PLOS ONE: Interacções entre dieta, estilo de vida e IL10, IL1B e PTGS2 /COX-2 Gene Polimorfismos em relação ao risco de câncer colorretal em um estudo prospectivo dinamarquesa Case-Cohort Study

Abstract

Fundo Visa

dieta contribui para o desenvolvimento do cancro colo-rectal e podem ser potencialmente modificada. Queríamos identificar os mecanismos biológicos carcinogênese colorretal subjacente através de uma avaliação das interações dieta-gene.

Métodos

Os polimorfismos

IL10

C-592A (rs1800872), C-rs3024505 -T,

IL1B

C-3737T (rs4848306), G-1464C (rs1143623), T-31C (rs1143627) e

PTGS2

(que codificam COX-2) A-1195G (rs689466) , G-765c (rs20417), e T8473C (rs5275) foram avaliados em relação ao risco de câncer colorretal (CRC) e interação com dieta (carne vermelha, peixe, fibras, cereais, frutas e legumes) e estilo de vida (não-esteróides anti-inflamatório uso de drogas e tabagismo) foi avaliada em um estudo de caso-coorte aninhada de novecentos e setenta casos CRC e 1789 participantes selecionados aleatoriamente a partir de um estudo prospectivo de 57,053 pessoas.

resultados

IL1B

C-3737T, G-1464C e

PTGS2

genótipos variantes T8473C foram associados com risco de CRC em comparação com o genótipo homozigoto de tipo selvagem (IRR = CI 0,81, 95%: 0,68-0,97 , p = 0,02, e TIR = 1,22, IC 95%: 1,04-1,44, p = 0,02, Cl = 0,75 TIR, 95%: 0,57-0,99, p = 0,04, respectivamente). Foram observadas interações entre dieta e

IL10

rs3024505 (P-valor para a interação (P

int); carne = 0,04, peixes = 0,007, fibra = 0.0008, legumes = 0,0005), C-592A (P

int; fibra = 0,025),

IL1B

C-3737T (p

int, legumes = 0,030, o uso de NSAID = 0,040) e

PTGS2

genótipos G-765c (P

int; carne = 0,006, fibra = 0,0003, frutas 0,004), e T8473C (P

int; carne 0,049, fruto = 0,03) e A-1195G (P

int; carne 0,038, fibra de 0,040, frutas = 0,059, vegetais = 0,025, o tabagismo atual e = 0,046).

Conclusões

determinada geneticamente baixo COX-2 e alta atividade de IL-1β foram associados com risco aumentado de CRC nesta norte coorte caucasiano. Além disso, foram observadas interações entre

IL10

,

IL1B

, e

PTGS2 Comprar e fatores de dieta e estilo de vida em relação ao CRC. O presente estudo demonstra que as interações gene-ambiente podem identificar genes e fatores ambientais envolvidos na carcinogênese colorretal

Citation:. Andersen V, Holst R, Kopp TI, Tjønneland A, Vogel U (2013) Interações entre dieta, estilo de vida e

IL10, IL1B

, e

PTGS2 /COX-2

Gene Polimorfismos em relação ao risco de câncer colorretal em um estudo dinamarquês case-coorte prospectivo. PLoS ONE 8 (10): e78366. doi: 10.1371 /journal.pone.0078366

editor: Xiaoping Miao, MOE chave do Laboratório de Ambiente e Saúde, Escola de Saúde Pública, Tongji Medical College, Huazhong Universidade de Ciência e Tecnologia, China

Recebido: 05 de agosto de 2013; Aceito: 20 de setembro de 2013; Publicação: 23 de outubro de 2013

Direitos de autor: © 2013 Andersen et al. Este é um artigo de acesso aberto distribuído sob os termos da Licença Creative Commons Attribution, que permite uso irrestrito, distribuição e reprodução em qualquer meio, desde que o autor original ea fonte sejam creditados

Financiamento:. Este trabalho foi financiado pelo Hospital of Southern Jutland. Os financiadores não tiveram nenhum papel no desenho do estudo, coleta de dados e análise, decisão de publicar ou preparação do manuscrito

CONFLITO DE INTERESSES:.. Os autores declararam que não existem interesses conflitantes

Introdução

o câncer colorretal (CRC) é um dos cancros mais comuns no mundo ocidental [1]. incidência crescente sugere que os fatores de estilo de vida estão profundamente envolvidos na etiologia da CRC e, que a modificação desses fatores podem afetar o risco [2]. A avaliação das interações gene-ambiente fornece uma ferramenta para a compreensão dos processos biológicos subjacentes pelo qual a dieta afeta a carcinogênese colorretal [3-5]. Este tópico foi recentemente revisto [6].

inflamação intestinal crônica é um fator de risco conhecido para o CRC [7]. Dieta e estilo de vida factores podem afectar a inflamação intestinal de muitas maneiras, directa ou indirectamente. A carne, por exemplo, tem sido encontrado para afectar a homeostase intestinal e.g. pela ativação de receptores de reconhecimento padrão, tais como receptores toll-like (TLRs) [8]. Além disso, a carne é uma fonte de N-6 ácidos gordos poli-insaturados (PUFA), que podem ser submetidos a conversão metabólica do ácido araquidónico a prostaglandinas e predominantemente pró-inflamatórias [9]. O peixe é uma fonte de AGPI n-3, o que pode modificar a inflamação [10]. Além disso, a fibra dietética a partir de vegetais, frutos e cereais são convertidos por bactérias do cólon de ácidos gordos de cadeia curta (SCFA), que foram encontrados para afectar a inflamação intestinal em várias formas, incluindo a estimulação da produção de IL-10 [11].

IL-10, IL-1β e COX-2 (codificada pelo

IL10

,

IL1B

, e

PTGS2

, respectivamente), são importantes mediadores da inflamação intestinal. Ambos SCFA e activação de TLR foram encontrados para afectar a produção de IL-10 e IL-1β e, assim, a activação de COX-2 [11,12]. IL-10 é uma citocina anti-inflamatória chave orquestração da resposta imune inata e adaptativa. IL-10 – /- murganhos desenvolvem colite e adenocarcinomas colorrectais, subsequentemente, [13]. IL-1β é uma citocina pró-inflamatória e variação genética em

IL1B

tem sido associado com o risco de câncer de pulmão e mieloma múltiplo [14,15]. Uma função fundamental da COX-2 na carcinogénese colorrectal é sugerida pela descoberta de que o uso a longo prazo dos inibidores COX-2 (Coxib) foi encontrado para conferir protecção contra o CRC em alguns estudos [16].

O uso de polimorfismos funcionais tem a vantagem de que os resultados podem permitir a interpretação dos percursos biológicos envolvidos na carcinogénese colorrectal.

Temos anteriormente avaliada dieta e

IL10

interações genéticas em uma coorte dinamarquesa prospectivo de trezentos e setenta e oito casos de CRC e um grupo de comparação de 775 participantes [17]. Nós não encontramos nenhuma associação com CRC

per ver

, ainda, encontramos interações entre

IL10

polimorfismos e ingestão de fibra alimentar [17]. Temos também previamente avaliadas variação genética em

IL1B

e

PTGS2

nesta coorte, não encontrando associação estatisticamente significativa com risco de CRC [3,18]. Vamos agora estender os nossos estudos para uma coorte maior, com mais de duas vezes o número de casos e membros do grupo de comparação e incluem fatores mais dietéticos e todos os três polimorfismos promotor funcional em

IL1B

.

Portanto, foram avaliados os polimorfismos funcionais

IL10

C-592A (rs1800872),

IL1B

C-3737T (rs4848306), G-1464C (rs1143623), T-31C (rs1143627) e

PTGS2

(que codificam COX-2) a-1195G (rs689466), G-765c (rs20417), T8473C (rs5275) e a

IL10

polimorfismo marcador C-rs3024505-T em relação à dieta (carne vermelha, peixe, fibras, cereais, frutas e legumes) e estilo de vida (não-esteróides anti-inflamatórios uso de drogas e tabagismo), em um estudo de caso-coorte aninhada de novecentos e setenta casos CRC e 1789 participantes selecionados aleatoriamente a partir de Dieta estudo prospectivo, Câncer e Saúde abrangendo 57,053 pessoas.

Métodos

indivíduos estudados

A dieta, câncer e Health Study é um estudo de coorte dinamarquesa em curso desenhado para investigar a relação entre a dieta, estilo de vida e risco de câncer [19]. A coorte consiste de 57,053 pessoas, recrutados entre Dezembro de 1993 e Maio de 1997. Todos os indivíduos nasceram na Dinamarca, e os indivíduos eram 50 a 64 anos de idade e não tinha cancros anteriores no início do estudo. Amostras de sangue e dados do questionário sobre dieta e estilo de vida foram coletadas no início do estudo.

Acompanhamento e endpoints

O acompanhamento foi baseado em registros de câncer de base populacional. Entre 1994 e 31 de dezembro de 2009, novecentos e setenta casos de CRC foram diagnosticados. A subcoorte de 1897 pessoas foi escolhido aleatoriamente dentro do grupo. Destes, 108 com dados em falta genótipo foram excluídos. Todas as informações sobre os genótipos e fatores de dieta e estilo de vida estava disponível para novecentos e setenta casos CRC e 1789 membros subcoorte.

dietéticos e estilo de vida questionário

As informações sobre dieta, estilo de vida, peso, altura, tratamento médico, exposições ambientais e outros fatores sócio-econômicos foram coletadas no momento da inscrição por meio de questionários e entrevistas. No questionário de freqüência alimentar, o consumo de dieta foi avaliada em 12 categorias de respostas pré-definidas, classificando de “nunca” a “oito vezes ou mais por dia”. A ingestão diária foi então calculada usando FoodCalc [19]; Este programa usa população receitas específicas padronizadas e tamanho das porções. Ingestão de carne vermelha em gramas por dia foi calculada somando-se a ingestão de carne de bovino, carne de porco, cordeiro e miudezas. Ingestão de carne processada em gramas por dia foi calculada somando-se a ingestão de carne processada vermelho, incluindo bacon, presunto, salame, salsicha, Cumberland lingüiça, frios e patês de fígado. ingestão de fibra alimentar foi baseado em tabelas de composição de alimentos específicos de cada país, os quais foram revistos para assegurar a comparabilidade com a associação de definição de fibra químicos analíticos oficiais (AOAC), que inclui lignina e amido resistente [20]. ingestão de fibra é calculada multiplicando a frequência de consumo de alimentos relevantes por seu conteúdo de fibras, como determinado a partir de bases de dados nacionais de conteúdos para alimentar [21].

Contribuindo itens alimentares para «cereais», o grupo alimentação incluída alimentos integrais (wholegrain pão, pão de centeio, farinha integral, aveia, sabugo de milho, muesli e pão estaladiço) e alimentos de grãos refinados (pão de trigo branco, farinha de trigo, farinha de arroz, farinha de batata, farinha de milho /amido, massas, trigo) e foi medida em gramas por dia [22]. A ingestão de ‘peixe’ em gramas por dia foi calculado somando-se o consumo de peixe fresco e processado. Para as frutas, apenas a ingestão de frutas frescas (conforme indicado no QFA) foi examinado, enquanto a ingestão de vegetais também incluiu contribuições provenientes de receitas. O questionário foi testado em um estudo de validação anterior à pesquisa Diet, Câncer e Saúde. Os coeficientes de correlação de Pearson (ajustado por ingestão total de energia) ilustrando a comparação dos escores de nutrientes estimados a partir do questionário de freqüência alimentar e dos registros de dieta pesados ​​foram 0,39 e 0,53 para fibra dietética e 0,37 e 0,14 para a carne para os homens e mulheres, respectivamente [23, 24].

Tabagismo foi classificada como nunca, no passado ou atual. Pessoas de fumar pelo menos um cigarro por dia durante o último ano foram classificados como fumantes

O questionário lifestyle incluiu esta questão a respeito do uso de AINE:. “Você já tomou mais de uma pílula para aliviar a dor por mês durante o último ano? “Se a resposta foi sim, o participante foi convidado a gravar a frequência com que eles tomaram cada um dos seguintes medicamentos:” aspirina “,” Paracetamol “,” Ibuprofeno “, ou” Outros analgésicos “. A última categoria incluiu outros do que a aspirina e ibuprofeno preparações AINE. Com base em todos os registros, classificamos sujeitos do estudo de acordo com o uso de “qualquer AINE” (≥ 2 comprimidos por mês durante um ano) no início do estudo.

A genotipagem

preparações buffy coat foram armazenadas a menos de 150 ° C até à sua utilização. O DNA foi extraído como descrito [25]. O ADN foi genotipados por KBioscience (KBioscience, Hoddesdon, Reino Unido) por ensaio Kasp ™ genotipagem baseada em PCR. (https://www.lgcgenomics.com/). Um polimorfismo marcador, a

IL10

C-rs3024505-T, e 8 polimorfismos funcionais foram selecionados;

IL10

C-592A (rs1800872),

IL1B

C-3737T (rs4848306), G-1464C (rs1143623), T-31C (rs1143627) e

PTGS2

( codificação de COX-2) A-1195G (rs689466), L-765c (rs20417), e T8473C (rs5275).

IL1B

T-31C (rs1143627) [18],

PTGS2

(que codificam COX-2) A-1195G (rs689466), G-765c (rs20417), e T8473C (rs5275) [ ,,,0],3] foram determinados e comunicados anteriormente para um subconjunto do grupo de estudo. Além disso, todos os três SNPs em IL1B foram determinadas para a totalidade do grupo de comparação, independentemente do presente trabalho e relatados anteriormente [26]. Para confirmar a reprodutibilidade, genotipagem foi repetido para 10% das amostras produzindo 100% de identidade.

Análise

Estatística

Desvio de Hardy-Weinberg foi avaliada através de um teste qui-quadrado.

rácios taxa de incidência (IRR) e 95% de intervalo de confiança (95% CI) foram calculados de acordo com os princípios de análise de estudos de caso-coorte, usando uma abordagem ponderada-un [27]. A idade foi utilizado como o intervalo de tempo em os modelos de regressão de Cox. Testes e intervalos de confiança foram baseadas em testes de Wald usando a estimativa robusta da matriz de variância-covariância para os parâmetros da regressão nos modelos de regressão Cox [28], como descrito anteriormente [3,5,17,18,29-34].

Todos os modelos foram ajustados para valores basais de fatores de risco suspeitos para o cancro colo-rectal, tais como índice de massa corporal (IMC) (kg /m

2, contínuo), NSAID (sim /não), uso de hormônio terapia de substituição (HRT) (nunca /passado /corrente, entre as mulheres), tabagismo (nunca /passado /corrente), a ingestão de fibra alimentar (g /dia, contínua), e carne vermelha e carne processada (g /dia, contínua ). Cereais, fibras, frutas e vegetais também foram inseridos de forma linear. Todas as análises foram estratificadas por sexo, para que os (subjacentes) perigos básicos eram específicos de gênero. Para todos os polimorfismos, TIR foi calculada separadamente para portadores do alelo variante heterozigotos e homozigotos. Para todos os SNPs, exceto para

PTGS2

A-1195G, todos os portadores do alelo variante foram posteriormente agrupadas para a interação analisa uma vez não foram observados efeitos recessivos. Para

PTGS2

A-1195G, um modo recessivo foi usado nas análises subsequentes.

haplótipos da

PTGS2

e

IL1B

foram inferidas manualmente como concluída anteriormente [3,35,36].

Para os diferentes genes, investigamos as possíveis interações entre os polimorfismos e consumo de carne, fibras, cereais, peixe, frutas e legumes, tabagismo e uso de AINE usando o probabilidade teste da razão [3,14,32,35-37].

Em um outro conjunto de interação análises entre os polimorfismos e a ingestão dietética subdividida em tercis, ingestão alimentar foi introduzido como uma variável categórica. Tertil pontos de corte foram baseadas na distribuição empírica entre os casos. As possíveis interacções foram investigados utilizando o teste da razão de verossimilhança.

Todas as análises foram realizadas utilizando-R versão 2,15-1 (R Core Team, 2013) [38]. Um p 0,05 foi considerado significativo.

Ética Declaração

Todos os participantes deram verbal e consentimento informado por escrito. O estudo Diet, Câncer e Saúde foi aprovado pela Comissão Nacional de Saúde Ética em Pesquisa (revista nr. (KF) 01-345 /93) e pela Agência de Protecção de Dados dinamarquesa.

Resultados

características da população do estudo e factores de risco para CRC são mostrados na Tabela 1. a distribuição dos genótipos dos polimorfismos na sub-coorte não se afastou da Hardy-Weinberg (resultados não mostrados). A freqüência do alelo variante no sub-coorte foram para

IL10

C-592A 0,22, rs3024505 0,17,

IL1B

C-3737T 0,43, G-1464C 0,27, T-31C 0,33 e

PTGS2

a-1195G 0,19, G-765c 0,15, e T8473C 0,34, respectivamente.

Cases

Sub-coorte

teste para diferença

Não .

medianas

valor-p No.

medianas

(%) (5-95% percentis) (%) (5-95% percentis) total de 970 (100 ) 1789 (100) Sex0.13 Men547 (56) 954 (53) Women423 (44) 835 (47) Idade no momento da inclusão (

anos

) 58 (51-64) 56 (50-64) 1e-16BMI (

kg /m

2

) 26,3 (20.7-34.3) 25,6 (20.5-33.0) ingestão 0.001Food (

g /dia

) álcool

1 14,0 (0.5-69.9) 13,5 (0.7-65.4) 0,23 fibra dietética 20,0 (10.6-32.8) 20,6 (10.8-34.2) 0,01 vermelho e meat113 processados ​​(47-233) 109 (42-236 ) 0.03Smoking status0.07 Never286 (30) 603 (34) Past301 (31) 518 (29) Current383 (40) 667 (37) AINE use0.65 No699 (70) 1218 (69) Yes293 (30) 557 (31) uso de TRH em mulheres

20.01 Never258 (61) 437 (52) Past55 (13) 132 (16) Current110 (26) 266 (32) Tabela 1. as características basais de população de estudo selecionados para a dieta, câncer e coorte de saúde.

1 entre os bebedores atuais

2 Percentagens entre os casos do sexo feminino /membros do grupo de comparação CSV Baixar CSV

Associações entre polimorfismos e CRC

IL1B

C-3737T portadores do alelo variante estavam em risco reduzido de CRC e os portadores do alelo variante G-1464C eram em maior risco de CRC em comparação com os portadores do tipo selvagem genótipo homozigoto (p = 0,02 e p = 0,02, respectivamente) (Tabela 2). As análises de haplótipos revelou que o

IL1B

combinações de haplótipos que incluíram o haplótipo CCC (C-3737T, G-1464C, T-31C) foram associados com risco aumentado de CRC em comparação com a referência TGT /TGT haplótipo (Tabela S1 ). No entanto, somente a combinação haplótipo CCC /CGT foram estatisticamente significativamente associados com o risco de CRC (p = 0,02). Portadores de uma cópia do CCC haplótipo teve uma TIR de 1,20 (p = 0,04) e portadores de dois haplótipos CCC teve uma TIR de 1,29 (p = 0,12) (grupo de referência: no haplótipo CCC) (Tabela 3). Portadores de uma cópia do haplótipo TGT teve uma TIR de 0,82 (p = 0,04) e portadores de duas cópias TGT teve uma TIR de 0,79 (p = 0,05) (Tabela 3).

N

case

N

sub-cohort

Crude

a

Adjusted

b

P-value

c

IRR

(95%CI)

IRR

(95%CI)

IL10

C-592A

CC

596

1072

1.00

1.00

AC2975800.92(0.78-1.10)0.92(0.77-1.10)0.38AA56961.02(0.71-1.45)1.00(0.70-1.44)0.98AC-AA3536760.94(0.79-1.11)0.93(0.79-1.11)0.44

IL10

rs3024505CC64812001.001.00CT2635110.97(0.81-1.16)0.98(0.82-1.18)0.87TT34541.03(0.66-1.63)0.99(0.62-1.58)0.96CT-TT2975650.98(0.82-1.16)0.98(0.83-1.17)0.87

IL1B

C-3737TCC3365601.001.00CT4338350.84(0.70-1.01)0.82(0.68-0.99)0.04TT1723510.79(0.63-1.00)0.79(0.63-1.01)0.06CT-TT60511860.83(0.70-0.98)0.81(0.68-0.97)0.02

IL1B

G-1464CGG4549251.001.00CG4086831.21(1.02-1.43)1.21(1.02-1.44)0.03CC841411.26(0.93-1.71)1.30(0.95-1.77)0.10CG-CC4928241.21(1.03-1.43)1.22(1.04-1.44)0.02

IL1B

T-31CTT3897731.001.00TC4407791.10(0.93-1.31)1.11(0.93-1.32)0.26CC1172041.22(0.94-1.59)1.22(0.93-1.59)0.16TC-CC5579831.13(0.96-1.33)1.13(0.95-1.33)0.16

PTGS2

A-1195GAA58711261.001.00AG3135601.06(0.89-1.27)1.07(0.90-1.28)0.43GG47611.41(0.94-2.11)1.46(0.97-2.20)0.07AA-AG vs GG

d90016861.38 (0.93-2.05) 1,42 (0.95-2.14) 0,09

PTGS2

G-765CGG70112561.001.00GC2134350.90(0.74-1.09)0.86(0.71-1.05)0.14CC22430.91(0.54-1.54)0.96(0.56-1.63)0.88GC-CC2354780.90(0.75-1.08)0.87(0.72-1.05)0.15

PTGS2

T8473CTT4307201.001.00CT4048150.86(0.72-1.02)0.84(0.71-1.01)0.06CC972030.77(0.59-1.02)0.75(0.57-0.99)0.04CT-CC50110180.84(0.71-0.99)0.82(0.70-0.97)0.02Table 2. rácios taxa de incidência e intervalos de confiança de 95% para os polimorfismos do gene estudado no estudo Diet, Câncer e Saúde.

a Ajustado por sexo e idade

b Além disso, ajustado para tabagismo, álcool, estatuto HRT (apenas mulheres), IMC, uso de NSAID, e ingestão de carne vermelha e processada, e fibra dietética

c P-valor para as estimativas ajustadas

d AA e AG contra GG. CSV Baixar CSV

Copy

N

cases

N

subcohort

IRR

a

(95%CI)

IRR

b

(95%CI)

P-value

c

IL1B

TGT0 3305631114248400,84 (0.70-1.01) 0,82 (0.68-0.99) 0.03521683530.78 (0.62-0.99) 0,79 (0.62-1.00) 0.051CCC0 4449291113976881.201.02-1.43)1.20(1.01-1.43)0.0402811391.25(0.92-1.70)1.29(0.94-1.76)0.116

PTGS2

GGT0 56011041112965591,05 (0.88-1.25) 1,06 (0.89-1.27) 0.514246571.58 (1.04-2.38) 1,62 (1.06-2.47) 0.024AGT0 14426711157311101,01 (0.80-1.27) 1,01 (0.80-1.27) 0.95221853431.05 (0.80-1.39) 1,05 ( 0,79-1,39) 0.750Table 3. As estimativas de risco para

IL1B

e

PTGS2

haplótipos em relação ao risco de câncer colorretal sequência de haplótipos

:.

IL1B

: C -3737T, G-1464C, T-31C PTGS2:. a-1195G, G-765c, T8473C

a ajustado por sexo e idade

b além disso, ajustados para o status de fumo, álcool, estado HRT (apenas as mulheres ), IMC, ingestão de vermelho e carne processada, e fibra dietética

c P-valor para o risco ajustado estima CSV Baixar CSV

Porta da alta atividade da COX-2

PTGS2

alelo variante T8473C eram em menor risco de CRC e portadores homozigotos da baixa atividade da COX-2

PTGS2

a-1195G variante G-alelo estavam em marginalmente maior risco de CRC que o genótipo homozigoto de tipo selvagem (p = 0,02 e p = 0,07 , respectivamente) (Tabela 2). Além disso, os portadores da combinação haplótipo que incluiu ambas as cópias dos alelos variantes a-1195G (GGT /GGT), estavam em risco aumentado de CRC (p = 0,09) em comparação com a referência

PTGS2

AGT /AGT (A-1195G, G-765c, T8473C) combinação de haplótipos (Tabela S1). Em uma análise separada, portadores de uma cópia GGT teve uma TIR de 1,06 (p = 0,51), enquanto portadores de duas cópias teve uma TIR de 1,62 em comparação com todos os não-portadores do haplótipo (p = 0,02) (Tabela 3).

Onde não foram observados efeitos recessivos, genótipos variantes foram combinados na análise de interação para maximizar o poder estatístico. Um efeito recessivo foi encontrada para

PTGS2

A-1195G e, consequentemente, AA e portadores AG foram agrupados contra portadores GG.

Gene-ambiente analisa

Carne.

IL10

portadores da variante rs3024505 foram de 6% maior risco de CRC por 25 g vermelha e carne processada por dia (IC 95%: 1,00-1,11), enquanto portadores de tipo selvagem homozigotos estavam em nenhum risco pelo consumo de carne (P-valor para a interação (P

int) = 0,04) (Tabela 4). Estes resultados foram apoiados por as análises tercil (Tabela S2).

IL10

portadores da variante rs3024505 estavam em 1,50 risco aumentado pela alta ingestão de carne em comparação com portadores homozigotos do tipo selvagem com baixa ingestão de carne (95% CI: 1.09-2.06, P

int=0.02).

IRR

a

(95%CI)

IRR

b

(95%CI)

P-value

IRR

a

(95%CI)

IRR

b

(95%CI)

P-value

IRR

a

(95%CI)

IRR

b

(95%CI)

P-value

c

Red e processados ​​de carne por 25 g /dia

Fish por 25 g /dia

cereal dietético por 50 g/day

IL10

C-592ACC1.03(0.99-1.07)1.02(0.98-1.06)0.94(0.85-1.04)0.94(0.85-1.04)0.95(0.89-1.02)0.97(0.90-1.04)AC-AA1.01(0.96-1.07)1.00(0.95-1.06)0.45530.99(0.88-1.12)0.98(0.86-1.11)0.55960.93(0.85-1.02)0.95(0.86-1.04)0.6419rs3024505CC1.01(0.97-1.05)1.00(0.96-1.04)0.91(0.83-1.00)0.90(0.82-0.99)0.93(0.86-0.99)0.94(0.87-1.02)CT-TT1.06(1.01-1.11)1.06(1.00-1.11)0.03611.08(0.94-1.24)1.08(0.94-1.24)0.00650.98(0.90-1.07)0.99(0.90-1.09)0.2715

IL1B

C-3737TCC1.01(0.96-1.07)1.01(0.96-1.07)0.98(0.86-1.11)0.98(0.86-1.11)0.98(0.89-1.08)1.00(0.90-1.11)CT-TT1.03(0.99-1.07)1.02(0.98-1.06)0.65190.94(0.86-1.04)0.93(0.84-1.03)0.45900.92(0.86-0.99)0.94(0.87-1.01)0.1743G-1464CGG1.02(0.98-1.07)1.02(0.97-1.06)0.95(0.86-1.05)0.94(0.85-1.04)0.93(0.86-1.01)0.95(0.88-1.03)GC-CC1.03(0.98-1.08)1.02(0.97-1.07)0.93670.97(0.86-1.08)0.97(0.86-1.09)0.62270.95(0.88-1.03)0.96(0.88-1.05)0.7630T-31CTT1.01(0.96-1.05)1.00(0.96-1.05)0.93(0.83-1.03)0.91(0.81-1.03)0.92(0.85-1.00)0.95(0.87-1.03)TC-CC1.04(0.99-1.08)1.03(0.98-1.07)0.39540.98(0.88-1.08)0.98(0.88-1.09)0.30890.95(0.88-1.03)0.96(0.89-1.04)0.7252

PTGS2

A-1195GAA-AG1.02(0.99-1.06)1.02(0.98-1.05)0.96(0.89-1.04)0.96(0.8481.04)0.95(0.90-1.01)0.97(0.91-1.03)GG1.05(0.87-1.27)1.06(0.87-1.29)0.54390.82(0.54-1.23)0.78(0.51-1.19)0.21160.77(0.58-1.03)0.77(0.58-1.04)0.0387G-765CGG1.00(0.96-1.04)0.99(0.95-1.03)0.93(0.85-1.01)0.92(0.84-1.01)0.93(0.87-0.99)0.94(0.88-1.01)GC-CC1.08(1.01-1.15)1.08(1.01-1.15)0.00581.05(0.90-1.23)1.05(0.89-1.25)0.06630.99(0.89-1.10)1.01(0.91-1.12)0.1771T8473CTT1.04(0.99-1.10)1.04(0.99-1.09)0.95(0.85-1.05)0.94(0.84-1.05)0.93(0.86-1.01)0.95(0.87-1.03)TC-CC1.01(0.97-1.06)1.01(0.96-1.05)0.29240.96(0.87-1.07)0.95(0.85-1.07)0.80290.94(0.87-1.02)0.96(0.88-1.04)0.8573

Dietary fibra por 10 g /dia

Fruit por 50 g /dia

Vegetais por 50 g/day

IL10

C-592ACC0.87(0.76-1.00)0.91(0.78-1.05)0.97(0.94-1.00)0.98(0.94-1.01)0.98(0.93-1.03)0.99(0.94-1.04)AC-AA0.79(0.64-0.96)0.79(0.64-0.98)0.16380.96(0.92-1.00)0.96(0.92-1.00)0.34430.96(0.89-1.04)0.97(0.89-1.04)0.5043rs3024505CC0.75(0.65-0.87)0.77(0.66-0.89)0.96(0.93-0.99)0.96(0.93-0.99)0.93(0.89-0.99)0.94(0.89-0.99)CT-TT1.03(0.85-1.25)1.06(0.87-1.30)0.00080.98(0.93-1.03)0.99(0.94-1.04)0.18911.04(0.98-1.11)1.06(0.99-1.13)0.0005

IL1B

C-3737TCC0.81(0.66-0.99)0.83(0.67-1.02)0.96(0.93-1.00)0.96(0.92-1.00)0.94(0.87-1.01)0.94(0.86-1.02)CT-TT0.85(0.73-0.98)0.88(0.75-1.02)0.56950.96(0.93-1.00)0.97(0.94-1.00)0.71660.98(0.94-1.03)1.00(0.95-1.05)0.0705G-1464CGG0.83(0.71-0.98)0.87(0.74-1.03)0.97(0.93-1.00)0.97(0.94-1.01)0.95(0.90-1.00)0.96(0.91-1.02)GC-CC0.84(0.71-0.99)0.85(0.72-1.01)0.81810.96(0.92-1.00)0.96(0.92-1.00)0.59551.00(0.93-1.06)1.00(0.94-1.07)0.2082T-31CTT0.82(0.69-0.97)0.86(0.72-1.03)0.97(0.93-1.01)0.98(0.94-1.01)0.96(0.91-1.02)0.97(0.92-1.03)TC-CC0.85(0.73-0.99)0.86(0.73-1.01)0.99040.96(0.92-0.99)0.96(0.93-1.00)0.47150.97(0.92-1.03)0.98(0.92-1.05)0.8110

PTGS2

A-1195GAA-AG0.85(0.76-0.96)0.88(0.78-1.00)0.96(0.94-0.99)0.97(0.94-0.99)0.97(0.93-1.01)0.98(0.94-1.03)GG0.49(0.23-1.07)0.47(0.21-1.05)0.02240.94(0.79-1.12)0.94(0.77-1.12)0.62460.92(0.77-1.11)0.91(0.77-1.09)0.3053G-765CGG0.76(0.67-0.87)0.79(0.68-0.91)0.95(0.92-0.98)0.95(0.92-0.98)0.96(0.92-1.01)0.98(0.93-1.03)GC-CC1.13(0.90-1.40)1.16(0.93-1.46)0.00031.02(0.96-1.07)1.02(0.97-1.07)0.00411.01(0.93-1.10)1.02(0.94-1.12)0.2457T8473CTT0.76(0.63-0.90)0.79(0.65-0.94)0.94(0.90-0.97)0.94(0.91-0.98)0.96(0.90-1.02)0.97(0.91-1.03)TC-CC0.92(0.79-1.07)0.94(0.80-1.10)0.06840.99(0.95-1.02)0.99(0.96-1.02)0.03330.99(0.93-1.05)1.00(0.94-1.06)0.3800Table 4. A interação entre fatores dietéticos e os polimorfismos estudados em relação ao risco de câncer colorretal.

a Crude ajustado para sexo e idade

b ajustadas para a situação fumo, álcool, estado HRT (apenas mulheres), BMI, ingestão de carne vermelha e processada, e fibra dietética

c P p-valor para a interação do risco ajustado estima CSV Baixar CSV

PTGS2

G-765c portadores do alelo variante foram de 8% risco de aumento CRC por 25 g de carne vermelha e processada por dia (IC 95%: 1,00-1,15). Considerando que as transportadoras de tipo selvagem homozigotos estavam em nenhum risco pelo consumo de carne (P

int = 0,006) (Tabela 4) Além disso,

PTGS2

L-765c portadores do alelo variante estavam em risco aumentado de CRC por ingestão de carne na análise tertil em comparação com os suportes de tipo selvagem homozigóticos (P

int = 0,005) (Tabela S2).

peixes.

IL10

rs3024505 portadores de tipo selvagem homozigotos foram em 10% risco de CRC reduzida por 25 g de peixe por dia enquanto portadores da variante não tinha redução de risco por ingestão semelhante (P

int = 0,007) .

Fibre, frutas, verduras e cereais.

IL10

rs3024505 portadores de tipo selvagem homozigotos foram a 23 e 6% menor risco de CRC por 10 g de fibra e 50 g legumes por dia enquanto portadores da variante não tinha redução de risco por ingestão semelhante (P

int = 0,0008 e 0,0005, respectivamente). Além disso,

IL10

portadores de tipo selvagem homozigotos rs3024505 estavam em risco reduzido de CRC entre os participantes do estudo com a maior ingestão de fibras (IRR = 0,73, 95% CI: ,57-,94, P

int = 0,007) e legumes (IRR = 0,72, 95% CI: ,56-,93, P

int = 0,001).

PTGS2

G-765c portadores de tipo selvagem homozigotos eram de 21% e 5% de redução do risco de CRC por 10 g de fibra e 50 g de fruta por dia enquanto portadores da variante não tinha redução de risco por ingestão semelhante (P

int = 0,0003 e 0,004, respectivamente). Na análise tertile, portadores de tipo selvagem homozigotos

PTGS2

G-765c eram de baixo risco de CRC pela alta ingestão de fibras (IRR = 0,71, 95% CI: 0,55-0,90, P

int = 0,004) e frutas: foi encontrado (IRR = CI 0,73, 95% 0,57-0,93, P

int = 0,006) interação .Não entre quaisquer genótipos e cereal em relação ao risco de CRC (Tabela 4). Nas análises tertile,

IL1B

G-3737C portadores do alelo variante estavam em risco reduzido de CRC no tercil mais baixo de vegetais (IRR = 0,66, 95% CI: 0,49-0,89), enquanto as estimativas de risco no mais alto tertile foi semelhante para os dois alelos (P

int = 0,03) (Tabela S2).

uso de AINE.

A associação estatisticamente significativa entre

IL1B

-3737T C e uso de AINE foi encontrado (Tabela S3). Baixo risco de CRC foi encontrado para o

IL1B

C-3737T portadores do alelo variante entre usuários não-AINE (IRR = 0,74, 95% CI: 0,60-0,91), mas não entre os usuários de NSAID (IRR = 0,82, 95 CI%: 0,64-1,06) em comparação com os portadores de tipo selvagem homozigotos (referência) (P

int = 0,04)

Smoking

a associação estatisticamente significativa entre

PTGS2

A-1195G e tabagismo foi encontrado (Tabela S4). Entre os fumantes atuais, portadores do alelo variante

PTGS2

A-1195G homozigotos eram em maior risco de CRC (IRR = 2,33, 95% CI: 1,13-4,78, P

int = 0,046) em comparação com as transportadoras de tipo selvagem homozigotos que nunca fumaram (grupo de referência).

Discussão

No estudo gene candidato presente, analisamos interações gene-ambiente em relação ao risco de CRC em uma coorte prospectiva dinamarquês. Descobrimos que funcional

IL1B

e

PTGS2

polimorfismos foram associados com risco de CRC (Tabela 2 e 3 e Tabela S1). Além disso, encontramos interações entre fatores da dieta e do estilo de vida e genes envolvidos na via inflamatória (Tabela 3 e Tabela S2, S3 e S4). Assim, encontramos interações entre a ingestão de carne e

IL10 Comprar e

PTGS2

, peixe e

IL10

, fibras e

IL10 Comprar e

PTGS2

, frutas e

PTGS2

, vegetais e

IL10

,

PTGS2

, e

IL1B

, o uso de NSAID e

IL1B

e, finalmente, entre tabagismo e

PTGS2

polimorfismos.

Associações entre polimorfismos e CRC

Temos agora estender os nossos estudos anteriores de

IL10

,

IL1B Comprar e

PTGS2

polimorfismos em relação à dieta e carcinogênese colorretal em um grupo de estudo de trezentos e setenta e oito casos CRC e 775 participantes de um grupo de comparação selecionados aleatoriamente [3,17,18] estudos para grupos maiores com mais de duas vezes o número de casos e membros de o grupo de comparação e incluem fatores mais dietéticos. Em contraste com nossos achados anteriores [3,18], os polimorfismos funcionais estudadas em

IL1B

e

PTGS2

foram associados com risco de CRC no presente grupo de estudo maior, provavelmente refletindo o aumento do poder estatístico . Reproduzimos as descobertas anteriores de que os polimorfismos estudados IL10 não foram associados com o risco de CRC

per

ver 17.

No presente estudo, o

IL1B

CCC (C- 3737T, L-1464C, t-31C) foi haplotipo associado ao aumento do risco de CRC. Este haplótipo dá níveis elevados de transcrição em estudos do promotor utilizando transfecções transientes [39]. Por outro lado, o haplótipo TGT foi associada com baixo risco CRC. Este haplótipo leva à baixa

IL1B

transcrição e engloba o alelo variante do C-3737T. O

IL1B

C-3737T polimorfismo suprime um local de ligação para a subunidade p50 anti-inflamatório NF-kB [39]. Assim, os nossos resultados, tanto em termos de análise de SNP e análises de haplótipos consistentemente indicam que os níveis elevados IL1B geneticamente determinadas estão associados com um risco aumentado de CRC e níveis baixos geneticamente IL1B conduz ao risco reduzido de CRC. Além disso, o nosso resultado sugere o envolvimento da subunidade p50 anti-inflamatória de NF-kB. Nós não encontramos nenhuma interação estatisticamente significativa entre os

IL1B

polimorfismos estudados e nenhuma das variáveis ​​dietéticas estudadas. No entanto, na análise tercil de consumo de vegetais (tabela S2) a associação entre as

polimorfismos IL1B

e risco de CRC foi mais forte no tercil mais baixo. Assim, os portadores do alelo variante do

IL1B

G-1464C e T-31C foram em 1,40 (95% CI: 1,05-1,86) e 1,47 (95% CI: 1,11-1,95) vezes o risco de CRC aumentou , respectivamente, enquanto que os portadores do alelo variante do C-3737T estavam em risco reduzido de CRC (IRR = 0,66, 95% CI: 0,49-0,89). Isto pode sugerir que a associação entre polimorfismos IL1B e risco de CRC só pode ser detectado em populações com ingestão relativamente baixa de vegetais como a população dinamarquesa [40].

O alelo variante

PTGS2

A-1195G leva a baixos níveis de transcrição de COX-2 [41] enquanto que

PTGS2

T8473C dá níveis de mRNA elevadas [42]. Em dinamarqueses, incluindo o grupo de estudo presente, o alelo variante do G-765c quase exclusivamente co-segrega com o alelo variante T8473C (Tabela S1). Este haplótipo foi mostrado estar associado com altamente elevada actividade de COX-2 [43]. No presente estudo, o

PTGS2

GGT (A-1195G, G-765c, T8473C) haplótipo foi associado com aumento do risco de CRC (P = 0,024). O

PTGS2

A-1195G genótipo homozigoto variante foi marginalmente associado ao aumento do risco de CRC (P = 0,07) e

PTGS2

portadores da variante T8473C com determinada geneticamente alta atividade da COX-2 estavam em risco reduzido de CRC (P = 0,02). De acordo com o presente estudo, geneticamente baixa atividade da COX-2 foi encontrado para predispor a doença inflamatória do intestino, um fator de risco para CRC [44].

Gene-ambiente analisa

A ingestão de carne na população dinamarquesa está entre as mais altas doses de todo o mundo e temos interações entre carne e genes [3,5] previamente identificados. Encontramos a interação entre a ingestão de carne e

PTGS2

G-765c. Assim, entre os portadores do alelo variante, a ingestão diária de carne foi associado com 8% maior risco de carnes 25g CRC PR, enquanto que os portadores do alelo de tipo selvagem homozigoto não estavam em maior risco (P

int = 0,006). O resultado está de acordo com o achado de uma associação estatisticamente significativa entre os genótipos variantes

PTGS2

G-765c e CRC entre indivíduos com alta ingestão de n-6 PUFA em uma coorte prospectiva, de base populacional de 310 Singapura casos chineses [45]. N-6 PUFAs está presente na carne. Encontramos também a interação entre a ingestão de carne e

IL10

rs3024505. A interacção semelhante foi encontrado para a ingestão de peixe. No entanto, é difícil de interpretar as implicações funcionais como

IL10

rs3024505 é um SNP marcador sem função conhecida. A falta de interacção com o polimorfismo do promotor funcional C-592A pode sugerir que a interacção detectada pode ser relacionado com outros genes do que

IL10, mas, por outro lado,

IL10

rs3024505 situa-se muito longe de outros genes [46]. Em resumo, as interações entre consumo de carne por um lado e variação genética em

PTGS2

e

IL10

, por outro lado, sugerem que a inflamação desempenha um papel na carcinogênese carne relacionados. Em apoio a esta, nós também descobriram a interação entre o polimorfismo promotor funcional

NFKB1

-94ins /del e consumo de carne em relação ao CRC [5].

Observamos forte interação entre o marcador

IL10

rs3024505 e ingestão de fibras e vegetais. Em ambos os casos, os portadores do alelo de tipo selvagem homozigotos beneficiou da alta ingestão, enquanto que os portadores do alelo variante não tinha redução de risco ao comer fibra ou vegetais em relação ao risco de CRC. No entanto, uma vez que os portadores do alelo variante no tercil com a ingestão menor de fibra foram na marginalmente risco de CRC (IRR: CI 0,73, 95%: 0,54-1,01) baixou os resultados sugerem que portadores do alelo tipo selvagem experimentar uma redução do risco de ingestão de fibra que variante portadores do alelo já tem. Os resultados apoiar e alargar a nossa anteriormente encontrar de interação entre fibra e IL10 em uma subcoorte do presente estudo de coorte [17]. Da mesma forma, observamos as interações entre a fibra dietética, cereais alimentares e frutas por um lado e variação genética em

PTGS2

no outro. As interações são bastante consistentes e sugerem que indivíduos com atividade geneticamente baixo PTGS2 as mais beneficiadas com alta ingestão de fibras, frutas e cereais. Além disso, as análises tercil mostraram que aqueles com menor actividade determinada geneticamente COX-2, os transportadores ou seja homozigotos do alelo variante de PTGS2 A-1195G, eram de alto risco de CRC no grupo com o menor consumo de fibras (TIR = 3,08 ( IC 95%: 1,51-6,28), e frutos (TIR = 2,11, 95% CI: 1,03-4,33), enquanto que aqueles com a elevada actividade determinada geneticamente COX-2, os portadores do alelo variante de PTGS2 L-765c, eram em

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