PLOS ONE: Crescimento Transcrição 5 níveis associados snoRNA Detenção-Specific estão relacionados com a expressão da p53 e danos no DNA em câncer colorretal

Abstract

Fundo

O

crescimento específico detenção transcrição 5 gene

(

GAS5

) codifica um RNA não-codificante longa (lncRNA) e os hosts um número de pequenos RNAs de nucléolos (snoRNAs) que tenham sido recentemente implicada em vários processos celulares e cancro. Aqui, nós investigamos a relação entre o dano ao DNA, p53, e

GAS5

snoRNAs para obter mais conhecimentos sobre o papel potencial deste lugar na sobrevivência celular e oncogênese ambos

in vivo

e

in vitro

.

Métodos

Nós usamos técnicas quantitativas para analisar o efeito de danos no DNA em

GAS5

expressão snoRNA e avaliar a relação entre p53 eo

GAS5

snoRNAs em linhas celulares de cancro e em técnicas biológicas normais, pré-malignas e tecido colorectal humana maligna e usados ​​para sugerir papéis potenciais para esses snoRNAs na resposta danos no DNA.

resultados

GAS5

expressão snoRNA -derived foi induzida por danos no ADN de um modo dependente de p53 em linhas celulares de cancro colorrectal e seus níveis não foram afectados por DICER. Além disso, os níveis de p53 fortemente correlacionada com a

GAS5

expressão snoRNA -derived no tecido colorectal.

Conclusões

Em conjunto, estes dados sugerem que o

GAS5

snoRNAs -derived estão sob o controlo de p53 e que têm um papel importante na mediação da resposta da p53 a danos no ADN, que não pode estar relacionada com a sua função no ribossoma. Nós sugerimos que essas snoRNAs não são processados ​​pelo DICER para formar RNAs menores snoRNA derivados com microRNA (miRNA) -como funções, mas o seu papel preciso requer uma avaliação mais aprofundada. Além disso, desde snoRNAs hospedeiras GAS5 são frequentemente utilizados como controles endógenos em quantificações qPCR mostramos que a sua utilização como genes de limpeza no DNA experimentos danos podem levar a resultados imprecisos

Citation:. Krell J, Frampton AE, Mirnezami R, Harding V, De Giorgio A, Roca Alonso L, et al. (2014)

Crescimento níveis de transcrição 5

Associated snoRNA Detenção-Specific estão relacionados com a expressão da p53 e danos no DNA em câncer colorretal. PLoS ONE 9 (6): e98561. doi: 10.1371 /journal.pone.0098561

editor: Raffaele A. Calogero, Universidade de Torino, Itália

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