Sumário

Nós teve como objetivo identificar uma assinatura hipermetilação microarray de DNA câncer de próstata (denotado como PHYMA) que diferencia o câncer de próstata de hiperplasia benigna da próstata (HBP), alta de baixo grau e letal de cancros não-letais . Este é um estudo retrospectivo não-randomizado em 111 homens asiáticos locais (87 cancros da próstata e 24 BPH) tratados 1995-2009 em nossa instituição. epitélio da próstata Arquivo de laser foram microdissecadas de captura e de ADN genómico extraído e bissulfito-convertido. As amostras foram perfilado usando Illumina GoldenGate metilação microarray, com dados brutos processados ​​pelo GenomeStudio. Um modelo de classificação foi gerado usando a máquina de vetores de suporte, constituída por uma 55-sonda assinatura de metilação do DNA de 46 genes. O modelo foi validado de forma independente em um conjunto de dados de teste interno, que resultou em sensibilidade de detecção do câncer e especificidade de 95,3% e 100% respectivamente, com precisão global de 96,4%. Segundo a validação em outra coorte ocidental independente rendeu 89,8% de sensibilidade e especificidade% 66,7, com precisão global de 88,7%. Uma pontuação PHYMA foi desenvolvido para cada amostra com base no estado de metilação na assinatura PHYMA. O aumento da pontuação PHYMA foi significativamente associada com maior pontuação de Gleason e Gleason grau primário. Homens com pontuações PHYMA superiores têm pior sobrevida em univariada (p = 0,0038, HR = 3,89) e multivariada quando controlados para (i) estágio clínico (p = 0,055, HR = 2,57), e (ii) estágio clínico e escore de Gleason ( p = 0,043, HR = 2,61). Nós ainda realizado sequenciamento genômico bisulfite em 2 genes relativamente desconhecidos para demonstrar a robustez dos resultados do ensaio. PHYMA é, portanto, uma assinatura com alta sensibilidade e especificidade para discriminar tumores de BPH, e tem um potencial papel na detecção precoce e na previsão de sobrevivência

Citation:. Goh LK, Liem N, Vijayaraghavan A, Chen G, Lim PL, Tay KJ, et ai. (2014) diagnóstico e prognóstico Utility de uma assinatura hypermethylated Gene DNA no câncer de próstata. PLoS ONE 9 (3): e91666. doi: 10.1371 /journal.pone.0091666

editor: Jörg D. Hoheisel, Deutsches Krebsforschungszentrum, Alemanha