Abstract
Fundo
As frequências de fusão EML4-ALK de genes em cancro do pulmão de células não pequenas (NSCLC) com diferentes características clinicopatológicas descritos por estudos anteriores são inconsistentes. As características demográficas e patológicas-chave associadas com o gene de fusão EML4-ALK não foram ainda estabelecidas. Esta meta-análise foi conduzida para comparar a frequência do gene de fusão EML4-ALK em pacientes com diferentes características clínico-patológicas e para identificar uma população enriquecida de pacientes com NSCLC abrigar gene de fusão EML4-ALK.
Métodos
as bases de dados PubMed e Embase para todos os estudos sobre o gene de fusão EML4-ALK em pacientes com NSCLC foram pesquisados até julho de 2014. a lista de critérios e critérios de exclusão foram estabelecidos para rastrear os estudos. A frequência do gene de fusão EML4-ALK e as características clínico-patológicas, incluindo tabagismo, tipo patológico, sexo e status de EGFR foram extraídos.
Resultados
Dezessete artigos que consistem em 4511 casos NSCLC foram incluídos nesta meta-análise. A menor taxa positiva gene de fusão EML4-ALK significativa foi associado com fumantes (agrupada OR = 0,40, 95% CI = 0,30-0,54,
P Art 0,00001). Um significativamente maior taxa de positividade gene de fusão EML4-ALK foi associada com adenocarcinomas (agrupada OR = 2,53, 95% CI = 1,66-3,86,
P Art 0,0001) e feminino (agrupada OR = 0,61, 95% CI = ,41-,90,
P
= 0,01). Descobrimos que a taxa de positividade gene de fusão significativamente menor EML4-ALK foi associado com a mutação EGFR (em pool ou CI = 0,07, 95% = ,03-,19,
P Art 0,00001). No viés de publicação foi observada em nenhuma meta-análise (todos os
P valor
de teste 0,05); no entanto, devido ao pequeno tamanho da amostra, não houve resultados foram na meta-análise sobre o status do gene EGFR.
Conclusão
Esta meta-análise revelou que o gene de fusão EML4-ALK é altamente correlacionado com uma história de fumar nunca mais /luz, do sexo feminino e do tipo patológico de adenocarcinoma, e é em grande parte mutuamente exclusivo de EGFR
Citation:. Wang Y, Wang S, Xu S, Qu J, Liu B (2014) Correlação características dos pacientes com não-pequenas células do cancro do pulmão albergando o gene de fusão EML4-ALK: Uma meta-análise. PLoS ONE 9 (10): e110617. doi: 10.1371 /journal.pone.0110617
editor: Srikumar P. Chellappan, H. Lee Moffitt Cancer Center Research Institute, Estados Unidos da América
Recebido: 24 Janeiro, 2014; Aceito: 19 de setembro de 2014; Publicação: 31 de outubro de 2014
Direitos de autor: © 2014 Wang et al. Este é um artigo de acesso aberto distribuído sob os termos da Licença Creative Commons Attribution, que permite uso irrestrito, distribuição e reprodução em qualquer meio, desde que o autor original ea fonte sejam creditados
Financiamento:. Este estudo foi financiado pelo Liaoning Ciência e Tecnologia Projeto (concessão No. 2007408001-8, 2012225019) e Natural Science Foundation da província de Liaoning (No. 20.061.030). Os financiadores não tiveram nenhum papel no desenho do estudo, coleta de dados e análise, decisão de publicar ou preparação do manuscrito
CONFLITO DE INTERESSES:.. Os autores declaram que não há interesses concorrentes existem
Introdução
Desde o início dos anos 2000, uma compreensão mais aprofundada da biologia molecular do câncer de pulmão de células não pequenas (NSCLC) tem levado a grandes avanços no tratamento desta neoplasia. subtipos distintos de NSCLC são accionados por alterações genéticas específicas e são sensíveis aos inibidores das vias oncogénicos activadas [1]. Identificação de mutações no receptor do factor de crescimento epidérmico (EGFR), gene K-ras, e mais recentemente, o echinoderm gene de fusão associada a microtúbulos quinase de linfoma anaplásico de proteína-like 4 e (EML4-ALK) tiveram um impacto decisivo sobre o tratamento de NSCLC.
o gene de fusão EML4-ALK foi descrita pela primeira vez em 2007 por Soda e [2] colegas, que rastreada uma biblioteca de cDNA derivado do tecido canceroso de um 62-year-old paciente do sexo masculino japonês com NSCLC. Inversões no braço curto do cromossomo 2 (envolvendo 2p21 e 2p23; cerca de 12 Mb de intervalo) resulta na formação deste gene de fusão, o que leva à ativação constitutiva da quinase ALK, possuindo actividade oncogénica potente ambos
in vitro Comprar e
in vivo
[2] – [4]. Nestes tumores, o gene de fusão EML4-ALK é o determinante de vias de crescimento críticos, resultando na activação da via PI3K /AKT e MAPK vias /ERK jusante [1]. Um inibidor de tirosina quinase, crizotinibe, foi demonstrado inibir selectivamente o crescimento de células cancerosas com o gene de fusão EML4-ALK.
De acordo com estudos anteriores, a presença deste gene de fusão é mais provável presente em pacientes com dados demográficos específicos características. Alguns dos investigadores anteriores identificaram EML4-ALK predominantemente no sexo feminino jovens não fumadores com adenocarcinoma [2], [5], [6], enquanto que outros relatos identificaram este gene de fusão em diferentes populações [7] – [9]. As características clínico-patológicas associadas a EML4-ALK não tenham sido completamente estabelecida. O pequeno número total de pacientes inscritos em cada estudo podem explicar essas discrepâncias. A fim de identificar uma população enriquecida de pacientes com NSCLC abrigar gene de fusão EML4-ALK e identificar mais informações úteis sobre a seleção de candidatos para o tratamento com inibidores da tirosina quinase ALK, realizamos esta meta-análise para comparar a frequência do gene de fusão EML4-ALK em pacientes com diferentes características clínico-patológicas.
Materiais e Métodos
a meta-análise foi realizada, de acordo com a declaração PRISMA (relatando Preferred itens para revisões sistemáticas e metanálises) [10], incluindo estratégia de pesquisa, critérios de seleção, abstração de dados e análise de dados.
1 Pesquisa estratégia
Foram pesquisados os bancos de dados PubMed e Embase para todos os artigos sobre a associação entre o gene de fusão EML4-ALK e NSCLC até julho de 2014. Os títulos de assuntos médicos e palavras-chave utilizadas para a busca foram “gene de fusão EML4-ALK, humana”, “câncer do pulmão não de pequenas células” “EML4-ALK”, “carcinoma, de pulmão de pequenas células não-“, “carcinoma do pulmão de células não pequenas”, “carcinoma do pulmão de células não pequenas”, “cancro do pulmão de células não pequenas” e “carcinoma do pulmão de células não pequenas”. Artigos relacionados também foram pesquisados para ampliar a pesquisa. Todas as citações e resumos adquiridos foram revistos. As referências dos artigos adquiridos, também foram pesquisados com a mão. Não foram instituídas restrições de linguagem
2 de inclusão e exclusão Critérios
Estudos elegíveis teve que seguir os seguintes critérios:. (1) a associação entre o gene EML4-ALK e as características clínico-patológicas de pacientes com NSCLC foi explorada; (2) o diagnóstico de NSCLC foi feita de acordo com os resultados patológicos; (3) estudos com artigos em texto completo; e (4) dados suficientes para estimar odds ratio (OR) com intervalo de confiança de 95% (CI)
Os critérios de exclusão foram: (1). duplicar os dados; (2) o sumário, comentário, análise e editorial; e (3) foram relatados dados insuficientes
3 Abstração de Dados
Os seguintes itens foram recolhidos:. primeiro nome do primeiro autor; ano de publicação; país de origem; etnia dos pacientes; número de pacientes inscritos; frequência do gene de fusão EML4-ALK; método de detecção; e as características clínico-patológicas (sexo, tabagismo, tipo patológico, e de estado EGFR). Todas as informações acima foram cuidadosamente extraídos independentemente de todas as publicações elegíveis por dois investigadores. Se os dois investigadores não puderam chegar a um consenso, o resultado foi revisto por um terceiro pesquisador.
4 Statistical Analysis
A força da associação entre o gene de fusão EML4-ALK e as características clínicas das NSCLC foi estimada pelo odds ratio (OR) e intervalos de confiança de 95% (IC). O teste baseado Q qui-quadrado foi utilizado para avaliar a heterogeneidade estatística entre os estudos. Quando heterogeneidade existiu, foi utilizado um modelo de efeitos aleatórios com base no método DerSimonian e Laird para calcular o pool ou de cada estudo; Caso contrário, foi utilizado um modelo de efeitos fixos com base no método de Mantel-Haenszel. viés de publicação foi examinada usando gráfico de funil e teste de Egger. Todas as análises foram realizadas utilizando o programa Review Manager (RevMan versão 5.3) eo pacote de software estatístico R (versão 2.15.1) [11]. Todos os testes foram em frente e verso eo nível de significância foi fixado em 0,05.
Resultados
O processo de aquisição de estudos está representado na Fig. 1. Um total de 17 artigos [5] – [8], [12] – [24] preencheram os critérios de inclusão e foram incluídos na meta-análise final, que consistia em 4511 casos NSCLC. As características de cada estudo são apresentados na Tabela S1. Dos 17 estudos, 13 asiáticos envolvidos, 2 caucasianos envolvidas, e 2 envolveu uma população mista. Os métodos de detecção de proteínas incluídos RT-PCR (10 estudos), FISH e IHC (2 estudos), peixe (3 estudos) e IHC (2 estudos).
Houve 16 estudos que tinham sido realizado para detectar o gene de fusão EML4-ALK em fumantes e não-fumantes com NSCLC. A frequência combinada de EML4-ALK foi 3,59% (72/2006) e 8,59% (174/2026) em fumantes e não /fumantes leves, respectivamente. Em geral, quando todos os estudos elegíveis foram reunidas na meta-análise (Fig. 2), não foi observada uma heterogeneidade significativa (I
2 = 37%,
P
= 0,07), portanto, nós escolhemos o modelo de efeitos fixos e descobriu que a taxa de positividade gene de fusão significativamente menor EML4-ALK foi associado com fumantes (agrupada OR = 0,40, 95% CI = 0,30-0,54,
P Art 0,00001).
Foram identificados 15 estudos que abordaram a frequência do gene de fusão EML4-ALK em adenocarcinomas e não-adenocarcinomas. A frequência combinada de EML4-ALK foi de 6,85% (158/2308) e 2,63% (26/990) em adenocarcinomas e não-adenocarcinomas, respectivamente. Quando todos os estudos elegíveis foram reunidas num meta-análise (Figura 3), não foi observada uma heterogeneidade significativa (I
2 = 18%,
P
= 0,25), assim nós escolhemos o fixo -Efeitos modelo e descobriram que uma significativamente maior taxa de positividade gene de fusão EML4-ALK foi associada com adenocarcinomas (agrupada OR = 2,53, 95% CI = 1,66-3,86,
P Art 0,0001).
informações Gender estava disponível para 16 estudos, e incluiu um total de 2265 homens e 1682 pacientes do sexo feminino. EML4-ALK foi detectada em 118 (4,82%) do sexo masculino e 135 (7,64%) do sexo feminino. Os resultados desta meta-análise são mostrados na Fig. 4. Em geral, quando todos os estudos elegíveis foram reunidas num meta-análise, foi observada uma heterogeneidade significativa (I
2 = 45%,
P
= 0,03), assim, o modelo de efeitos aleatórios foi escolhido. tumores mutantes EML4-ALK eram mais propensos a ser mulheres (agrupada OR = 0,61, 95% CI = 0.41-0.90,
P
= 0,01).
Quatro estudos de dados clínicos apresentados de uma associação entre os genes EML4-ALK e EGFR. Os resultados da meta-análise são mostrados na Fig. 5. em 399 pacientes com NSCLC com uma mutação do EGFR, foram 3 (0,75%) pacientes que albergam EML4-ALK. Em 743 pacientes com NSCLC com EGFR de tipo selvagem, havia 91 (12,25%) pacientes que alberga o gene EML4-ALK. Todos os estudos elegíveis foram agrupados em meta-análise, e não foi observada uma heterogeneidade significativa (I
2 = 6%,
P
= 0,37); Assim, foi escolhido o modelo de efeitos fixos. Descobrimos que a taxa de positividade gene de fusão significativamente menor EML4-ALK foi associada com tumores EGFR mutantes (agrupada OR = 0,07, 95% CI = 0,03-0,19,
P Art 0,00001).
no viés de publicação foi observado em qualquer meta-análise (todos os
P
-Valores de testes de Egger foram 0,05) como mostrado na Tabela S2. No entanto, devido ao pequeno tamanho da amostra, não houve resultados na meta-análise sobre a associação do estado EML4-ALK e EGFR.
Discussão
Com base nos estudos incluídos nesta meta -Análise, a incidência de EML4-ALK variou de 1,6% a 16,4% em doentes com NSCLC [5] – [8], [12] – [24]. Embora a frequência de EML4-ALK em doentes com NSCLC foi baixa, porque a incidência de NSCLC está a aumentar em todo o mundo, o número absoluto de doentes com NSCLC ancorando o gene de fusão EML4-ALK é notável. De fato, as características clínico-patológicas poderia nos ajudar a selecionar precisamente uma população enriquecida com este subconjunto molecular específico de NSCLC na prática clínica. A presente meta-análise de 17 estudos, que incluiu 4511 casos, revelou que o gene de fusão EML4-ALK é altamente correlacionado com uma história de fumar nunca mais /luz, do sexo feminino e do tipo patológico de adenocarcinoma, e é em grande parte mutuamente exclusivo de EGFR.
As frequências de EML4-ALK em pacientes com NSCLC com diferentes status fumadores descritos em relatórios anteriores são inconsistentes. No primeiro relatório deste gene de fusão em NSCLC [2], EML4-ALK foi detectada em cinco pacientes, dos quais dois foram anotados para ter uma história de tabagismo. Nos estudos subsequentes anteriores a 2009, EML4-ALK foi variavelmente detectado em fumantes e não-fumantes [18], [19], [25], [26], o que sugere uma falta de associação entre a presença de EML4-ALK e história de tabagismo. Em 2009, Shaw e seus colegas [7] relatou que a presença de EML4-ALK é mais provável em pacientes com um status de fumar nunca mais /luz. Na meta-análise atual, descobrimos que EML4-ALK está fortemente associada com uma história de fumar nunca mais /light
Estudos anteriores relataram que EML4-ALK ocorre com uma frequência significativamente maior no adenocarcinoma [5]. – [7], [12], [15], [18], [19], enquanto alguns estudos também relataram que EML4-ALK ocorre com uma frequência semelhante em não-adenocarcinomas [8], [13], [14] [16], [17]. Nossa meta-análise confirmou que EML4-ALK é significativamente associado com adenocarcinoma. Em comparação com os não-adenocarcinomas, o total OR de EML4-ALK em adenocarcinomas de pulmão foi de 2,53.
As frequências indicadas de EML4-ALK entre machos e fêmeas têm sido inconsistentes. Shaw et al. [7] demonstraram que os pacientes EML4-Alq têm maior probabilidade de ser do sexo masculino. Em contraste, genes de fusão EML4-ALK foram observados predominantemente em mulheres em outros estudos [15], [18]. Uma meta-análise realizada por Li et al. [6] constatou que não houve diferença significativa entre os grupos masculino e feminino. No entanto, a meta-análise atual mostrou que os pacientes com tumores EML4-ALK positivos são mais propensos a ser do sexo feminino.
Pode haver potenciais interações entre o status de sexo e tabagismo. Nos países asiáticos, a taxa de tabagismo nas mulheres foi muito menor do que o homem, e menor do que as mulheres nos países ocidentais [27] – [30]. Esta meta-análise envolveu mais estudos realizados em população asiática, e os pacientes mais mulheres eram não-fumantes, que podem ser a razão da inconformidade do género entre a meta-análise de Li [6] e esta meta-análise.
tem sido relatado que a concordância de mutações de fusão e EGFR ALK é um evento raro (3/399) [17] – [19], [23], [26]. Em pacientes com uma mutação do EGFR, a presença de EML4-ALK foi significativamente menor do que os pacientes com EGFR de tipo selvagem. Zhang et al. [5] relatou que a presença de fusões Alk é correlacionada com o estado de EGFR de tipo selvagem. Ele identificou 1 de 12 pacientes que tiveram o gene de fusão EML4-ALK e uma mutação EGFR; o paciente era um não-fumante feminina chinesa com um adenocarcinoma histológico [5]. Embora os pacientes com EML4-ALK compartilham várias características clínico-patológicas em pacientes com mutações EGFR, como a história de fumar nunca mais /light e histologia de adenocarcinoma, a meta-análise atual descobriu que gene de fusão EML4-ALK foi mutuamente exclusivas para mutações EGFR, sugerindo assim um distinto subtipo genético de adenocarcinoma de pulmão
em estudos anteriores, EML4-ALK foi mais encontrada em pacientes jovens [7], [8], [13].; No entanto, nesta meta-análise, os dados em geral não foi reunidas devido aos diferentes pontos de demarcação.
Crizotinibe é uma pequena molécula de tirosina-quinase inibidor que foi originalmente desenvolvido como um inibidor do factor de crescimento epitelial-mesenquimal (c-MET). Em 2010, uma fase 1 julgamento de braço único envolvendo crizotinib em pacientes com NSCLC abrigar EML4-ALK foi concluído [31]. A taxa de resposta global foi de 57% e as taxas de controle da doença foram de 87% em 8 semanas e 66% em 16 semanas [31]. Os resultados da meta-análise atual pode facilitar a seleção de pacientes para tratamento com inibidores da EML4-ALK.
Algumas limitações deste meta-análise deve ser reconhecido. Primeiro de tudo, não houve estudo controlado randomizado (RCT) envolvidos nesta meta-análise. Dado que não havia dados de ensaios clínicos randomizados para este tópico, limitamos nosso escopo a estes estudos prospectivos e retrospectivos para obter os melhores dados disponíveis. Em segundo lugar, devido à pequena proporção de doentes com NSCLC EML4-ALK-positivos, o tamanho da amostra disponível para análise foi pequeno. Em terceiro lugar, os estudos anteriores foram realizados principalmente no leste-Ásia. Havia apenas dois estudos envolveram caucasianos, e dois envolveu uma população mista. Se a corrida diferente contribui para a diferença de EML4-ALK permanece desconhecida. Os resultados desta meta-análise pode ser tendenciosa por raça. Finalmente, não poderíamos analisar a associação entre EML4-ALK ea idade do paciente por causa dos diferentes conjuntos de apresentação de dados na idade.
Em resumo, a nossa meta-análise demonstrou que a incidência do gene de fusão EML4-ALK foi significativamente maior nos nunca ou luz fumantes, mulheres, pacientes com EGFR de tipo selvagem e adenocarcinomas. No entanto, os estudos incluídos neste meta-análise de todos os teve um pequeno tamanho da amostra; Assim, são necessários mais estudos com grandes amostras para confirmar nossas descobertas.
Informações de Apoio
Tabela S1. .
Um resumo descritivo dos estudos utilizados na meta-análise
doi: 10.1371 /journal.pone.0110617.s001
(DOCX)
Tabela S2.
Os resultados dos testes de Egger para viés de publicação
doi:. 10.1371 /journal.pone.0110617.s002
(DOCX)
Checklist S1.
PRISMA lista
doi:. 10.1371 /journal.pone.0110617.s003
(DOC)
Reconhecimentos
Os autores agradecem a Internacional Edição Ciência para seu perito ajudar na edição do manuscrito.