Abstract
Purpose
Este estudo teve como objetivo identificar o padrão do fator de crescimento endotelial vascular (VEGF) no cancro do pulmão de células não pequenas (NSCLC) expressão e para explorar sua possível associação com a progressão do NSCLC.
Métodos
perfil de expressão génica GSE39345 foi descarregado a partir do banco de dados Omnibus Gene Expression. Vinte controlos saudáveis e 32 amostras antes da quimioterapia NSCLC foram analisados para identificar os genes expressos diferencialmente (degs). Em seguida, a análise via enriquecimento dos degs foi realizada e redes de interacção proteína-proteína foram construídos. Particularmente, foram analisados os genes de VEGF e da via de sinalização de VEGF. A sub-rede foi construída seguido de análise de enriquecimento funcional.
Resultados
total 1666-regulada e foram identificados 1542 degs down-regulamentados. Os degs regulada para baixo foram enriquecidos principalmente nas vias associadas ao câncer.
VEGFA
e
VEGFB
foram encontrados para ser o fator inicial de VEGF via de sinalização. Além disso, no receptor do factor de crescimento epidérmico (
EGFR
),
VEGFA
e
VEGFB
associado sub-rede, receptor de quinase do domínio de inserção (
KDR
), fibronectina 1 (
FN1
), transformando beta do fator de crescimento induzida (
TGFBI
) e antígeno nuclear de proliferação celular (
PCNA
) foram encontrados para interagir com, pelo menos, dois dos três genes de cubo. Os degs nesta sub-rede foram enriquecidos principalmente em termos Gene Ontologia relacionadas à proliferação celular.
Conclusão
EGFR
,
KDR
,
FN1
,
TGFBI
e
PCNA
podem interagir com o
VEGFA
a desempenhar papéis importantes em NSCLC tumorigênese. Estes genes e proteínas correspondentes podem ter o potencial de ser utilizados como alvos para qualquer diagnóstico ou tratamento de pacientes com NSCLC
citação:. Wang Y, Huang L, Wu S, Jia Y, Yang Y, Luo L , et ai. Análises (2015) Bioinformática do papel do Fator de Crescimento Vascular endotelial em pacientes com não-pequenas células do cancro do pulmão. PLoS ONE 10 (9): e0139285. doi: 10.1371 /journal.pone.0139285
editor: Selvakumar Subbian, Instituto de Pesquisa de Saúde Pública da RBHS, United States