PLOS ONE: falta de associação do TP53BP1 Glu353Asp Polimorfismo com risco de cancro: uma revisão sistemática e meta-análise

Abstract

Objectivo

O gene TP53BP1 podem estar envolvidos no desenvolvimento do cancro através da interrupção de reparo do DNA. No entanto, os estudos que investigam a relação entre TP53BP1 Glu353Asp (rs560191) polimorfismo e câncer produziram resultados contraditórios e inconclusivos. A fim de realizar estes resultados ambíguos, uma meta-análise foi realizada para avaliar a associação entre a (rs560191) polimorfismo TP53BP1 Glu353Asp e susceptibilidade ao câncer.

Métodos

Foi realizada uma pesquisa de tudo Inglês relatórios sobre estudos para a associação entre o (rs560191) polimorfismo TP53BP1 Asp353Glu e susceptibilidade ao câncer usando Medline, a Biblioteca Cochrane, Embase, web of Science, Google (scholar), e todos os relatórios chineses foram identificadas manualmente e on-line usando CBMDisc , banco de dados VIP Chongqing, e banco de dados CNKI. Foram determinados os rigorosos critérios de seleção e critérios de exclusão, e odds ratio (OR) com intervalo de confiança de 95% (IC) foram usadas para avaliar a força das associações. O modelo de efeito fixo ou aleatório foi selecionado com base no teste de heterogeneidade entre os estudos. viés de publicação foi estimada utilizando parcelas funil e testes de regressão de Egger.

Resultados

Um total de sete estudos foram incluídos na meta-análise incluindo 3.213 casos e 3.849 controles. Os resultados indicaram que o polimorfismo Glu353Asp (rs560191) no gene TP53BP1 teve nenhuma associação com o risco de cancro em todos os modelos genéticos. Na análise de subgrupo, os resultados sugerem que o polimorfismo Glu353Asp não foi associado com o risco de cancro de acordo com a etnia, tipo de câncer, o método de genotipagem, ajustado com o controle ou não, HWE e qualidade pontuação.

Conclusões

Esta meta-análise sugeriu que o polimorfismo Glu353Asp (rs560191) no gene TP53BP1 não foi associado com risco de câncer de

Citation:. Liu L, Jiao J, Wang Y, Zhang D, Wu J, Huang D (2014) Falta de Associação do TP53BP1 Glu353Asp Polimorfismo com risco de cancro: uma revisão sistemática e meta-análise. PLoS ONE 9 (3): e90931. doi: 10.1371 /journal.pone.0090931

editor: William B. Coleman, University of North Carolina School of Medicine, Estados Unidos da América

Recebido: 27 Dezembro, 2013; Aceito: 04 de fevereiro de 2014; Publicação: 06 de março de 2014

Direitos de autor: © 2014 Liu et al. Este é um artigo de acesso aberto distribuído sob os termos da Licença Creative Commons Attribution, que permite uso irrestrito, distribuição e reprodução em qualquer meio, desde que o autor original ea fonte sejam creditados

Financiamento:. Os autores não têm apoio ou financiamento para relatar

Conflito de interesses:.. Os autores declararam que não existem interesses conflitantes

Introdução

foi relatado que havia cerca de 12,7 milhões de novos casos de câncer e 7,6 milhões de mortes por câncer através do mundo em 2008 [1]. No entanto, a etiologia de cancro continua a ser desconhecido e tratamentos modificadores da doença, são limitados. Além disso, desde o envolvimento de citocinas no cancro foi levantada a hipótese, havia muitos genes candidatos que se aproximam na concepção de um estudo de associação de caso-controle de polimorfismos de nucleotídeo único (SNPs), incluindo proteína de ligação de p53 1 (TP53BP1).

gene TP53BP1 tem desempenhado um papel importante tanto na reparação e ciclo celular controle de DNA e também medeia o dano checkpoint DNA através da cooperação com sensores de danos e transdutores de sinal [2]. O TP53BP1 contém dois domínios BRCA1 C-terminal (BRCT), que são essenciais para as funções supressoras de tumor [3]. O SNP para TP53BP1 gene pode desempenhar um papel importante na etiologia de cancro devido a um papel directo de TP53BP1 na resposta celular a danos no ADN. Pesquisas anteriores revelaram que não houve associação entre TP53BP1 Asp353Glu (rs560191) SNPs e risco de câncer [4] – [9], mas Kiyohara et al. relataram que o genótipo Glu /Glu de TP53BP1 Asp353Glu foi associada a uma diminuição do risco de cancro do pulmão [10]. Assim, os resultados de estudos sobre associação entre Asp353Glu polimorfismo (rs560191) no gene TP53BP1 eo risco de câncer são conflitantes.

Considerando-se um único estudo pode não ter a energia para fornecer uma conclusão confiável, foi realizada uma meta-análise sobre estes estudos elegíveis para investigar a relação precisa entre TP53BP1 Asp353Glu (rs560191) polimorfismo e suscetibilidade ao câncer, o que teria um muito maior possibilidade de chegar a conclusões razoavelmente fortes.

Métodos

Seleção de estudos elegíveis

foram pesquisados ​​Medline (National Library of Medicine, Bethesda, MD EUA), Embase, Cochrane Library, Medicina Biológica chinês, Infra-estrutura Nacional da China Knowledge, Wang fang de dados e banco de dados Chongqing VIP (Última pesquisa foi atualizada em dezembro de 20, 2013), utilizando os termos “de ligação a proteína p53 1 ou TP53BP1 ou 53BP1”, “Asp353Glu ou rs560191 ou D353E”, “câncer ou tunor ou carcinoma” e “polimorfismo, variante ou mutação”. A seleção foi feita sem restrição de linguagem, mas nós só incluiu artigos publicados escritos em Inglês ou chinês. Usamos a opção PubMed “Artigos Relacionados” para cada estudo para recuperar artigos adicionais potencialmente relevantes. listas de referência foram verificados e pesquisadores foram contatados para literaturas adicionais

Critérios de Seleção

Os estudos foram selecionados se cumpridos os seguintes critérios:. (1) estudo de associação com um caso-controle ou coorte; (2) o estudo investigou a associação entre TP53BP1 (rs560191) polimorfismo eo risco de câncer; . (3) no caso de várias publicações do mesmo grupo de estudo, foram utilizados os resultados mais completos e recentes

Critérios de exclusão

Os critérios de exclusão foram definidas como: 1) Resumos, revisões e estudos em animais; 2) dados inúteis relatados, número genótipo ou freqüência não incluído; e 3) o estudo sem dados suficientes para a meta-análise. Se mais de um estudo foi publicado pelos mesmos autores utilizando a mesma série de casos, somente o estudo mais recente ou o estudo com o maior tamanho das amostras foi incluído na nossa meta-análise.

Data Extraction

Dois revisores (Lei Liu e Jinghua Jiao) controladas de forma independente estudos sobre as associações entre TP53BP1 Asp353Glu (rs560191) polimorfismo eo risco de câncer. Quando discrepâncias foram apareceu, todos os investigadores foram recrutados para avaliar os dados. As seguintes informações foram coletadas: Primeiro autor, ano de publicação, localização, etnia, tamanho das amostras de pacientes e controles, desenho do estudo e números de genótipos

Os revisores desenvolveram uma escala de avaliação da qualidade (Tabela 1), que foi modificado. a partir de estudos anteriores [11] – [13], para avaliar a qualidade dos estudos elegíveis

a revisão e análise foram orientados a realizar pela declaração PRISMA para a comunicação preferido de revisão sistemática e meta-análise. [14].

Análise estatística

odds ratio (OR) com intervalo de confiança de 95% (IC) para genótipos e alelos foram utilizados para avaliar a força da associação entre TP53BP1 Asp353Glu (rs560191) polimorfismo eo risco de câncer. Os ORs foram realizados para os contrastes de alelos, modelo genético aditivo, bem como modelo genético recessivo e modelo genético dominante, respectivamente. A heterogeneidade foi examinada com

I

2

estatística interpretado como a proporção da variação total contribuído por variação entre-estudo. Nós também mediram o efeito da heterogeneidade usando uma medida quantitativa,

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2

= 100% x (Q-d f) /Q. Se houve uma diferença estatística em termos de heterogeneidade (p 0,10,

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2 50%

), o modelo de efeitos aleatórios seria usado para estimar as RUP agrupados [15], [16] . Caso contrário, as RUP reunidas foram estimadas pelo modelo de efeitos fixos [17]. A análise de sensibilidade foi realizada por supressão de um único estudo de cada vez para examinar a influência dos dados individuais definidos nas RUP em pool. O viés de publicação possível foi avaliada com parcelas funil e teste de Egger. Uma trama assimétrica sugere um possível viés de publicação eo valor P de ensaio inferior a 0,05 de Egger foi considerada representativa de viés de publicação estatisticamente significativa [18]. Todos os testes estatísticos foram realizados com RevMan versão 5.0 (Review Manager, Copenhaga: O Nordic Cochrane Centre, The Cochrane Collaboration, 2010) e Comprehensive software Meta-Analysis versão 2.0 (Biostat, Englewood Cliffs, I.N.J., EUA).

valor P

de menor que 0,05 para qualquer teste foi considerado estatisticamente significativo.

Resultados

Inclusão Estudo e Características

Como mostrado na Figura 1 , um total de sete estudos foram incluídos nesta meta-análise incluindo 3.213 casos e 3.849 controles [4] – [10]. Os estudos identificadas e as suas características principais estão resumidos na Tabela 1 e Tabela 2. A distribuição do genótipo de seis estudos de polimorfismo não diferiu do equilíbrio de Hardy-Weinberg nos grupos de controlo com (todos eram superiores a 0,05, tabela 3).

dados Quantitativos síntese

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