PLOS ONE: TGFBR1 intraloco epistática Interaction como um fator de risco para câncer colorretal

Abstract

No cancro colorectal (CRC), um risco susceptibilidade hereditária afeta cerca de 35% dos pacientes, enquanto que mutações germinativas de alta penetrância representam 6% dos casos. Uma proporção considerável de tumores esporádicos poderia ser explicada pela co-hereditariedade de múltiplas variantes de baixa penetrância, algumas das quais são comuns. Nós avaliamos a susceptibilidade a CRC conferida por variantes genéticas no

TGFBR1

lócus. Foram analisados ​​14 polimorfismos e da expressão alelo-específico (ASE) de

TGFBR1

em 1025 indivíduos da população espanhola. Um estudo de caso-controle foi realizado com 504 controles e 521 pacientes com CCR esporádico. Quatorze polimorfismos localizados no

TGFBR1

lócus foram genotipados com o

Iplex Ouro e (

MassARRAY-Sequenom

) tecnologia. A análise descritiva dos polimorfismos e haplótipos e estudos de associação foram realizadas com o pacote de trabalho SNPator. Nenhuma associação relevantes foram detectadas entre polimorfismos ou haplótipos individuais e o risco de CRC. O

TGFBR1 * 9A /6A

polimorfismo foi utilizado para a análise ASE. indivíduos heterozigóticos foram analisados ​​por ASE por análise de fragmentos utilizando ADNc de tecido normal. O nível relativo de expressão alélica foi extrapolada a partir de uma curva padrão. O valor de corte foi calculada com o índice de Youden. ASE foi encontrada em 25,4% dos pacientes e 16,4% dos controles. Considerando tipos tanto bimodais e contínuas de distribuição, não foram identificadas diferenças significativas entre os valores ASE de pacientes e controles. Curiosamente, uma análise combinada dos polimorfismos e ASE para a associação com a ocorrência CRC revelou que os indivíduos ASE-positivos que transportam um dos haplótipos mais comuns (H2: 20,7%) apresentaram susceptibilidade notável para CRC (RR: 5,25; IC 95%: 2,547 -5,250; p 0,001) com um factor de sinergia de 3,7. Em nosso estudo, 54,1% dos casos esporádicos CRC fossem atribuíveis à co-hereditariedade do haplótipo H2 e

TGFBR1

ASE. Estes resultados suportam a hipótese de que a arquitetura alélica dos genes do cancro, em vez de polimorfismos individuais, define com mais precisão o risco CRC

Citation:. Martinez-Canto A, Castillejo A, Mata-Balaguer T, Castillejo MI, Hernandez E -Illan, Irles E, et al. (2012)

TGFBR1

Interação intraloco epistática como um fator de risco para câncer colorretal. PLoS ONE 7 (1): e30812. doi: 10.1371 /journal.pone.0030812

editor: Aedín C. Culhane, Harvard School of Public Health, Estados Unidos da América

Recebido: 20 de setembro de 2011; Aceito: 21 de dezembro de 2011; Publicado: January 23, 2012

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