PLOS ONE: Utility Multi-Purpose de circulação Teste de DNA plasmático em pacientes com cancros avançados

Abstract

Tumor instabilidade genômica e tratamento selectivo pressões resultar na evolução da doença clonal; estratificação molecular para a administração da droga molecularmente alvo requer acesso repetido para DNA tumor. Trabalhamos com a hipótese de que o DNA no plasma (cpDNA) em pacientes com câncer avançado de circulação é, em grande parte derivado do tumor, tem utilidade de prognóstico, e pode ser utilizado para tumor multiplex mutação sequenciamento quando repetição biópsia não é viável. Nós utilizamos o painel Sequenom Sistema MassARRAY e OncoCarta para perfilamento mutação somática. amostras emparelhadas, adquiridos a partir do mesmo paciente, mas em diferentes pontos de tempo foram avaliados; estes (FFPE) tecido composto fixado em formalina embebido em parafina do tumor de arquivo (primária e /ou metastático) e cpDNA. A viabilidade, sensibilidade e especificidade deste alto rendimento, a abordagem de detecção de mutação multiplex foi testado utilizando amostras adquiridas de 105 pacientes com tumores sólidos que se refere à participação em ensaios de Fase I da droga molecularmente direcionados. A concentração cpDNA mediana foi de 17 ng /mL (intervalo: 0,5-1600); este era de 3 vezes mais elevada do que em voluntários saudáveis. Além disso, as concentrações mais elevadas cpDNA associado à sobrevida global pior; havia uma relação de sobrevida global (OS) de perigo de 2,4 (IC 95% 1,4, 4,2) para cada aumento de 10 vezes na concentração cpDNA e em análises multivariadas, a concentração cpDNA, albumina e performance status permaneceram preditores independentes de OS. Estes dados sugerem que o DNA do plasma nestes pacientes com cancro é, em grande parte derivado do tumor. Observamos também elevada concordância de detecção de mutações crítica “hot-spot” (

KRAS

,

BRAF

,

PIK3CA

) em cpDNA combinados e tecido tumoral de arquivo, e importantes diferenças entre tumor de arquivo e cpDNA. Este ensaio de sequenciação em multiplex pode ser utilizada para detectar mutações somáticas a partir do plasma em doentes com cancro avançado, quando repetição da biópsia do tumor de segurança não é viável e análise genómica de tumor de arquivo é considerado insuficiente. No geral, que circulam estudos de biomarcadores ácidos nucleicos têm utilidade polivalente clinicamente importante em pacientes com câncer avançado e mais estudos para prosseguir a sua incorporação no padrão de atendimento são garantidos

Citation:. Perkins G, Yap TA, o Papa G, Cassidy AM, Dukes JP, Riisnaes R, et al. (2012) Multi-Purpose utilitário de circulação Teste de DNA plasmático em pacientes com cancros avançados. PLoS ONE 7 (11): e47020. doi: 10.1371 /journal.pone.0047020

editor: Jose Luis Perez-Gracia, Clínica Universidade de Navarra, Espanha

Deixe uma resposta