico. PLoS ONE 9 (3): e92815. doi: 10.1371 /journal.pone.0092815

editor: Robert Dante, Institut national de la santé et de la recherche médicale, França

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