Abstract

adenocarcinoma do pâncreas (PAC) é um dos mais difíceis de tratar tumores. Grande parte deste é atribuído à tarde diagnóstico. Para identificar biomarcadores para a detecção precoce, foram examinadas diferenças de metilação de DNA no DNA dos leucócitos entre casos e controles PAC em um estudo de duas fases. Na fase I, medimos níveis de metilação em 1.505 locais de CpG no DNA dos leucócitos virgem de tratamento de 132 pacientes PAC não-fumadores e 60 não-fumante controles saudáveis. Foram encontradas diferenças significativas em 110 locais CpG (taxa de descoberta de falsas 0,05). Na fase II, foi testada e validada 88 de 96 de fase I selecionado locais de CpG em 240 casos PAC e 240 controles pareados (p≤0,05). Usando regressão logística penalizada, construímos um modelo de previsão consiste em cinco locais CpG (IL10_P348, LCN2_P86, ZAP70_P220, AIM2_P624, TAL1_P817) que discriminou pacientes PAC de controles (estatística C = 0,85 na fase I; 0,76 na fase II). Curiosamente, um site de CpG (LCN2_P86) só poderia discriminar pacientes operados de controles (estatística C = 0,78 na fase I; 0,74 na fase II). Também foi realizada a análise de metilação Quantitative Trait Loci (methQTL) e identificou três locais CpG (AGXT_P180_F, ALOX12_E85_R, JAK3_P1075_R), onde os níveis de metilação foram significativamente associados com polimorfismos de nucleotídeo único (SNPs) (taxa de detecção falsa 0,05). Os nossos resultados demonstram que a variação epigenética em DNA de leucócitos facilmente obtenível, manifesta-se por metilação diferenças reproduzíveis, podem ser usadas para detectar pacientes Pac. As diferenças de metilação em determinados locais CpG são parcialmente atribuível à variação genética. Este estudo apoia fortemente estudo de associação do epigenoma futuro usando DNA de leucócitos para a descoberta de biomarcadores em doenças humanas

Citation:. Pedersen KS, Bamlet WR, Oberg AL, de Andrade M, Matsumoto ME, Tang H, et al. (2011) Leucócitos DNA metilação Assinatura Diferencia pancreáticas pacientes com câncer de controles saudáveis. PLoS ONE 6 (3): e18223. doi: 10.1371 /journal.pone.0018223

editor: Hana algul, Technische Universität München, Alemanha