Abstract

Fundo

É possível inferir o passado das populações através da comparação de genomas entre os indivíduos. Em geral, as populações mais velhas têm mais diversidade genômica do que as populações mais jovens. A força da seleção também pode ser inferida a partir diversidade populacional. Se a seleção é forte e frequentemente elimina as variantes menos aptos, a diversidade será limitado, porque as populações novas, inicialmente homogêneos emergem constantemente.

Metodologia e Resultados

Aqui nós traduzir uma abordagem genética de populações ao câncer somáticas humanas populações de células medindo diversidade genômica dentro e entre as pequenas glândulas de câncer colorretal (CRC). de cultura de tecidos de xenoenxerto de controlo e experiências demonstram que a diversidade da população de certos padrões de metilação de ADN passageiro é reduzida após a clonagem, mas subsequentemente aumenta com o tempo. Quando medido em populações de glândula de CRC, a metilação do passageiro diversidade de diferentes partes de nove CRCs foi relativamente elevada e uniforme, consistente com as linhagens mais velhos, estáveis, em vez de misturas de populações homogéneas mais jovens que derivam de ciclos frequentes de selecção. A diversidade das seis metástases também era elevada, sugerindo disseminação precoce após a transformação. A diversidade foi menor nas glândulas CRC deficientes DNA mismatch reparação, possivelmente sugerindo mais a selecção ea eliminação de variantes menos aptos quando as taxas de mutação são elevados.

Conclusão /Significado

O passageiro que viaja muitas variantes observada em populações de células de CRC primários e metastáticos são consistentes com populações relativamente velhos, sugerindo que a evolução clonal levando a varreduras selectivos podem ser raros após transformação. Seleção em cancros humanos parece ser uma força mais fraca do que se supunha, após transformação, de acordo com a raridade observado de mutações motorista em genomas do câncer. plasticidade fenotípica, em vez de a aquisição gradual de novas mutações motorista pode mais em conta para os muitos fenótipos diferentes dentro de tumores humanos

Citation:. Siegmund KD, manjerona P, tavare S, Shibata D (2011) High DNA metilação padrão intratumoral diversidade Implica seleção fraca em muitos cancros colo Humano. PLoS ONE 6 (6): e21657. doi: 10.1371 /journal.pone.0021657

editor: Chris T. L. Chan, da Universidade de Hong Kong, Hong Kong

Recebido: 14 Dezembro, 2010; Aceito: 06 de junho de 2011; Publicado: 28 Junho 2011