Abstract

Fundo

Os polimorfismos em genes envolvidos no metabolismo de grupos de folato e metílico têm sido implicados com o risco de cancro do sistema digestivo. A metionina sintase (MTR) desempenha um papel central no metabolismo do folato, afectando assim a metilação de DNA. A associação entre o polimorfismo A2756G (rs1805087) em MTR e digestivo suscetibilidade ao câncer do sistema foi inconsistente em estudos anteriores. Para investigar essa inconsistência, realizamos esta meta-análise.

Métodos

As bases de dados, incluindo Pubmed, Embase, ISI Web of Science and Infrastructure China National Knowledge (CNKI) foram pesquisados ​​para encontrar estudos relevantes. odds ratio (OR) com intervalo de confiança de 95% (IC) foram utilizados para avaliar a força da associação. As fontes potenciais de heterogeneidade também foram avaliados por análise de subgrupo e meta-regressão.

Resultados

Um total de 29 artigos com 15,368 pacientes e 23,959 controles foram incluídos. Nós não encontramos nenhuma associação entre o polimorfismo MTR A2756G e câncer do sistema digestivo da população geral (G alelo: OR = 1,03, 95% CI = 0,98-1,09, P = 0,25; modelo dominante: CI OR = 1,03, 95% = 0,97-1,10, P = 0,33; modelo recessivo: OR = 1,02, 95% CI = 0,89-1,17, P = 0,79). Na análise estratificada de acordo com o tipo de câncer, tamanho da amostra e método de genotipagem, nenhuma evidência de qualquer associação do gene da doença foi obtida em quase todos os modelos genéticos. No entanto, associações significativas marginais foram encontrados para leste-asiáticos e estudos baseados em hospitais.

Conclusões

Esta meta-análise sugere que não existe uma associação significativa entre o polimorfismo MTR A2756G e risco de câncer sistema digestivo .

Citation: Zhao Y, Z Chen, Ma Y, Xia Q, Zhang F, Fu D, et al. (2013) Ausência de associação entre Metionina sintase A2756G Polimorfismo e do Aparelho Digestivo Risco de Câncer: Evidências de 39327 indivíduos. PLoS ONE 8 (4): e61511. doi: 10.1371 /journal.pone.0061511

editor: Pal Bela Szécsi, Hospital Universitário Gentofte, Dinamarca |

Recebido: 27 de setembro de 2012; Aceito: 10 de março de 2013; Publicação: 16 de abril de 2013

Direitos de autor: © 2013 Zhao et al. Este é um artigo de acesso aberto distribuído sob os termos da Licença Creative Commons Attribution, que permite uso irrestrito, distribuição e reprodução em qualquer meio, desde que o autor original ea fonte sejam creditados

Financiamento:. Este trabalho foi apoiado por uma bolsa da National Science Foundation Natural da China (81201535), Shanghai Natural Science Foundation (12ZR1436000), Programa de Inovação Conhecimento de Xangai Institutos de Ciências Biológicas (2012KIP203) e Jovens Inovação Associação de Promoção da Academia chinesa de Ciências. Os financiadores não tiveram nenhum papel no desenho do estudo, coleta de dados e análise, decisão de publicar ou preparação do manuscrito

CONFLITO DE INTERESSES:.. Os autores declararam que não existem interesses conflitantes

Introdução

a previsão é que até 2020, o número de novos casos de câncer no mundo vai aumentar para mais de 15 milhões, com mortes aumentando para 12 milhões [1]. cancros do sistema digestivo são os tumores malignos mais comuns em todo o mundo, com três milhões de novos casos a cada ano (cerca de 30% de todos os cânceres) [1], [2]. A incidência de cânceres do sistema digestivo será constantemente a aumentar, principalmente devido às tendências do câncer gástrico (GC) e cancro colorectal (CRC) [2]. Nos países europeus, havia uma estimativa de 0,91 milhões de novos casos de cancros digestivos do sistema (436.000 CRC e 149.000 GC) e 0,59 milhões de mortes por estes problemas de saúde em 2008 [3]. Na maioria dos países em desenvolvimento, as tendências para o aumento das taxas de mortalidade para os cânceres do sistema digestivo também têm sido observadas [4], [5].

A metilação das ilhas CpG associada ao promotor é uma modificação epigenética bem documentado , agindo como um mecanismo para regular a expressão de genes associados com o desenvolvimento do cancro [6], [7]. metilação aberrante do promotor do gene supressor de tumor ou de reparação do ADN foi detectada em muitos tipos diferentes de cancros [8], [9]. A metionina sintase, uma enzima dependente de vitamina B 12, desempenha um papel importante no metabolismo do folato [10]. Catalisa a remetilação da homocisteína em metionina e a desmetilação concomitante de 5-metiltetraidrofolato para tetrahydrofolate. A metionina sintase é crítica para a manutenção da metionina intracelular adequado, um aminoácido essencial e o precursor de S-adenosilmetionina (SAM). SAM é um grupo dador de metilo fundamental envolvido em mais de 100 reacções de metilação, incluindo a metilação do DNA. Recentemente, um polimorfismo no gene da metionina sintase (MTR) (2756A → L, rs1805087), resultando na substituição de ácido aspártico (D919) por glicina (G), foi identificado em pacientes com deficiência de metionina sintase e verificou-se ser polimórficos entre os controles saudáveis ​​[11]. Além disso, Goode et al. sugeriu uma relação inversa entre modesta 2756GG polimorfismo e os níveis de homocisteína, indicando um aumento na actividade enzimática do genótipo variante [12]. Por outro lado, um nível de homocisteína reduzida foi ligado com o genótipo GG, em alguns estudos [13] – [15], que conduz à hipótese de que este polimorfismo podem ter um efeito de activação no enzima que aumenta a conversão de homocisteína a metionina. Além disso, Paz et al. relatou que indivíduos que realizaram 2756GG apresentaram uma menor frequência de CpG ilha hipermetilação em genes supressores de tumor [16].

Apesar da plausibilidade biológica de polimorfismo funcional MTR como modulador da digestivo suscetibilidade ao câncer do sistema, anteriormente resultados inconsistentes têm aparecido na literatura. estudos publicados têm sido geralmente restrito em termos de tamanho da amostra e diversidade étnica e estudos individuais podem ter poder suficiente para alcançar uma conclusão abrangente e confiável. Nós, portanto, realizaram uma meta-análise de estudos publicados para esclarecer esta contradição e para estabelecer um quadro abrangente da relação entre a MTR e câncer do sistema digestivo.

Materiais e Métodos

Identificação e Qualificação de relevantes estudos

estudos de associação genética publicadas antes do final de setembro 2012 sobre o câncer sistema digestivo e polimorfismo dentro gene MTR foram identificados através de uma pesquisa de PubMed, Embase, ISI web of Science, e CNKI (Infra-estrutura chinesa Knowledge Nacional ), sem restrições de linguagem, utilizando as seguintes palavras-chave e termos de assunto: ‘metionina sintase’ ou ‘MTR’, ‘polimorfismo “ou” variação “e” câncer “ou” carcinoma “ou” neoplasia “. Os títulos e resumos de artigos potenciais foram selecionados de acordo com sua relevância, e quaisquer estudos claramente irrelevantes foram excluídos. foram lidos os textos completos dos artigos restantes para determinar se eles continham informações sobre o tema de interesse. Além disso, listas de referência de estudos primários e artigos de revisão, também foram revisados ​​por uma busca manual para identificar publicações relevantes adicionais. Estudos incluídos na meta-análise teve que satisfaçam todos os seguintes critérios: (1) Os documentos originais contendo dados independentes, (2) estudos de caso-controle ou coorte, (3) associação entre MTR polimorfismo eo risco de câncer do sistema digestivo foi explorada (4 ) a identificação dos casos de câncer do sistema digestivo foi confirmado histologicamente ou patologicamente e (5) relação da informação de distribuição de genótipo ou de chances (OR) e seu intervalo de confiança de 95% (CI) e P-valor. As principais razões para a exclusão dos estudos foram (1) a sobreposição de dados e (2) estudos de caso-somente, e artigos de revisão.

Data Extraction

Para cada estudo, os seguintes dados foram extraídos independentemente por dois autores: primeiro autor, ano de publicação, o critério diagnóstico, idade, sexo, etnia, Hardy-Weinberg (HWE) de status, método de genotipagem, tipo de câncer, fonte de controle, número total de casos e controles, MTR polimorfismo contagens genótipo e interações entre fatores ambientais ou genes. Os resultados foram comparados, e discordâncias foram discutidas entre todos os autores e resolvidas com o consenso. Se vários relatórios publicados a partir da mesma população do estudo estavam disponíveis, incluímos somente aquele com maior tamanho da amostra e as informações mais detalhadas. Estudos com diferentes grupos étnicos foram considerados como estudos individuais para as nossas análises.

Análise Estatística

Desvio de Hardy-Weinberg foi examinada pelo teste do qui-quadrado com 1 grau de liberdade. rácio bruto Odds (RUP) com os correspondentes intervalos de confiança de 95% (IC) foram utilizados para avaliar a força da associação entre o polimorfismo MTR A2756G gene eo risco de câncer do sistema digestivo. Para o polimorfismo A2756G, foi investigada a associação entre as variantes genéticas e risco de câncer digestivo no modelo multiplicativo (G-alelo vs. A-alelo), dominante (AA + AG vs. GG) e modelo de genética recessiva (GG vs. AA + AG ). Entre estudo de heterogeneidade foi medida usando o teste Q estatística-padrão [17]. De efeitos aleatórios e medidas sumárias de efeito fixo foram calculados como inversa-variância média ponderada do odds ratio de registo [18]. Os resultados do resumo de efeitos aleatórios foram relatados no texto, pois leva em conta a variação entre os estudos. O teste de Z foi utilizada para determinar a significância da OU reunidas. análise de subgrupo foi estratificada pela característica de estudo de acordo com a etnia (Leste Asiático, Caucasiano e outros), desenho do estudo (hospital-based vs base populacional) tamanho da amostra (≥500 ou 500 casos), método de genotipagem (RFLP vs outros) e o tipo de cancro (cancro colorectal, cancro do esófago, cancro gástrico, cancro pancreático e carcinoma hepatocelular), respectivamente. Além disso, a análise de meta-regressão foi realizada para investigar sete fontes potenciais de heterogeneidade incluindo etnia, tamanho da amostra, fonte de controles, método de genotipagem, tipo de câncer, distribuição por sexo entre os casos e controles, com idade média de casos e controles [19]. viés de publicação foi investigada por lote de funil. assimetria gráfico de funil foi avaliada pelo método de teste de regressão linear de Egger [20]. A análise de sensibilidade, que determina a influência de estudos individuais sobre a estimativa combinada, foi determinada através da remoção de cada estudo sequencialmente e recalculando o risco relativo total e intervalo de confiança de 95%. As análises estatísticas foram realizadas com o software Stata versão 10.0 (Stata Corporation, College Station, TX). A taxa de erro tipo I foi de 0,05. Todos os valores P foram bicaudais.

Resultados

Características de Estudos

A busca combinados produziram 217 referências. processo de selecção estudo foi mostrado na Figura 1. Finalmente, um total de 29 estudos com 34 conjuntos de dados foram finalmente incluído envolvendo pacientes 15,368 e 23,959 controlos [15], [21] – [48]. As características detalhadas dos estudos incluídos nesta meta-análise são apresentados na Tabela 1. Dos casos, 82% eram caucasianos, 16% eram do Leste Asiático e 2% eram outras origens étnicas. A distribuição dos genótipos nos controles era consistente com Hardy-Weinberg em todos os estudos de polimorfismo A2756G MTR.

Dados Quantitativos síntese |

Conforme mostrado na Figura 2, o L distribuição dos alelos do polimorfismo A2756G varia entre os controlos em diferentes etnias, variando 0,06-0,25. Para controles do Leste Asiático, a frequência alelo G foi (IC 95%: 0,11-0,18) 0,14, que foi menor do que nos controles caucasianos (0,20; IC 95%: 0,18-0,22), indicando uma diferença significativa entre os asiáticos, em comparação com caucasianos (P = 0,003).

no geral, não havia nenhuma evidência de uma associação entre o aumento do risco de cancro do sistema digestivo e o polimorfismo A2756G em diferentes modelos genéticos quando todos os estudos elegíveis foram reunidas no meta-análise. Sob modelo de efeitos aleatórios, a per-alelo geral OR da variante G para o câncer sistema digestivo foi de 1,03 [IC 95%: 0,98-1,09,

P

(Z) = 0,25,

P

(Q) = 0,05], com resultados correspondentes em modelos genéticos dominantes e recessivos de CI 1,03 [95%: 0,97-1,10,

P

(Z) = 0,33,

P

(Q) = 0,06] e 1,02 [IC 95%:. 0,89-1,17,

P

(Z) = 0,79,

P

(Q) = 0,25], respectivamente

Este análise baseia na partilha de dados a partir de um número de diferentes populações étnicas. Na estratificação por etnia, uma OR de 1,00 (IC 95%: 0,94-1,05, P = 0,88) e (IC 95%: 1,02-1,25, P = 0,02) 1,13 resultou para o alelo G, entre os caucasianos e asiáticos, respectivamente. Na análise estratificada por tipo de câncer, não aumentou significativamente os riscos de câncer foi encontrado com cancro colo-rectal, cancro do esófago, cancro gástrico, cancro pancreático e carcinoma hepatocelular em todos os modelos genéticos (Figura 3). Ao considerar subgrupos fonte de controle, o OR foi (IC 95%: 0,95-1,07, P = 0,78) 1,01 nos controles de base populacional, em comparação com 1,13 (IC 95%: 1,02-1,25, P = 0,02) nos controles hospitalares. Além disso, não houve associação significativa entre o genótipo de MTR A2756G e risco de câncer sistema digestivo na análise estratificada de acordo com o tamanho da amostra ou método de genotipagem (Tabela 2).

Embora o teste formal para heterogeneidade não foi significativa na análise global, foi realizada meta-regressão, conforme havia também motivos para considerar a etnia, tamanho da amostra, método de genotipagem, tipo de câncer, e características clínicas dos casos e controles (idade e distribuição por sexo) como fontes potenciais de heterogeneidade. Na análise de meta-regressão, etnia (P = 0,19), tipo de câncer (P = 0,96), fonte de controles (P = 0,07), idade dos casos (P = 0,62) e controles (P = 0,72), método de genotipagem (média P = 0,29) e distribuição por sexo entre os casos (P = 0,65) e controles (P = 0,97) não foram significativamente correlacionada com a magnitude do efeito genético. Por outro lado, o tamanho da amostra (P = 0,008) foi significativamente correlacionada com a heterogeneidade entre os estudos.

Análises de sensibilidade e viés de publicação

A fim de avaliar a estabilidade dos resultados da meta- análise, foi realizada uma análise de sensibilidade por meio de estudos individuais sequencialmente excluídos. Estatisticamente resultados semelhantes foram obtidos após a exclusão sequencialmente cada estudo, sugerindo estabilidade das meta-análises. gráfico de funil de Begg e teste de Egger foram realizados para acessar o viés de publicação das literaturas. A forma das parcelas funil foi simétrico para o polimorfismo (Figura S1). Os resultados estatísticos indicaram também uma falta de viés de publicação da meta-análise atual. (Teste de Egger:

P

= 0,25)

Discussão

grande amostra e imparciais estudos epidemiológicos de genes de predisposição polimorfismos poderia fornecer uma visão sobre a relação in vivo entre genes candidatos e doenças. a síntese de metionina é o primeiro passo na síntese de SAM, que é um doador de metilo-grupo universal envolvidos em reacções de metilação, incluindo a metilação do DNA. Este relatório é a primeira meta-análise de examinar o efeito do polimorfismo A2756G MTR sobre o risco de cancro do sistema digestivo. No total, o meta-análise envolveu 29 estudos para o câncer sistema digestivo que forneceu 15,368 casos e 23,959 controles. Os nossos resultados demonstram que o alelo G do polimorfismo A2756G no MTR não é um factor de risco para o desenvolvimento de cancro do sistema digestivo. análise de sensibilidade indicou robustez dos resultados.

Em meta-análise, avaliação heterogeneidade foi sempre conduzida. Assim, foram realizadas meta-análises de subgrupos. Em tipo subgrupos de câncer, não houve associação estatisticamente significativa entre MTR polimorfismo e diferentes tipos de câncer foram encontrados. No entanto, em nossa meta-análise, apenas um ou dois estudos estavam disponíveis para alguns tipos de câncer específicos, e não tinham dimensão limitada da amostra, e, portanto, os resultados podem ser caprichoso e devem ser interpretados com cautela. Meta-análise é muitas vezes dominado por alguns grandes estudos, o que reduz significativamente as evidências de estudos menores. No entanto, na análise estratificada de acordo com o tamanho da amostra, não houve associação significativa entre digestivo suscetibilidade ao câncer sistema de um MTR foram encontrados tanto em estudos grandes e pequenas para todos os modelos genéticos. Além disso, estudos utilizando método de genotipagem diferente também obter resultados negativos consistentes.

Na análise estratificada por etnia, há associações significativas foram encontradas em caucasianos para o polimorfismo em todos os modelos genéticos. No entanto, observou-se uma associação marginal significativa entre o polimorfismo A2756G e aumento do risco de cancro do sistema digestivo em populações do leste asiático. Há várias explicações para este fenómeno. Em primeiro lugar, o câncer é uma doença complexa e diferentes origens genéticas podem causar a discrepância uma vez que as distribuições alelo G do polimorfismo A2756G varia entre o Leste Asiático e Europeu. Além disso, diferentes populações geralmente têm diferentes padrões de desequilíbrio de ligação. Um polimorfismo pode estar em ligação estreita com outra variante causal nas proximidades de uma população étnica, mas não em outro. MTR polimorfismo A2756G pode estar em estreita ligação com as diferentes variantes causais próximos em diferentes populações. Além disso, a heterogeneidade clínica como a idade, a proporção sexual, alimentar, anos de início e gravidade da doença também pode explicar a discrepância. populações diferentes podem ter diferenças na ingestão de nutrientes, alguns dos quais tomam parte na formação tumor.

Nossos resultados indicaram que marginal aumentou significativamente o risco de câncer do sistema digestivo em portadores do alelo G foram encontrados entre os estudos baseados em hospitais mas não em estudos de base populacional. Esta razão pode ser que os estudos baseados em hospitais têm alguns preconceitos, porque esses controlos podem representar apenas uma amostra da população de referência mal definido, e podem não ser representativos da população em geral muito bem, especialmente quando os genótipos sob investigação foram associados com o condições de doença que os controles baseados em hospitais pode ter. Portanto, o uso de objetos apropriados e representativos de controle de base populacional é muito importante para reduzir os vieses em tais estudos de associação genética.

cancro do sistema digestivo é uma doença extremamente complexa e ao mesmo polimorfismo pode ter diferentes funções em diferentes locais do tumor . Portanto, são necessários mais estudos para um tipo específico de cancro do sistema digestivo para identificar efeitos específicos do tumor potencial do polimorfismo MTR. Além disso, é possível que o efeito de um único polimorfismo no risco de cancro do sistema digestivo pode ser muito pequena. Foram identificados vários outros polimorfismos, sugerindo que os possíveis efeitos combinados destes polimorfismos na actividade MTR podem existir [49]. Além disso, o efeito do factor genético único sobre o risco de cancro do sistema digestivo pode ser mais pronunciado na presença de outros factores de risco genéticos ou ambientais comuns, tais como o abuso de álcool, tabaco, infecção pelo vírus da hepatite.

Comparado com o anterior meta-análise [50], [51], o presente estudo é muito maior, com mais que o dobro de casos de câncer do sistema digestivo como o meta-análise anterior. Além disso, diversas análises análise de subgrupo e meta-regressão foram realizadas para identificar potenciais fontes de heterogeneidade.

Algumas limitações deste meta-análise deve ser reconhecido. Em primeiro lugar, o subgrupo meta-análises considerando interações entre MTR genótipo e do tipo de tumor diferentes são baseadas em um pequeno número de estudos com essa informação disponível. Em segundo lugar, nossos resultados foram baseados em estimativas não ajustadas, enquanto que uma análise mais precisa deve ser realizada se os dados estavam disponíveis a nível individual, o que permitiria para o ajuste por outras variáveis, incluindo status de beber, o consumo de cigarros, folato e vitamina B12, história familiar , fatores ambientais e estilo de vida [52]. Em terceiro lugar, apenas estudos publicados foram incluídos nesta meta-análise. Portanto, o viés de publicação pode ter ocorrido, embora o uso de um teste estatístico não mostrá-lo. Apesar destes, o nosso presente meta-análise também teve algumas vantagens. Em primeiro lugar, não significativa entre os estudos heterogeneidade foram detectados em todas as comparações. Em segundo lugar, não há vieses de publicação foram encontradas, indicando que todos os resultados do pool pode ser imparcial.

Para concluir, a nossa meta-análise não suportam a associação do polimorfismo A2756G de MTR com câncer do sistema digestivo. Para estudos de associação futuros, bem concebida estudos com tamanho de amostra em diversas populações étnicas, mais tipos de cânceres do sistema digestivo, juntamente com são necessárias características bioquímicas, funcionais e Expressional de tecidos específicos.

Informações de Apoio

Figura S1. gráfico de funil de

Begg de MTR polimorfismo A2756G e câncer do sistema digestivo

doi:. 10.1371 /journal.pone.0061511.s001

(TIF)

Checklist S1.

doi: 10.1371 /journal.pone.0061511.s002

(DOC)