Abstract
O câncer de pâncreas é a principal causa de morte por tumores sólidos em todo o mundo. Actualmente, gemcitabina é o único fármaco aprovado para o tratamento do cancro pancreático. O desenvolvimento de novos fármacos terapêuticos para esta doença é, portanto, uma necessidade urgente. O projeto C-Map forneceu uma riqueza de dados de expressão gênica que pode ser extraído para o reposicionamento drogas, uma abordagem promissora para descoberta de novas drogas. Tipicamente, uma droga é considerada potencialmente útil para o tratamento de uma doença, se o diferencial perfil de expressão de gene induzida por drogas está negativamente correlacionada com os genes diferencialmente expressos em a doença alvo. No entanto, muitas das drogas potencialmente úteis (Puds) identificados pelo gene correlação perfil de expressão são susceptíveis de falsos positivos, porque, em C-Map, as linhas de células cultivadas para a qual é aplicada a droga não são derivadas de tecidos de doentes. Para resolver este problema, desenvolvemos uma abordagem combinada para a previsão de drogas candidatas para o tratamento de câncer de pâncreas. Nós primeira Puds para câncer de pâncreas identificado por meio da correlação de expressão gênica baseada em C-Map analisa. Nós então aplicado um algoritmo (Met-express) para prever enzimas-chave do cancro do pâncreas (KPC) envolvidos no metabolismo do câncer de pâncreas. Finalmente, foram selecionados candidatos dos Puds, exigindo que os seus objectivos ser enzimas KPC ou os substratos /produtos de enzimas KPC. Usando esta abordagem combinada, previmos sete candidatos drogas para o tratamento de câncer de pâncreas, três dos quais são suportadas pela evidência da literatura, e três foram validadas experimentalmente para ser inibidor para celllines câncer pancreático
Citation:. Ma Y, Hu J , Zhang N, Dong X, Li Y, Yang B, et al. (2016) Previsão de candidatos drogas para tratar o cancro do pâncreas utilizando uma abordagem combinada. PLoS ONE 11 (2): e0149896. doi: 10.1371 /journal.pone.0149896
editor: Aamir Ahmad, University of South Alabama Cancer Institute Mitchell, United States