Abstract

estudos de associação

Genome-larga (GWAS) identificaram vários polimorfismos de nucleotídeo único (SNPs) associado com o risco de câncer de próstata. No entanto, se essas associações podem ser consistentemente replicado, variam de acordo com a agressividade da doença (estágio do tumor e grau) e /ou interagir com potenciais fatores de risco não-genéticos ou outros SNPs é desconhecida. Nós, portanto, genotipados 39 SNPs de regiões identificadas por vários câncer de próstata GWAS nos casos de câncer de próstata 10.501 e 10.831 controles da mama NCI e Prostate Cancer Cohort Consortium (BPC3). Nós replicado 36 de 39 SNPs (valores-p variam de 0,01 a 10

-28). Dois SNPs localizados perto

KLK3

associado com níveis de PSA mostrou associação diferencial com Gleason grau (rs2735839, P = 0,0001 e rs266849, P = 0,0004; caso único teste), onde os alelos associados com a diminuição dos níveis de PSA eram inversamente associado com baixo grau (conforme definido pelo Gleason grau 8) tumores, mas positivamente associada com tumores de alto grau. Nenhum outro SNP apresentaram associações diferenciais de acordo com o estágio da doença ou grau. Observamos nenhuma modificação efeito pelo SNP para a associação com a idade no momento do diagnóstico, história familiar de câncer de próstata, diabetes, IMC, altura, tabagismo ou o consumo de álcool. Além disso, não encontramos nenhuma evidência de interações SNP-SNP de pares. Embora esses SNPs representam novos fatores de risco independentes para câncer de próstata, vimos pouca evidência de modificação de efeito por outros SNPs ou pelos fatores ambientais examinados

Citation:. Lindstrom S, Schumacher F, Siddiq A, Travis RC, Campa D, Berndt SI, et ai. (2011) Associações caracterização e interações SNP-Ambiente para GWAS-Identificados do cancro da próstata risco Marcadores de resultados de BPC3. PLoS ONE 6 (2): e17142. doi: 10.1371 /journal.pone.0017142

editor: Marie-Pierre Dubé, Université de Montreal, Canadá