Abstract
O
BRAF
(V600E) mutação no cancro colorectal que são estáveis microssatélite (MSS) confere um prognóstico pobre paciente, enquanto que
BRAF
mutante microssatélite instável (MSI) cancro colorectal tem um excelente prognóstico.
BRAF
cânceres do tipo selvagem são tipicamente MSS e instabilidade de exibição cromossômica (CIN). CIN não tem sido extensivamente estudada em uma base de todo o genoma em relação ao
BRAF
estado mutacional no cancro colorectal.
BRAF
mutante /MSS (
BRAF
mut /MSS) cancros (n = 33) e
BRAF
mutante /MSI (
BRAF
mut /MSI ) cancros (n = 30) foram comparados para a presença de aberrações no número de cópias (CNAs) indicativo da CIN, com
BRAF
tipo selvagem /MSS (
BRAF
p /MSS) cancros (n = 18) utilizando Illumina CytoSNP-12 matrizes.
BRAF
mut /MSS e
BRAF cancros
wt /MSS mostrou números comparáveis de CNAs /câncer em 32,8 e 29,8, respectivamente. No entanto, houve diferenças nos padrões de comprimento CNA entre os grupos de MSS, com
BRAF
mut /cânceres MSS tendo proporções significativamente maiores de CNAs focal em relação ao
BRAF
p /cânceres MSS (p 0,0001 ); Considerando que todo o braço cromossômico CNAs foram mais comuns em
cancros BRAF
p /MSS (p 0,0001). Este relacionada a um reduzido comprimento CNA médio em
BRAF
mut /MSS em comparação com
BRAF
p /cânceres MSS (20,7 Mb vs 33,4 Mb; p 0,0001); e uma percentagem média menor de CIN afetados genomas em
BRAF
mut /MSS em comparação com
cancros BRAF
p /MSS (23,9% vs 34,9%, respectivamente).
BRAF
mut /cânceres MSI foram confirmados para ter taxas baixas CNA (5,4 /cancro) e mínimas genomas CIN afetadas (média de 4,5%) em comparação com coortes MSS (p 0,0001).
BRAF
mut /cânceres MSS tinha eliminação mais frequente CNAs em relação ao
BRAF
p /MSS cancros sobre 6p e 17q em loci normalmente não se correlacionaram com cancro colo-rectal, e maior amplificação CNAs em 8q e 18q em comparação com
cancros BRAF
p /MSS. Estes resultados indicam que as taxas comparáveis de CIN ocorrer entre subgrupos MSS, as diferenças no entanto significativas em seus padrões de instabilidade existem, com
BRAF
mut /cânceres MSS mostrando um “padrão focal” e
BRAF
wt /cânceres MSS tendo um ‘padrão de braço inteiro “do CIN. Este eo loci genômico mais acometido em
BRAF
mut /cânceres MSS fornece uma evidência adicional das distinções biológicas desta importante subgrupo câncer
Citation:. Bond CE, Nancarrow DJ, Wockner LF, Wallace L, Montgomery GW, Leggett BA, et ai. (2014) microssatélites cânceres colorretais estáveis estratificados pelo
BRAF V600E
Mutation Mostrar padrões distintos de instabilidade cromossômica. PLoS ONE 9 (3): e91739. doi: 10.1371 /journal.pone.0091739
editor: Daniela Aust, University Hospital Carl Gustav Carus, Alemanha