PLoS ONE: divergente genômica e epigenômico Landscapes of Lung Cancer subtipos ressaltam a Seleção de diferentes vias oncogênicas durante o desenvolvimento do tumor

Abstract

Para fins terapêuticos, o cancro do pulmão de células não pequenas (NSCLC) tem sido tradicionalmente considerado como uma única doença. No entanto, evidências recentes sugerem que os dois principais subtipos de NSCLC, adenocarcinoma (AC) e carcinoma de células escamosas (SqCC) respondem de forma diferente a ambas as quimioterapias geração de alvo molecular e novos. Portanto, identificando as diferenças moleculares entre estes tipos de tumores podem impactar nova estratégia de tratamento. Foi realizada a primeira análise em grande escala de 261 tumores NSCLC primárias (169 AC e 92 SqCC), integrando perfis no número de cópias de DNA, de metilação e de expressão de genes do genoma para identificar alterações moleculares específicos do subtipo relevantes para projeto novo agente e escolha da terapia . Comparação de paisagens genômicas e epigenômicos AC e SqCC revelou 778 genes alterados com mudanças de expressão que são selecionados durante o desenvolvimento do tumor de uma maneira específica do subtipo correspondente. Análise de 200 CPNPC adicionais confirmaram que estes genes são responsáveis ​​por impulsionar o desenvolvimento diferencial e resultando fenótipos de AC e SqCC. É importante ressaltar que nós identificamos vias oncogênicas chaves interrompidas em cada subtipo que provavelmente servem como base para a sua biologia do tumor diferencial e resultados clínicos. Regulação negativa do

HNF4α

genes alvo foi a via mais comum específico para AC, enquanto SqCC demonstrado interrupção de numerosas enzimas histona modificação, bem como o factor de transcrição

E2F1. Em silico

rastreio de candidatos compostos terapêuticos que utilizam componentes da via específica para subtipos identificados inibidores de HDAC e PI3K como tratamentos potenciais adaptados para SqCC pulmão. Juntos, nossos resultados sugerem que AC e SqCC desenvolvem através vias moleculares distintos que têm implicação significativa na nossa abordagem para a gestão clínica do NSCLC

Citation:. Lockwood WW, Wilson IM, Coe BP, Chari R, Pikor LA , Thu KL, et al. (2012) Divergente genômica e epigenômico Landscapes of Lung Cancer subtipos ressaltam a Seleção de diferentes vias oncogênicas durante o desenvolvimento do tumor. PLoS ONE 7 (5): e37775. doi: 10.1371 /journal.pone.0037775

editor: Alfons Navarro, da Universidade de Barcelona, ​​Espanha

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