Abstract

Fundo

aberração de metilação do DNA e microRNA desregulamentação (miRNA) foram observadas em muitos tipos de cancro. Um estudo sistemático de methylome e transcriptoma no carcinoma urotelial de bexiga nunca foi relatado.

Metodologia /Principais Achados

A metilação do DNA foi perfilado por cariotipagem digitais específicos de metilação modificado (MMSDK) ea expressão de mRNAs e miRNAs foi analisada por expressão do gene digitais (DGE) sequenciamento em tumores e combinados tecidos adjacentes normais obtidas a partir de pacientes com carcinoma urotelial 9 bexiga. Descobrimos que um conjunto de vias significativamente enriquecidos interrompidas no carcinoma urotelial da bexiga relacionados principalmente a “neurogênese” e “diferenciação celular” por análise integrada de dados -ómicas. Além disso, foi identificada uma coleção intrigante de genes relacionados ao câncer que foram desregulados nos níveis de metilação do DNA e expressão do mRNA, e nós validado vários destes genes (HIC1, Slit2, RASAL1 e KRT17) por Bissulfito Sequencing PCR e Transcrição Reversa qPCR em um painel de amostras de cancro da bexiga 33.

Conclusões /Significado

Foram caracterizados os perfis entre methylome e transcriptoma no carcinoma urotelial de bexiga, identificou um conjunto de vias principais significativamente enriquecidos, e selecionados quatro aberrante genes metilados e expressos. Conclusivamente, nossos achados lançar luz sobre uma nova avenida para a pesquisa básica câncer de bexiga

Citation:. Zhu J, Jiang Z, Gao F, Hu X, Zhou L, Chen J, et al. (2011) uma análise sistemática de DNA metilação ea expressão de ambos os mRNA e microRNA no cancro de bexiga. PLoS ONE 6 (11): e28223. doi: 10.1371 /journal.pone.0028223

editor: Amr H. Sawalha, da Universidade de Oklahoma e Oklahoma Medical Foundation Research, Estados Unidos da América

Recebido: 05 de julho de 2011; Aceito: 03 de novembro de 2011; Publicado: November 30, 2011