Sumário
ARN anti-sentido transcrito HOX intergénica (
HOTAIR
) é um longo ARN não codificante (lncRNA) que funciona como uma molécula de oncogénica em células de cancro diferentes. variantes genéticas de
HOTAIR
pode afectar a actividade de certos factores de regulação e de continuar a regular a expressão aberrante de
HOTAIR
, o que pode ser subjacente mecanismos que afetam a susceptibilidade do tumor e prognóstico. Recentemente, vários estudos têm sido realizados para examinar a possível ligação entre os polimorfismos em
HOTAIR
eo risco de câncer; no entanto, os resultados foram inconclusivos. Por isso, foi realizada uma meta-análise para estimar as associações entre
HOTAIR
polimorfismos (rs920778, rs4759314 e rs1899663) e risco de câncer. Oito estudos que compreendem 7,151 casos e 8,740 controles foram incluídos em nosso estudo. No geral, há associações significativas entre o
foram observados HOTAIR
polimorfismos (rs920778, rs4759314 e rs1899663) e risco de câncer. No entanto, em análises mais estratificados, o alelo variante T de rs920778 exibiram um aumento significativo do risco de desenvolver cancros digestivos (modelo dominante: OR = 1,44; IC95% = 1,31-1,59). Tais descobertas proporcionam evidência de que
HOTAIR
rs920778 podem modificar a suscetibilidade a certos tipos de câncer. Novos estudos que incorporam indivíduos com diferentes origens étnicas combinados com re-sequenciamento da região marcados e avaliações funcionais são garantidos
Citation:. Tian T, Li C, Xiao J, Shen Y, Lu Y, Jiang L, et ai. (2016) Avaliação quantitativa dos polimorfismos no
HOTAIR
lncRNA e Risco de Câncer: uma meta-análise de 8 Estudos de Caso-Controle. PLoS ONE 11 (3): e0152296. doi: 10.1371 /journal.pone.0152296
editor: Qing-Yi Wei, Cancer Institute, Duke, Estados Unidos
Recebido: 08 de dezembro de 2015; Aceito: 12 de março de 2016; Publicação: 24 de março de 2016
Direitos de autor: © 2016 Tian et al. Este é um artigo de acesso aberto distribuído sob os termos da Licença Creative Commons Attribution, que permite uso irrestrito, distribuição e reprodução em qualquer meio, desde que o autor original ea fonte sejam creditados
Data Availability:. Todos relevante os dados estão dentro do papel e seus arquivos de suporte de informação
Financiamento:. Este trabalho foi financiado pela National Science Foundation Natural da China (81502876), a Pesquisa de Ciências Naturais de Instituições de Ensino Superior Jiangsu (15KJB330006), a Ciência e Programa de Tecnologia de Nantong City (MS22015088) e da Fundação de Pesquisa de Doutorado Científico da Universidade de Nantong (14R16). As fontes de financiamento não teve nenhum papel a desempenhar no desenho do estudo, a recolha e interpretação dos dados, elaboração do relatório, ou a decisão de apresentar este artigo para publicação
Conflito de interesses:. Os autores declararam que nenhum existem interesses conflitantes.
Introdução
os cânceres são a principal causa de mortes em todo o mundo. Segundo estimativas da OMS, havia 14,1 milhões de novos casos de câncer em 2012, e mais de 20 milhões de novos casos de câncer serão esperados anualmente tão cedo quanto 2025, indicando uma crescente carga global do câncer [1]. Geralmente, os cancros são consideradas doenças multifatoriais, ea ocorrência de cânceres estão relacionados a fatores ambientais, genéticos e estilo de vida. Entre esses fatores, os fatores genéticos são de particular interesse, especialmente porque recentes estudos de associação do genoma (GWAS) e da próxima geração de sequenciamento (NGS) têm muito aumentadas nossa compreensão das variações genéticas que conferem riscos para cânceres.
RNAs não-codificantes longas (lncRNAs) são um tipo de ARN não codificante (ncRNA) que contêm mais do que 200 nucleótidos e não codificam proteínas, mas tem um papel central em diversas funções biológicas. Relatos recentes sugerem que a expressão aberrante de lncRNAs pode desempenhar papéis importantes no desenvolvimento e progressão de tumores [2,3,4] que são provavelmente mediados através de alterações ao nível da transcrição, cromatina ou pós-transcricional que influenciam a expressão do gene alvo [5] . Além disso, identificaram com êxito GWASs vários polimorfismos lncRNA que estão associados com o risco de desenvolver diferentes tipos de cancro. No entanto, semelhante ao outro relatado GWAS, a maioria dos SNPs lncRNA que foram identificadas por GWAS foram mapeados para regiões intergénicas ou intrões que não codificam proteínas, e as funções potenciais desses SNPs na patogénese do cancro permanecem indefinidos. Além disso, devido aos critérios de selecção rigorosas de GWASs, alguns lncRNAs causais putativos e variantes que estão associados com a carcinogénese pode ter sido em grande parte ser ignorado. Assim, esforços adicionais voltados para lncRNAs candidatos que funcionam no desenvolvimento de câncer pode ser conveniente para descobrir parte da hereditariedade em falta. Um tal lncRNA é o transcrito de ARN anti-sentido HOX intergénica (
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), a função dos quais tem sido demonstrado ser intimamente relacionada com o desenvolvimento e progressão de alguns tipos de cancro [6,7,8].
até o momento, a relação entre a expressão aberrante de
HOTAIR Comprar e prognóstico do câncer tem sido explorado por muitos pesquisadores. Além disso, meta-análises demonstraram que a expressão aberrante de
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pode servir como um indicador de que prediz mau prognóstico tanto no câncer geral [9], nomeadamente os tipos de cânceres (por exemplo, os cancros do sistema digestivo e estrogénios tumores malignos dependentes) [10,11,12]. Além disso, uma meta-análise realizada por Cai et al. revelou que a sobre-expressão de
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está significativamente associado a metástases linfonodais em pacientes com câncer, o que pode afectar ainda mais o prognóstico de câncer [13].
Em 2015, Bayram S et al. demonstrou que rs920778 SNP de
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está significativamente associado à fase avançada TNM, metástases à distância e grau histológico pobres em pacientes com câncer de mama, o que indica que esse polimorfismo pode estar associada com o prognóstico do cancro da mama [14]. Do mesmo modo, tem sido relatado que um outro SNP em
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(rs12826786) está associada com as características clinicopatológicas envolvidos na progressão cárdia adenocarcinoma gástrico [15]. Além disso, as relações de
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polimorfismos (incluindo rs4759314 e rs920778) com a expressão de
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e vários riscos de câncer foram observados [15,16,17,18]. Além disso, Zhang et al. informou que rs920778 SNP em
HOTAIR
podem alterar a atividade de um romance intrônica
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potenciador [17]. Assim, é biologicamente possível que as variantes genéticas de
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possam afectar as actividades de certos fatores regulatórios e continuar a regular a expressão aberrante de
HOTAIR
, o que pode ser um dos mecanismos subjacentes que afectar a susceptibilidade do tumor e prognóstico. Como esperado, as relações
HOTAIR
de polimorfismos com sensibilidades a cancros têm atraído muito interesse [14,15,16,17,18,19,20,21]. No entanto, os resultados dos estudos que têm explorado essa associação não são conclusivos. Por exemplo, um relatório de estudo anterior que o genótipo variante rs920778 aumenta significativamente o risco de câncer gástrico no povo chinês [16]; No entanto, entre as pessoas turcos, a mesma variante não exibiram associação significativa, e os valores de efeitos foram ainda na direcção oposta relativamente aos estudos anteriores de populações Chinês [19]. Portanto, com base em todos os dados publicados atualmente, foi realizada uma meta-análise para caracterizar mais precisamente as associações de
HOTAIR
polimorfismos (rs920778, rs4759314 e rs1899663), com o risco de câncer.
Materiais e Métodos
Identificação e elegibilidade dos estudos relevantes
a pesquisa bibliográfica abrangente de PubMed e Embase até 30 de novembro de 2015 foi realizada utilizando as seguintes palavras-chave: ( “
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“ou” HOX transcrito anti-sentido intergénica ARN “) e (” cancro “,” carcinoma “,” tumor “,” tumor “, ou” neoplasia “) e (” polimorfismo “,” variante “,” variante “, ou” mutação”). As referências em artigos recuperados também foram revisados para possível inclusão. Somente publicações escritas em Inglês, com artigos de texto completo disponíveis foram incluídos nesta meta-análise. Os estudos foram incluídos se eles preencheram os seguintes critérios de elegibilidade: (1) Estudos de caso-controle com foco na relação entre
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polimorfismos e qualquer tipo de câncer, (2) mais de dois artigos para cada estudou
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polimorfismo, (3) as informações disponíveis sobre a frequência de genótipo de cada incluídos
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SNP (ou seja, rs920778, rs4759314 ou rs1899663), e (4) publicado como um trabalho completo em Inglês. As principais razões para a exclusão dos estudos foram os seguintes: (1) não incidiu sobre o risco de câncer, (2) não estudou o
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SNPs (rs920778, rs4759314 ou rs1899663), (3) não reportaram os dados de freqüência do genótipo relevante, (4) não publicados em Inglês, e (5) de pesquisa não-humana. Em última análise, um total de 8 artigos incluindo 7,151 casos e 8,740 controles foram incluídos nesta meta-análise (Fig 1).
Dados extração
Dois investigadores (TT e LJ) de forma independente extraíram os dados e chegaram a um consenso a respeito de todos os itens. As informações a seguir foi procurado de cada artigo: o nome do primeiro autor, ano de publicação, país de origem, etnia, tipo de câncer, o número de casos e controles, plataforma de genotipagem e genotipados SNPs. Nós classificou as diferentes etnias como caucasianos e asiáticos.
A análise estatística
O risco de cancro associado a cada
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polimorfismo foi estimada para cada estudo, utilizando a razão de chances (OR ) e o seu intervalo de confiança de 95% (IC 95%). A heterogeneidade entre os estudos foi examinada com um
Q
teste estatístico qui-quadrado-base, e
P
≤ 0,05 foi considerado estatisticamente significativo. Nós agrupados os resultados usando modelos de efeito fixo quando a heterogeneidade entre os estudos estava ausente. Caso contrário, foi selecionado um modelo de efeitos aleatórios. Subsequentemente, foram avaliados os riscos de o heterozigoto e genótipos homozigóticos variantes em relação ao genótipo homozigoto de tipo selvagem e, em seguida, avaliou os riscos de o heterozigoto combinadas e variante genótipos homozigotos em relação ao genótipo homozigoto de tipo selvagem enquanto assumindo os efeitos dominantes da variante alelo. Para rs920778, nós também realizadas análises uma estratificação com base na etnia (dividido em caucasianos e asiáticos) e tipos de câncer. parcelas funil e teste de Begg foram utilizados para avaliar o viés de publicação. Todas as análises foram realizadas com o Stata versão 12.0 (Stata Corporation, College Station, TX, EUA).
anotação funcional com base em bancos de dados publicamente disponíveis
O SNPs em alta LD (
r
2 ≥ 0,80) com as rs920778 SNP marcadores foram identificados de acordo com SNAP 2,2 (https://www.broadinstitute.org/mpg/snap/ldsearch.php/). Quantitative Trait Loci análise de expressão (eQTL) foi realizada com base no banco de dados do projeto genótipo-Tissue expressão (Gtex) (https://www.gtexportal.org/home/). As influências dos SNPs no miRNA ligação foram previstas com um serviço online (https://www.bioguo.org/miRNASNP2/). Além disso, outros resultados anotação funcional foram obtidos a partir da base de dados ENCODE (https://genome.ucsc.edu/ENCODE/).
Resultados
Características dos estudos publicados
Após a aplicação dos critérios de seleção rigorosos, 8 artigos que incluíram um total de 7,151 casos e 8,740 controles portadores de câncer gástrico, câncer de mama, câncer colorretal e carcinoma de células escamosas do esôfago (ESCCs) acabaram por ser incluídos na análise quantitativa atual. As características gerais dos estudos incluídos estão listados na Tabela 1, e os estudos excluídos são listados na Tabela S1. Entre os estudos incluídos, seis estudos foram conduzidos em populações asiáticos (chineses), e dois estudos foram conduzidos em populações Caucasiano (Turco). Os anos de publicação dos estudos incluídos foram entre 2014 e 2015, e a gama de tamanhos de amostra foi de 245 para 4.248. Um total de quatro artigos relataram os efeitos da
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polimorfismos em câncer gástrico, duas no cancro da mama, uma em carcinoma de células escamosas esofágico (CCEE), e um em câncer colorretal. Entre os estudos que exploraram as relações de
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SNPs com o risco de câncer, cinco focada no SNP rs920778, seis no SNP rs4759314 e três do SNP rs1899663. A genotipagem foi realizada utilizando TaqMan em 4 estudos, PCR-RFLP em 3 estudos e CRS-RFLP em um estudo. As distribuições dos genótipos e alelos do
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polimorfismos (rs920778, rs4759314 e rs1899663) nos estudos individuais estão listadas nas Tabelas S2-S4.
As avaliações de qualidade da incluído estudos
a qualidade metodológica de cada estudo incluído foi avaliada usando a escala de avaliação da qualidade Newcastle-Ottawa (NOS). Usando este método, cada estudo foi julgado em critérios padrão e, posteriormente, classificados com base em três fatores: seleção, comparabilidade e exposição. escores sumários que variam de 0 a 9 pontos foram calculados, e os escores mais elevados indicam menor risco de viés (S5 tabela).
síntese quantitativa
As avaliações das associações de rs920778 com os riscos de câncer são apresentados na Tabela 2. em geral, a variante do alelo T não exibiram uma associação significativa com o risco de cancro em qualquer um dos modelos testados (CT contra CC: OR = 1,11, IC 95% = 0,86-1,44;
P = 0,014 para
o teste de heterogeneidade,
I
2
= 67,8%; TT contra o CC: OR = 1,55; IC95% = 0,84-2,85;
P = 0,000
para o teste de heterogeneidade,
I
2
= 85,8%; modelo dominante: OR = 1,20; IC95% = 0,92-1,57,
P = 0,005
para o teste de heterogeneidade,
I
2
= 73,2%; Fig 2)
a seguir, avaliou o efeito da rs920778. polimorfismo no risco de câncer entre os subgrupos (Tabela 2). Em análises estratificadas, foi observado um aumento significativo do risco de câncer entre os asiáticos (chinês, modelo dominante: OR = 1,46; IC95% = 1,32-1,61;
P
= 0,953 para o teste de heterogeneidade,
I
2
= 0,0%). Em contraste, um significativamente diminuído foi observado risco de câncer entre os caucasianos (turco; modelo dominante: OR = 0,65; IC95% = 0,42-1,00;
P
= 0,080 para o teste de heterogeneidade,
I
2
= 67,4%). Além disso, porque a maioria (60%, 05/03) dos estudos incluídos em nossa meta-análise envolveu cancros digestivos (câncer gástrico e ESCC), nós então realizada uma análise separada para os cancros digestivos. Curiosamente, a variante rs920778 exibiram uma associação significativa com o aumento do risco de cancros digestivos (modelo dominante: OR = 1,44; IC95% = 1,31-1,59;
P
= 0,339 para o teste de heterogeneidade,
I
2
= 7,6%;. Tabela 2)
as avaliações de as associações entre os outros 2 SNPs (rs4759314 e rs1899663) e risco de câncer são apresentados nas figuras 3 e 4. no geral, o alelo variante G do rs4759314 exibiu nenhuma associação significativa com o risco de câncer (modelo dominante: OR = 1,05; IC95% = 0,86-1,27,
P
= 0,024 para o teste de heterogeneidade,
I
2
= 61,5%). O alelo variante T de rs1899663 também exibiu nenhuma associação significativa com o risco de câncer (modelo dominante: OR = 0,77; IC95% = 0,51-1,15,
P
= 0,000 para o teste de heterogeneidade,
I
2
= 89,3%).
Teste de heterogeneidade
Para rs920778, foi observada uma heterogeneidade significativa após os dados foram combinados ( modelo dominante:
P Compra de heterogeneidade = 0,005,
I
2
= 73,2%). (Tabela 2) Quando os indivíduos foram estratificados com base na etnia, a heterogeneidade, obviamente, desapareceu nos asiáticos (modelo dominante:
P Compra de heterogeneidade = 0,953,
I
2
= 0,0%); no entanto, a heterogeneidade ainda estava presente entre os caucasianos (modelo dominante:
P Compra de heterogeneidade = 0,080,
I
2
= 67,4%), o que pode ter sido devido à heterogeneidade genética entre as diferentes etnias incluídos. Além disso, na análise estratificada com base nos tipos de câncer, a heterogeneidade foi significativamente reduzida para os cancros digestivos (modelo dominante:
P Compra de heterogeneidade = 0,339,
I
2
= 7,6%).
análise de sensibilidade
Para testar a estabilidade dos resultados rs920778, realizamos análises de sensibilidade, removendo sequencialmente cada estudo elegível (S6 Tabela). O estudo de Bayram et al. que incidiu sobre câncer de mama foi o principal contribuinte da heterogeneidade no modelo dominante (
I
2
= 73,2%,
P Compra de heterogeneidade = 0,005). Após a remoção deste estudo, a heterogeneidade foi significativamente reduzida (
I
2
= 0,0%,
P Compra de heterogeneidade = 0,536). Como esperado, foram observados resultados semelhantes nos outros modelos genéticos (ou seja, contra CT TT CC e contra CC) e indicou que o estudo por Bayram et ai. que incidiu sobre o câncer de mama altera profundamente o comportamento ou centralizadas.
O viés de publicação
Nós usamos parcelas funil e teste de Begg para avaliar potenciais vieses de publicação da literatura estudada. Como ilustrado na S1-S3 figos, as formas das parcelas funil eram simétricos, e um teste de Begg forneceu mais evidências estatísticas para a ausência de viés de publicação (
P
= 0,14 para rs920778,
P
= 0,85 para rs4759314, e
P
= 0,60 para rs1899663).
Discussão
recentemente, um número crescente de estudos investigaram as associações de diferentes
HOTAIR
níveis de expressão com a sobrevida câncer, mas poucos estudos têm-se centrado atenção específica sobre as relações de
hOTAIR
polimorfismos com sensibilidade e de sobrevivência de câncer. No entanto, as relações de
HOTAIR
polimorfismos com sensibilidades câncer têm atraído muito interesse; No entanto, os resultados são controversos. No presente estudo, foi realizada uma meta-análise de agrupamento 8 estudos com totais de 7,151 casos e 8,740 controles e demonstrou que o alelo T do rs920778 foi associada a um aumento significativo do risco de cancros digestivos. No entanto, os rs4759314 e rs1899663 variantes alelos não apresentaram associações significativas com o risco de câncer.
O SNP rs920778 em 12q13.13 está localizado no intrão 2 de
HOTAIR
. Com base em conjuntos de dados públicos e ferramentas (veja Métodos; S7 Tabela), foi realizada mais de anotações funcionais dos rs920778 marcador SNP e os SNPs que estão em forte LD com rs920778 (
r
2 0,8). Entre os 11 SNPs que foram encontrados para estar em forte LD com rs920778, efeitos significativos específicas de genótipo de 5 SNPs (ou seja, rs10783618, rs11170775, rs4759059, rs4237809 e rs2366150) sobre a expressão de mRNA de
HOTAIR
foram observados (análise eQTL). Posteriormente, nós exploramos os possíveis mecanismos pelos quais esses SNPs modulam a expressão de
HOTAIR
. De acordo com os dados do chip-Seq do banco de dados CODIFICAR (https://genome.ucsc.edu/ENCODE/), um total de 10 SNPs foram localizados em motivos que pode afectar as actividades de ligação de inúmeros factores de transcrição, incluindo EZH2, CTBP2 , CHD1, ZNF143, SUZ12, TCF7L2, CTCF, RAD21, e YY1. Os factores de transcrição mencionados acima podem ser intimamente ligado com o aparecimento e progressão de muitos tipos de tumores em humanos. Por exemplo, potenciador de zeste homólogo 2 (EZH2) é sobre-expresso em diversos tumores humanos e representa a agressividade e prognósticos desfavoráveis de vários tumores [22,23]. Além disso, a proteína supressora de zeste-12 (SUZ12) é de grande importância na tumorigénese de vários cancros humanos [24,25] e está envolvida na progressão de cancro do pulmão de não pequenas células, através do seu papel na promoção da proliferação celular e metástase [26]. Além disso, como previsto por uma análise de ligação ao sítio de miARN (https://www.bioguo.org/miRNASNP2/), o SNP rs7958904 pode afectar a actividade de ligação do conjugado de HSA-miR-615. Este miARN é um supressor de tumor recentemente identificada que pode regular a proliferação, migração, invasão e apoptose de vários tipos de células cancerosas [27,28]. Assim, estas anotações funcionais sugerem que os SNPs acima mencionados (incluindo os rs920778 SNP marcadores e os SNPs marcada) pode influenciar separadamente ou em conjunto, as actividades aberrantes de determinados factores de transcrição ou miARNs e afectar ainda mais a ocorrência e progressão de certos tumores através de diferentes mecanismos . No entanto, evidências experimentais de validação dessa hipótese é limitado e estudos funcionais futuros são necessários para esclarecer os possíveis mecanismos.
Nesta meta-análise, não identificamos uma relação significativa do SNP rs920778 com o risco de câncer. No entanto, de acordo com as análises estratificadas por etnia população, o SNP rs920778 foi significativamente associada com um risco aumentado de câncer nos asiáticos (chineses). Em contrapartida, verificou-se que o polimorfismo rs920778 exibiram a associação oposto, com o risco de câncer em caucasianos (Turco). As possíveis razões para os resultados diferentes entre asiáticos e caucasianos são os seguintes. Em primeiro lugar, a diferença pode ter resultado de diferenças nas origens genéticas das populações estudadas. Por exemplo, com base nos dados do HapMap (Projeto Internacional HapMap), as frequências de alelos do SNP rs920778 são diferentes entre as populações asiáticas e caucasianos. Em segundo lugar, a diferença pode dever à utilização de diferentes métodos de genotipagem, que incluiu PCR-RFLP, CRS-RFLP, TaqMan PCR em tempo real, etc. Em terceiro lugar, em comparação com populações asiáticas, os tamanhos das amostras das populações caucasianas não poderia ter sido suficientemente grande para chegar a uma conclusão convincente sobre a associação do SNP rs920778 com o risco de câncer. Além disso, os diferentes tipos de cânceres envolvidos e erros aleatórios também podem ser razões potenciais para as diferenças nos resultados entre asiáticos e caucasianos.
Em 2014, Deng et al. conduziram uma meta-análise que revelou que
HOTAIR
abundância pode servir como um novo fator preditivo para o prognóstico de câncer pobres [9]. Os resultados deste estudo e os nossos resultados ambos mostram relações significativas entre
HOTAIR
e câncer. Os resultados do nosso estudo prova, desde que
HOTAIR
polimorfismos pode modificar a suscetibilidade ao câncer. Infelizmente, em sua meta-análise do valor prognóstico da
HOTAIR
em câncer, Deng et al. não explorar as associações de
HOTAIR
polimorfismos com prognósticos de câncer, ea pesquisa relevante sobre
HOTAIR
polimorfismos e prognósticos do câncer é limitado. No entanto, com base em ambas as conclusões e resultados anotação funcional, especula-se que
HOTAIR
polimorfismos pode regular a expressão de
HOTAIR Comprar e afectar ainda mais o desenvolvimento e progressão de cancro através de certos mecanismos sublinhado, o que pode abrir novas caminhos para a prevenção e tratamento do câncer.
a força desta meta-análise é que nós sistematicamente em revista as relações entre
hOTAIR
polimorfismos e susceptibilidade do tumor, pela primeira vez, e nós identificamos diferente associações do SNP rs920778 com o risco de câncer em diferentes populações étnicas. Além disso, as anotações funcionais bem concebido que ainda verificados nossas descobertas são outra força deste estudo. No entanto, também existem algumas limitações que precisam ser abordadas. Em primeiro lugar, foi observada uma heterogeneidade significativa entre os estudos. Entre os 8 estudos publicados incluídos em nossa meta-análise, alguns dos estudos foram de base populacional, enquanto outros eram de base hospitalar. Em segundo lugar, nós não pesquisar bancos de dados chineses, o que resultará em um viés de publicação. Em terceiro lugar, em alguns dos estudos, informações detalhadas (por exemplo, idade, sexo, tabagismo e consumo de álcool) não foi fornecida, o que limita ainda mais a estratificação analisa. Além disso, se tivéssemos sido capazes de adquirir informações mais detalhadas, teríamos conseguido estimativas mais precisas através do ajuste para outras variáveis potenciais. Finalmente, para este estudo, foram coletadas apenas 8 relatórios. A maioria dos indivíduos eram asiáticos, eo número de indivíduos caucasianos incluídos neste estudo foi relativamente pequeno. Assim, estudos quantitativos bem conduzidos são necessários para explorar ainda mais os riscos de cancro associados
HOTAIR
SNPs, especialmente em caucasianos.
Conclusões
Esta meta-análise fornecida evidência de que
HOTAIR
rs920778 podem modificar a suscetibilidade a certos tipos de câncer. Novos estudos que incorporam indivíduos com diferentes origens étnicas combinados com re-sequenciamento da região marcados e avaliações funcionais são garantidos.
Informações de Apoio
S1 Fig. gráfico de funil para um viés de publicação do
(foi usada gráfico de funil com pseudo limites de confiança de 95%) HOTAIR
polimorfismo rs920778 eo risco de câncer sob o modelo dominante
doi:. 10.1371 /journal.pone.0152296.s001
(TIF)
S2 Fig. gráfico de funil para um viés de publicação do
(foi usada gráfico de funil com pseudo limites de confiança de 95%) HOTAIR
polimorfismo rs4759314 eo risco de câncer sob o modelo dominante
doi:. 10.1371 /journal.pone.0152296.s002
(TIF)
S3 Fig. gráfico de funil para um viés de publicação do
(foi usada gráfico de funil com pseudo limites de confiança de 95%) HOTAIR
polimorfismo rs1899663 eo risco de câncer sob o modelo dominante
doi:. 10.1371 /journal.pone.0152296.s003
(TIF)
S1 Table. Lista de artigos excluídos e as suas razões para a exclusão
doi:. 10.1371 /journal.pone.0152296.s004
(DOCX)
S2 Table. Distribuições dos genótipos e alelos do
HOTAIR
polimorfismo rs920778
doi:. 10.1371 /journal.pone.0152296.s005
(DOCX)
S3 Tabela. Distribuições dos genótipos e alelos do
HOTAIR
polimorfismo rs4759314
doi:. 10.1371 /journal.pone.0152296.s006
(DOCX)
S4 Table. Distribuições dos genótipos e alelos do
HOTAIR
polimorfismo rs1899663
doi:. 10.1371 /journal.pone.0152296.s007
(DOCX)
S5 Table. Newcastle-Ottawa escala de avaliação da qualidade de cada estudo incluído
doi:. 10.1371 /journal.pone.0152296.s008
(DOCX)
S6 Table. Análise de sensibilidade dos rs920778 no modelo dominante
doi:. 10.1371 /journal.pone.0152296.s009
(DOCX)
S7 Table. anotação funcional para os rs920778 marcador SNP e os SNPs em forte desequilíbrio de ligação com o SNP marcador
doi:. 10.1371 /journal.pone.0152296.s010
(DOCX)