Abstract

Objetivos

Nosso objetivo foi determinar as associações de polimorfismos genéticos de reparação por excisão grupo de acesso a complementação 1 (

ERCC1

) rs11615, grupo xeroderma pigmentoso D (

XPD

/

ERCC2)

rs13181, grupo complementar de raio-X de reparação cruz 1 (

XRCC1

) rs25487,

XRCC3

rs1799794, e suscetibilidade ao câncer de mama gene 1 (

BRCA1

) rs1799966 da via de reparação do ADN e resistência a múltiplas drogas 1 (

MDR1 /ABCB1

) rs1045642 com resposta à quimioterapia e sobrevivência do cancro do pulmão de células não pequenas (NSCLC) em uma população chinesa.

Materiais e Métodos

um total de 352 pacientes com NSCLC foram inscritos para avaliar as associações dos seis SNPs com a resposta à quimioterapia e sobrevida global. regressões logísticas foram aplicados para testar as associações de polimorfismos genéticos com resposta à quimioterapia em 161 pacientes com NSCLC avançado. A sobrevida global foi analisado em 161 avançado e 156 pacientes com NSCLC fase de início utilizando o método de Kaplan-Meier com o teste log-rank, respectivamente. Multivariada Cox modelo de riscos proporcionais foi realizada para determinar os fatores independentemente associados com NSCLC prognóstico.

Resultados

BRCA1

rs1799966 menor alelo C (TC + ​​CC

vs.

TT, OR = 0,402, IC 95% = 0,204-0,794, p = 0,008) e

MDR1 /ABCB1

rs1045642 alelo secundário A (GA + AA

vs.

GG, OR = 0,478, IC 95% = 0,244-0,934, p = 0,030) foram associados com uma melhor resposta à quimioterapia em pacientes com NSCLC avançado. As análises de sobrevivência indicou que

BRCA1

genótipos rs1799966 TC + CC foram associados com uma diminuição do risco de morte (HR = 0,617, IC 95% = 0,402-0,948, p = 0,028) em pacientes com NSCLC avançado, ea associação foi ainda significativa após o ajuste para co-variáveis. Multivariada Cox análise de regressão mostrou que

ERCC1

rs11615 genótipo AA (

P

= 0,020) e tabagismo (p = 0,037) foram associados a maior risco de morte em pacientes com NSCLC fase precoce após a cirurgia.

Conclusões

Os polimorfismos de genes em via de reparo de DNA e

MDR1

poderia contribuir para a resposta à quimioterapia e sobrevida dos pacientes com NSCLC

Citation:. Du Y, su T, Zhao L, Tan X, Chang W, Zhang H, et al. (2014) Associações de polimorfismos em genes de reparo de DNA e Gene MDR1 com quimioterapia Response and Survival of Non-Small Cell Lung Cancer. PLoS ONE 9 (6): e99843. doi: 10.1371 /journal.pone.0099843

editor: Xiaoping Miao, MOE chave do Laboratório de Ambiente e Saúde, Escola de Saúde Pública, Tongji Medical College, Huazhong Universidade de Ciência e Tecnologia, China

Recebido: 17 Abril de 2014; Aceito: 19 de maio de 2014; Publicação: 16 de junho de 2014

Direitos de autor: © 2014 Du et al. Este é um artigo de acesso aberto distribuído sob os termos da Licença Creative Commons Attribution, que permite uso irrestrito, distribuição e reprodução em qualquer meio, desde que o autor original ea fonte sejam creditados

Data Availability:. O autores confirmam que todos os dados subjacentes às conclusões estão totalmente disponíveis sem restrições. Todos os dados relevantes estão dentro do papel e seus arquivos de suporte de informação

Financiamento:. Este estudo foi apoiado pelo Projeto Chave de Xangai Ciência e concessão Comitê de Tecnologia (06DZ19503 para G. Cao) e National Natural Science Foundation da China ( 81025015 a G. CaO). As agências de financiamento não teve nenhum papel no desenho do estudo, recolha e análise de dados, decisão de publicar ou preparação do manuscrito

CONFLITO DE INTERESSES:.. Os autores declararam que não existem interesses conflitantes

introdução

o cancro do pulmão é uma das principais causas de morte por câncer em todo o mundo [1]. cancro do pulmão de não-pequenas células (CPNPC) é o subtipo mais comum e responde por 85% de todos os cânceres de pulmão. A maioria dos pacientes com NSCLC está em desenvolvido estágio do tumor avançado no momento do diagnóstico e perder a oportunidade de ressecção cirúrgica [2]. quimioterapia combinada à base de platina é um tratamento padrão para NSCLC avançado. No entanto, o resultado ea sobrevivência das NSCLC avançado são geralmente pobres, com uma taxa de sobrevida em 5 anos de apenas cerca de 15%. Além disso, a taxa de sobrevivência de NSCLC avançado varia muito em populações diferentes com diversos antecedentes genéticos [3], [4]. Além disso, a eficácia terapêutica dos regimes baseados em platina foi afectada pela resistência à droga. Possíveis mecanismos de chemoresistance incluem alterações no efluxo de droga ou fluxo, a capacidade de reparo do DNA, e outros percursos celulares necessários para a resposta ao dano no DNA. Para os doentes com NSCLC fase precoce que pode ser excisado cirurgicamente, o prognóstico a longo prazo não é satisfatória e que a taxa de sobrevivência de 5 anos após a cirurgia for inferior a 50% [5]. O resultado da fase inicial de pacientes com NSCLC que receberam tratamento cirúrgico também está intimamente relacionado com características genéticas individuais, uma vez variação e de expressão níveis de certos genes podem afetar a resposta de sobrevivência e quimioterapia adjuvante [6], [7]. análise de variação genética em vias candidatos demonstrou que a base genética de um indivíduo tem um papel importante no desenvolvimento da doença, resposta ao tratamento, e sobrevivência. Por exemplo, os pacientes com NSCLC completamente ressecada e expressão negativa de reparação de excisão de grupo trans-complementação 1 (ERCC1) proteína em tumores beneficiar mais a partir de quimioterapia adjuvante à base de cisplatina do que aqueles com expressão positiva ERCC1 [8]. Estudos anteriores mostraram que o tumor-nódulo-metástase (TNM) sistema de estadiamento, idade, estado de desempenho e perda de peso estão associados com NSCLC prognóstico; no entanto, os poderes de previsão destes factores não são ideais. Portanto, é crucial para identificar novos biomarcadores que podem melhorar a precisão avaliação prognóstica e preditiva para ajudar a desenvolver o tratamento personalizado do câncer e quimioterapia adaptados-paciente e, eventualmente, alcançar melhores resultados para os pacientes com NSCLC.

capacidade de reparo do DNA (RDC) é uma faca de dois gumes na etiologia e tratamento do câncer. Defeitos no sistema de reparo do DNA aumentar drasticamente o risco de câncer [9]. Por outro lado, o mecanismo de reparação do ADN pode reduzir a eficácia terapêutica da quimioterapia, permitindo que as células cancerosas para reparar danos de ADN causados ​​por esses agentes [10]. reparo do DNA envolve a coordenação de muitos genes em quatro principais vias de reparo de DNA, que são de reparo de nucleotídeos excisão (NER), a reparação por excisão de bases (BER), reparo ruptura de fita dupla (DSBR), e as vias de reparo incompatível (MMR). polimorfismos de nucleotídeo único (SNPs) em genes de reparo do DNA pode modular a capacidade de reparo do DNA via influenciar a expressão da proteína ou atividades, e, portanto, afetar o risco de câncer de pulmão [11] – [13]. ADN polimorfismos do gene de reparação pode ser associada com o risco e prognóstico do NSCLC. grupo xeroderma pigmentoso D (

XPD

/

ERCC2)

polimorfismo pode alterar a estrutura secundária do mRNA [14]; e SNP no raio-X cruz reparação grupo 1 complementando (

XRCC1

) gene 5 ‘não traduzida (UTR) aumentar consideravelmente elemento de ligação trans-ativador SP1, portanto, diminuindo a atividade do promotor e diminuindo a expressão da proteína [15]. Além disso, os polimorfismos nestes genes também podem ser potenciais marcadores prognósticos tanto para dar resposta a quimioterapia ea sobrevida global dos pacientes com NSCLC [16] – [19].

múltipla resistência aos medicamentos 1 (

MDR1

, também conhecido como

ABCB1

) gene codifica a P-glicoproteína (P-gp), um transportador transmembranar que pertence à família de cassete de ligação de ATP, que pode bombear quimioterapêuticos intracelulares e induzir resistência múltipla a drogas.

/ABCB1 C3435T

polimorfismo MDR1 (rs1045642) está associada com o nível de expressão e função de MDR1 [20], portanto, pode afetar as respostas ao tratamento anticâncer drogas.

Neste estudo, foram selecionados seis SNPs previamente estudados, localizados na regiões ou em regiões reguladoras dos genes, incluindo

ERCC1

rs11615,

XPD /ERCC2

rs13181 e suscetibilidade ao câncer de mama gene 1 (

BRCA1 proteína codificante

) rs1799966 da via NER;

XRCC1

rs25487 da via BER,

XRCC3

rs1799794 da via DSBR, bem como

MDR1 /ABCB1

rs1045642 (Tabela S1). Em primeiro lugar, investigou as associações entre esses SNPs e resposta à quimioterapia em pacientes com NSCLC avançado, em seguida, avaliou as suas relações com a sobrevivência de pacientes com NSCLC que receberam tratamento cirúrgico ou quimioterapia.

Materiais e Métodos

População do estudo

os participantes foram recrutados em Changhai Hospital da segunda Universidade médica Militar. Um total de 352 pacientes com NSCLC primários diagnosticados entre julho de 1997 a outubro de 2008 foram inscritos (Dataset S1). Todos os pacientes foram histologicamente confirmados como NSCLC. Os dados clínicos e histopatológicos de pacientes foram extraídas de seus registros médicos. Todos os pacientes eram de origem étnica chinesa Han. O protocolo do estudo conformado com as diretrizes éticas da Declaração de Helsinki (2000), e foi aprovado pelo Institutional Review Board desta universidade. Todos os participantes forneceram consentimento informado por escrito.

A recolha de dados e acompanhamento

Dos 352 pacientes com NSCLC, 161 (45,7%) pacientes com NSCLC avançado receberam quimioterapia baseada em platina avaliável. Além de cisplatina (DDP) ou carboplatina (CBP), regimes de quimioterapia também incluiu gemcitabina (GEM), paclitaxel (TAX), docetaxel (DOC), vinorelbina (NVB), ou pemetrexed diss�ico (PEM). doses de droga foram: DDP 75 mg /m

2 no dia 1; CBP área sob a curva (AUC) = 5-6 g no dia 1; GEM 1250 mg /m

2 nos dias 1 e 8; IMPOSTO 135~175 mg /m

2 no dia 1 mais de 3 horas; DOC 75 mg /m

2 no dia 1 ao longo de 1 hora; NVB 25 mg /m

2 nos dias 1 e 8; PEM 500 mg /m

2 no dia 1. Todos os fármacos foram administrados por infusão intravenosa, a cada 3-4 semanas para um ciclo de tratamento. A resposta tumoral foi avaliada após 2 ciclos de tratamento de acordo com os critérios de avaliação da resposta em tumores sólidos [21]. As respostas foram classificadas em resposta completa (CR), resposta parcial (PR), a doença estável (SD) ou doença progressiva (DP). Os pacientes com CR, PR ou SD foram definidos como “pacientes com benefício clínico”, e os pacientes com DP foram definidos como “doentes sem benefício clínico” [22].

O acompanhamento foi iniciado 2 meses após a definitiva diagnóstico. O acompanhamento foi realizado por telefone ou em pessoa entrevista no ambulatório, com um intervalo de 3 meses de acordo com o nosso procedimento epidemiológica padrão. Período médio de acompanhamento foi de 20,8 meses (intervalo: 1,0 a 178,6 meses).

A genotipagem

O DNA genômico foi extraído de sangue periférico usando DNA QIAmp kits de extração (QIAGEN, Hilden, Alemanha). SNPs foram genotipados usando fluorescente-probe-PCR em tempo real quantitativo (qPCR) num LightCycler

TM480 (Roche, Basel, Suíça). Primers e sondas (Taqman ou sulco menor Binder [MGB]) foram concebidos e sintetizados por GeneCore biotecnologias (Xangai, China). As sequências dos iniciadores e sondas estão disponíveis na Tabela S1. Cada mistura de reacção continha 0,2 mol /L de iniciadores, 0,2 umol /L de sonda, 0,1 ug-0,5 ug de modelos purificados em sistema de reacção de pré-mistura Ex Taq (Takara, Dalian, China). As reacções foram programado a 95 ° C durante 10 s, seguido de 40 ciclos de 95 ° C durante 10 s e 60 ° C durante 30 s. Todas as amostras foram genotipados com sucesso (Dataset S1). Para controle de qualidade, 5% das amostras foram selecionados aleatoriamente e directamente sequenciado, e 100% de resultados idênticos foram obtidos.

A análise estatística

A análise de regressão logística foi realizada para obter odds ratio (OR) e seus intervalos de confiança de 95% (95% IC) para as relações de polimorfismos genéticos com resposta à quimioterapia em 161 pacientes com NSCLC avançado. A sobrevida global (OS) foi analisada pelo método de Kaplan-Meier em 161 avançado e 156 pacientes com NSCLC fase primeiros separadamente. -Rank log de teste foi utilizado para comparar as curvas de sobrevivência. Adiante multivariada stepwise Cox modelo de riscos proporcionais (

P

entrada = 0,05,

P

remoção = 0,10) foi realizada para determinar os fatores que contribuem de forma independente para NSCLC prognóstico e estimar o taxas de risco (HR) e os seus 95% da CEI. Outras análises de subgrupos estratificar por histologia, tabagismo, também foram realizadas performance status Eastern Cooperative Oncology Group (ECOG), e estágio. Co-variáveis ​​foram ajustadas para obter horas e correspondente ICs de 95% em análises de subgrupos. Todos os testes estatísticos foram em frente e verso e conduzida usando Programa Estatístico para Ciências Sociais (SPSS 16.0 para Windows, SPSS, Chicago, IL).

P Art 0,05 foi considerado estatisticamente significante

Resultados

As características dos pacientes

As características demográficas e clínicas dos pacientes estão apresentadas na Tabela 1. . dos 352 casos NSCLC, 156 (44,3%) eram pacientes em início de carreira que foram submetidos a tratamento cirúrgico, 161 (45,7%) eram pacientes avançadas numa fase inoperável e receberam quimioterapia à base de platina, 10 (2,8%) pacientes se recusou qualquer tratamento para razões pessoais, e 25 (7,1%) pacientes perderam o acompanhamento após o primeiro tratamento em Changhai Hospital. A maioria dos pacientes (120/156, 76,9%) fase inicial NSCLC submetidos à cirurgia receberam pré-operatório ou quimioterapia adjuvante pós-operatório. pacientes com NSCLC avançado eram mais propensos a receber terapia de radiação em comparação com pacientes em estágio inicial (44,1%

vs

20,5%, p . 0,0001). Outras características demográficas e clínicas foram semelhantes entre fase precoce e pacientes com NSCLC avançado (p 0,05 para todos). Tabela S2 apresentou as distribuições genotípicas destes seis SNPs em diferentes categorias dos pacientes com NSCLC.

Associações de SNPs com resposta à quimioterapia

Dos 161 pacientes com NSCLC avançado que receberam platina avaliável quimioterapia base, o número de pacientes com CR, PR, SD ou PD foi de 0, 44, 65 e 52, respectivamente. O benefício clínico global (CR + PR + SD) a taxa foi de 67,7% (109/161).

BRCA1

rs1799966,

MDR1 /ABCB1

rs1045642 e estádio clínico foram significativamente associados com benefício clínico (Tabela 2). Os pacientes portadores de

BRCA1

menor alelo C (TC + ​​CC) tinham significativamente mais chances de alcançar o benefício clínico do que os pacientes portadores de rs1799966 genótipo TT (75,2%

vs.

55,0%, OR = 0,402 , IC 95% = 0,204-0,794, p = 0,008). Da mesma forma, pacientes portadores

MDR1 /ABCB1

rs1045642 alelo secundário A (GA + AA) tiveram benefício mais clínica de pacientes portadores rs1045642 genótipo GG (74,5%

vs.

58,2%, OR = 0,478, IC de 95% = 0,244-0,934, p = 0,030). Além disso, os pacientes com estágio IV clínica tiveram significativamente menos chances de alcançar o benefício clínico do que aqueles com estádio clínico III (61,3%

vs.

80,0%, OR = 2,523, IC 95% = 1,171-5,437, p = 0,016). Além disso, as associações continuaram a ser significativas na análise de regressão logística multivariada, que sugeriu que

BRCA1

rs1799966 (TC + ​​CC

vs.

TT),

MDR1 /ABCB1

rs1045642 (GA + AA

vs

GG.) e estágio clínico foram fatores independentes que afectam a resposta à quimioterapia (

BRCA1

rs1799966 (IV

vs

III.): OR ajustado = 0,410 , IC95% = ,203-0,831, ajustado p = 0,013;

MDR1 /ABCB1

rs1045642: OR ajustado = 0,488, IC 95% = 0,242-0,984, p ajustado = 0,045; estágio clínico: OR ajustado = 2.698 , IC 95% = 1,214-5,996, ajustado p = 0,015). Não foram observadas associações significativas entre os outros quatro SNPs (

ERCC1

rs11615,

XPD /ERCC2

rs13181,

XRCC1

rs25487,

XRCC3

rs1799794) ou outras características (idade, sexo, histologia, regimes de quimioterapia, performance status, tabagismo, e radioterapia) e benefício clínico (p 0,05 para todos).

Associações de SNPs com OS de pacientes com NSCLC avançado

univariada analisa o uso de curvas de Kaplan-Meier e log-rank testes indicaram que

BRCA1

rs1799966 (TC + ​​CC

vs.

genótipos TT), radioterapia (ever

vs. nunca

), e tabagismo (nunca

vs.

sempre) foram significativamente associados com um aumento do OS de pacientes com NSCLC avançado com valores de log-rank de p = 0,042, 0,049 e 0,042, respectivamente (Fig. 1). A análise multivariada Cox por etapas mostrou que

BRCA1

rs1799966 (TC + ​​CC

vs

TT:. HR = 0,617, IC 95% = ,402-,948, p = 0,028), radioterapia (ever

vs

nunca:. HR = 0,611, IC 95% = 0,396-0,944, p = 0,027), e tabagismo (nunca

vs

sempre:. HR = 0,574, IC 95% = 0,373 -0,882, p = 0,011) previu independentemente favorável de sobrevivência dos pacientes com NSCLC avançados. Não foram observadas associações significativas entre os outros SNPs ou outras características e OS (-rank log P 0,05 para todos).

(A) a terapia de radiação

BRCA1

rs1799966, (B), ( C) tabagismo.

Foram examinados ainda mais a associação de

BRCA1

rs1799966 com a sobrevivência em análises de subgrupos por categorizar os pacientes de acordo com a histologia, tabagismo, estado de desempenho ECOG e estágio . Com carcinoma de células escamosas, aqueles que nunca fumaram, aqueles com estado de desempenho ECOG de 1, ou aqueles em estágio III,

BRCA1

rs1799966 TC + CC genótipos previu um sistema operacional mais tempo do que o genótipo TT (log-rank p 0,05 para todos) (Fig. 2). Após o ajuste para idade, sexo, histologia, palco, performance status ECOG, tabagismo e terapia de radiação no modelo de Cox,

genótipos BRCA1

rs1799966 TC + CC foram associados a um menor risco de morte em pacientes com escamosas carcinoma de células (HR = 0,324, IC 95% = 0,137-0,765, p = 0,010), os pacientes que nunca fumaram (HR = 0,406, IC 95% = 0,221-0,743, p = 0,004), ou aqueles com estatuto de um desempenho ECOG ( HR = 0,563, IC 95% = 0,353-0,898, p = 0,016).

(A) grupo de carcinoma de células escamosas, (B) sempre status = 1 grupo fumantes grupo, (C) desempenho ECOG, (D ) fase de grupos III. Número entre parênteses, o número de mortes /número de casos.

Associações de SNPs com OS no pós-operatório de pacientes com estágio inicial NSCLC

ERCC1

rs11615 e fumar estatuto foram estatisticamente significativamente associada com o sistema operacional de pacientes em fase inicial NSCLC (log-rank p = 0,009 e 0,013, respectivamente) (fig. 3). Na análise multivariada de Cox por etapas, os pacientes com

ERCC1

rs11615 genótipo AA tiveram um risco aumentado de morte (mortes /casos: 5/9 para AA

vs

44/147 para GG + GA. , HR = 3,087, IC 95% = 1,197-7,961, p = 0,020,). O fumo também foi associado com pior sobrevida (mortes /casos:. 30/76 para sempre fumantes

vs

19/80 para que nunca fumaram, HR = 1,896, IC 95% = 1,040-3,455, p = 0,037). Não foram observadas quaisquer associações significativas de outros SNPs ou outras características com OS (log-rank p 0,05 para todos)

(A)

ERCC1

rs11615, (B) tabagismo. .

Outras análises de estratificação em pacientes com NSCLC fase iniciais indicaram que

ERCC1

rs11615 genótipo AA previu um sistema operacional mais pobre significativo do que genótipos GG + GA em pacientes com carcinoma de células escamosas (log-rank p = 0,004), aqueles que nunca fumaram (log-rank p = 0,018), aqueles com estado de desempenho ECOG de 1 (log-rank p = 0,007), ou aqueles de nunca receber terapia de radiação (log-rank p 0,001) (Fig. 4). Após o ajuste para idade, sexo, histologia, palco, performance status ECOG, tabagismo, radioterapia e quimioterapia adjuvante no modelo de Cox,

ERCC1

rs11615 genótipo AA previu um maior risco de morte em pacientes em estágio inicial com carcinoma de células escamosas (HR = 6,633, IC 95% = 1,184-37,164, p = 0,031), aqueles que nunca fumaram (HR = 3,324, IC 95% = 1,040-10,627, p = 0,043), aqueles com estatuto de um desempenho ECOG ( HR = 2,835, IC 95% = 1,063-7,560, p = 0,037), ou aqueles de nunca receber terapia de radiação (HR = 5,381, IC 95% = 1,857-15,593, p = 0,002).

(A) grupo carcinoma de células escamosas, (B) sempre grupo fumantes, status = 1 grupo (C) desempenho ECOG, (D) de nunca receber grupo de terapia de radiação. Número entre parênteses, o número de mortes /número de casos.

Discussão

Neste estudo, avaliamos as relações entre seis SNPs com resposta à quimioterapia e sobrevivência das NSCLC em uma população chinesa Han . Observou-se que o menor alelo C de

BRCA1

rs1799966 da via DSBR foi associada com uma melhor resposta ao tratamento e uma maior sobrevida em pacientes com NSCLC avançado foi submetido à quimioterapia à base de platina. Além disso, alelo secundário A do

MDR1 /ABCB1

rs1045642 foi significativamente associada com benefício clínico da quimioterapia em pacientes com NSCLC avançado. Para pacientes com NSCLC início, portadores de

genótipo ERCC1

rs11615 AA tiveram um risco aumentado de morte.

BRCA1

gene pertence ao sistema NER [23], que é o grande sistema de reparação que reduz o dano ao DNA induzido por platina.

BRCA1

envolve em muitas actividades, incluindo a recombinação homóloga, o fim não homóloga juntar e reparo incompatível [24]. proteína BRCA1 é uma fosfoproteína nuclear com múltiplas funções não só no DNA reparação de danos, mas também no posto de controle do ciclo celular ou máquinas morte celular [24], [25].

In vitro

estudos têm relatado que BRCA1 pode regular a quimioterapia sensibilidade agente; Por exemplo, a ausência de BRCA1 provoca uma elevada sensibilidade ao cisplatino [24]. expressão de BRCA1 é um indicador fiável de quimioresistência em doentes com NSCLC que recebem tratamento por agentes que danificam o ADN, tais como platina [26] – [28]. Os pacientes com menor expressão BRCA1 têm melhor sobrevida em quimioterapia neoadjuvante com platina [26] – [28], o que é confirmado por uma recente meta-análise [29]. Os polimorfismos genéticos podem afectar a expressão da proteína, a estrutura e /ou função; No entanto, estudos anteriores raramente investigou as associações entre a

BRCA1

polimorfismos com a sobrevivência NSCLC. Um estudo em uma população coreana relatou nenhuma associação entre o

rs1799966 e sobrevivência NSCLC BRCA1

; no entanto, eles se encontrar

BRCA1

haplótipo AACC (rs1799966-rs8176199-rs8067269-rs2070833) previu mais curta sobrevivência entre os pacientes com NSCLC avançado que receberam quimioterapia à base de platina [18]. Em nossa análise, observamos

BRCA1

rs1799966 menor alelo C foi significativamente associada com uma melhor resposta à quimioterapia e maior sobrevida em pacientes com NSCLC avançado. rs1799966 é um SNP nonsynonymous na região codificadora do domínio do terminal COOH, denominado como BRCT, que é essencial para a recombinação homóloga na reparação de ADN de cadeia dupla quebras [30]. A mudança de aminoácidos de prolina para a leucina na posição 871 de rs799917 conduz a uma alteração não conservadora de propriedades estruturais únicas da proteína BRCA1. Além disso, este SNP está em desequilíbrio de ligação com rs799917, que se encontra no meio de uma região fortemente conservada do

BRCA1 gene

[31].

ERCC1 é outra enzima importante na NER via de reparação do ADN, e é responsável pela ‘incisão de DNA danificado [32] 5. Estudos anteriores demonstraram que a expressão ERCC1 está relacionada com benefício clínico de quimioterapia à base de platina [5], [8], [33], [34], e pode ser utilizado como um biomarcador para o tratamento de NSCLC. O genótipo variante em

ERCC1

polimorfismos podem destruir ou alterar as funções de reparação possivelmente através de alterar os níveis de expressão. rs11615 é um SNP sinónimo localizado no códon 118 do

ERCC1

gene, que codifica os aminoácidos asparagina. O alelo variante do rs11615 pode resultar em nível de mRNA alterada [35]. Estudos realizados em diferentes populações mostrou que o genótipo GG do

ERCC1

rs11615 foi associada com uma melhor sobrevida em pacientes NSCLC avançado [36], [37]. Ao contrário, um estudo realizado no Japão não encontrou associações significativas entre a

rs11615 ERCC1

e sobrevivência [38]. Além disso, uma meta-análise incluindo 17 estudos não poderia confirmar a associação de

ERCC1

rs11615 com a sobrevivência, nem nas análises estratificadas globais nem étnicos [39]. Os resultados inconsistentes de estudos anteriores pode ser devido a diferenças étnicas, o estágio da doença, e /ou variações terapêuticos. Poucos estudos já investigaram a associação entre rs11615 e sobrevivência da fase inicial NSCLC. No presente estudo, verificou-se que o genótipo AA de rs11615 foi associada com o OS mais pobre em pacientes com NSCLC fase precoce. Uma importante meta-análise concluiu que a alta ERCC1 foi associada com significativamente pior OS em pacientes com NSCLC tratados com platina [40]. Estas evidências indicam que o genótipo do alelo variante (AA) de rs11615 está relacionada com a alta expressão de ERCC1. No entanto, os efeitos da terapia de radiação são complexas. Uma fração de nossos pacientes com NSCLC fase inicial (32/156, 20,5%) receberam terapia de radiação, portanto, não podemos descartar a possível influência da terapia de radiação sobre a associação de

ERCC1

rs11615 com a sobrevivência.

Um motivo de falha do tratamento em doentes com cancro é a resistência à droga, que pode ser influenciado por factores que afectam o efluxo e influxo de agentes quimioterapêuticos através da membrana celular. MDR1 /ABCB1 é responsável para o efluxo de muitos agentes quimioterapêuticos através da membrana celular por meio de hidrólise de ATP [41]. rs1045642 tem um G A mudança na posição 3435 de ADNc do exão 26 e desempenha um papel na função da P-gp [20]. No entanto, os resultados de estudos de

MDR1 /ABCB1

rs1045642 e resposta à quimioterapia à base de platina de NSCLC são inconsistentes em diferentes populações [36], [42]. Meta-análises recentes confirmou esta SNP foi associada a resposta à quimioterapia em populações globais e asiáticos [39], [43]. No entanto, obtivemos resultados opostos a partir dos achados de meta-análise, mostrando

MDR1 /ABCB1

portadores do alelo variante tiveram benefícios clínicos de quimioterapia. A discrepância pode, eventualmente, ser explicado por fatores de confusão potenciais, tais como a terapia de radiação.

Não surpreendentemente, o tabagismo foi associado com NSCLC prognóstico, tanto em pacientes em estágio inicial e avançado. Fumar provoca a função pulmonar diminuída, e é o fator de risco bem estabelecido de ocorrência NSCLC e mau prognóstico. Fumar pode causar danos de ADN, tal como aductos de ADN e as lesões de quebra de DNA de cadeia dupla [44]. Ele também pode interferir com a função de reparo do DNA, o que afecta significativamente os resultados dos pacientes.

O presente estudo tem várias limitações. Em primeiro lugar estão o tamanho da amostra relativamente pequena e um curto período de acompanhamento, especialmente em análises de subgrupos, portanto, levantar a questão dos resultados falsos positivos. Nossos resultados não alcançaram significância estatística após correção para comparações múltiplas, e esses achados precisam ser ainda mais validado. Em segundo lugar, foram coletados dados do sistema operacional em vez de sobrevivência específica da doença, uma vez que é difícil de confirmar a verdadeira causa da morte em alguns pacientes. Em terceiro lugar, nós só selecionada número limitado de SNPs com base em suas funções, enquanto outros polimorfismos nestes genes podem afetar a resposta a quimioterapia NSCLC e prognóstico. Última, NSCLC é um grupo heterogêneo de neoplasias, e vários mecanismos podem determinar a resposta e prognóstico, não fomos capazes de conta todos os factores na análise atual.

Para concluir, o nosso estudo forneceu mais evidências de que polimorfismos no DNA genes da via de reparação e

MDR1

gene poderia influenciar a resposta ao tratamento e sobrevida dos pacientes com NSCLC. Os mecanismos pelos quais as diferenças nas sequências nucleotídicas SNP ou repetições em série podem afectar a transcrição de genes continuam a ser largamente claro. Além disso estudos em grande escala são necessários para elucidar as funções e mecanismos que podem ajudar a melhorar os resultados dos pacientes com NSCLC.

Informações de Apoio

Tabela S1. informação

Polimorfismo de primers e sondas para genotipagem

doi: 10.1371. /journal.pone.0099843.s001

(DOC)

Tabela S2. distribuições

Genótipo de SNPs em pacientes com NSCLC

doi: 10.1371. /journal.pone.0099843.s002

(DOC)

Dataset S1.

doi: 10.1371 /journal.pone.0099843.s003

(XLS)