Abstract

Fundo

Acumulando evidência suporta que o crescimento do tumor e a recidiva do câncer são movidos por células-tronco cancerosas. Nosso trabalho anterior demonstrou a existência de CD90

+ células-tronco do câncer de fígado (CSCs) no carcinoma hepatocelular (HCC). No entanto, as características destas células são ainda pouco compreendidos. Neste estudo, foram empregados a mais sensível RNA-seqüenciamento (RNA-Seq) para comparar o perfil de CD90

+ células classificadas de tumor (CD90

+ CSCs) com os tecidos do fígado não-tumorais paralelas (CD90 expressão gênica

+ NTSCs) e explicar as funções dos genes-alvo putativos na hepatocarcinogênese.

Metodologia /Principais achados

CD90

+ células foram classificadas, respectivamente, de tumor humano e não-tumoral adjacente tecidos do fígado por meio de triagem de células activadas por fluorescência. Os ARNs amplificados de CD90

+ células de 3 pacientes com carcinoma hepatocelular foram submetidos a análise de RNA-Seq. Um perfil de expressão gênica diferencial foi estabelecida entre CD90

+ CSCs e CD90

+ NTSCs, e validado pela quantitativa PCR em tempo real (qRT-PCR) sobre o mesmo conjunto de RNAs amplificados, e posteriormente confirmado em uma coorte independente de 12 doentes com HCC. Quinhentos genes foram diferencialmente expressos (119 up-regulada e 381 genes regulados negativamente)

NTSCs entre CD90

+ CSCs e CD90 +. Análise do gene ontologia indicaram que os genes sobre-expressos em CD90

+ CSCs foram associadas com a inflamação, a resistência aos medicamentos e o metabolismo lipídico. Entre os genes diferencialmente expressos, glipicano-3 (GPC3), um membro da família glipicana, foi marcadamente elevada em CD90

+ CSCs em comparação com CD90

+ NTSCs. A imuno-histoquímica demonstrou que GPC3 foi altamente expressa em quarenta e dois tecidos de tumor humano do fígado, mas ausente em tecidos do fígado não-tumorais adjacentes. Citometria de fluxo indicou que GPC3 foi altamente expresso no fígado CD90

+ CSCs e células cancerosas maduros em linhas celulares de cancro do fígado e tecidos tumorais do fígado humano. Além disso, a expressão GPC3 foi positivamente correlacionada com o número de CD90

CSCs + em tecidos tumorais do fígado.

Conclusões /Significado

Os genes identificados, como GPC3 que são claramente expressas no fígado CD90

+ CSCs, podem ser candidatos promissores de genes para a terapia HCC sem induzir danos às células-tronco do fígado normais

Citation:. Ho DWY, Yang ZF, Yi K, Lam CT, Ng MNP, Yu WC, et ai. (2012) Gene Expression Profiling de cancro do fígado Stem Cells por RNA-Sequencing. PLoS ONE 7 (5): e37159. doi: 10.1371 /journal.pone.0037159

editor: Dean G. Tang, da Universidade do Texas MD Anderson Cancer Center, Estados Unidos da América

Recebido: 01 de setembro de 2011; Aceito em 15 de abril de 2012; Publicado em: 14 de maio de 2012