Abstract

Fundo

Atualmente, o prognóstico para pancreático ductal adenocarcinoma (PDAC) é com base em um sistema de estadiamento clínico grosseira. Assim, são necessários testes prognósticos mais precisos para pacientes PDAC para auxiliar as decisões de tratamento.

métodos e resultados

Affymetrix perfil de expressão gênica foi realizada em 15 tumores PDAC humanos e dos dados que identificou um 13-gene assinatura de expressão (escore de risco) que se correlacionaram com a sobrevida do paciente. O escore de risco expressão do gene foi então validado de forma independente usando dados de expressão de genes publicados e dados de sobrevivência para um adicional de 101 pacientes com câncer de pâncreas. Os pacientes com escores de alto risco tinham significativamente maior risco de morte em comparação com pacientes com escores de baixo risco (HR 2,27, p = 0,002). Quando o marcador 13-gene foi combinada com o estado do linfonodo o risco-pontuação discriminados ainda mais a duração do tempo de sobrevivência do paciente (p 0,001). Os pacientes com uma pontuação de alto risco teve pobres independente de sobrevivência do estado nodal; no entanto, o estado nodal maior previsibilidade para a sobrevivência em pacientes com uma pontuação gene assinatura de baixo risco (baixo risco N1 vs. N0 de baixo risco: HR = 2,0, p = 0,002). Enquanto estágio AJCC correlacionada com a sobrevida do paciente (p = 0,03), a pontuação de 13 gene foi superior na previsão de sobrevivência. Dos 13 genes que compõem o modelo preditivo, quatro foram mostrados para ser importante no PDAC, seis são não declarada no PDAC, mas importante em outros tipos de câncer, e três são não declarada em qualquer tipo de câncer.

Conclusões

Identificamos uma assinatura de expressão de 13 genes que prediz sobrevida de pacientes PDAC e poderia revelar-se útil para a tomada de decisões de tratamento. Este escore de risco deve ser avaliada prospectivamente em ensaios clínicos para o prognóstico e para predizer a resposta à quimioterapia. A investigação de novos genes identificados no nosso modelo pode levar-se a novos alvos terapêuticos

citação:. Newhook TE, Blais EM, Lindberg JM, Adair SJ, Xin W, Lee JK, et ai. (2014) A Treze-Gene Expression Assinatura prediz sobrevida de pacientes com cancro do pâncreas e identifica novos genes de interesse. PLoS ONE 9 (9): e105631. doi: 10.1371 /journal.pone.0105631

editor: Alfons Navarro, da Universidade de Barcelona, ​​Espanha |

Recebido: 15 Abril de 2014; Aceito: 22 de julho de 2014; Publicação: 02 de setembro de 2014

Direitos de autor: © 2014 Newhook et al. Este é um artigo de acesso aberto distribuído sob os termos da Licença Creative Commons Attribution, que permite uso irrestrito, distribuição e reprodução em qualquer meio, desde que o autor original ea fonte sejam creditados

Data Availability:. O autores confirmam que todos os dados subjacentes às conclusões estão totalmente disponíveis sem restrições. Os dados apresentados nesta publicação foram depositados em Gene Expression Omnibus NCBI e são acessíveis através do número de acesso GEO Series GSE46385

Financiamento:.. Os autores não têm financiamento ou apoio ao relatório

Conflito de interesses :. os autores declararam que não existem interesses conflitantes

Introdução

pâncreas adenocarcinoma ductal (PDAC) tem a duração mais curta sobrevivência de qualquer doença maligna de órgãos sólidos [1], [2]. Atualmente, o prognóstico para pacientes com PDAC é baseado no 7

th edição do American Joint Committee on Cancer (AJCC) sistema de estadiamento que leva em conta a dimensão e as propriedades invasivas do tumor ea presença de doença metastática nodal e distante [3 ]. Este sistema de estadiamento continua a ser a principal consideração pelos médicos para determinar o tratamento adequado, bem como oferecer informações de prognóstico para pacientes e familiares [3]. gamas significativa na sobrevivência existir dentro estágios clínicos individuais AJCC [4], [5], [6]; por exemplo, pacientes com estágio IV pode viver apenas algumas semanas após o diagnóstico ou podem viver mais do que um ou dois anos com o tratamento. É provável que esta variação intra-estágio é devido à expressão do gene tumor heterogêneo resultando em diferenças na biologia do tumor.

Nós relatamos a identificação e validação de uma assinatura de expressão de 13 genes que prediz a sobrevivência de doentes com PDAC com estratificação dos pacientes em grupos de alto e baixo risco com base na expressão coordenada de genes definidos pela assinatura de expressão gênica. Avaliação do estado do linfonodo ainda acrescentou à eficácia do prognóstico da assinatura. Os genes e vias cuja expressão torna-se a assinatura de 13 genes representam possíveis alvos para novas pesquisas sobre a biologia dos tumores PDAC.

Métodos

Declaração de Ética

coleta de amostras PDAC e processamento foram realizadas com a aprovação do Conselho de revisão Institucional da Universidade da Virgínia, em coordenação com o biorrepositório e Tissue Research Facility. Todos os pacientes forneceram consentimento por escrito para a participação. Este estudo foi realizado em estrita conformidade com as recomendações contidas no Guia para o Cuidado e Uso de Animais de Laboratório dos Institutos Nacionais de Saúde [7]. O protocolo foi aprovado pelo Comitê de Cuidado e Uso Animal da Universidade de Virginia (PHS Assurance # A3245-01).

Propagação de tumores de pacientes-Derived em ratinhos imunocomprometidos para Gene Expression Profiling

a recolha, exame patológico, e a propagação de espécimes PDAC derivados de paciente humano em ratinhos imunocomprometidos foram realizados como previamente descrito [8], [9]. Após a ressecção cirúrgica e avaliação patológico do tumor do paciente, tecidos de tumor residuais foram recolhidos e colocados no Roswell Park Memorial Institute meios (RPMI) para o transplante cirúrgico em ratos. Seis a oito semanas de idade, do sexo masculino, foram usadas não obesas, diabéticas, grave imunodeficiência combinada (NOD SCID) e murganhos nus atímicos (National Cancer Institute, Fredricksbu, MD). Para conseguir o enxerto mais eficiente durante o estabelecimento inicial da linha de tumor PDAC humana, ratinhos NOD SCID foram usadas para as primeiras duas gerações. Para a propagação da linha de tumor para além destas duas primeiras gerações, foram utilizados ratinhos nus atimicos, em que mantêm a imunidade inata (células assassinas naturais, os linfócitos B, células que apresentam antigénios, e complementar a actividade), a qual é dificultada em ratinhos NOD SCID. Os ratos foram alojados em condições livres de patógenos, aclimatados ao novo ambiente durante pelo menos 48 horas antes do enxerto do tumor, e mantidos de acordo com as normas institucionais. Todos os animais cirurgia foi realizada sob anestesia com 2,2,2-tribromoetanol (4 mg /10 g de peso corporal). camundongos pós-cirurgia foram administrados cetoprofeno 0,1 mg para controle da dor e foram observados continuamente para detectar sinais de dor ou angústia (hipoatividade, inquietação, vocalização, escondendo, falta de higiene, postura anormal, tremores ou dificuldade respiratória), até que se recuperou da anestesia, em seguida, monitorados diariamente durante 48 horas para detectar sinais de dor ou angústia. endpoints humanas foram observados ao longo experimentos com ratos serem sacrificados quando os tumores atingiram um volume maior de 1500 mm

3 por avaliação de MRI ou quando ratinhos desenvolveram 15% de perda de peso. Os ratinhos foram sacrificados por anestesia de isofluorano, seguido por deslocação cervical.

tumores humanos foram implantados cirurgicamente para o pâncreas dos murganhos imediatamente após a ressecção a partir de um paciente ou de xenoenxerto de geração anterior. Uma incisão flanco esquerdo de 1,5 cm foi usado para acessar o peritônio de ratos anestesiados, o pâncreas foi exteriorizado com um cotonete estéril e um pequeno pedaço (~ 25 mm

3) de tumor fresco paciente foi suturada sobre o pâncreas, usando 5 -0 Prolene (Ethicon, Cornelia, GA). O pâncreas foi reposicionada e que a ferida fechada com 4-0 Vicryl (Ethicon).

tecido tumoral humano compreendendo tumor e estroma associado (sem microdissecção a laser) foi preservado após a colheita de xenotransplantes individuais usando AllProtect (Qiagen, Valencia , CA) para a preservação RNA eficiente. homogeneização do tecido foi realizada utilizando o TissueLyzer LT (Qiagen) e extracção de RNA foi realizada usando o kit RNAeasy (Qiagen), de acordo com as instruções do fabricante. análise da expressão gênica usando a plataforma Affymetrix GeneChip (Affymetrix, Santa Clara, CA), utilizando o Genoma Humano U133 mais 2,0 Arrays eo GeneChipt 3 ‘IVT expresso Labeling ensaio foi realizado pela Facilidade Universidade de Virginia Biomolecular Research.

Desenvolvimento de gene prognóstico Assinatura e Análise estatística

conjuntos de dados de expressão de duas coortes distintas pacientes foram empregados para a modelagem de predição de genes e validação independente (Tabela 1). O primeiro conjunto de dados foi obtida a partir de uma coorte de 15 pacientes com cancro do pâncreas na Universidade da Virgínia (UVA-15; GSE46385) e foi utilizado para a descoberta de biomarcadores a expressão do gene e modelagem de predição para a sobrevivência do paciente. Para identificar um conjunto de dados de validação externa apropriada, realizamos uma pesquisa para a expressão de genes ligados e dados de sobrevivência global para pacientes com câncer pancreático nas seguintes bases de dados disponíveis publicamente: Centro Nacional de Informações sobre Biotecnologia – Gene Expression Omnibus (NCBI GEO; http: //www.ncbi.nlm.nih.gov/geo/), Laboratório Europeu de Biologia Molecular – Instituto Europeu de Bioinformática matriz Express (EBML EBI; https://www.ebi.ac.uk/arrayexpress/), The Cancer Genome Atlas (http : //cancergenome.nih.gov/), e Oncomine (https://www.oncomine.org/resource/login.html). A partir desta pesquisa, verificou-se um conjunto de dados derivada de uma coorte de 101 pacientes PDAC (Stratford-101; NCBI GEO Banco de Dados: GSE21501). Os segundos dados externos definidos relatado informação apropriada sobrevivência de 45 amostras de pacientes (PDAC GSE28735), de modo que o conjunto de dados externo maior (Stratford-101; GSE21501) foi selecionado como o conjunto de validação. dados de expressão matérias foram baixados do GEO, examinados para controle de qualidade e pré-processados ​​usando robusto multi-gama média (RMA) e métodos de normalização quantílicas no ambiente de programação R /Bioconductor. Os pacientes foram agrupados por período de sobrevida global em tempo de sobrevida curta (n = 7, intervalo de sobrevivência: 2,0-9,0 mo; mediana: 6,1 mo) e tempo de sobrevivência a longo (n = 8, faixa de sobrevivência: 10,6-32,8 mo; mediana: 13,7 mo , Fig. 1A). Usando o conjunto de dados UVA-15, os genes que foram significativamente diferencialmente expressos entre os grupos de sobrevivência curtas e longas foram identificados usando tanto teste não paramétrico de Wilcoxon e t de duas amostras-teste para identificar genes que foram consistentemente associados à sobrevida dos pacientes. Os dados foram ajustados a um modelo de regressão de riscos proporcionais de Cox utilizando as assinaturas METAGENE (componentes principais) de 15 genes com base em uma técnica de redução de dimensão estatística.

(A) de Kaplan-Meier de sobrevida global dos pacientes compreendendo a UVA 15 derivação conjunto agrupado por tempo de sobrevida curta (n = 7, intervalo de sobrevivência: 2,0-9,0 mo; mediana: 6,1 mo) e tempo de sobrevivência a longo (n = 8, faixa de sobrevivência: 10,6-32,8 mo; mediana: 13,7 mo; log- rank p 0,001). (B) A expressão de 13 genes para efeitos da obtenção de 15 tumor conjunto de pacientes com PDAC revela agrupamento em alta (bar roxo) e de baixo risco (barra amarela) populações. (C) Aplicação da assinatura de 13 gene a um conjunto de validação independente de 101 pacientes com PDAC localizada e ressecado revela agrupamento em alta (bar roxo) e grupos com base na expressão de genes de baixo risco (barra amarela). (D) de Kaplan-Meier de sobrevida global da validação independente definido de acordo com alto e grupos de baixo risco, conforme determinado pela assinatura de 13 gene (p = 0,001 log-rank).

a aplicação do modelo de regressão de Cox equipado de forma independente, foram determinados os tempos de sobrevivência para pacientes na coorte de Stratford-101. Os tempos de sobrevivência dos pacientes preditos Stratford-101 foram classificados e convertido em percentis – 1 para o paciente com o tempo de sobrevivência mais curto e 100 para o paciente com o tempo de sobrevivência mais longo. A significância estatística das pontuações de sobrevivência previstas foram avaliados em comparação com os tempos de sobrevivência de pacientes reais usando Student t de duas amostras-teste no cutoff pontuação óptima de predição (percentil) que maximizou o benefício de sobrevivência com o mais alto valor preditivo positivo para sobreviventes de longo prazo. Análise de sobrevivência de Kaplan-Meier também foi realizada neste ponto de corte. taxas de risco de risco também foram obtidos a partir do modelo de regressão de Cox para várias condições contrastantes de juros sobre a coorte de Stratford-101.

de nível Pathway mudanças de expressão gênica entre alto risco e pacientes de baixo risco do conjunto de dados Stratford-101 foram gene identificado utilizando análise de enriquecimento definido. conjuntos de genes anotados para Kyoto Encyclopedia of Genes e vias Genomas (KEGG) foram baixados da assinaturas moleculares de banco de dados [10], [11], [12]. Expressão muda para os genes e as vias KEGG foram avaliados utilizando modelos lineares para microarrays (limma) e análise de conjunto de genes variabilidade [13], [14], [15]. Um corte p-valor de 0,05 foi aplicado após a taxa de descoberta de falsas (FDR) correção.

Resultados

paciente e do tumor características

A tabela 1 resume as informações para os 15 pacientes que compreende a derivação definir os quais foram submetidos a cirurgia para PDAC na Universidade de Virginia. estágio do tumor variou de I a IV, com a maioria dos doentes com estádio IIb doença com nódulos linfáticos positivos. A 40% de pacientes na derivação definido com doença fase IV foram submetidos a excisão /biópsia de uma metástase (4 doentes com metástases hepáticas, um paciente com metástase peritoneal, e uma com metástase pleural), mas não foi submetido a ressecção do tumor primário. Nenhum doente no conjunto de derivação recebido qualquer forma de terapia neoadjuvante, enquanto todos os pacientes com doença localizada que foram submetidos a ressecção receberam quimioterapia pós-operatória baseada gemcitabina e 5 de 6 pacientes com doença metastática recebidos pós-operatório quimioterapia baseada em gemcitabina paliativos (Tabela 1 ).

Um total de 101 pacientes com PDAC localizado, ressecado compreendeu o conjunto de validação para a assinatura de expressão gênica [16]. A maioria dos pacientes deste grupo tiveram fase IIb PDAC (72%) e nenhum tinha insuficiência fase IV, como todos os tumores foram operável (Tabela 1). Frequência de neoadjuvante e terapias adjuvantes administrados para este grupo de doentes não estava disponível.

Identificação e validação de um 13-gene assinatura prognóstico

Os 13 genes que compõem a assinatura de expressão de 13 genes são descritos em tabela 2. Para avaliar a capacidade preditiva do candidato inicial 13-gene assinatura prognóstico avaliou um conjunto de dados de expressão gênica independente derivado de 101 pacientes com PDAC primária localizada [16]. O ponto de corte ótimo diferenciando baixo escore de risco vs. pontuação alto risco foi determinado como sendo 70 por meio da maximização do índice de Youden (sensibilidade + especificidade-1), com a restrição de que a proporção de pacientes de alto risco foi de pelo menos 10% ou superior para prática aplicações clínicas. O escore prognóstico 13-gene foi então aplicada com um ponto de corte de 70 (por exemplo, baixo risco: 70; alto risco: 70), que forneceu o benefício de sobrevivência significativo e diferença entre os pacientes com escore de alto risco baixo vs. na derivação conjunto de 15 doentes (Fig. 1a). mapas de calor da assinatura de expressão gênica para a UVA-15 derivação definido e 101-tumor conjunto de validação são apresentados na Figura 1. Esta aplicação da assinatura gene pacientes efetivamente estratificados em grupos de alto e de baixo risco, com uma mediana de sobrevida global (MS ) de 14.0. 21.0 v meses, respectivamente (Fig. 1D). Além disso, os pacientes no grupo de alto risco teve um aumento de risco maior do que duas vezes maior de morte, em comparação com os do grupo de baixo risco (HR 2,27 [95% IC 1,34-3,85], p = 0,002; A Fig. 1D) .

a assinatura de expressão de 13 genes prevê mais precisão a sobrevida dos pacientes PDAC quando combinado com o status nodal

a seguir, procurou, para refinar mais a nossa pontuação gene prognóstico, incorporando estado dos linfonodos com o escore de risco. Isso efetivamente estratificadas pacientes em quatro grupos – tiveram a pontuação de baixo risco, o nó-negativos (n = 22); pontuação de baixo risco, nódulo positivo (n = 48); pontuação de alto risco, linfonodos negativos (n = 6); e pontuação de alto risco, nódulo positivo (n = 25). Como demonstrado na Figura 2A, em pacientes de baixo risco, grupo nó-negativo teve a melhor prognóstico (MS: 41,0 MO), seguida de baixo risco, os pacientes com nódulo-positivo (MS: 18,0 meses). Pacientes com pontuação de alto risco tinham menor sobrevida mediana, independente do status do nó de linfa (nó-negativo: 15,5 mo; nódulo positivo:. 14,0 mo; p = NS; Fig 2A). Em comparação com baixo risco, os pacientes nó-negativo, o alto risco, os pacientes com gânglios positivos teve um quase 4 vezes maior risco de morte (HR [IC 95%: 1,75-8,10] = 3,77, p = 0,007), e de alta -risco, os pacientes nó-negativos teve aumento de 3 vezes ([IC 95%: 1,05-9,03] HR = 3,09, p = 0,007), enquanto que de baixo risco, os pacientes com gânglios positivos teve um 2 vezes maior risco (HR = [IC 95%: 0,98-3,88] 1,95, p = 0,007; Fig 2A)

Kaplan-Meier de sobrevida global de (a) um conjunto de validação de 101 pacientes com localizada, ressecado PDAC de acordo com 13-.. gene escore prognóstico combinado com o estado do linfonodo patológica no momento da cirurgia, e (B) os mesmos 101 pacientes agrupados de acordo com uma de alto risco 13-gene escore prognóstico sozinho ou baixo risco 13-gene escore prognóstico mais estatuto nodal patológica na momento da cirurgia

Curiosamente, o que é evidente a partir dos resultados acima mencionados é que os pacientes com tumores de alto risco com base na expressão do gene têm um mau prognóstico, independentemente do status nodal.; enquanto, o status nodal refina ainda mais o prognóstico para pacientes com tumores de baixo risco. Assim, existem três grupos de prognóstico distintos: os doentes de alto risco (n = 31; EM: 14,0 mo; Fig. 2B), de baixo risco, os pacientes com nódulo-positivo (n = 48; EM:. 18,0 mo; Figura 2B) e de baixo risco, os pacientes nó-negativos. (n = 22; MS: 41,0 mo; 2B)

análise Pathway revela vias principais diferencialmente expressos entre tumores com risco alto e baixo assinaturas prognósticos

Para fazer o link as mudanças observadas na expressão do gene com vias moleculares e celulares que podem ter impacto na sobrevivência diferencial observada entre grupos de alto e baixo risco, avaliou 5199 de 17623 genes e 97 de 186 vias KEGG que foram significativamente diferencialmente expressos entre os pacientes com alto risco e escores prognósticos de baixo risco. Diferencialmente expressos vias KEGG entre pacientes de alto e de baixo risco incluídos

célula cancerosa vias de sinalização

(MAPK, VEGF, MTOR e erbB vias) e

caminhos cancro

(leucemia mielóide aguda, não câncer de pulmão de células -pequeno, leucemia mielóide crónica e cancro pancreático; Tabela 3). Além disso, três genes da assinatura prognóstica de 13 genes,

MDM2

,

PLCG1

, e

TGFA

, foram representados em 9 dos 20 principais vias significativas. Estes resultados revelaram que os genes envolvidos no câncer de vias de sinalização canônicos foram mais diferencialmente expressos entre os de alto risco e de baixo risco de tumores e que a atividade destas vias pode ser responsável pela diferença observada na sobrevivência entre os grupos de alto e baixo risco do paciente.

Discussão

Nós relatamos uma assinatura de expressão de 13 genes, derivado da análise de 15 pacientes expressão do gene com PDAC e externamente validado em dados de expressão gênica de uma coorte separada de 101 pacientes, que é capaz de predizer a sobrevida do paciente. Porque este modelo foi baseado na sobrevida global para pacientes com estágio I a IV da doença, acreditamos que esta é a assinatura de expressão gênica prognóstico mais lógica e precisa relatado para pacientes com PDAC.

Devido à variação na sobrevivência dentro AJCC clínica fases e à grande heterogeneidade genómico dentro de tumores PDAC, investigação sobre os padrões de expressão de genes tem sido cada vez prognósticos relatado [3], [16], [17], [18], [19], [20]. Num estudo relatado anteriormente de pacientes com metastática X PDAC não metastático, uma assinatura prognóstico 6-gene correlacionado com a sobrevivência; No entanto, esta assinatura foi derivada a partir da fase do tumor a apresentação e não de sobrevivência dos pacientes [16]. Além disso, não existe sobreposição entre os genes candidatos na assinatura de 6 gene ea assinatura de expressão de 13 genes aqui descrito, que foi, de facto, com base na sobrevida do paciente. Assim, por causa da seleção da derivação set paciente, acreditamos que esta assinatura de expressão de 13 genes supera outros relatados na literatura para pacientes com PDAC.

plataformas de mutação e perfil de expressão gênica comercialmente disponíveis são cada vez mais utilizados como adjuntos aos algoritmos convencionais clínicas de tratamento para o tratamento de cancros, incluindo mama, próstata e câncer de cólon [21], [22], [23], [24]. Estas análises de expressão são, indiscutivelmente, mais robusta na previsão de resultados para os pacientes com câncer de mama, incluindo OncotypeDX e MammaPrint [25], [26]. Estas plataformas são usadas para prever os resultados imediatos e risco de metástase em câncer de mama; No entanto, outras aplicações destas ferramentas ajuda a adequar o tratamento baseado na previsão da resposta às terapias [25], [27], [28], [29], [30], [31]. Até à data, não existe tal ferramenta de prognóstico é comercialmente disponível para os pacientes com PDAC; no entanto, a previsão de sobrevida para pacientes com PDAC baseada na biologia tumor individual beneficiariam claramente pacientes e clínicos “decisões terapêuticas.

Os genes individuais cujos níveis de expressão foram utilizados para obter este 13-gene assinatura prognóstico revelam uma rede intrigante das vias que afetam a sobrevida do paciente PDAC (Tabela 2 e 3). Muitos destes genes têm sido implicados em vários cancros humanos, incluindo cancro do pâncreas; No entanto, algumas não têm sido relatados para ser associada com qualquer cancros até à data. genes reconhecíveis, tais como

TGFA

,

ELAVL1

e

MDM2

, e menos

MS4A3 Quais são sobre-expressos em lesões PDAC ou associados com o prognóstico do paciente , [33] [34] [35] [36] [32],,,. Curiosamente, os genes tais como

CCDC88C

,

CD200R1

, e

CUL3

têm sido associados com o prognóstico ou sendo altamente expresso em outras formas de câncer, no entanto, eles não foram relatados no PDAC com o melhor de nosso conhecimento [37], [38], [39], [40]. O seu envolvimento na assinatura prognóstica de 13 genes é o primeiro relato de sua expressão estar implicado na sobrevida do paciente em PDAC. A identificação das diferenças mensuráveis ​​na expressão genética entre os tumores PDAC de pacientes com diferentes tempos de sobrevivência apoia a continuação da aplicação de nossa assinatura genética e investigação sobre estas diferentes vias

.

Nenhum paciente dentro do conjunto de derivação receberam terapia neoadjuvante de qualquer forma , e por conseguinte a análise destas amostras tumorais expressão do gene representa o perfil do tumor antes de qualquer terapia sistémica (Tabela 1). No entanto, dentro do cálculo de prognóstico é a expressão de

ELAVL1

, também conhecida como antigénio-Hu R (Hur), que tem sido implicado na resposta à quimioterapia PDAC [33]. Na verdade, os pacientes PDAC com baixos níveis de expressão

ELAVL1

ter um aumento de 7 vezes na mortalidade [33]. Em nossa análise, os tumores PDAC de alto risco têm uma diminuição da expressão de

ELAVL1

em comparação com tumores de baixo risco e 93% dos pacientes dentro do conjunto de derivação recebeu padrão de atendimento adjuvante ou terapia baseada em gemcitabina paliativos . Infelizmente, os dados clínicos sobre regime de terapia adjuvante dos 101 pacientes dentro de conjunto de validação não estava disponível; no entanto, é lógico que a maioria dos pacientes também recebeu padrão de terapia adjuvante gemcitabina cuidado. A assinatura de expressão de 13 genes pode prever a resposta do paciente ao adjuvante gemcitabina e pretendemos avaliar a capacidade da assinatura de 13 genes para prever a resposta ao tratamento em estudos futuros.

A força particular deste estudo é que os tumores de pacientes dentro do conjunto de derivação são de uma boa amostra representativa de estádios da doença AJCC (Tabela 1). Uma limitação do estudo é que o conjunto de validação foi composta de 101 pacientes com localizada, PDAC ressecável e, assim, a grande maioria dos pacientes tinha AJCC fase IIb ou menos (Tabela 1). Nós supomos que ter um aumento do número de doentes com estádio III ou IV da doença no conjunto de derivação serviria apenas para aumentar a estratificação com base no nosso gene assinatura com e sem a adição de estatuto nodal, porque isso iria acrescentar um maior número de pacientes com ambos doença de alto risco, ou, doença do nó-positivo de baixo risco e empurre essas estratificações de sobrevivência para uma maior significância estatística. Apesar disso, o fato de que a nossa assinatura foi validada externamente em um conjunto de 101 pacientes com PDAC cujo gene expressão e de dados clínicos foi publicamente disponíveis acrescenta à natureza imparcial de nosso estudo.

Devido à natureza grosseira da atual paradigma PDAC estadiamento clínico, ferramentas prognósticos adicionais são necessários para auxiliar na tomada de decisão terapêutica. A decisão de se submeter a ressecção pancreática, que é a única opção potencialmente curativa para pacientes PDAC, é uma estressante considerando a taxa de readmissão 15-26% e complicações que ocorrem em aproximadamente 40% dos pacientes após a cirurgia, mesmo em centros de referência [41], [42], [43], [44]. Além disso, a quimioterapia sistémica pode ser associada com uma toxicidade significativa e pode afectar negativamente a qualidade de vida. Dado o benefício incerto de quimioterapia para um determinado paciente, as preocupações sobre a toxicidade do tratamento e qualidade de vida são fatores-chave que enfrentam os pacientes. A capacidade de oferecer aos pacientes e médicos dados de prognóstico precisas sobre tumores PDAC com base na medição da biologia tumor individual expressão do gene é inestimável e poderia influenciar a decisão de oferecer (ou renunciar) terapia. Este instrumento de prognóstico tem o potencial para ajudar pacientes e médicos na tomada de decisões de tratamento, que em última instância pode afectar resultado e impacto na qualidade de vida. avaliação futura deste gene assinatura irá avaliar a capacidade de prever a resposta à quimioterapia.