PLOS ONE: A associação entre Individual SNPs ou haplótipos da metaloproteinase de matriz 1 e câncer gástrico suscetibilidade, progressão e Prognóstico

Abstract

Fundo

Os polimorfismos de nucleotídeo único (SNPs) na matriz metaloproteinase 1 (MMP-1) desempenham um papel importante em alguns tipos de câncer. Este estudo examinou a associação entre SNPs ou haplótipos individuais de MMP-1 e susceptibilidade, os parâmetros clínico e prognóstico do câncer gástrico em uma grande amostra da população Han, no norte da China.

Métodos

neste estudo de caso-controle, havia 404 pacientes com câncer gástrico e 404 controles saudáveis. Sete SNPs foram genotipados utilizando o sistema de MALDI-TOF MS. Então, o software SPSS, Haploview 4,2 software, software Haplo.states e software THEsias foram usadas para estimar a associação entre SNPs individuais ou haplótipos da MMP-1 e susceptibilidade câncer gástrico, progressão e prognóstico.

Resultados

Entre sete SNPs, não houve SNPs individuais associados ao risco de câncer gástrico. Além disso, apenas o genótipo rs470206 teve uma correlação com graus histológicos, e os pacientes com GA /AA teve bem diferenciação celular em comparação com os pacientes com o genótipo GG (OR = 0,573; IC 95%: 0,353-0,929; P = 0,023). Então, construímos um bloco haplótipo de quatro marcador que continha 4 haplótipos comuns: TCCG, GCCG, TTCG e TTTA. No entanto, todos os quatro haplótipos comuns não teve correlação com o risco de câncer gástrico e nós não encontrou qualquer relação entre estes haplótipos e os parâmetros clínico em câncer gástrico. Além disso, nem os SNPs individuais nem haplótipos teve uma associação com a sobrevida dos pacientes com câncer gástrico.

Conclusões

Este estudo polimorfismos avaliados do gene MMP-1 em câncer gástrico com MALDI-TOF método de MS em uma grande coorte de caso-controle do norte da China. Nossos resultados indicaram que estes sete SNPs de MMP-1 pode não ser úteis como marcadores importantes para prever a susceptibilidade câncer gástrico, progressão ou prognóstico, pelo menos na população Han no norte da China

Citation:. Canção YX, Zhou X, Wang Zn, Gao P, Li aL, Liang JW, et ai. (2012) A associação entre Individual SNPs ou haplótipos da metaloproteinase de matriz 1 e câncer gástrico suscetibilidade, progressão e prognóstico. PLoS ONE 7 (5): e38002. doi: 10.1371 /journal.pone.0038002

editor: Yury E. Khudyakov, Centers for Disease Control and Prevention, Estados Unidos da América

Recebido: 30 Janeiro, 2012; Aceito: 29 de abril de 2012; Publicado em: 24 de maio de 2012

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