Abstract
aminoacil-ARNt sintetases (ARSS) e ARS-interagindo proteínas multifuncionais (AIMPs) exibem notável versatilidade funcional além de suas atividades catalíticas na síntese de proteínas. Suas funções não-canônicos foram patologicamente ligadas a cânceres. Aqui, descrevemos a nossa análise de todo o genoma integrativa da ARSS para mostrar atividades associados ao câncer em glioblastoma multiforme (GBM), o tumor cerebral primário maligno mais agressivo. Nós primeira selecionados 23 ARS /AIMPs (em conjunto referidas como ARSN), 124 genes associados ao câncer druggable alvo (DTGS) e 404 interagentes proteína-proteína (IBP) de ARSS usando o índice de gene do câncer do NCI. 254 dados GBM Affymetrix microarrays em The Cancer Genome Atlas (TCGA) foram utilizados para identificar os conjuntos de sondas cuja expressão foram mais fortemente correlacionada com a sobrevivência (Gráficos de Kaplan-Meier contra tempos de sobrevivência, log-rank teste t 0,05). A análise identificou 122 conjuntos de sondas como assinaturas de sobrevivência, incluindo 5 de ARSN (VARS, QARs, carros, NARS, FARS) e 115 de DTGS e PPIs (PARD3, RXRB, ATP5C1, HSP90AA1, CD44, THRA, TRAF2, KRT10, MED12 , etc). É de notar, 61 sondas relacionados à sobrevivência foram diferencialmente expressos em três diferentes subgrupos de prognóstico em pacientes com GBM e mostrou correlação com marcadores de prognóstico estabelecidos, tais como idade e assinaturas moleculares fenotípicas. Carros e FARS também mostraram significativamente maior associação com diferentes redes moleculares em pacientes com GBM. Tomados em conjunto, os nossos resultados demonstram evidências de uma contribuição biologia dominante ARSN na biologia do GBM
Citation:. Kim YW, Kwon C, Liu JL, Kim SH, Kim S (2012) Estudo Cancer Association of Aminoacil -tRNA Sintetase Rede de Sinalização em Glioblastoma. PLoS ONE 7 (8): e40960. doi: 10.1371 /journal.pone.0040960
editor: Natarajan Kannan, University of Georgia, Estados Unidos da América
Recebido: 09 de março de 2012; Aceito: 15 de junho de 2012; Publicado: August 31, 2012